Centre de Documentation Campus Montignies
Horaires :
Lundi : 8h-18h30
Mardi : 8h-18h30
Mercredi 9h-16h30
Jeudi : 8h-18h30
Vendredi : 8h-16h30
Attention, votre centre de documentation sera fermé du 27/04 au 12/05 inclus.
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Détail de l'auteur
Auteur Véronique Yvette Miendje Deyi |
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Evaluation comparative de 6 kits commerciaux pour la détection de l’hémoglobine dans les selles / Marie Lavaert
Titre : Evaluation comparative de 6 kits commerciaux pour la détection de l’hémoglobine dans les selles Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Marie Lavaert, Auteur ; Alaeddine Meghraoui, Directeur de la recherche ; Véronique Yvette Miendje Deyi, Directeur de la recherche ; Luc Blockx, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2020 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Contexte : La présence du sang dans les selles est un indicateur de plusieurs pathologies gastro-intestinales, dont le cancer du côlon. Les tests qualitatifs immuno-chromatographiques sont souvent utilisés afin d’orienter le clinicien à faire des examens complémentaires et diagnostiquer de manière précoce ces pathologies.
But : Le but de cette étude est de comparer les performances de 6 kits commerciaux : Bionexia® FOBplus (BioMérieux), FOB-test® (Ultimed), Hemdetect® immo i-FOB (Diplomed), Proflow® FOB (Prolab Diagnostics), Bioline® SD FOB (Abott), Hemoccult® (Beckman Coulter). Cela permettra de remplacer au LHUB-ULB le kit Bionexia® FOBplus (BioMérieux) qui ne sera plus commercialisé.
Matériels/méthodes : Les échantillons sont prélevés dans la routine de manière aléatoire et testés à l’aide des 6 kits à comparer. Les échantillons présentant des disparités sont testés sur l’OC Sensor pour quantifier l’hémoglobine présent dans les selles. Le résultat final permet de comptabiliser les faux positifs, faux négatifs, vrai positifs et vrai négatifs et ainsi calculer les performances analytiques de chaque kit.
Résultats : L’étude a été effectuée sur 138 tests avec un pourcentage de positivité de 34.7%. Hemdetect® immo i-FOB, FOB-Test® et Proflow® FOB montrent les meilleures performances car leurs sensibilités et spécificités sont plus ou moins équilibrées. Un effet de saturation a également été prouvé pour le Proflow®FOB provoquant une diminution d’intensité de la bande test (T) à des fortes concentrations d’hémoglobine. Nous notons que les pathologies retrouvées chez les patients positifs sont pour 62.5% d’entre-elles liées à un problème gastro-intestinal dont seulement 1 patient présentant un cancer du côlon.
Conclusion : Le choix final du test à implémenter au laboratoire se porte sur FOB-Test®, puisqu’il présente les meilleures performances analytiques (sensibilité : 91.3%, spécificité : 95.65), une bonne spécificité en comparaison avec Hemdetect® et l’effet de saturation est détectable puisqu’il touche également la ligne contrôle (C).Note de contenu : Table des matières
1 Présentation du lieu de stage .................................................................................................................. 1
2 Introduction ............................................................................................................................................. 1
2.1 Contexte général.............................................................................................................................. 2
2.1.1 Types de saignements gastro-intestinaux ................................................................................. 2
2.1.2 Les pathologies liées à une présence du sang dans les selles ................................................... 3
2.1.2.1 Maladies hémorroïdaires : ................................................................................................. 3
2.1.2.2 Rectocolite hémorragique ou colite ulcéreuse : ................................................................ 3
2.1.2.3 Maladie de Crohn : ............................................................................................................. 3
2.1.2.4 Cancers colorectaux : ......................................................................................................... 4
2.1.2.4.1 Données anatomiques ................................................................................................... 4
2.1.2.4.2 Les types de cancer colorectal ....................................................................................... 5
2.1.2.4.3 Stade d’un cancer colorectal : ....................................................................................... 6
2.1.2.4.4 Quels sont les symptômes du cancer colorectal ?......................................................... 8
2.1.2.4.5 Quelles sont les personnes à risque ? ............................................................................ 8
2.1.2.4.6 Les tests de dépistage du cancer colorectal .................................................................. 9
2.1.2.4.7 Traitements .................................................................................................................. 12
2.1.3 Détection de l’hémoglobine dans les selles ............................................................................ 12
2.1.3.1 Principe de l’immuno-chromatographie .......................................................................... 13
2.2 But de l’étude ................................................................................................................................ 14
3 Matériels et méthodes .......................................................................................................................... 15
