Étude de l’impact des étapes pré analytiques et analytiques sur l’agrégation, les caractéristiques et la numération plaquettaire. / Sultan Kasikci

Public ISBD Titre : Étude de l’impact des étapes pré analytiques et analytiques sur l’agrégation, les caractéristiques et la numération plaquettaire. Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Sultan Kasikci, Auteur ; Gaël Gilbert, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2019 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale  CHU Dinant Godinne  Mont Godinne Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Ce travail de fin d’études aborde l’impact des étapes pré-analytiques et analytiques telles que le type d’anticoagulant, l’homogénéisation du prélèvement, le délai et le diluant sur l’agrégation plaquettaire, les caractéristiques plaquettaires (volume plaquettaire moyen, fraction immature des plaquettes) et sur la numération plaquettaire. Depuis peu, une nouvelle alternative a été mise au point pour mesurer l’agrégation plaquettaire. Elle vise à substituer le tube hirudine par le tube citrate à condition d’utiliser le chlorure de calcium en échange du chlorure de sodium afin d’obtenir une agrégation plaquettaire identique entre le sang récolté sur tube hirudine et le sang récolté sur tube citrate en utilisant toujours les mêmes inducteurs. Afin de vérifier l’impact du calcium sur l’agrégation plaquettaire, une autre série d’agrégation plaquettaire sera réalisée à partir de sang récolté sur tube citrate dilué au chlorure de sodium. En parallèle, le Sysmex XN 9000 a effectué la numération plaquettaire par impédance, fluorescence et par méthode optique ainsi que le MPV et l’IPF sur tubes citrate, hirudine et EDTA. De plus, des frottis ont été tirés et colorés avec ces mêmes tubes afin de justifier les éventuelles variations de la numération plaquettaire. La numération plaquettaire, les paramètres caractérisant les plaquettes, l’agrégation, ainsi que les frottis de sang seront effectués au cours des délais suivants : 5, 30, 60, 120 et 180 minutes. Afin de mener à bien cette étude, vingt personnes ont fait don de leur sang. Cette étude a démontré qu’il était préférable de réaliser les agrégations plaquettaires sur tube hirudine dilué au NaCl entre 30 et 120 minutes avec le Multiplate et que la numération plaquettaire au Sysmex doit s’effectuer sur EDTA entre 5 et 120 minutes. De plus, la fraction immature plaquettaire peut être mesurée sur EDTA entre 5 et 180 minutes ou sur citrate entre 30 et 180 minutes. Finalement, il est préférable de mesurer le volume plaquettaire moyen sur citrate entre 30 et 180 minutes sachant que cette variable est moins stable que l’IPF. En conclusion, les étapes pré-analytiques et analytiques telles que le type d’anticoagulant, l’homogénéisation du prélèvement, le délai et le diluant doivent être standardisés car ils influencent l’agrégation plaquettaire, les caractéristiques (volume plaquettaire moyen et fraction immature des plaquettes) et la numération plaquettaire. Note de contenu : Présentation du lieu de stage ................................................................................................................... 5 Introduction générale ............................................................................................................................... 6 1. Contexte théorique .............................................................................................................................. 7 1.1 L’hémostase ................................................................................................................................... 7 1.2 L’hémostase primaire .................................................................................................................... 7 1.2.1 La paroi vasculaire ...................................................................................................................... 7 1.2.2 Le facteur Von Willebrand .......................................................................................................... 8 1.3 Les plaquettes................................................................................................................................ 8 1.3.1 L’origine plaquettaire ............................................................................................................. 8 1.3.2 La structure plaquettaire ....................................................................................................... 8 1.3.3 Les fonctions plaquettaires .................................................................................................. 10 1.4 Les étapes menant à l’agrégation plaquettaire .......................................................................... 10 1.4.1 L’adhésion plaquettaire ............................................................................................................ 10 1.4.2 L’activation plaquettaire ........................................................................................................... 11 1.4.3 L’agrégation plaquettaire ......................................................................................................... 12 1.4.3.1 L’adénosine diphosphate ................................................................................................... 12 1.4.3.2 Le collagène ....................................................................................................................... 13 1.4.3.3 Le peptide activant le récepteur de la thrombine ............................................................. 13 1.4.3.4 Les valeurs de référence .................................................................................................... 14 1.5 Application clinique de l’agrégation plaquettaire ....................................................................... 14 1.5.1 L’intérêt clinique de l’étude de la fonction plaquettaire ......................................................... 14 1.5.2 Les tests d’agrégation plaquettaire .......................................................................................... 15 1.5.3 Le système Multiplate .............................................................................................................. 16 1.5.3.1 Principe du Multiplate ....................................................................................................... 16 1.5.3.2 Appareillage du Multiplate ................................................................................................ 17 1.6 La numération et les caractéristiques plaquettaires avec le Sysmex XN 9000 ........................... 18 1.6.1 La numération plaquettaire par impédancemétrie .................................................................. 19 1.6.2 La numération plaquettaire par méthode optique .................................................................. 19 1.6.3 La numération plaquettaire par fluorescence .......................................................................... 21 1.6.4 La mesure des caractéristiques plaquettaires avec le Sysmex XN 9000 .................................. 22 1.6.4.1 Le volume plaquettaire moyen .......................................................................................... 22 1.6.4.2 La fraction immature plaquettaire .................................................................................... 