Centre de Documentation Campus Montignies
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12 résultat(s) recherche sur le mot-clé 'PLASMIDES'
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Développement de techniques nécessaires à la transformation génétique du rotifère bdelloïde Adineta vaga / LUDOVIC HERTER
Titre : Développement de techniques nécessaires à la transformation génétique du rotifère bdelloïde Adineta vaga Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : LUDOVIC HERTER, Auteur Année de publication : 2016 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : Biologie médicale Unité de Recherche en Biologie Environnementale et Evolutive URBE rotifères adineta vaga écologie souches plasmides additifs culture ADN ARN électrophorèse sur gel agarose purification ADN feeding transformation bactérienne transfection DAPI Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Présentation du lieu de stage ................................................................................ 11
Introduction générale ............................................................................................ 13
1. Contexte général ........................................................................................... 15
1.1 Les rotifères… ........................................................................................ 15
1.2 …un embranchement très diversifié ..................................................... 15
1.3 Notre rotifère bdelloïde modèle, Adineta vaga .................................... 17
1.3.1 Ecologie .............................................................................................. 17
1.3.2 Anatomie/physiologie ........................................................................ 17
1.3.3 Un organisme eutélique ..................................................................... 21
1.4 « Un Scandale de l’évolution» ............................................................... 21
1.5 De nombreux gènes étrangers .............................................................. 23
1.6 Un organisme extraordinairement résistant ......................................... 23
1.7 Les transferts horizontaux, source de variabilité ? ............................... 25
2. Objectifs et stratégies ................................................................................... 27
3. Matériel et méthodes ................................................................................... 29
3.1 Souches et plasmides ............................................................................ 29
3.1.1 Rotifère bdelloïde .............................................................................. 29
3.1.2 Souche bactérienne ........................................................................... 29
3.1.3 Plasmides ........................................................................................... 29
3.2 Milieux, tampons et solutions ............................................................... 30
3.2.1 Milieux de culture .............................................................................. 30
3.2.2 Additifs aux milieux de culture .......................................................... 30
3.2.3 Tampons et solutions ......................................................................... 31
3.3 Maintien des cultures de rotifères ........................................................ 31
3.3.1 Conditions de culture ......................................................................... 31
3.3.2 Récolte d’un grand nombre d’individus ............................................ 32
3.4 Techniques relatives aux acides nucléiques .......................................... 32
3.4.1 Techniques relatives à l’ADN ............................................................. 32
3.4.2 Techniques relatives à l’ARN .............................................................. 38
3.4.3 Electrophorèse sur gel d’agarose ...................................................... 39
3.4.4 Purification d’ADN sur gel d’agarose ................................................. 39
3.5 Techniques relatives à l’utilisation de bactéries ................................... 40
3.5.1 Feeding des rotifères aux bactéries fluorescentes ............................ 40
3.5.2 Transformation de bactéries.............................................................. 40
3.6 Transfection de A. vaga ........................................................................ 42
3.7 Dessiccation du rotifère bdelloïde A.vaga ............................................ 42
3.8 Microscopie ........................................................................................... 43
3.8.1 Technique de fixation ........................................................................ 43
3.8.2 Marquage au DAPI et montage au Mowiol ....................................... 43
4. Résultats et discussion ................................................................................. 45
4.1 Processus d’internalisation d’acides nucléiques ................................... 45
4.1.1 Synthèse des acides nucléiques marqués ......................................... 45
4.1.2 Transfection des acides nucléiques marqués chez A.vaga ................ 52
4.1.3 Nourrissage d’A.vaga aux bactéries fluorescentes : est-ce que la
localisation du signal est identique ? ...................................................................... 54
4.1.4 La dessiccation, origine probable des transferts horizontaux .......... 55
4.2 La fluorescence est-elle altérée par la fixation ? .................................. 58
4.2.1 Fixation au paraformaldéhyde .......................................................... 58
4.2.2 « Le monde est stone » ..................................................................... 59
4.2.3 Observation d’A.vaga in vivo ............................................................. 60
4.2.4 Transfection sur des oeufs, plus efficace ? ........................................ 60
4.3 Transgenèse transitoire ........................................................................ 61
4.3.1 Purification et validation des plasmides pCS2+ et pCS2+eGFP ......... 61
4.3.2 Construction du plasmide mCherry ................................................... 62
4.4 Etude de la résistance/sensibilité d’A.vaga aux antibiotiques ............. 68
Conclusion générale et perspectives ..................................................................... 73
Liste des illustrations ............................................................................................. 77
Lexique .................................................................................................................. 78
Bibliographie .......................................................................................................... 79
Annexes ................................................................................................................. 81
Résumé .................................................................................................................. 94Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65674 Développement de techniques nécessaires à la transformation génétique du rotifère bdelloïde Adineta vaga [TFE / Mémoire] / LUDOVIC HERTER, Auteur . - 2016.
