Centre de Documentation Campus Montignies
Horaires :
Lundi : 8h-18h30
Mardi : 8h-17h30
Mercredi 9h-16h30
Jeudi : 8h-18h30
Vendredi : 8h30-12h30 et 13h-14h30
Attention,
Votre centre de documentation sera fermé ce lundi 26 août.
Également, ce mercredi 28 août il sera fermé de 12 à 13h.
Enfin, ce jeudi 29 août il ouvrira à 14h45.
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Attention,
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Détail de l'éditeur
Helha. Paramédical - Biologie médicale
localisé à :
Montignies-sur-Sambre
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Titre : Validation d’une méthode de dosage antigénique du SARS-CoV-2 dans le sérum Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Nathan Hanot, Auteur ; Louise-Marie Vincent, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2022 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
1 Description du lieu de stage .......................................................................................... 5
2 Contexte du stage ......................................................................................................... 6
3 Introduction .................................................................................................................. 6
3.1 Contexte clinique.............................................................................................................. 6
3.2 Dosage du SARS-CoV-2 dans l’analyseur SIMOA HD-X ...................................................... 9
4 Objectif........................................................................................................................ 14
5 Stratégie...................................................................................................................... 14
6 Matériel et méthode ................................................................................................... 19
6.1 Matériel ...........................................................................................................................19
6.2 Méthode..........................................................................................................................19
6.2.1 Préparation de la plaque ELISA ................................................................................................. 19
6.2.2 Chargement des réactifs........................................................................................................... 20
6.2.3 Extraction des résultats ............................................................................................................ 20
6.2.4 Critères d’acceptabilité d’un run............................................................................................... 20
7 Résultats et discussion ................................................................................................ 21
7.1 Précision ..........................................................................................................................21
7.1.1 Répétabilité ............................................................................................................................. 21
7.1.2 Fidélité intermédiaire ............................................................................................................... 24
7.1.3 Simplicat ou duplicat ................................................................................................................ 26
7.2 Stabilité des échantillons .................................................................................................27
7.3 Stabilité des réactifs ........................................................................................................30
7.4 Linéarité et étendue de mesure.......................................................................................31
7.5 Problèmes rencontrés .....................................................................................................34
7.5.1 Valeur obtenue pour le calibrateur A ........................................................................................ 34
8 Conclusion et perspectives .......................................................................................... 35
9 Abréviations ................................................................................................................ 37
10 Bibliographie ............................................................................................................... 38
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=105752 Validation d’une méthode de dosage antigénique du SARS-CoV-2 dans le sérum [TFE / Mémoire] / Nathan Hanot, Auteur ; Louise-Marie Vincent, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2022.
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Langues : Français (fre)
Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
1 Description du lieu de stage .......................................................................................... 5
2 Contexte du stage ......................................................................................................... 6
3 Introduction .................................................................................................................. 6
3.1 Contexte clinique.............................................................................................................. 6
3.2 Dosage du SARS-CoV-2 dans l’analyseur SIMOA HD-X ...................................................... 9
4 Objectif........................................................................................................................ 14
5 Stratégie...................................................................................................................... 14
6 Matériel et méthode ................................................................................................... 19
6.1 Matériel ...........................................................................................................................19
6.2 Méthode..........................................................................................................................19
6.2.1 Préparation de la plaque ELISA ................................................................................................. 19
6.2.2 Chargement des réactifs........................................................................................................... 20
6.2.3 Extraction des résultats ............................................................................................................ 20
6.2.4 Critères d’acceptabilité d’un run............................................................................................... 20
7 Résultats et discussion ................................................................................................ 21
