Centre de Documentation Campus Montignies
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Lundi : 8h-18h30
Mardi : 8h-18h30
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Lundi 1er juillet : de 8h à 12h et de 12h30 à 16h
Mardi 2 juillet : de 8h à 12h15
Mercredi 3 juillet : de 9h à 12h et de 12h30 à 15h15
Jeudi 4 juillet : de 8h à 12h30 et de 13h à 18h30
Lundi 8 juillet : de 8h à 12h et de 12h30 à 16h
Mardi 9 juillet : de 8h à 12h15
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Titre : |
Construction génétique de la protéine C-GFP du virus BVDV |
Type de document : |
TFE / Mémoire |
Auteurs : |
Virginie Coorens, |
Année de publication : |
2016 |
Note générale : |
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. |
Langues : |
Français (fre) |
Mots-clés : |
Biologie médicale ASBL Culture in vivo Nivelles virus BVD flaviviridae génome viral cycle du virus traduction du génome du virus infection virale transmission virale vaccination transfection passage des cellules microscopie a fluorescence PCR électrophorèse sur gel d'agarose midiprep plasmide plasmide vecteur ligation bactéries compétentes transformation bactérienne miniprep |
Index. décimale : |
TFE Bio Med TFE Biologie médicale |
Note de contenu : |
Table des matières
Remerciements....................................................................................................................................... 3
Présentation de l’ASBL Culture in vivo .............................................................................................. 7
Introduction ........................................................................................................................................... 9
Partie théorique ................................................................................................................................... 11
1) Historique ................................................................................................................................. 11
2) Caractéristiques d’un virus .................................................................................................... 11
3) Structure du virus BVD .......................................................................................................... 12
3.1) Famille des Flaviviridae .................................................................................................... 12
3.2) Génome viral ..................................................................................................................... 14
3.3) Cycle du virus .................................................................................................................... 15
3.4) Traduction du génome du virus BVD................................................................................ 16
4) Description du virus BVD ....................................................................................................... 17
4.1) Différentes étapes d’une infection virale ........................................................................... 18
4.2) Transmission ..................................................................................................................... 18
4.3) Différence entre un animal infecté de manière permanente et transitoire ......................... 20
5) Diagnostic ................................................................................................................................. 20
6) Prévention ................................................................................................................................ 23
6.1) Prise en charge des bovins ..................................................................................................... 23
6.2) Vaccination ............................................................................................................................ 23
7) Présentation des plasmides utilisés ........................................................................................ 25
Partie pratique ..................................................................................................................................... 27
1) Objectif et stratégie ................................................................................................................. 27
2) Matériel et méthodes ............................................................................................................... 28
2.1) Techniques associées à la culture cellulaire ...................................................................... 28
a) Passage des cellules ............................................................................................................... 28
b) Transfection ........................................................................................................................... 28
c) Microscopie à fluorescence ................................................................................................... 29
2.2) Techniques associées à la biologie moléculaire ................................................................ 29
a) Midiprep ................................................................................................................................ 29
b) PCR : Polymerase Chain Reaction ........................................................................................ 29
c) Electrophorèse sur gel d’agarose ........................................................................................... 31
d) Préparation du plasmide vecteur pEGFP-N1 par BamHI et HindIII ..................................... 32
Vérification de la double digestion du plasmide pEGFP-N1 ................................................ 32
Préparation du plasmide vecteur ........................................................................................... 32
e) Concentration du plasmide vecteur pEFGP-N1 .................................................................... 32
f) Ligation ................................................................................................................................. 32
g) Préparation des bactéries compétentes .................................................................................. 32
h) Transformation bactérienne ................................................................................................... 32
i) Miniprep ................................................................................................................................ 33
3) Résultats ................................................................................................................................... 34
a) Stratégie de la construction génétique ................................................................................... 34
b) Vérification du plasmide pEGFP-N1 .................................................................................... 36
Transfection des cellules COS-7 ........................................................................................... 36
Electrophorèse sur gel d’agarose ........................................................................................... 36
Spectrophotométrie ............................................................................................................... 37
c) Amplification de l’insert (gène C) par PCR .......................................................................... 38
d) Double digestion du plasmide pEGFP-N1 par BamHI et HindIII ......................................... 39
e) Préparation du plasmide vecteur pEGFP-N1 par les enzymes de restriction BamHI et HindIII ………………………………………………………………………………………………………………………………………….40
f) Double digestion du produit PCR par BamHI et HindIII .......................................................... 41
g) Digestion enzymatique du produit PCR par BamHI et HindIII ............................................ 43
h) Ligation ................................................................................................................................. 44
i) Transformation bactérienne ................................................................................................... 45