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Langues : Français (fre)
Mots-clés : Biologie médicale Unité de Recherche en Biologie Environnementale et Evolutive URBE rotifères adineta vaga écologie souches plasmides additifs culture ADN ARN électrophorèse sur gel agarose purification ADN feeding transformation bactérienne transfection DAPI Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Présentation du lieu de stage ................................................................................ 11
Introduction générale ............................................................................................ 13
1. Contexte général ........................................................................................... 15
1.1 Les rotifères… ........................................................................................ 15
1.2 …un embranchement très diversifié ..................................................... 15
1.3 Notre rotifère bdelloïde modèle, Adineta vaga .................................... 17
1.3.1 Ecologie .............................................................................................. 17
1.3.2 Anatomie/physiologie ........................................................................ 17
1.3.3 Un organisme eutélique ..................................................................... 21
1.4 « Un Scandale de l’évolution» ............................................................... 21
1.5 De nombreux gènes étrangers .............................................................. 23
1.6 Un organisme extraordinairement résistant ......................................... 23
1.7 Les transferts horizontaux, source de variabilité ? ............................... 25
2. Objectifs et stratégies ................................................................................... 27
3. Matériel et méthodes ................................................................................... 29
3.1 Souches et plasmides ............................................................................ 29
3.1.1 Rotifère bdelloïde .............................................................................. 29
3.1.2 Souche bactérienne ........................................................................... 29
3.1.3 Plasmides ........................................................................................... 29
3.2 Milieux, tampons et solutions ............................................................... 30
3.2.1 Milieux de culture .............................................................................. 30
3.2.2 Additifs aux milieux de culture .......................................................... 30
3.2.3 Tampons et solutions ......................................................................... 31
3.3 Maintien des cultures de rotifères ........................................................ 31
3.3.1 Conditions de culture ......................................................................... 31
3.3.2 Récolte d’un grand nombre d’individus ............................................ 32
3.4 Techniques relatives aux acides nucléiques .......................................... 32
3.4.1 Techniques relatives à l’ADN ............................................................. 32
3.4.2 Techniques relatives à l’ARN .............................................................. 38
3.4.3 Electrophorèse sur gel d’agarose ...................................................... 39
3.4.4 Purification d’ADN sur gel d’agarose ................................................. 39
3.5 Techniques relatives à l’utilisation de bactéries ................................... 40
3.5.1 Feeding des rotifères aux bactéries fluorescentes ............................ 40
3.5.2 Transformation de bactéries.............................................................. 40
3.6 Transfection de A. vaga ........................................................................ 42
3.7 Dessiccation du rotifère bdelloïde A.vaga ............................................ 42
3.8 Microscopie ........................................................................................... 43
3.8.1 Technique de fixation ........................................................................ 43
3.8.2 Marquage au DAPI et montage au Mowiol ....................................... 43
4. Résultats et discussion ................................................................................. 45
4.1 Processus d’internalisation d’acides nucléiques ................................... 45
4.1.1 Synthèse des acides nucléiques marqués ......................................... 45
4.1.2 Transfection des acides nucléiques marqués chez A.vaga ................ 52
4.1.3 Nourrissage d’A.vaga aux bactéries fluorescentes : est-ce que la
localisation du signal est identique ? ...................................................................... 54
4.1.4 La dessiccation, origine probable des transferts horizontaux .......... 55
4.2 La fluorescence est-elle altérée par la fixation ? .................................. 58
4.2.1 Fixation au paraformaldéhyde .......................................................... 58
4.2.2 « Le monde est stone » ..................................................................... 59
4.2.3 Observation d’A.vaga in vivo ............................................................. 60
4.2.4 Transfection sur des oeufs, plus efficace ? ........................................ 60
4.3 Transgenèse transitoire ........................................................................ 61
4.3.1 Purification et validation des plasmides pCS2+ et pCS2+eGFP ......... 61
4.3.2 Construction du plasmide mCherry ................................................... 62
4.4 Etude de la résistance/sensibilité d’A.vaga aux antibiotiques ............. 68
Conclusion générale et perspectives ..................................................................... 73
Liste des illustrations ............................................................................................. 77
Lexique .................................................................................................................. 78
Bibliographie .......................................................................................................... 79
Annexes ................................................................................................................. 81
Résumé .................................................................................................................. 94Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65674 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Etude du rôle de la protéine PicC de Brucella abortus. / SABRINA DELMOITIE