3.1 Echantillons .................................................................................................................................... 15
3.2 Les différents kits commerciaux utilisés ........................................................................................ 15
3.2.1 Bionexia FOBplus® ................................................................................................................... 16
3.2.2 Comparaison des différents kits commerciaux testés............................................................. 17
3.3 Détection quantitative de l’hémoglobine par l’OC Sensor ............................................................ 18
3.4 Définition de cas ............................................................................................................................ 19
3.5 Méthodes statistiques ................................................................................................................... 19
3.5.1 La sensibilité............................................................................................................................. 19
3.5.2 La spécificité............................................................................................................................. 20
3.5.3 La valeur prédictive positive (VPP) .......................................................................................... 20
3.5.4 La valeur prédictive négative (VPN) ........................................................................................ 20
3.5.5 Sexe ratio et âge médian ......................................................................................................... 20
3.5.6 Comparaison statistique .......................................................................................................... 21
3.6 Tableau de contingence ................................................................................................................. 21
4 Résultats et discussion ........................................................................................................................... 22
4.1 Données sur les prélèvements et les patients ............................................................................... 22
4.2 Performances analytiques des différents kits ............................................................................... 23
4.2.1 Comparaison et interprétation des performances analytiques des différents kits ................ 25
4.3 Analyse du tableau clinique des patients positifs ......................................................................... 27
4.4 Effet de saturation ......................................................................................................................... 29
4.5 Effet de l’homogénéisation ........................................................................................................... 31
4.6 Facilité d’exécution et problèmes pratiques ................................................................................. 32
5 Conclusion .............................................................................................................................................. 33
6 Références ............................................................................................................................................. 35
7 Annexes .................................................................................................................................................. 39
Abstract .......................................................................................................................................................... 44Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=89141 Evaluation comparative de 6 kits commerciaux pour la détection de l’hémoglobine dans les selles [TFE / Mémoire] / Marie Lavaert, Auteur ; Alaeddine Meghraoui, Directeur de la recherche ; Véronique Yvette Miendje Deyi, Directeur de la recherche ; Luc Blockx, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2020.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Contexte : La présence du sang dans les selles est un indicateur de plusieurs pathologies gastro-intestinales, dont le cancer du côlon. Les tests qualitatifs immuno-chromatographiques sont souvent utilisés afin d’orienter le clinicien à faire des examens complémentaires et diagnostiquer de manière précoce ces pathologies.
But : Le but de cette étude est de comparer les performances de 6 kits commerciaux : Bionexia® FOBplus (BioMérieux), FOB-test® (Ultimed), Hemdetect® immo i-FOB (Diplomed), Proflow® FOB (Prolab Diagnostics), Bioline® SD FOB (Abott), Hemoccult® (Beckman Coulter). Cela permettra de remplacer au LHUB-ULB le kit Bionexia® FOBplus (BioMérieux) qui ne sera plus commercialisé.
Matériels/méthodes : Les échantillons sont prélevés dans la routine de manière aléatoire et testés à l’aide des 6 kits à comparer. Les échantillons présentant des disparités sont testés sur l’OC Sensor pour quantifier l’hémoglobine présent dans les selles. Le résultat final permet de comptabiliser les faux positifs, faux négatifs, vrai positifs et vrai négatifs et ainsi calculer les performances analytiques de chaque kit.
Résultats : L’étude a été effectuée sur 138 tests avec un pourcentage de positivité de 34.7%. Hemdetect® immo i-FOB, FOB-Test® et Proflow® FOB montrent les meilleures performances car leurs sensibilités et spécificités sont plus ou moins équilibrées. Un effet de saturation a également été prouvé pour le Proflow®FOB provoquant une diminution d’intensité de la bande test (T) à des fortes concentrations d’hémoglobine. Nous notons que les pathologies retrouvées chez les patients positifs sont pour 62.5% d’entre-elles liées à un problème gastro-intestinal dont seulement 1 patient présentant un cancer du côlon.