7.1 Précision ..........................................................................................................................21
7.1.1 Répétabilité ............................................................................................................................. 21
7.1.2 Fidélité intermédiaire ............................................................................................................... 24
7.1.3 Simplicat ou duplicat ................................................................................................................ 26
7.2 Stabilité des échantillons .................................................................................................27
7.3 Stabilité des réactifs ........................................................................................................30
7.4 Linéarité et étendue de mesure.......................................................................................31
7.5 Problèmes rencontrés .....................................................................................................34
7.5.1 Valeur obtenue pour le calibrateur A ........................................................................................ 34
8 Conclusion et perspectives .......................................................................................... 35
9 Abréviations ................................................................................................................ 37
10 Bibliographie ............................................................................................................... 38
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=105752 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Validation technique de I’identification d’espèces de dermatophytes et autres champignons filamenteux par spectrométrie de masse (technique du Maldi-Tof) / Aleandro Forgione
Titre : Validation technique de I’identification d’espèces de dermatophytes et autres champignons filamenteux par spectrométrie de masse (technique du Maldi-Tof) Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Aleandro Forgione, Auteur ; Julie Schmitz, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2021 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : dermatophytes champignons filamenteux spectrométrie de masse technique du Maldi-Tof laboratoire de bactériologie Saint-Joseph Gilly Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Au vu des infections plus fréquentes causées par les mycètes plus précisément les dermatophytes et d’autres champignons filamenteux, le laboratoire de bactériologie de Saint-Joseph à Gilly a débuté une recherche sur une nouvelle méthode d’identification. Pour ce faire, l’objectif de ce travail est de valider un technique d’identification des dermatophytes et d’autres champignons filamenteux par spectrométrie de masse à l’aide du Maldi-Tof. Cette étude permettra de lancer cette technique en routine afin d’aider les laborantins dans l’identification des champignons et d’avoir un diagnostic plus rapidement par rapport à la méthode classique d’identification des mycètes. Cette méthode classique correspond à un examen microscopique et macroscopique. La stratégie de ce mémoire consiste à réaliser différents tests à partir de 31 souches de
plusieurs genres de champignons reçues du CHU de Liège. Une vérification des noms des souches, des tests de croissance et d’extraction ont été effectués afin d’obtenir les conditions optimales pour une bonne identification. La répétabilité, la fiabilité et la reproductibilité de la méthode ont été également analysées dans le but que la validation soit acceptée. Les résultats de ces expériences ont montré que 27 souches sur les 28 souches testées ont été identifiées avec succès à l’aide de la méthode classique du dépôt avec et sans acide formique sur la plaque du Maldi-Tof. Une extraction longue a été mise au point dans le cas d’un mauvais résultat lors de la procédure classique. Celle-ci a démontré un pourcentage d’identification de 100%. Le test de répétabilité réalisé 20 fois sur la même souche a révélé que l’ajout d’acide
formique lors du dépôt entraine des variations de scores sur l’automate et chaque identification a été correcte. Enfin, le test de fiabilité et de reproductibilité quant à lui a montré des résultats allant d’un pourcentage de 80% à 100% pour chaque identification de chaque souche. Toutes les manipulations qui ont été exécutées dans le but de valider la méthode d’identification à l’aide du Maldi-Tof ont fonctionné avec succès. Cette technique d’identification des dermatophytes et autres champignons filamenteux par spectrométrie de masse pourra donc être mise en routine au laboratoire de l’Hôpital Saint-Joseph.Note de contenu : Table des matières
REMERCIEMENTS 4
PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE 9
INTRODUCTION GÉNÉRALE 10
PARTIE THÉORIQUE 12
1. LES MYCÈTES 12
1.1 GÉNÉRALITÉS 12
1.2 STRUCTURE 13
1.2.1 COMPOSITION DE LA PAROI 13
1.2.2 MYCÉLIUM 14
1.2.3 LES SPORES 14
1.3 MODE DE VIE 15
1.4 CLASSIFICATION 15
1.5 IMPORTANCE DES CHAMPIGNONS 15
1.6 PATHOLOGIE HUMAINE 16
1.6.1 MYCOSES SUPERFICIELLES 16
1.6.1.1 MYCOSES CUTANÉES 16
1.6.1.2 MYCOSES SOUS-CUTANÉES 16
1.6.2 MYCOSES SYSTÉMIQUES 16
1.6.3 MYCOSES OPPORTUNISTES 16
2 LES CHAMPIGNONS FILAMENTEUX 17
2.1 LES DERMATOPHYTES 17
2.1.1 GÉNÉRALITÉS 17
2.1.2 LES GENRES 17
2.1.2.1 TRICHOPHYTON 17
2.1.2.2 MICROSPORUM 17
2.1.2.3 EPIDERMOPHYTON 17
2.1.3 IDENTIFICATION 18
2.1.3.1 ASPECTS MORPHOLOGIQUES 18
2.1.3.1.1 MORPHOLOGIE DES CONIDIES 18
2.1.3.1.2 MORPHOLOGIE DES MYCÉLIUMS 19
2.1.4 ORIGINE 19
2.1.5 CARACTÉRISATION DES SOUCHES MANIPULÉES AU LABORATOIRE 19
3 AUTRES CHAMPIGNONS FILAMENTEUX 24
3.1 ORGANE DE CARACTÉRISATION 24
3.2 CARACTÉRISATION DES SOUCHES 24
4 LE MALDI TOF 30
4.1 GÉNÉRALITÉ 30
4.2 LA SPECTROMETRIE DE MASSE 30
4.3 PRINCIPE DU MALDI-TOF 31
4.3.1 MATRICE 33
4.3.2 ANALYSE DES DONNÉES 33
4.4 LES BIBLIOTHÈQUES 33
4.4.1 IVD 33
4.4.2 RUO 34
4.5 VALIDATION TECHNIQUE 34
PARTIE PRATIQUE 35
1 OBJECTIF 35
2 MATÉRIEL ET RÉACTIFS 35
2.1 MATÉRIEL 35
2.2 RÉACTIFS 36
2.3 ÉCHANTILLONS 36
3 ENSEMENCEMENT ET CULTURE DE DERMATOPHYTES 36
3.1 CULTURE 36
4 IDENTIFICATION PAR SPECTROSCOPIE DE MASSE 38
4.1 MODE OPÉRATOIRE 38
4.2 EXTRACTION 39
4.3 CROISSANCE : 40
5 RÉSULTATS ET DISCUSSION 41
5.1 IDENTIFICATION 41
5.2 CULTURE 44
5.3 EXTRACTION 46
5.4 CROISSANCE 47
5.5 LA RÉPÉTABILITÉ 49
5.6 REPRODUCTIBILITÉ ET FIABILITÉ 51
CONCLUSION 54
LISTE DES ABRÉVIATIONS 56
LISTE DES FIGURES ET DES TABLEAUX 57
LEXIQUE 58
BIBLIOGRAPHIE 62
TABLE DES ANNEXES 68
ANNEXES 69Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=100297 Validation technique de I’identification d’espèces de dermatophytes et autres champignons filamenteux par spectrométrie de masse (technique du Maldi-Tof) [TFE / Mémoire] / Aleandro Forgione, Auteur ; Julie Schmitz, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2021.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur
Langues : Français (fre)
Mots-clés : dermatophytes champignons filamenteux spectrométrie de masse technique du Maldi-Tof laboratoire de bactériologie Saint-Joseph Gilly Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Au vu des infections plus fréquentes causées par les mycètes plus précisément les dermatophytes et d’autres champignons filamenteux, le laboratoire de bactériologie de Saint-Joseph à Gilly a débuté une recherche sur une nouvelle méthode d’identification. Pour ce faire, l’objectif de ce travail est de valider un technique d’identification des dermatophytes et d’autres champignons filamenteux par spectrométrie de masse à l’aide du Maldi-Tof. Cette étude permettra de lancer cette technique en routine afin d’aider les laborantins dans l’identification des champignons et d’avoir un diagnostic plus rapidement par rapport à la méthode classique d’identification des mycètes. Cette méthode classique correspond à un examen microscopique et macroscopique. La stratégie de ce mémoire consiste à réaliser différents tests à partir de 31 souches de
plusieurs genres de champignons reçues du CHU de Liège. Une vérification des noms des souches, des tests de croissance et d’extraction ont été effectués afin d’obtenir les conditions optimales pour une bonne identification. La répétabilité, la fiabilité et la reproductibilité de la méthode ont été également analysées dans le but que la validation soit acceptée. Les résultats de ces expériences ont montré que 27 souches sur les 28 souches testées ont été identifiées avec succès à l’aide de la méthode classique du dépôt avec et sans acide formique sur la plaque du Maldi-Tof. Une extraction longue a été mise au point dans le cas d’un mauvais résultat lors de la procédure classique. Celle-ci a démontré un pourcentage d’identification de 100%. Le test de répétabilité réalisé 20 fois sur la même souche a révélé que l’ajout d’acide
formique lors du dépôt entraine des variations de scores sur l’automate et chaque identification a été correcte. Enfin, le test de fiabilité et de reproductibilité quant à lui a montré des résultats allant d’un pourcentage de 80% à 100% pour chaque identification de chaque souche. Toutes les manipulations qui ont été exécutées dans le but de valider la méthode d’identification à l’aide du Maldi-Tof ont fonctionné avec succès. Cette technique d’identification des dermatophytes et autres champignons filamenteux par spectrométrie de masse pourra donc être mise en routine au laboratoire de l’Hôpital Saint-Joseph.Note de contenu : Table des matières
REMERCIEMENTS 4
PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE 9
INTRODUCTION GÉNÉRALE 10
PARTIE THÉORIQUE 12
1. LES MYCÈTES 12
1.1 GÉNÉRALITÉS 12
1.2 STRUCTURE 13
1.2.1 COMPOSITION DE LA PAROI 13
1.2.2 MYCÉLIUM 14
1.2.3 LES SPORES 14
1.3 MODE DE VIE 15
1.4 CLASSIFICATION 15
1.5 IMPORTANCE DES CHAMPIGNONS 15
1.6 PATHOLOGIE HUMAINE 16
1.6.1 MYCOSES SUPERFICIELLES 16
1.6.1.1 MYCOSES CUTANÉES 16
1.6.1.2 MYCOSES SOUS-CUTANÉES 16
1.6.2 MYCOSES SYSTÉMIQUES 16
1.6.3 MYCOSES OPPORTUNISTES 16
2 LES CHAMPIGNONS FILAMENTEUX 17
2.1 LES DERMATOPHYTES 17
2.1.1 GÉNÉRALITÉS 17
2.1.2 LES GENRES 17
2.1.2.1 TRICHOPHYTON 17
2.1.2.2 MICROSPORUM 17
2.1.2.3 EPIDERMOPHYTON 17
2.1.3 IDENTIFICATION 18
2.1.3.1 ASPECTS MORPHOLOGIQUES 18
2.1.3.1.1 MORPHOLOGIE DES CONIDIES 18
2.1.3.1.2 MORPHOLOGIE DES MYCÉLIUMS 19
2.1.4 ORIGINE 19
2.1.5 CARACTÉRISATION DES SOUCHES MANIPULÉES AU LABORATOIRE 19
3 AUTRES CHAMPIGNONS FILAMENTEUX 24
3.1 ORGANE DE CARACTÉRISATION 24
3.2 CARACTÉRISATION DES SOUCHES 24
4 LE MALDI TOF 30
4.1 GÉNÉRALITÉ 30
4.2 LA SPECTROMETRIE DE MASSE 30
4.3 PRINCIPE DU MALDI-TOF 31
4.3.1 MATRICE 33
4.3.2 ANALYSE DES DONNÉES 33
4.4 LES BIBLIOTHÈQUES 33
4.4.1 IVD 33
4.4.2 RUO 34
4.5 VALIDATION TECHNIQUE 34
PARTIE PRATIQUE 35
1 OBJECTIF 35
2 MATÉRIEL ET RÉACTIFS 35
2.1 MATÉRIEL 35
2.2 RÉACTIFS 36
2.3 ÉCHANTILLONS 36
3 ENSEMENCEMENT ET CULTURE DE DERMATOPHYTES 36
3.1 CULTURE 36
4 IDENTIFICATION PAR SPECTROSCOPIE DE MASSE 38
4.1 MODE OPÉRATOIRE 38
4.2 EXTRACTION 39
4.3 CROISSANCE : 40
5 RÉSULTATS ET DISCUSSION 41
5.1 IDENTIFICATION 41
5.2 CULTURE 44
5.3 EXTRACTION 46
5.4 CROISSANCE 47
5.5 LA RÉPÉTABILITÉ 49
5.6 REPRODUCTIBILITÉ ET FIABILITÉ 51
CONCLUSION 54
LISTE DES ABRÉVIATIONS 56
LISTE DES FIGURES ET DES TABLEAUX 57
LEXIQUE 58
BIBLIOGRAPHIE 62
TABLE DES ANNEXES 68
ANNEXES 69Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=100297 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire
Titre : Validation du temps de conservation des germes pour le monitoring des fluides. Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Nanouchka Sioli, Auteur ; Martine Bierman, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2019 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale GSK Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Ce travail d’étude aborde le monitoring des fluides qui permet d’évaluer la charge microbiologique des échantillons d’eau via la technique de filtration réalisée à l’aide de l’appareil Milliflex Plus. Actuellement, la pharmacopée autorise une conservation des échantillons d’eau à tester
dans un contenant stérile pendant 2h à température ambiante et 24h entre 2 et 8°C. Vu la grandeur du site pharmaceutique, le délai endéans les 24h n’est pas toujours réalisable. C’est pourquoi, un liquide de conservation a été mis en place afin de favoriser la conservation de la viabilité des germes présents dans l’eau au-delà de 24H à 2-8°C. Deux études ont été réalisés, l’étude de stabilité de la charge microbienne des échantillons
d’eau pour le monitoring des fluides et l’étude de viabilité sur une sélection de microorganismes. Ces études ont pour objectif d’évaluer les conditions optimales de stockage à différents temps de conservation allant jusqu’à 72h aussi bien à température ambiante qu’à
2-8°C.
Les résultats générés ont montré que le flacon avec conservateur permet jusqu’à 72h une bonne conservation des différents microorganismes testés, dans les deux conditions de température. Seul le microorganisme Pseudomonas aeruginosa montre une sensibilité après stockage de 24H à 2-8°C.
Toutefois, trois types de comportement ont été mis en évidence lors de l’étude de la stabilité de la charge microbienne des échantillons d’eau testés en routine. La majorité(95%) des microorganismes restent stables au cours du temps aussi bien à température ambiante qu’à 2-8°C. Une minorité de microorganismes augmente considérablement au cours de temps mais sans impact car le seul risque est une surestimation de la charge
microbienne. Et enfin, une autre minorité diminue significativement et présente donc un impact l’estimation de la charge microbienne.