Titre : Etude du rôle de la protéine PicC de Brucella abortus. Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : SABRINA DELMOITIE, Année de publication : 2016 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : Biologie médicale Unamur URBM brucella abortus zoonose réplication ADN cycle cellulaire protéine PicC escherichia coli DH10B escherichia coli S-17-1 brucella abortus 544 plasmides levures PCR Digestion ADN ligation transformation par choc thermique isolation ADN plasmidique conjugaison induction à l'IPTG marquage au TRSE western blot purification de fragment Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Remerciements ........................................................................................................................... 3
Présentation du lieu de stage ...................................................................................................... 6
Introduction ................................................................................................................................ 7
Contexte général ....................................................................................................................... 9
1. La zoonose causée par Brucella abortus............................................................................. 9
1.1 Transmission ................................................................................................................. 9
1.1.1 Chez les animaux ................................................................................................... 9
1.1.2 Chez l’homme ...................................................................................................... 10
1.2 Pathologie ................................................................................................................... 10
1.2.1 Chez les animaux ................................................................................................. 10
1.2.2 Chez l’homme ...................................................................................................... 11
2. Trafic intracellulaire ......................................................................................................... 12
3. Cycle cellulaire ................................................................................................................. 13
3.1 Généralités .................................................................................................................. 13
3.2 Brucella abortus et sa croissance unipolaire particulière ........................................... 14
3.3 Réplication de l’ADN et division cellulaire de Brucella abortus ............................... 16
3.4 Contrôle du cycle cellulaire et l’intrigue de la protéine PicC ..................................... 17
Objectifs et stratégies ............................................................................................................. 20
Matériel et méthodes .............................................................................................................. 23
1. Matériel ............................................................................................................................. 23
1.1 Souches de bactéries ................................................................................................... 23
1.1.1 Escherichia coli DH10B ...................................................................................... 23
1.1.2 Escherichia coli S-17-1 ........................................................................................ 23
1.1.3 Brucella abortus 544 ............................................................................................ 24
1.2 Plasmides .................................................................................................................... 24
1.3 Souches de levures ...................................................................................................... 24
1.3.1 Saccharomyces cerevisiae MaV103 ..................................................................... 24
1.3.2 Saccharomyces cerevisiae MaV203 ..................................................................... 25
2. Méthodes .......................................................................................................................... 25
2.1 Polymerase chain reaction (PCR) ............................................................................... 25
2.2 Digestion de l’ADN .................................................................................................... 27
2.3 Ligation ....................................................................................................................... 27
2.4 Transformation par choc thermique ............................................................................ 28
2.5 Isolation de l’ADN plasmidique (miniprep) ............................................................... 29
2.6 Conjugaison ................................................................................................................ 29
2.7 Induction à l’IPTG ...................................................................................................... 30
2.8 Marquage au TRSE ..................................................................................................... 30
2.9 Western Blot ............................................................................................................... 31
2.10 Test double hybride en levure ................................................................................... 32
2.11 Trousse de purification de fragments d’ADN ........................................................... 34
Résultats .................................................................................................................................. 35
1. Caractérisation des anticorps His6-PicC ........................................................................... 35
2. Analyse des souches surexprimant la protéine PicC ........................................................ 39
2.1 Surexpression de la protéine PicC à l’aide du plasmide pBBRI-picC ........................ 39
2.2 Surexpression de la protéine PicC à l’aide du plasmide pBBR-1-picC ...................... 44
3. Recherche des nouveaux partenaires protéiques de PicC ................................................. 46
Discussions .............................................................................................................................. 51
Conclusion et perspectives ..................................................................................................... 55
Lexique .................................................................................................................................... 57
Bibliographie ........................................................................................................................... 58
Annexes ................................................................................................................................... 59Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65668 Etude du rôle de la protéine PicC de Brucella abortus. [TFE / Mémoire] / SABRINA DELMOITIE, . - 2016.