Conclusion : Le choix final du test à implémenter au laboratoire se porte sur FOB-Test®, puisqu’il présente les meilleures performances analytiques (sensibilité : 91.3%, spécificité : 95.65), une bonne spécificité en comparaison avec Hemdetect® et l’effet de saturation est détectable puisqu’il touche également la ligne contrôle (C).Note de contenu : Table des matières
1 Présentation du lieu de stage .................................................................................................................. 1
2 Introduction ............................................................................................................................................. 1
2.1 Contexte général.............................................................................................................................. 2
2.1.1 Types de saignements gastro-intestinaux ................................................................................. 2
2.1.2 Les pathologies liées à une présence du sang dans les selles ................................................... 3
2.1.2.1 Maladies hémorroïdaires : ................................................................................................. 3
2.1.2.2 Rectocolite hémorragique ou colite ulcéreuse : ................................................................ 3
2.1.2.3 Maladie de Crohn : ............................................................................................................. 3
2.1.2.4 Cancers colorectaux : ......................................................................................................... 4
2.1.2.4.1 Données anatomiques ................................................................................................... 4
2.1.2.4.2 Les types de cancer colorectal ....................................................................................... 5
2.1.2.4.3 Stade d’un cancer colorectal : ....................................................................................... 6
2.1.2.4.4 Quels sont les symptômes du cancer colorectal ?......................................................... 8
2.1.2.4.5 Quelles sont les personnes à risque ? ............................................................................ 8
2.1.2.4.6 Les tests de dépistage du cancer colorectal .................................................................. 9
2.1.2.4.7 Traitements .................................................................................................................. 12
2.1.3 Détection de l’hémoglobine dans les selles ............................................................................ 12
2.1.3.1 Principe de l’immuno-chromatographie .......................................................................... 13
2.2 But de l’étude ................................................................................................................................ 14
3 Matériels et méthodes .......................................................................................................................... 15
3.1 Echantillons .................................................................................................................................... 15
3.2 Les différents kits commerciaux utilisés ........................................................................................ 15
3.2.1 Bionexia FOBplus® ................................................................................................................... 16
3.2.2 Comparaison des différents kits commerciaux testés............................................................. 17
3.3 Détection quantitative de l’hémoglobine par l’OC Sensor ............................................................ 18
3.4 Définition de cas ............................................................................................................................ 19
3.5 Méthodes statistiques ................................................................................................................... 19
3.5.1 La sensibilité............................................................................................................................. 19
3.5.2 La spécificité............................................................................................................................. 20
3.5.3 La valeur prédictive positive (VPP) .......................................................................................... 20
3.5.4 La valeur prédictive négative (VPN) ........................................................................................ 20
3.5.5 Sexe ratio et âge médian ......................................................................................................... 20
3.5.6 Comparaison statistique .......................................................................................................... 21
3.6 Tableau de contingence ................................................................................................................. 21
4 Résultats et discussion ........................................................................................................................... 22
4.1 Données sur les prélèvements et les patients ............................................................................... 22
4.2 Performances analytiques des différents kits ............................................................................... 23
4.2.1 Comparaison et interprétation des performances analytiques des différents kits ................ 25
4.3 Analyse du tableau clinique des patients positifs ......................................................................... 27
4.4 Effet de saturation ......................................................................................................................... 29
4.5 Effet de l’homogénéisation ........................................................................................................... 31
4.6 Facilité d’exécution et problèmes pratiques ................................................................................. 32
5 Conclusion .............................................................................................................................................. 33
6 Références ............................................................................................................................................. 35
7 Annexes .................................................................................................................................................. 39
Abstract .......................................................................................................................................................... 44Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=89141 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse (MALDI-TOF) / Gédéon Julio Tchuidjang Tchetnya
Titre : Identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse (MALDI-TOF) Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Gédéon Julio Tchuidjang Tchetnya ; Véronique Yvette Miendje Deyi, Promoteur du mémoire Editeur : Montignies-sur-Sambre : Haute Ecole Louvain en Hainaut Année de publication : 2023 Importance : 66p. Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur . Langues : Français (fre) Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Introduction
Les champignons filamenteux sont de plus en plus impliqués en pathologie humaine notamment chez les personnes immunodéprimées. Les méthodes d’identification conventionnelles sont fastidieuses et nécessitent une longue formation. Dans le contexte de centralisation des activités de mycologie du LHUB-ULB sur un seul centre d’activités, l’implémentation d’une méthode rapide et fiable serait la bienvenue.
But du travail
Le but de ce travail est de valider la technique MBT HT Filamentous fungi de Bruker pour l’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse (MALDI-TOF). En cas de résultats satisfaisants, l’objectif est d’implémenter cette méthode rapide en routine afin d’améliorer la prise en charge des patients et simplifier la tâche aux technologues du secteur de mycologie.
Matériels et méthodes
Les prélèvements cliniques issus des 5 hôpitaux partenaires du LHUB-ULB pour la recherche de moisissures, ainsi que les prélèvements issus des services de dermatologie de l’hôpital Erasme et du CHU Saint-Pierre pour recherche des dermatophytes seront traités en parallèle suivant les méthodes conventionnelles (culture, microscopie et macroscopie) et par spectrométrie de masse (MALDI-TOF). Le taux de concordance entre les 2 méthodes sera calculé. Les souches présentant les résultats discordants seront identifiées par séquençage afin de pouvoir départager les 2 méthodes.