23 1.7 Le frottis sanguin ......................................................................................................................... 24 1.8 L’impact des étapes pré-analytiques et analytiques ....................................................................... 24 1.8.1 Avant le prélèvement ............................................................................................................... 25 1.8.1.1 Le choix des anticoagulants ............................................................................................... 25 1.8.2 Pendant le prélèvement ........................................................................................................... 27 1.8.3 Après le prélèvement ............................................................................................................... 27 2. Objectifs et stratégie ......................................................................................................................... 28 2.1 Les objectifs ..................................................................................................................................... 28 2.2 La stratégie ....................................................................................................................................... 28 3. Matériel et méthode.......................................................................................................................... 29 3.1 Matériel ....................................................................................................................................... 29 3.1.1 Matériel pour le comptage des agrégats plaquettaires au microscope .................................. 29 3.1.2 Matériel pour l’agrégation plaquettaire ................................................................................... 29 3.1.3 Matériel pour la numération plaquettaire au Sysmex XN9000 ............................................... 30 3.1.4 Matériel pour la réalisation des frottis sanguins ...................................................................... 30 3.2 Méthode ...................................................................................................................................... 30 4. Résultats et discussions ..................................................................................................................... 34 4.1 Résultats de l’agrégation plaquettaire ............................................................................................ 34 4.2 Discussion concernant l’agrégation plaquettaire ............................................................................ 38 4.3 Résultats de la numération plaquettaire ......................................................................................... 40 4.4 Discussion concernant la numération plaquettaire ........................................................................ 45 4.5 Résultats du pourcentage d’agrégats plaquettaires ....................................................................... 47 4.6 Discussion concernant le pourcentage d’agrégats plaquettaires ................................................... 48 4.7 Résultats des caractéristiques plaquettaires ................................................................................... 49 4.8 Discussion concernant les caractéristiques plaquettaires .............................................................. 52 5. Conclusion générale........................................................................................................................... 54 Liste des figures ....................................................................................................................................... 55 Liste des tableaux .................................................................................................................................... 56 Abréviations ............................................................................................................................................ 57 Bibliographie ........................................................................................................................................... 58 Annexes ................................................................................................................................................... 61 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=79992 Étude de l’impact des étapes pré analytiques et analytiques sur l’agrégation, les caractéristiques et la numération plaquettaire. [TFE / Mémoire] / Sultan Kasikci, Auteur ; Gaël Gilbert, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2019. Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale  CHU Dinant Godinne  Mont Godinne Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Ce travail de fin d’études aborde l’impact des étapes pré-analytiques et analytiques telles que le type d’anticoagulant, l’homogénéisation du prélèvement, le délai et le diluant sur l’agrégation plaquettaire, les caractéristiques plaquettaires (volume plaquettaire moyen, fraction immature des plaquettes) et sur la numération plaquettaire. Depuis peu, une nouvelle alternative a été mise au point pour mesurer l’agrégation plaquettaire. Elle vise à substituer le tube hirudine par le tube citrate à condition d’utiliser le chlorure de calcium en échange du chlorure de sodium afin d’obtenir une agrégation plaquettaire identique entre le sang récolté sur tube hirudine et le sang récolté sur tube citrate en utilisant toujours les mêmes inducteurs. Afin de vérifier l’impact du calcium sur l’agrégation plaquettaire, une autre série d’agrégation plaquettaire sera réalisée à partir de sang récolté sur tube citrate dilué au chlorure de sodium. En parallèle, le Sysmex XN 9000 a effectué la numération plaquettaire par impédance, fluorescence et par méthode optique ainsi que le MPV et l’IPF sur tubes citrate, hirudine et EDTA. De plus, des frottis ont été tirés et colorés avec ces mêmes tubes afin de justifier les éventuelles variations de la numération plaquettaire. La numération plaquettaire, les paramètres caractérisant les plaquettes, l’agrégation, ainsi que les frottis de sang seront effectués au cours des délais suivants : 5, 30, 60, 120 et 180 minutes. Afin de mener à bien cette étude, vingt personnes ont fait don de leur sang. Cette étude a démontré qu’il était préférable de réaliser les agrégations plaquettaires sur tube hirudine dilué au NaCl entre 30 et 120 minutes avec le Multiplate et que la numération plaquettaire au Sysmex doit s’effectuer sur EDTA entre 5 et 120 minutes. De plus, la fraction immature plaquettaire peut être mesurée sur EDTA entre 5 et 180 minutes ou sur citrate entre 30 et 180 minutes. Finalement, il est préférable de mesurer le volume plaquettaire moyen sur citrate entre 30 et 180 minutes sachant que cette variable est moins stable que l’IPF. En conclusion, les étapes pré-analytiques et analytiques telles que le type d’anticoagulant, l’homogénéisation du prélèvement, le délai et le diluant doivent être standardisés car ils influencent l’agrégation plaquettaire, les caractéristiques (volume plaquettaire moyen et fraction immature des plaquettes) et la numération plaquettaire. Note de contenu : Présentation du lieu de stage ................................................................................................................... 