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Mots-clés : Biologie médicale Unamur URBM brucella abortus zoonose réplication ADN cycle cellulaire protéine PicC escherichia coli DH10B escherichia coli S-17-1 brucella abortus 544 plasmides levures PCR Digestion ADN ligation transformation par choc thermique isolation ADN plasmidique conjugaison induction à l'IPTG marquage au TRSE western blot purification de fragment Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Remerciements ........................................................................................................................... 3
Présentation du lieu de stage ...................................................................................................... 6
Introduction ................................................................................................................................ 7
Contexte général ....................................................................................................................... 9
1. La zoonose causée par Brucella abortus............................................................................. 9
1.1 Transmission ................................................................................................................. 9
1.1.1 Chez les animaux ................................................................................................... 9
1.1.2 Chez l’homme ...................................................................................................... 10
1.2 Pathologie ................................................................................................................... 10
1.2.1 Chez les animaux ................................................................................................. 10
1.2.2 Chez l’homme ...................................................................................................... 11
2. Trafic intracellulaire ......................................................................................................... 12
3. Cycle cellulaire ................................................................................................................. 13
3.1 Généralités .................................................................................................................. 13
3.2 Brucella abortus et sa croissance unipolaire particulière ........................................... 14
3.3 Réplication de l’ADN et division cellulaire de Brucella abortus ............................... 16
3.4 Contrôle du cycle cellulaire et l’intrigue de la protéine PicC ..................................... 17
Objectifs et stratégies ............................................................................................................. 20
Matériel et méthodes .............................................................................................................. 23
1. Matériel ............................................................................................................................. 23
1.1 Souches de bactéries ................................................................................................... 23
1.1.1 Escherichia coli DH10B ...................................................................................... 23
1.1.2 Escherichia coli S-17-1 ........................................................................................ 23
1.1.3 Brucella abortus 544 ............................................................................................ 24
1.2 Plasmides .................................................................................................................... 24
1.3 Souches de levures ...................................................................................................... 24
1.3.1 Saccharomyces cerevisiae MaV103 ..................................................................... 24
1.3.2 Saccharomyces cerevisiae MaV203 ..................................................................... 25
2. Méthodes .......................................................................................................................... 25
2.1 Polymerase chain reaction (PCR) ............................................................................... 25
2.2 Digestion de l’ADN .................................................................................................... 27
2.3 Ligation ....................................................................................................................... 27
2.4 Transformation par choc thermique ............................................................................ 28
2.5 Isolation de l’ADN plasmidique (miniprep) ............................................................... 29
2.6 Conjugaison ................................................................................................................ 29
2.7 Induction à l’IPTG ...................................................................................................... 30
2.8 Marquage au TRSE ..................................................................................................... 30
2.9 Western Blot ............................................................................................................... 31
2.10 Test double hybride en levure ................................................................................... 32
2.11 Trousse de purification de fragments d’ADN ........................................................... 34
Résultats .................................................................................................................................. 35
1. Caractérisation des anticorps His6-PicC ........................................................................... 35
2. Analyse des souches surexprimant la protéine PicC ........................................................ 39
2.1 Surexpression de la protéine PicC à l’aide du plasmide pBBRI-picC ........................ 39
2.2 Surexpression de la protéine PicC à l’aide du plasmide pBBR-1-picC ...................... 44
3. Recherche des nouveaux partenaires protéiques de PicC ................................................. 46
Discussions .............................................................................................................................. 51
Conclusion et perspectives ..................................................................................................... 55
Lexique .................................................................................................................................... 57
Bibliographie ........................................................................................................................... 58
Annexes ................................................................................................................................... 59Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65668 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Les bactéries, leur monde et nous / Janine GUESPIN-MICHEL
Titre : Les bactéries, leur monde et nous : vers une biologie intégrative et dynamique Type de document : texte imprimé Auteurs : Janine GUESPIN-MICHEL, Auteur Editeur : Paris : Dunod Année de publication : DL 2011 Autre Editeur : "La Recherche" Collection : UniverSciences (Paris), ISSN 1635-625X Importance : 1 vol. (192 p.) Présentation : ill., couv. ill. en coul. Format : 22 cm ISBN/ISSN/EAN : 978-2-10-055799-8 Prix : 19,90 EUR Note générale : Bibliogr. p. 175-181. Glossaire. Index Langues : Français (fre) Mots-clés : MICROBIOLOGIE BACTERIES SYSTEMES DYNAMIQUES NON LINEAIRES SDNL EXTERIEUR INTERIEUR VIRUS PHAGES PLASMIDES ENZYMES RESTRICTION METABOLISME EVOLUTION ECOLOGIE TRANSFERT DE GENES OPERON LACTOSE EFFET GLUCOSE SENSEUR REGULATEUR Index. décimale : 579 Microbiologie Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=85459 Les bactéries, leur monde et nous : vers une biologie intégrative et dynamique [texte imprimé] / Janine GUESPIN-MICHEL, Auteur . - Paris : Dunod : [S.l.] : "La Recherche", DL 2011 . - 1 vol. (192 p.) : ill., couv. ill. en coul. ; 22 cm. - (UniverSciences (Paris), ISSN 1635-625X) .