Résultats et discussion
Au terme de ce travail, 100 souches de champignons filamenteux ont été identifiées par MALDI-TOF et par les méthodes conventionnelles avec une concordance de 94% entre ces 2 méthodes. Les scores obtenus par spectrométrie de masse étaient particulièrement bons. Les 6 souches discordantes n’ont donné aucune identification par MALDI-TOF. L’analyse par séquençage, concluante pour 4 souches, a confirmé que les cas d’échecs d’identification par MALDI-TOF étaient attribués à l’absence des souches concernées dans la base de données. Aucune concordance n’a été observée entre la biologie moléculaire et la méthode de routine pour les 4 cas souches. Par conséquent, le MALDI-TOF est une excellente méthode pour l’identification des champignons filamenteux pour autant que la souche à identifier soit présente dans la base de données.
Conclusion et perspectives
Au terme de ce travail, la technique MBT HT Filamentous fungi de Bruker pour l’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse a été validée néanmoins, il faudra progressivement enrichir la base de données du spectromètre de masse du LHUB-ULB. L’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse sera intégrée dans la routine du laboratoire de Mycologie du LHUB-ULB, ce qui permettra une simplification de la tâche des technologues et surtout une réponse plus rapide et par conséquent une amélioration de la prise en charge des patients.Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=114743 Identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse (MALDI-TOF) [TFE / Mémoire] / Gédéon Julio Tchuidjang Tchetnya ; Véronique Yvette Miendje Deyi, Promoteur du mémoire . - Montignies-sur-Sambre : Haute Ecole Louvain en Hainaut, 2023 . - 66p.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur .
Langues : Français (fre)
Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Introduction
Les champignons filamenteux sont de plus en plus impliqués en pathologie humaine notamment chez les personnes immunodéprimées. Les méthodes d’identification conventionnelles sont fastidieuses et nécessitent une longue formation. Dans le contexte de centralisation des activités de mycologie du LHUB-ULB sur un seul centre d’activités, l’implémentation d’une méthode rapide et fiable serait la bienvenue.
But du travail
Le but de ce travail est de valider la technique MBT HT Filamentous fungi de Bruker pour l’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse (MALDI-TOF). En cas de résultats satisfaisants, l’objectif est d’implémenter cette méthode rapide en routine afin d’améliorer la prise en charge des patients et simplifier la tâche aux technologues du secteur de mycologie.
Matériels et méthodes
Les prélèvements cliniques issus des 5 hôpitaux partenaires du LHUB-ULB pour la recherche de moisissures, ainsi que les prélèvements issus des services de dermatologie de l’hôpital Erasme et du CHU Saint-Pierre pour recherche des dermatophytes seront traités en parallèle suivant les méthodes conventionnelles (culture, microscopie et macroscopie) et par spectrométrie de masse (MALDI-TOF). Le taux de concordance entre les 2 méthodes sera calculé. Les souches présentant les résultats discordants seront identifiées par séquençage afin de pouvoir départager les 2 méthodes.
Résultats et discussion
Au terme de ce travail, 100 souches de champignons filamenteux ont été identifiées par MALDI-TOF et par les méthodes conventionnelles avec une concordance de 94% entre ces 2 méthodes. Les scores obtenus par spectrométrie de masse étaient particulièrement bons. Les 6 souches discordantes n’ont donné aucune identification par MALDI-TOF. L’analyse par séquençage, concluante pour 4 souches, a confirmé que les cas d’échecs d’identification par MALDI-TOF étaient attribués à l’absence des souches concernées dans la base de données. Aucune concordance n’a été observée entre la biologie moléculaire et la méthode de routine pour les 4 cas souches. Par conséquent, le MALDI-TOF est une excellente méthode pour l’identification des champignons filamenteux pour autant que la souche à identifier soit présente dans la base de données.
Conclusion et perspectives
Au terme de ce travail, la technique MBT HT Filamentous fungi de Bruker pour l’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse a été validée néanmoins, il faudra progressivement enrichir la base de données du spectromètre de masse du LHUB-ULB. L’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse sera intégrée dans la routine du laboratoire de Mycologie du LHUB-ULB, ce qui permettra une simplification de la tâche des technologues et surtout une réponse plus rapide et par conséquent une amélioration de la prise en charge des patients.Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=114743 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire