Centre de Documentation Campus Montignies
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Lundi : 8h-18h30
Mardi : 8h-18h30
Mercredi 9h-16h30
Jeudi : 8h-18h30
Vendredi : 8h-16h30
Attention, votre centre de documentation sera fermé du 27/04 au 12/05 inclus.
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8 résultat(s) recherche sur le mot-clé 'TAXONOMIE'
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Evaluation des performances analytiques de deux PCRs real-time détectant la présence de Campylobacter spp directement sur prélèvement de selles / SALIMA AZAIZAOUI
Titre : Evaluation des performances analytiques de deux PCRs real-time détectant la présence de Campylobacter spp directement sur prélèvement de selles Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : SALIMA AZAIZAOUI, Année de publication : 2016 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : CHU Saint-Pierre Bruxelles LHUB-ULB Biologie médicale campylobacter bactérie taxonomie gastro entérite germes pathogènes traitement MALDI-TOF extraction ADN PCR Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : TABLE DES MATIERES
REMERCIEMENTS
PRESENTATION DU LIEU DE STAGE ............................................................................................ 5
INTRODUCTION .......................................................................................................................... 6
1.1 Prévalence de l’infection à Campylobacter et enjeu de santé publique .................... 6
1.2 Historique de la découverte de la bactérie Campylobacter ........................................ 6
1.3 Taxonomie ................................................................................................................... 7
1.4 Morphologie et caractéristiques biochimiques ........................................................... 7
1.5 Croissance .................................................................................................................... 8
1.6 Mode de transmission ................................................................................................. 8
1.7 Pathologies .................................................................................................................. 9
1.7.1 Gastro – entérite: ................................................................................................. 9
1.7.2 Complications : ................................................................................................... 10
1.8 Pathogénèse .............................................................................................................. 11
1.8.1 Motilité : ............................................................................................................. 11
1.8.2 L’adhésion et invasion : ...................................................................................... 11
1.8.3 Production de toxines : ...................................................................................... 11
1.9 Diagnostic .................................................................................................................. 11
1.10 Traitement ............................................................................................................. 12
OBJECTIFS ET STRATEGIE .......................................................................................................... 14
MATERIEL ET METHODES ......................................................................................................... 16
3.1 Collecte des souches et des échantillons .................................................................. 16
3.2 Repiquage des souches ............................................................................................. 16
3.3 Identification des souches sur MALDI-TOF (Matrix-Assisted Laser Desorption/ionisation time-of-Flight) .................................................................................. 17
3.4 Extraction automatique de l’ADN .............................................................................. 19
3.5 Amplification par PCR en temps réel ......................................................................... 21
3.6 Interprétation des résultats ....................................................................................... 26
RESULTATS ................................................................................................................................ 28
4.1 Comparaison de la sensibilité et de la spécificité d’espèce de la PCR « home-made » et de la PCR commerciale ..................................................................................................... 28
4.2 Détermination et comparaison de la limite de détection de la PCR « home-made » et de la PCR commerciale ..................................................................................................... 30
4.3 Répétabilité ................................................................................................................ 32
4.4 Reproductibilité inter-PCR ......................................................................................... 33
4.5 Stabilité de l’échantillon ............................................................................................ 34
4.6 Comparaison de la méthode PCR avec la méthode de référence ............................. 35
DISCUSSION .............................................................................................................................. 38
CONCLUSION ET PERSPECTIVES ............................................................................................... 40
LISTE DES ABREVIATIONS ......................................................................................................... 41
BIBLIOGRAPHIE ......................................................................................................................... 42
ANNEXES ................................................................................................................................... 44Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65658 Evaluation des performances analytiques de deux PCRs real-time détectant la présence de Campylobacter spp directement sur prélèvement de selles [TFE / Mémoire] / SALIMA AZAIZAOUI, . - 2016.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : CHU Saint-Pierre Bruxelles LHUB-ULB Biologie médicale campylobacter bactérie taxonomie gastro entérite germes pathogènes traitement MALDI-TOF extraction ADN PCR Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : TABLE DES MATIERES
REMERCIEMENTS
PRESENTATION DU LIEU DE STAGE ............................................................................................ 5
INTRODUCTION .......................................................................................................................... 6
1.1 Prévalence de l’infection à Campylobacter et enjeu de santé publique .................... 6
1.2 Historique de la découverte de la bactérie Campylobacter ........................................ 6
1.3 Taxonomie ................................................................................................................... 7
1.4 Morphologie et caractéristiques biochimiques ........................................................... 7
1.5 Croissance .................................................................................................................... 8
1.6 Mode de transmission ................................................................................................. 8
1.7 Pathologies .................................................................................................................. 9