ISBN : 978-2-10-055799-8 : 19,90 EUR
Bibliogr. p. 175-181. Glossaire. Index
Langues : Français (fre)
Mots-clés : MICROBIOLOGIE BACTERIES SYSTEMES DYNAMIQUES NON LINEAIRES SDNL EXTERIEUR INTERIEUR VIRUS PHAGES PLASMIDES ENZYMES RESTRICTION METABOLISME EVOLUTION ECOLOGIE TRANSFERT DE GENES OPERON LACTOSE EFFET GLUCOSE SENSEUR REGULATEUR Index. décimale : 579 Microbiologie Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=85459 Réservation
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Cote Support Localisation Section Disponibilité 579 GUE B Livre Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Etagères livres Disponible
DisponibleEtude structurale et fonctionnelle de la 1-déoxy-D-xykulose-5-phosphate réductoisomérase – Like de Brucella abortus, une enzyme impliquée dans la biosynthèse des isoprénoïdes / TATIANA SULIMOWSKI
Titre : Etude structurale et fonctionnelle de la 1-déoxy-D-xykulose-5-phosphate réductoisomérase – Like de Brucella abortus, une enzyme impliquée dans la biosynthèse des isoprénoïdes Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : TATIANA SULIMOWSKI, Auteur Année de publication : 2013 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : BIOLOGIE MÉDICALE BRUCELLA ABORTUS ISOPRENOIDES VOIE MEVALONIQUE PLASMIDES BIOLOGIE MOLECULAIRE LYSE CELLULAIRE SDS-PAGE CHROMATOGRAPHIE Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65269 Etude structurale et fonctionnelle de la 1-déoxy-D-xykulose-5-phosphate réductoisomérase – Like de Brucella abortus, une enzyme impliquée dans la biosynthèse des isoprénoïdes [TFE / Mémoire] / TATIANA SULIMOWSKI, Auteur . - 2013.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
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Mots-clés : BIOLOGIE MÉDICALE BRUCELLA ABORTUS ISOPRENOIDES VOIE MEVALONIQUE PLASMIDES BIOLOGIE MOLECULAIRE LYSE CELLULAIRE SDS-PAGE CHROMATOGRAPHIE Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65269 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Mine , un filon pour les chercheurs in Biofutur, 138 (1994)
[article]
Titre : Mine , un filon pour les chercheurs Type de document : texte imprimé Année de publication : 1994 Article en page(s) : 31 - 36 Mots-clés : COLLECTION DE MICROORGANISMES BACTERIES LACTIQUES BACTERIOPHAGES LEVURES PLASMIDES TAXONOMIE SONDES SPECIFIQUES RESISTANCE AU : CUIVRE / CADMIUM Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=67945
in Biofutur > 138 (1994) . - 31 - 36[article] Mine , un filon pour les chercheurs [texte imprimé] . - 1994 . - 31 - 36.
in Biofutur > 138 (1994) . - 31 - 36Exemplaires (1)
Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Réserve Consultable sur demande auprès des documentalistes
Exclu du prêtPermalinkPlace des intégrons dans la dissémination de la résistance aux antibiotiques in Annales de Biologie Clinique, 4 (2000)
PermalinkPlasmid mediated resistance to trimethoprim in Enterobacteriaceae isolated in Gran Canaria , Canaria Islands (Spain) in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses, 12 (1994)
PermalinkPoison , antidote et clonage d'ADN in Biofutur, 211 (2001)
PermalinkPrincipes de génie génétique / Sandy Blackadder Primrose
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