Une étude plus approfondie devra être menée afin d’optimiser le dernier comportement.Note de contenu : Table des matières
Lieu de stage .............................................................................................................................. 6
Introduction générale ................................................................................................................ 8
Partie théorique ....................................................................................................................... 10
1. Types d’eaux produits et utilisés chez GSK, distribution et contrôle qualité ............... 10
1.1 Eau de ville – city water (CIW) .................................................................................... 10
1.2 Eau purifiée - purified water (PW) .............................................................................. 11
1.3 Eau ultrafiltrée – low endotoxin purified water (LPW) .............................................. 12
1.4 Eau pour injection – water for injection (WFI) ........................................................... 12
1.5 Les boucles d’eau ....................................................................................................... 12
1.6 Tests et fréquences (contrôle qualité) ....................................................................... 13
2. Types de microorganismes dans les eaux .................................................................... 14
2.1 Les biofilms ................................................................................................................. 14
2.2.1 Bactéries formant des biofilms dans les systèmes d’eau ........................................ 17
2.2.2 Bactéries ne formant pas de biofilms dans les systèmes d’eau .............................. 17
2.2 Les endotoxines .......................................................................................................... 18
2.3 Sources de contamination .......................................................................................... 19
2.3.1 Contamination exogène .......................................................................................... 19
2.3.2 Contamination endogène ........................................................................................ 20
3. Surveillance régulière de la charge microbiologique. .................................................. 21
4. Prélèvement des eaux. ................................................................................................. 23
5. Filtration des eaux. ....................................................................................................... 24
5.1 Généralités sur le Milliflex Plus .................................................................................. 24
5.3 Mécanisme du Milliflex Plus ....................................................................................... 27
5.4 Types de milieux gélosés ............................................................................................ 28
5.5 Contrôles .................................................................................................................... 29
5.6 Maintenance .............................................................................................................. 30
6. Normes pour la numération des colonies .................................................................... 31
Partie pratique ......................................................................................................................... 32
7. Objectif et stratégie ...................................................................................................... 32
8. Matériels, milieux et équipements ............................................................................... 32
9. Méthode ....................................................................................................................... 33
9.1 Test de viabilité .......................................................................................................... 33
9.1.1 Préparation des suspensions microbiennes ....................................................... 33
9.1.2 Préparation des échantillons .............................................................................. 33
9.1.3 Test de filtration avec l’équipement Milliflex ..................................................... 34
9.1.4 Incubation et lectures ......................................................................................... 34
9.1.5 Stockage des échantillons .................................................................................. 34
9.2 Test de stabilité de la charge microbiologique des échantillons testés en
routine ......................................................................................................................... 36
9.2.1 Stockage des échantillons à tester ..................................................................... 36
9.2.2 Test de filtration avec l’équipement Milliflex ..................................................... 36
9.2.3 Incubation et lectures ......................................................................................... 36
10. Résultats et interprétations ................................................................................. 37
10.1 Résultat du test de viabilité ................................................................................. 37
10.2 Interprétations des résultats du test de viabilité ................................................ 41
10.3 Interprétations des résultats du test de stabilité de la charge microbiologique
des échantillons testés en routine .............................................................................. 41
Conclusion générale et perspectives ................................................................................... 46
Glossaire .............................................................................................................................. 48
Liste des abréviations .......................................................................................................... 49
Liste des figures ................................................................................................................... 50
Liste des tableaux ................................................................................................................ 51
Bibliographie ....................................................................................................................... 52
Annexe : résultats du test de stabilité de la charge microbienne dans les échantillons
testés en routine. .................................................................................................................. 1
1. Résultats de la première série d’échantillons ....................................................... 1
2. Résultats de la deuxième série d’échantillons ...................................................... 3
3. Résultats de la troisième série d’échantillons ....................................................... 7
4. Résultats de la quatrième série d’échantillons ................................................... 10
5. Résultats de la cinquième série d’échantillons ................................................... 13Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=80001 Validation du temps de conservation des germes pour le monitoring des fluides. [TFE / Mémoire] / Nanouchka Sioli, Auteur ; Martine Bierman, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2019.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale GSK Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Ce travail d’étude aborde le monitoring des fluides qui permet d’évaluer la charge microbiologique des échantillons d’eau via la technique de filtration réalisée à l’aide de l’appareil Milliflex Plus. Actuellement, la pharmacopée autorise une conservation des échantillons d’eau à tester
dans un contenant stérile pendant 2h à température ambiante et 24h entre 2 et 8°C. Vu la grandeur du site pharmaceutique, le délai endéans les 24h n’est pas toujours réalisable. C’est pourquoi, un liquide de conservation a été mis en place afin de favoriser la conservation de la viabilité des germes présents dans l’eau au-delà de 24H à 2-8°C. Deux études ont été réalisés, l’étude de stabilité de la charge microbienne des échantillons
d’eau pour le monitoring des fluides et l’étude de viabilité sur une sélection de microorganismes. Ces études ont pour objectif d’évaluer les conditions optimales de stockage à différents temps de conservation allant jusqu’à 72h aussi bien à température ambiante qu’à
2-8°C.
Les résultats générés ont montré que le flacon avec conservateur permet jusqu’à 72h une bonne conservation des différents microorganismes testés, dans les deux conditions de température. Seul le microorganisme Pseudomonas aeruginosa montre une sensibilité après stockage de 24H à 2-8°C.
Toutefois, trois types de comportement ont été mis en évidence lors de l’étude de la stabilité de la charge microbienne des échantillons d’eau testés en routine. La majorité(95%) des microorganismes restent stables au cours du temps aussi bien à température ambiante qu’à 2-8°C. Une minorité de microorganismes augmente considérablement au cours de temps mais sans impact car le seul risque est une surestimation de la charge
microbienne. Et enfin, une autre minorité diminue significativement et présente donc un impact l’estimation de la charge microbienne.