j) Criblage par miniprep ............................................................................................................ 45
k) Transfection ........................................................................................................................... 49
4) Discussion ................................................................................................................................. 50
Conclusion et perspectives .................................................................................................................. 53
Annexes ................................................................................................................................................ 55
Annexe 1 : Carte du plasmide pEGFP-N1 ............................................................................ 55
Annexe 2 : Mode opératoire ................................................................................................... 56
Annexe 3 : Préparation de différentes solutions ................................................................... 64
Liste des figures ................................................................................................................................... 67
Liste des tableaux ................................................................................................................................ 69
Liste des abréviations .......................................................................................................................... 71
Bibliographie ........................................................................................................................................ 73 |
Permalink : |
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Construction génétique de la protéine C-GFP du virus BVDV [TFE / Mémoire] / Virginie Coorens, . - 2016. Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français ( fre)
Mots-clés : |
Biologie médicale ASBL Culture in vivo Nivelles virus BVD flaviviridae génome viral cycle du virus traduction du génome du virus infection virale transmission virale vaccination transfection passage des cellules microscopie a fluorescence PCR électrophorèse sur gel d'agarose midiprep plasmide plasmide vecteur ligation bactéries compétentes transformation bactérienne miniprep |
Index. décimale : |
TFE Bio Med TFE Biologie médicale |
Note de contenu : |
Table des matières
Remerciements....................................................................................................................................... 3
Présentation de l’ASBL Culture in vivo .............................................................................................. 7
Introduction ........................................................................................................................................... 9
Partie théorique ................................................................................................................................... 11
1) Historique ................................................................................................................................. 11
2) Caractéristiques d’un virus .................................................................................................... 11
3) Structure du virus BVD .......................................................................................................... 12
3.1) Famille des Flaviviridae .................................................................................................... 12
3.2) Génome viral ..................................................................................................................... 14
3.3) Cycle du virus .................................................................................................................... 15
3.4) Traduction du génome du virus BVD................................................................................ 16
4) Description du virus BVD ....................................................................................................... 17
4.1) Différentes étapes d’une infection virale ........................................................................... 18
4.2) Transmission ..................................................................................................................... 18
4.3) Différence entre un animal infecté de manière permanente et transitoire ......................... 20
5) Diagnostic ................................................................................................................................. 20
6) Prévention ................................................................................................................................ 23
6.1) Prise en charge des bovins ..................................................................................................... 23
6.2) Vaccination ............................................................................................................................ 23
7) Présentation des plasmides utilisés ........................................................................................ 25
Partie pratique ..................................................................................................................................... 27
1) Objectif et stratégie ................................................................................................................. 27
2) Matériel et méthodes ............................................................................................................... 28
2.1) Techniques associées à la culture cellulaire ...................................................................... 28
a) Passage des cellules ............................................................................................................... 28
b) Transfection ........................................................................................................................... 28
c) Microscopie à fluorescence ................................................................................................... 29
2.2) Techniques associées à la biologie moléculaire ................................................................ 29
a) Midiprep ................................................................................................................................ 29
b) PCR : Polymerase Chain Reaction ........................................................................................ 29
c) Electrophorèse sur gel d’agarose ........................................................................................... 31
d) Préparation du plasmide vecteur pEGFP-N1 par BamHI et HindIII ..................................... 32
Vérification de la double digestion du plasmide pEGFP-N1 ................................................ 32
Préparation du plasmide vecteur ........................................................................................... 32
e) Concentration du plasmide vecteur pEFGP-N1 .................................................................... 32
f) Ligation ................................................................................................................................. 32
g) Préparation des bactéries compétentes .................................................................................. 32
h) Transformation bactérienne ................................................................................................... 32
i) Miniprep ................................................................................................................................ 33
3) Résultats ................................................................................................................................... 34
a) Stratégie de la construction génétique ................................................................................... 34
b) Vérification du plasmide pEGFP-N1 .................................................................................... 36
Transfection des cellules COS-7 ........................................................................................... 36
Electrophorèse sur gel d’agarose ........................................................................................... 36
Spectrophotométrie ............................................................................................................... 37
c) Amplification de l’insert (gène C) par PCR .......................................................................... 38
d) Double digestion du plasmide pEGFP-N1 par BamHI et HindIII ......................................... 39
e) Préparation du plasmide vecteur pEGFP-N1 par les enzymes de restriction BamHI et HindIII ………………………………………………………………………………………………………………………………………….40
f) Double digestion du produit PCR par BamHI et HindIII .......................................................... 41
g) Digestion enzymatique du produit PCR par BamHI et HindIII ............................................ 43
h) Ligation ................................................................................................................................. 44
i) Transformation bactérienne ................................................................................................... 45
j) Criblage par miniprep ............................................................................................................ 45
k) Transfection ........................................................................................................................... 49
4) Discussion ................................................................................................................................. 50
Conclusion et perspectives .................................................................................................................. 53
Annexes ................................................................................................................................................ 55
Annexe 1 : Carte du plasmide pEGFP-N1 ............................................................................ 55
Annexe 2 : Mode opératoire ................................................................................................... 56
Annexe 3 : Préparation de différentes solutions ................................................................... 64
Liste des figures ................................................................................................................................... 67
Liste des tableaux ................................................................................................................................ 69
Liste des abréviations .......................................................................................................................... 71
Bibliographie ........................................................................................................................................ 73 |
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|
Exemplaires
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Titre : |
Rôle du plasmide de la souche Bacillus amyloliquefaciens S499 dans les interactions au sein de la rhizosphère |
Type de document : |
TFE / Mémoire |
Auteurs : |
BRIEUC VAN HASSEL, Auteur |
Année de publication : |
2016 |
Note générale : |
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur |
Langues : |
Français (fre) |
Mots-clés : |
AGRONOMIE AIBT Gembloux Agro-Biotech plasmide rhizosphère Bacillus amyloliquefaciens S499 |
Index. décimale : |
TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies |
Note de contenu : |
Table des matières
Remerciements ........................................................................................................................ 3
Table des matières ................................................................................................................... 4
Introduction générale ............................................................................................................... 7
1. Contexte général .............................................................................................................. 9
1.1. La rhizosphère .......................................................................................................... 9
1.2. Les PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) ................................................. 9
1.2.1. Mécanismes d’aide à la croissance d’espèces végétales ............................... 10
1.2.1.1. Mécanismes directs ................................................................................ 11
1.2.1.2. Mécanismes indirects ............................................................................. 11
1.3. Les Bacillus et leurs lipopeptides............................................................................ 13
1.3.1. Les surfactines ................................................................................................ 15
1.3.2. L’iturine........................................................................................................... 16
1.3.3. La fengycine .................................................................................................... 17
1.4. Bacillus amyloliquefaciens...................................................................................... 18
1.4.1. La souche FZB42 ............................................................................................. 19
1.4.2. La souche S499 ............................................................................................... 20
2. Objectifs et stratégie ...................................................................................................... 21
3. Matériel .......................................................................................................................... 23
3.1. Centrifugeuse ......................................................................................................... 23
3.2. Spectromètre UV-visible ........................................................................................ 23
3.3. SpectraMax ............................................................................................................. 24
3.4. Acquity class H UPLC Waters .................................................................................. 24
3.5. Sonicateur............................................................................................................... 25
3.6. NanoDrop 2000 ...................................................................................................... 26
3.7. StepOnePlus REAL-Time PCR System ..................................................................... 26
3.8. La souche 14A ......................................................................................................... 27 3.9. Graines de tomate (Solanum lycopersicum) et de tabac (Nicotiana tabacum) ..... 28
3.10. Fusarium oxysporum et Cladosporum cucumerinum ........................................ 28
4. Résultats ......................................................................................................................... 29
4.1. Influence du plasmide de la souche S499 (pS499) sur la colonisation et la production de lipopeptides in planta ................................................................................. 29
4.1.1. Tests sur tabac ................................................................................................ 29
4.1.2. Tests sur tomate ............................................................................................. 31
5
4.2. Croissance et production de lipopeptides ex vivo sur milieu « exudats recomposés » ..................................................................................................................... 36
4.2.1. Tests sur LB .................................................................................................... 36
4.2.2. Tests sur RE .................................................................................................... 37
4.3. Influence du plasmide sur les propriétés antagonistes de S499 ........................... 40
4.3.1. Antagonismes sur milieu LBA ......................................................................... 40
4.3.2. Antagonismes sur milieu REA ........................................................................ 43