1.7.1 Gastro – entérite: ................................................................................................. 9
1.7.2 Complications : ................................................................................................... 10
1.8 Pathogénèse .............................................................................................................. 11
1.8.1 Motilité : ............................................................................................................. 11
1.8.2 L’adhésion et invasion : ...................................................................................... 11
1.8.3 Production de toxines : ...................................................................................... 11
1.9 Diagnostic .................................................................................................................. 11
1.10 Traitement ............................................................................................................. 12
OBJECTIFS ET STRATEGIE .......................................................................................................... 14
MATERIEL ET METHODES ......................................................................................................... 16
3.1 Collecte des souches et des échantillons .................................................................. 16
3.2 Repiquage des souches ............................................................................................. 16
3.3 Identification des souches sur MALDI-TOF (Matrix-Assisted Laser Desorption/ionisation time-of-Flight) .................................................................................. 17
3.4 Extraction automatique de l’ADN .............................................................................. 19
3.5 Amplification par PCR en temps réel ......................................................................... 21
3.6 Interprétation des résultats ....................................................................................... 26
RESULTATS ................................................................................................................................ 28
4.1 Comparaison de la sensibilité et de la spécificité d’espèce de la PCR « home-made » et de la PCR commerciale ..................................................................................................... 28
4.2 Détermination et comparaison de la limite de détection de la PCR « home-made » et de la PCR commerciale ..................................................................................................... 30
4.3 Répétabilité ................................................................................................................ 32
4.4 Reproductibilité inter-PCR ......................................................................................... 33
4.5 Stabilité de l’échantillon ............................................................................................ 34
4.6 Comparaison de la méthode PCR avec la méthode de référence ............................. 35
DISCUSSION .............................................................................................................................. 38
CONCLUSION ET PERSPECTIVES ............................................................................................... 40
LISTE DES ABREVIATIONS ......................................................................................................... 41
BIBLIOGRAPHIE ......................................................................................................................... 42
ANNEXES ................................................................................................................................... 44Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65658 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Bactériologie in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses, 1 JANVIER (1995)
[article]
Titre : Bactériologie Type de document : texte imprimé Année de publication : 1995 Article en page(s) : 9 - 19 Mots-clés : TAXONOMIE TUBERCULOSE DIPHTERIE LISTERIOSE RAA STREPTOCOCCUS PYOGENES RESISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES SONDES GENETIQUES PCR INFECTIONS NOSOCOMIALES VIRULENCE Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=68099
in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses > 1 JANVIER (1995) . - 9 - 19[article] Bactériologie [texte imprimé] . - 1995 . - 9 - 19.
in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses > 1 JANVIER (1995) . - 9 - 19Réservation
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Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Réserve Empruntable sur demande auprès des documentalistes
DisponibleBiodiversité marine et génomique in Biofutur, 301 (2009)
[article]
Titre : Biodiversité marine et génomique Type de document : texte imprimé Année de publication : 2009 Article en page(s) : 33 Mots-clés : BIODIVERSITE MARINE BIODIVERSITE GENOMIQUE EVOLUTION POLYMORPHISME GENETIQUE GENOMIQUE TAXONOMIE MUTATIONS EPONGES DIVERSITE MOLECULAIRE Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=72017
in Biofutur > 301 (2009) . - 33[article] Biodiversité marine et génomique [texte imprimé] . - 2009 . - 33.
in Biofutur > 301 (2009) . - 33Exemplaires (1)
Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Réserve Consultable sur demande auprès des documentalistes
Exclu du prêtDefining management units for european captive aardvarks / Ludmila POHLOVA in Zoobiology, 5/33 (September/October 2014)
[article]
Titre : Defining management units for european captive aardvarks Type de document : texte imprimé Auteurs : Ludmila POHLOVA, Auteur Année de publication : 2014 Article en page(s) : 433-439 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : ORYCTEROPUS: AFER GENETIQUE TAXONOMIE MITOCHONDRIE MANAGEMENT: CAPTIVITE ZOO Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=74285
in Zoobiology > 5/33 (September/October 2014) . - 433-439[article] Defining management units for european captive aardvarks [texte imprimé] / Ludmila POHLOVA, Auteur . - 2014 . - 433-439.
Langues : Anglais (eng)
in Zoobiology > 5/33 (September/October 2014) . - 433-439
Mots-clés : ORYCTEROPUS: AFER GENETIQUE TAXONOMIE MITOCHONDRIE MANAGEMENT: CAPTIVITE ZOO Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=74285 Réservation
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Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Armoires à volets Disponible
DisponibleMine , un filon pour les chercheurs in Biofutur, 138 (1994)
[article]
Titre : Mine , un filon pour les chercheurs Type de document : texte imprimé Année de publication : 1994 Article en page(s) : 31 - 36 Mots-clés : COLLECTION DE MICROORGANISMES BACTERIES LACTIQUES BACTERIOPHAGES LEVURES PLASMIDES TAXONOMIE SONDES SPECIFIQUES RESISTANCE AU : CUIVRE / CADMIUM Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=67945
in Biofutur > 138 (1994) . - 31 - 36[article] Mine , un filon pour les chercheurs [texte imprimé] . - 1994 . - 31 - 36.
in Biofutur > 138 (1994) . - 31 - 36Exemplaires (1)
Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Réserve Consultable sur demande auprès des documentalistes
Exclu du prêtUn pathogène mal connu : Streptococcus anginosus (' Streptococcus milleri ') in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses, 4-avr (1993)
PermalinkSystématique animale / Maxime Hervé
PermalinkTularémie, guerre bactériologique et bioterrorisme in RFL : Revue Francophone des Laboratoires, 415 (2009)
Permalink