Une étude plus approfondie devra être menée afin d’optimiser le dernier comportement.Note de contenu : Table des matières
Lieu de stage .............................................................................................................................. 6
Introduction générale ................................................................................................................ 8
Partie théorique ....................................................................................................................... 10
1. Types d’eaux produits et utilisés chez GSK, distribution et contrôle qualité ............... 10
1.1 Eau de ville – city water (CIW) .................................................................................... 10
1.2 Eau purifiée - purified water (PW) .............................................................................. 11
1.3 Eau ultrafiltrée – low endotoxin purified water (LPW) .............................................. 12
1.4 Eau pour injection – water for injection (WFI) ........................................................... 12
1.5 Les boucles d’eau ....................................................................................................... 12
1.6 Tests et fréquences (contrôle qualité) ....................................................................... 13
2. Types de microorganismes dans les eaux .................................................................... 14
2.1 Les biofilms ................................................................................................................. 14
2.2.1 Bactéries formant des biofilms dans les systèmes d’eau ........................................ 17
2.2.2 Bactéries ne formant pas de biofilms dans les systèmes d’eau .............................. 17
2.2 Les endotoxines .......................................................................................................... 18
2.3 Sources de contamination .......................................................................................... 19
2.3.1 Contamination exogène .......................................................................................... 19
2.3.2 Contamination endogène ........................................................................................ 20
3. Surveillance régulière de la charge microbiologique. .................................................. 21
4. Prélèvement des eaux. ................................................................................................. 23
5. Filtration des eaux. ....................................................................................................... 24
5.1 Généralités sur le Milliflex Plus .................................................................................. 24
5.3 Mécanisme du Milliflex Plus ....................................................................................... 27
5.4 Types de milieux gélosés ............................................................................................ 28
5.5 Contrôles .................................................................................................................... 29
5.6 Maintenance .............................................................................................................. 30
6. Normes pour la numération des colonies .................................................................... 31
Partie pratique ......................................................................................................................... 32
7. Objectif et stratégie ...................................................................................................... 32
8. Matériels, milieux et équipements ............................................................................... 32
9. Méthode ....................................................................................................................... 33
9.1 Test de viabilité .......................................................................................................... 33
9.1.1 Préparation des suspensions microbiennes ....................................................... 33
9.1.2 Préparation des échantillons .............................................................................. 33
9.1.3 Test de filtration avec l’équipement Milliflex ..................................................... 34
9.1.4 Incubation et lectures ......................................................................................... 34
9.1.5 Stockage des échantillons .................................................................................. 34
9.2 Test de stabilité de la charge microbiologique des échantillons testés en
routine ......................................................................................................................... 36
9.2.1 Stockage des échantillons à tester ..................................................................... 36
9.2.2 Test de filtration avec l’équipement Milliflex ..................................................... 36
9.2.3 Incubation et lectures ......................................................................................... 36
10. Résultats et interprétations ................................................................................. 37
10.1 Résultat du test de viabilité ................................................................................. 37
10.2 Interprétations des résultats du test de viabilité ................................................ 41
10.3 Interprétations des résultats du test de stabilité de la charge microbiologique
des échantillons testés en routine .............................................................................. 41
Conclusion générale et perspectives ................................................................................... 46
Glossaire .............................................................................................................................. 48
Liste des abréviations .......................................................................................................... 49
Liste des figures ................................................................................................................... 50
Liste des tableaux ................................................................................................................ 51
Bibliographie ....................................................................................................................... 52
Annexe : résultats du test de stabilité de la charge microbienne dans les échantillons
testés en routine. .................................................................................................................. 1
1. Résultats de la première série d’échantillons ....................................................... 1
2. Résultats de la deuxième série d’échantillons ...................................................... 3
3. Résultats de la troisième série d’échantillons ....................................................... 7
4. Résultats de la quatrième série d’échantillons ................................................... 10
5. Résultats de la cinquième série d’échantillons ................................................... 13Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=80001 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire
Titre : Validation du test à la mépacrine sur FACS lyric Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Vincent Cauchie, Auteur ; François Mullier, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2020 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : L’analyse scientifique a de plus en plus souvent besoin de tests rapides et fiables pour diagnostiquer des patients tout en évitant un coût financier trop important. L’analyse cytométrique couplée à la fluorescence permet de réunir ces avantages, malgré le coût élevé des réactifs.
Ce travail traitera du test à la mépacrine sur un cytomètre en flux, le FACS Lyric. Il y sera abordé divers points essentiels, en commençant par la présentation générale de l’automate, de ses fonctions et applications, mais également une étude approfondie du test à la mépacrine.
Une partie théorique viendra compléter l’application pratique de notre analyse : principes de validation d’une méthode et des différents paramètres explorés, répétabilité et établissement des valeurs de référence. Ce travail permettra de suivre l’évolution de la démarche scientifique mise en place pour valider le protocole préétabli du test à la mépacrine, et de le rendre réalisable à plus grande échelle.Note de contenu : Table des matières
1. Présentation du lieu de stage ........................................................................................................ 8
Introduction générale ........................................................................................................................ 9
2. Partie théorique ........................................................................................................................... 11
Chapitre 1 : Le FACS Lyric ............................................................................................................ 11
1.1. La cytométrie en flux ........................................................................................................ 11
1.2. La fluorescence ................................................................................................................. 13
1.2.1. Les colorants fluorescents ........................................................................................ 13
1.2.2. L’immunofluorescence ............................................................................................. 13
1.3. Présentation du cytomètre en flux « FACS Lyric » ........................................................... 15
Chapitre 2 : Test à la mépacrine .................................................................................................. 16
2.1. L’hémostase primaire et le rôle des plaquettes ............................................................... 16
2.1.1. Les 3 phases de l’hémostase .................................................................................... 16
2.1.2. Origine des plaquettes sanguines ............................................................................ 16
2.1.3. L’hémostase primaire ............................................................................................... 18
2.2. Les thrombopathies constitutionnelles ............................................................................ 18
2.2.1. Pathologies des récepteurs des agonistes solubles ................................................. 19
2.2.2. Altérations des voies de signalisation plaquettaire ................................................. 19
2.2.3. Pathologies sécrétoires ............................................................................................ 20
2.2.4. Pathologies des récepteurs glycoprotéiques des protéines adhésives .................... 20
2.2.5. Anomalies des phospholipides membranaires plaquettaires .................................. 21
2.3. Les anomalies de sécrétion et leur exploration ............................................................... 21
2.3.1. Granules denses ....................................................................................................... 22
2.3.1.1. Formation des granules denses .......................................................................... 22
2.3.1.2. Défaut des granules denses ................................................................................ 23
2.4. La mépacrine et principes généraux du test .................................................................... 24
2.4.1. Le test à la mépacrine .............................................................................................. 24
2.4.1.1. Pré-analytique .................................................................................................... 24
2.4.1.2. Analytique........................................................................................................... 25
2.4.1.3. Remarques .......................................................................................................... 26
2.4.2. Etablissement de valeurs de référence sur automate .............................................. 27
2.4.3. Validation d’un test et modification de paramètres ................................................ 28
2.4.4. Répétabilité .............................................................................................................. 28
7
3. Partie pratique ............................................................................................................................. 29
Chapitre 1 : Test à la mépacrine .................................................................................................. 29
Chapitre 2 : Validation du test à la mépacrine ............................................................................ 30
2.1. Activation au TRAP : avant et après addition de mépacrine ............................................ 31
2.2. Réévaluation des différentes concentrations en mépacrine (Lyric 1) ............................. 32
2.3. Stabilité de l’attente devant le cytomètre ....................................................................... 34
2.4. Stabilité échantillon sur 2 jours : H0, H1, H2, H4, H6, H24 .............................................. 35
2.5. Etude de la stabilité de la mépacrine en fonction du temps (Lyric 1) .............................. 35
2.5.1. Stabilité de la solution stock sur 1 mois ................................................................... 36
2.5.2. Stabilité de la solution mère sur 5 jours ................................................................... 37
2.5.3. Stabilité de la solution fille sur 5 jours ..................................................................... 37
2.6. Répétabilité et reproductibilité ........................................................................................ 39
2.7. Calcul du biais entre les 2 cytomètres .............................................................................. 40
Chapitre 3 : Etablissement des valeurs de référence .................................................................. 42
4. Conclusion générale et perspectives ........................................................................................... 44
5. Glossaire ...................................................................................................................................... 45
6. Bibliographie ................................................................................................................................ 47
7. Annexes ....................................................................................................................................... 50Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=89149 Validation du test à la mépacrine sur FACS lyric [TFE / Mémoire] / Vincent Cauchie, Auteur ; François Mullier, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2020.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : L’analyse scientifique a de plus en plus souvent besoin de tests rapides et fiables pour diagnostiquer des patients tout en évitant un coût financier trop important. L’analyse cytométrique couplée à la fluorescence permet de réunir ces avantages, malgré le coût élevé des réactifs.