5. Discussion ....................................................................................................................... 46
5.1. Implication du plasmide dans la colonisation de la rhizosphère ........................... 46
5.2. Implication du plasmide dans la production de lipopeptides ................................ 47
Conclusion et perspectives .................................................................................................... 49
Abréviations ........................................................................................................................... 50
Liste des figures ..................................................................................................................... 51
Liste des tableaux ................................................................................................................... 53
Bibliographie .......................................................................................................................... 54
Annexes .................................................................................................................................. 55 |
Permalink : |
./index.php?lvl=notice_display&id=65738 |
Rôle du plasmide de la souche Bacillus amyloliquefaciens S499 dans les interactions au sein de la rhizosphère [TFE / Mémoire] / BRIEUC VAN HASSEL, Auteur . - 2016. Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français ( fre)
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AGRONOMIE AIBT Gembloux Agro-Biotech plasmide rhizosphère Bacillus amyloliquefaciens S499 |
Index. décimale : |
TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies |
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Table des matières
Remerciements ........................................................................................................................ 3
Table des matières ................................................................................................................... 4
Introduction générale ............................................................................................................... 7
1. Contexte général .............................................................................................................. 9
1.1. La rhizosphère .......................................................................................................... 9
1.2. Les PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) ................................................. 9
1.2.1. Mécanismes d’aide à la croissance d’espèces végétales ............................... 10
1.2.1.1. Mécanismes directs ................................................................................ 11
1.2.1.2. Mécanismes indirects ............................................................................. 11
1.3. Les Bacillus et leurs lipopeptides............................................................................ 13
1.3.1. Les surfactines ................................................................................................ 15
1.3.2. L’iturine........................................................................................................... 16
1.3.3. La fengycine .................................................................................................... 17
1.4. Bacillus amyloliquefaciens...................................................................................... 18
1.4.1. La souche FZB42 ............................................................................................. 19
1.4.2. La souche S499 ............................................................................................... 20
2. Objectifs et stratégie ...................................................................................................... 21
3. Matériel .......................................................................................................................... 23
3.1. Centrifugeuse ......................................................................................................... 23
3.2. Spectromètre UV-visible ........................................................................................ 23
3.3. SpectraMax ............................................................................................................. 24
3.4. Acquity class H UPLC Waters .................................................................................. 24
3.5. Sonicateur............................................................................................................... 25
3.6. NanoDrop 2000 ...................................................................................................... 26
3.7. StepOnePlus REAL-Time PCR System ..................................................................... 26
3.8. La souche 14A ......................................................................................................... 27 3.9. Graines de tomate (Solanum lycopersicum) et de tabac (Nicotiana tabacum) ..... 28
3.10. Fusarium oxysporum et Cladosporum cucumerinum ........................................ 28
4. Résultats ......................................................................................................................... 29
4.1. Influence du plasmide de la souche S499 (pS499) sur la colonisation et la production de lipopeptides in planta ................................................................................. 29
4.1.1. Tests sur tabac ................................................................................................ 29
4.1.2. Tests sur tomate ............................................................................................. 31
5
4.2. Croissance et production de lipopeptides ex vivo sur milieu « exudats recomposés » ..................................................................................................................... 36
4.2.1. Tests sur LB .................................................................................................... 36
4.2.2. Tests sur RE .................................................................................................... 37
4.3. Influence du plasmide sur les propriétés antagonistes de S499 ........................... 40
4.3.1. Antagonismes sur milieu LBA ......................................................................... 40
4.3.2. Antagonismes sur milieu REA ........................................................................ 43
5. Discussion ....................................................................................................................... 46
5.1. Implication du plasmide dans la colonisation de la rhizosphère ........................... 46
5.2. Implication du plasmide dans la production de lipopeptides ................................ 47
Conclusion et perspectives .................................................................................................... 49
Abréviations ........................................................................................................................... 50
Liste des figures ..................................................................................................................... 51
Liste des tableaux ................................................................................................................... 53
Bibliographie .......................................................................................................................... 54
Annexes .................................................................................................................................. 55 |
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Revue | Revue | Centre de Documentation HELHa Campus Montignies | Réserve | Consultable sur demande auprès des documentalistes Exclu du prêt |
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Revue | Revue | Centre de Documentation HELHa Campus Montignies | Réserve | Empruntable sur demande auprès des documentalistes Disponible |
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BIO 0153 | Livre | Centre de Documentation HELHa Campus Montignies | Réserve | Empruntable sur demande auprès des documentalistes Disponible |
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