Ce travail traitera du test à la mépacrine sur un cytomètre en flux, le FACS Lyric. Il y sera abordé divers points essentiels, en commençant par la présentation générale de l’automate, de ses fonctions et applications, mais également une étude approfondie du test à la mépacrine.
Une partie théorique viendra compléter l’application pratique de notre analyse : principes de validation d’une méthode et des différents paramètres explorés, répétabilité et établissement des valeurs de référence. Ce travail permettra de suivre l’évolution de la démarche scientifique mise en place pour valider le protocole préétabli du test à la mépacrine, et de le rendre réalisable à plus grande échelle.Note de contenu : Table des matières
1. Présentation du lieu de stage ........................................................................................................ 8
Introduction générale ........................................................................................................................ 9
2. Partie théorique ........................................................................................................................... 11
Chapitre 1 : Le FACS Lyric ............................................................................................................ 11
1.1. La cytométrie en flux ........................................................................................................ 11
1.2. La fluorescence ................................................................................................................. 13
1.2.1. Les colorants fluorescents ........................................................................................ 13
1.2.2. L’immunofluorescence ............................................................................................. 13
1.3. Présentation du cytomètre en flux « FACS Lyric » ........................................................... 15
Chapitre 2 : Test à la mépacrine .................................................................................................. 16
2.1. L’hémostase primaire et le rôle des plaquettes ............................................................... 16
2.1.1. Les 3 phases de l’hémostase .................................................................................... 16
2.1.2. Origine des plaquettes sanguines ............................................................................ 16
2.1.3. L’hémostase primaire ............................................................................................... 18
2.2. Les thrombopathies constitutionnelles ............................................................................ 18
2.2.1. Pathologies des récepteurs des agonistes solubles ................................................. 19
2.2.2. Altérations des voies de signalisation plaquettaire ................................................. 19
2.2.3. Pathologies sécrétoires ............................................................................................ 20
2.2.4. Pathologies des récepteurs glycoprotéiques des protéines adhésives .................... 20
2.2.5. Anomalies des phospholipides membranaires plaquettaires .................................. 21
2.3. Les anomalies de sécrétion et leur exploration ............................................................... 21
2.3.1. Granules denses ....................................................................................................... 22
2.3.1.1. Formation des granules denses .......................................................................... 22
2.3.1.2. Défaut des granules denses ................................................................................ 23
2.4. La mépacrine et principes généraux du test .................................................................... 24
2.4.1. Le test à la mépacrine .............................................................................................. 24
2.4.1.1. Pré-analytique .................................................................................................... 24
2.4.1.2. Analytique........................................................................................................... 25
2.4.1.3. Remarques .......................................................................................................... 26
2.4.2. Etablissement de valeurs de référence sur automate .............................................. 27
2.4.3. Validation d’un test et modification de paramètres ................................................ 28
2.4.4. Répétabilité .............................................................................................................. 28
7
3. Partie pratique ............................................................................................................................. 29
Chapitre 1 : Test à la mépacrine .................................................................................................. 29
Chapitre 2 : Validation du test à la mépacrine ............................................................................ 30
2.1. Activation au TRAP : avant et après addition de mépacrine ............................................ 31
2.2. Réévaluation des différentes concentrations en mépacrine (Lyric 1) ............................. 32
2.3. Stabilité de l’attente devant le cytomètre ....................................................................... 34
2.4. Stabilité échantillon sur 2 jours : H0, H1, H2, H4, H6, H24 .............................................. 35
2.5. Etude de la stabilité de la mépacrine en fonction du temps (Lyric 1) .............................. 35
2.5.1. Stabilité de la solution stock sur 1 mois ................................................................... 36
2.5.2. Stabilité de la solution mère sur 5 jours ................................................................... 37
2.5.3. Stabilité de la solution fille sur 5 jours ..................................................................... 37
2.6. Répétabilité et reproductibilité ........................................................................................ 39
2.7. Calcul du biais entre les 2 cytomètres .............................................................................. 40
Chapitre 3 : Etablissement des valeurs de référence .................................................................. 42
4. Conclusion générale et perspectives ........................................................................................... 44
5. Glossaire ...................................................................................................................................... 45
6. Bibliographie ................................................................................................................................ 47
7. Annexes ....................................................................................................................................... 50Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=89149 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire
Titre : Vérification de méthode pour l’analyse des liquides de ponction sur l’IQ200 Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Antoine Verriez, Auteur ; Caroline Charlier, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2019 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Centre hospitalier de Valenciennes Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : L’organisme humain est composé de cavités contenant un liquide nécessaire au bon fonctionnement de ce dernier. La sécrétion importante de liquide nécessite des investigations biologiques car cette dernière peut être d’origine infectieuse et ou inflammatoire. Pour ce faire, le clinicien réalise des prélèvements afin que ceux-ci soient exploités. Ces liquides de ponction proviennent de l’abdomen, la plèvre, le péricarde et des articulations. Leur analyse est incontournable puisqu’elle oriente les hypothèses diagnostiques du clinicien, et permet la mise en oeuvre d’un traitement éventuel. Cette analyse repose sur le décompte des leucocytes et des hématies. Actuellement, au Centre Hospitalier de Valenciennes, cet examen est réalisé manuellement.
L’objectif du stage consiste à développer la numération de liquides de ponction à l’aide d’un automate, l’IQ200, par la construction d’un dossier de vérification. Ainsi, l’évaluation des performances consiste en l’étude de la répétabilité, la fidélité intermédiaire (ou reproductibilité), la variabilité inter-opérateurs, la comparaison de méthodes, l’étendue de mesure, la contamination et l’intervalle de références.
En pratique, 132 liquides ont été analysés à la fois manuellement (décompte sur KOVA slide) et sur l’automate. Seuls 131 liquides ont été comparés dont 95 ascites, 31 pleuraux, 2 articulaires, 1 péricardique ainsi que 2 liquides de dialyse péritonéale. 119 d’entre eux possèdent des résultats concordants entre la numération automatique et la numération manuelle, soit 90,8% de corrélation.
La majorité des résultats montre les mêmes significations cliniques en méthode manuelle et automatique. De plus, nous avons pu déterminer la précision de la méthode par la mesure de la répétabilité, la reproductibilité de la méthode, le seuil de détection et de quantification ainsi qu’une étude sur la contamination inter-échantillons. Cependant, la variabilité inter-opérateurs n’a pas pu être étudiée. Alors que la cytologie automatisée des liquides pleuraux et d’ascites pourra très prochainement être mise en place, une prolongation d’étude est à envisager pour les liquides péricardiques, articulaires et les liquides de dialyse péritonéale.Note de contenu : Table des matières
1 Présentation de l’établissement ......................................................................................... 8
1.1 Généralités ................................................................................................................... 8
1.2 Politique de l’établissement ........................................................................................ 8
1.3 Présentation du laboratoire ........................................................................................ 9
1.3.1 Secteur ICAAR ....................................................................................................... 9
1.3.2 Hématologie et hémostase ................................................................................ 10
1.3.3 Immuno-sérologie .............................................................................................. 10
1.3.4 Microbiologie ..................................................................................................... 11
1.4 La certification et l’accréditation ............................................................................... 11
Introduction .............................................................................................................................. 12
2 Contexte théorique ........................................................................................................... 13
2.1 Liquide d’ascite .......................................................................................................... 13
2.1.1 Définition ............................................................................................................ 13
2.1.2 Etiologie .............................................................................................................. 13
2.1.3 Biochimie ............................................................................................................ 14
2.1.4 Cytologie ............................................................................................................. 14
2.1.5 Arbre décisionnel ............................................................................................... 16
2.2 Liquide pleural ........................................................................................................... 17
2.2.1 Définition ............................................................................................................ 17
2.2.2 Etiologie .............................................................................................................. 17
2.2.3 Biochimie ............................................................................................................ 18
2.2.4 Cytologie ............................................................................................................. 19
2.2.5 Arbre décisionnel ............................................................................................... 20
2.3 Liquide articulaire ...................................................................................................... 21
2.3.1 Définition ............................................................................................................ 21
2.3.2 Etiologie .............................................................................................................. 22
2.3.3 Biochimie ............................................................................................................ 22
2.3.4 Cytologie ............................................................................................................. 22
2.3.5 Arbre décisionnel ............................................................................................... 23
2.4 Liquide péricardique .................................................................................................. 24
2.4.1 Définition ............................................................................................................ 24
2.4.2 Etiologie .............................................................................................................. 25
2.4.3 Biochimie ............................................................................................................ 26
2.4.4 Cytologie ............................................................................................................. 26
2.5 IQ 200 ......................................................................................................................... 26
2.5.1 Principe ............................................................................................................... 26
2.5.2 Consommables ................................................................................................... 28
2.5.3 Contrôles internes de qualité ............................................................................. 29
2.5.4 Liquides analysables sur IQ200 .......................................................................... 31
3 Objectifs et stratégie ......................................................................................................... 32
4 Matériel et méthodes ....................................................................................................... 32
4.1 Echantillons étudiés ................................................................................................... 32
4.2 Méthodes ................................................................................................................... 33
4.2.1 Mode opératoire pour le passage des CIQ ......................................................... 33
4.2.2 Mode opératoire pour le passage des échantillons patients............................. 33
4.2.3 Mode opératoire pour le décompte sur cellule KOVA® ..................................... 34
4.2.4 Etude de la linéarité ........................................................................................... 34
4.2.5 Vérification du bruit de fond .............................................................................. 35
5 Résultats et discussion ...................................................................................................... 35
5.1 Etendue des valeurs................................................................................................... 35
5.2 Etude de la répétabilité ............................................................................................. 36
5.3 Etude de la fidélité intermédiaire .............................................................................. 37
5.4 Etude de la variabilité inter-opérateurs .................................................................... 38
5.5 Comparaison de méthodes........................................................................................ 38
5.5.1 Liquide d’ascite ................................................................................................... 39
5.5.2 Liquides pleuraux ............................................................................................... 41
5.5.3 Autres liquides .................................................................................................... 41
5.5.4 Résultats globaux de la comparaison de méthodes .......................................... 42
5.6 Etendue de mesure.................................................................................................... 43
5.6.1 Limite de détection ............................................................................................ 43
5.6.2 Limite de quantification ..................................................................................... 43
5.6.3 Linéarité .............................................................................................................. 43
5.6.4 Conclusion de l’étude ......................................................................................... 45
5.7 Etude de la contamination inter-échantillons ........................................................... 45
5.8 Intervalles de référence et valeurs de décision clinique ........................................... 47
5.9 Mise en pratique ........................................................................................................ 47
Conclusion et perspectives ....................................................................................................... 48
Liste des figures ........................................................................................................................ 49
Liste des abréviations ............................................................................................................... 50
Bibliographie ............................................................................................................................ 51
Table des annexes .................................................................................................................... 53Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=80005 Vérification de méthode pour l’analyse des liquides de ponction sur l’IQ200 [TFE / Mémoire] / Antoine Verriez, Auteur ; Caroline Charlier, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2019.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale Centre hospitalier de Valenciennes Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : L’organisme humain est composé de cavités contenant un liquide nécessaire au bon fonctionnement de ce dernier. La sécrétion importante de liquide nécessite des investigations biologiques car cette dernière peut être d’origine infectieuse et ou inflammatoire. Pour ce faire, le clinicien réalise des prélèvements afin que ceux-ci soient exploités. Ces liquides de ponction proviennent de l’abdomen, la plèvre, le péricarde et des articulations. Leur analyse est incontournable puisqu’elle oriente les hypothèses diagnostiques du clinicien, et permet la mise en oeuvre d’un traitement éventuel. Cette analyse repose sur le décompte des leucocytes et des hématies. Actuellement, au Centre Hospitalier de Valenciennes, cet examen est réalisé manuellement.
L’objectif du stage consiste à développer la numération de liquides de ponction à l’aide d’un automate, l’IQ200, par la construction d’un dossier de vérification. Ainsi, l’évaluation des performances consiste en l’étude de la répétabilité, la fidélité intermédiaire (ou reproductibilité), la variabilité inter-opérateurs, la comparaison de méthodes, l’étendue de mesure, la contamination et l’intervalle de références.
En pratique, 132 liquides ont été analysés à la fois manuellement (décompte sur KOVA slide) et sur l’automate. Seuls 131 liquides ont été comparés dont 95 ascites, 31 pleuraux, 2 articulaires, 1 péricardique ainsi que 2 liquides de dialyse péritonéale. 119 d’entre eux possèdent des résultats concordants entre la numération automatique et la numération manuelle, soit 90,8% de corrélation.
La majorité des résultats montre les mêmes significations cliniques en méthode manuelle et automatique. De plus, nous avons pu déterminer la précision de la méthode par la mesure de la répétabilité, la reproductibilité de la méthode, le seuil de détection et de quantification ainsi qu’une étude sur la contamination inter-échantillons. Cependant, la variabilité inter-opérateurs n’a pas pu être étudiée. Alors que la cytologie automatisée des liquides pleuraux et d’ascites pourra très prochainement être mise en place, une prolongation d’étude est à envisager pour les liquides péricardiques, articulaires et les liquides de dialyse péritonéale.Note de contenu : Table des matières
1 Présentation de l’établissement ......................................................................................... 8
1.1 Généralités ................................................................................................................... 8
1.2 Politique de l’établissement ........................................................................................ 8
1.3 Présentation du laboratoire ........................................................................................ 9
1.3.1 Secteur ICAAR ....................................................................................................... 9
1.3.2 Hématologie et hémostase ................................................................................ 10
1.3.3 Immuno-sérologie .............................................................................................. 10
1.3.4 Microbiologie ..................................................................................................... 11
1.4 La certification et l’accréditation ............................................................................... 11
Introduction .............................................................................................................................. 12
2 Contexte théorique ........................................................................................................... 13
2.1 Liquide d’ascite .......................................................................................................... 13
2.1.1 Définition ............................................................................................................ 13
2.1.2 Etiologie .............................................................................................................. 13
2.1.3 Biochimie ............................................................................................................ 14
2.1.4 Cytologie ............................................................................................................. 14
2.1.5 Arbre décisionnel ............................................................................................... 16
2.2 Liquide pleural ........................................................................................................... 17
2.2.1 Définition ............................................................................................................ 17
2.2.2 Etiologie .............................................................................................................. 17
2.2.3 Biochimie ............................................................................................................ 18
2.2.4 Cytologie ............................................................................................................. 19
2.2.5 Arbre décisionnel ............................................................................................... 20
2.3 Liquide articulaire ...................................................................................................... 21
2.3.1 Définition ............................................................................................................ 21
2.3.2 Etiologie .............................................................................................................. 22
2.3.3 Biochimie ............................................................................................................ 22
2.3.4 Cytologie ............................................................................................................. 22
2.3.5 Arbre décisionnel ............................................................................................... 23
2.4 Liquide péricardique .................................................................................................. 24
2.4.1 Définition ............................................................................................................ 24
2.4.2 Etiologie .............................................................................................................. 25
2.4.3 Biochimie ............................................................................................................ 26
2.4.4 Cytologie ............................................................................................................. 26
2.5 IQ 200 ......................................................................................................................... 26
2.5.1 Principe ............................................................................................................... 26
2.5.2 Consommables ................................................................................................... 28
2.5.3 Contrôles internes de qualité ............................................................................. 29
2.5.4 Liquides analysables sur IQ200 .......................................................................... 31
3 Objectifs et stratégie ......................................................................................................... 32
4 Matériel et méthodes ....................................................................................................... 32
4.1 Echantillons étudiés ................................................................................................... 32
4.2 Méthodes ................................................................................................................... 33
4.2.1 Mode opératoire pour le passage des CIQ ......................................................... 33
4.2.2 Mode opératoire pour le passage des échantillons patients............................. 33
4.2.3 Mode opératoire pour le décompte sur cellule KOVA® ..................................... 34
4.2.4 Etude de la linéarité ........................................................................................... 34
4.2.5 Vérification du bruit de fond .............................................................................. 35
5 Résultats et discussion ...................................................................................................... 35
5.1 Etendue des valeurs................................................................................................... 35
5.2 Etude de la répétabilité ............................................................................................. 36
5.3 Etude de la fidélité intermédiaire .............................................................................. 37
5.4 Etude de la variabilité inter-opérateurs .................................................................... 38
5.5 Comparaison de méthodes........................................................................................ 38
5.5.1 Liquide d’ascite ................................................................................................... 39
5.5.2 Liquides pleuraux ............................................................................................... 41
5.5.3 Autres liquides .................................................................................................... 41
5.5.4 Résultats globaux de la comparaison de méthodes .......................................... 42
5.6 Etendue de mesure.................................................................................................... 43
5.6.1 Limite de détection ............................................................................................ 43
5.6.2 Limite de quantification ..................................................................................... 43
5.6.3 Linéarité .............................................................................................................. 43
5.6.4 Conclusion de l’étude ......................................................................................... 45
5.7 Etude de la contamination inter-échantillons ........................................................... 45
5.8 Intervalles de référence et valeurs de décision clinique ........................................... 47
5.9 Mise en pratique ........................................................................................................ 47
Conclusion et perspectives ....................................................................................................... 48
Liste des figures ........................................................................................................................ 49
Liste des abréviations ............................................................................................................... 50
Bibliographie ............................................................................................................................ 51
Table des annexes .................................................................................................................... 53Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=80005 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Vérification des performances analytiques de 2 kits commerciaux pour le dosage des vitamines A/E et du bêta-carotène par chromatographie liquide (HPLC-UV) / Cemile Develi
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