5 Introduction générale ............................................................................................................................... 6 1. Contexte théorique .............................................................................................................................. 7 1.1 L’hémostase ................................................................................................................................... 7 1.2 L’hémostase primaire .................................................................................................................... 7 1.2.1 La paroi vasculaire ...................................................................................................................... 7 1.2.2 Le facteur Von Willebrand .......................................................................................................... 8 1.3 Les plaquettes................................................................................................................................ 8 1.3.1 L’origine plaquettaire ............................................................................................................. 8 1.3.2 La structure plaquettaire ....................................................................................................... 8 1.3.3 Les fonctions plaquettaires .................................................................................................. 10 1.4 Les étapes menant à l’agrégation plaquettaire .......................................................................... 10 1.4.1 L’adhésion plaquettaire ............................................................................................................ 10 1.4.2 L’activation plaquettaire ........................................................................................................... 11 1.4.3 L’agrégation plaquettaire ......................................................................................................... 12 1.4.3.1 L’adénosine diphosphate ................................................................................................... 12 1.4.3.2 Le collagène ....................................................................................................................... 13 1.4.3.3 Le peptide activant le récepteur de la thrombine ............................................................. 13 1.4.3.4 Les valeurs de référence .................................................................................................... 14 1.5 Application clinique de l’agrégation plaquettaire ....................................................................... 14 1.5.1 L’intérêt clinique de l’étude de la fonction plaquettaire ......................................................... 14 1.5.2 Les tests d’agrégation plaquettaire .......................................................................................... 15 1.5.3 Le système Multiplate .............................................................................................................. 16 1.5.3.1 Principe du Multiplate ....................................................................................................... 16 1.5.3.2 Appareillage du Multiplate ................................................................................................ 17 1.6 La numération et les caractéristiques plaquettaires avec le Sysmex XN 9000 ........................... 18 1.6.1 La numération plaquettaire par impédancemétrie .................................................................. 19 1.6.2 La numération plaquettaire par méthode optique .................................................................. 19 1.6.3 La numération plaquettaire par fluorescence .......................................................................... 21 1.6.4 La mesure des caractéristiques plaquettaires avec le Sysmex XN 9000 .................................. 22 1.6.4.1 Le volume plaquettaire moyen .......................................................................................... 22 1.6.4.2 La fraction immature plaquettaire .................................................................................... 23 1.7 Le frottis sanguin ......................................................................................................................... 24 1.8 L’impact des étapes pré-analytiques et analytiques ....................................................................... 24 1.8.1 Avant le prélèvement ............................................................................................................... 25 1.8.1.1 Le choix des anticoagulants ............................................................................................... 25 1.8.2 Pendant le prélèvement ........................................................................................................... 27 1.8.3 Après le prélèvement ............................................................................................................... 27 2. Objectifs et stratégie ......................................................................................................................... 28 2.1 Les objectifs ..................................................................................................................................... 28 2.2 La stratégie ....................................................................................................................................... 28 3. Matériel et méthode.......................................................................................................................... 29 3.1 Matériel ....................................................................................................................................... 29 3.1.1 Matériel pour le comptage des agrégats plaquettaires au microscope .................................. 29 3.1.2 Matériel pour l’agrégation plaquettaire ................................................................................... 29 3.1.3 Matériel pour la numération plaquettaire au Sysmex XN9000 ............................................... 30 3.1.4 Matériel pour la réalisation des frottis sanguins ...................................................................... 30 3.2 Méthode ...................................................................................................................................... 30 4. Résultats et discussions ..................................................................................................................... 34 4.1 Résultats de l’agrégation plaquettaire ............................................................................................ 34 4.2 Discussion concernant l’agrégation plaquettaire ............................................................................ 38 4.3 Résultats de la numération plaquettaire ......................................................................................... 40 4.4 Discussion concernant la numération plaquettaire ........................................................................ 45 4.5 Résultats du pourcentage d’agrégats plaquettaires ....................................................................... 47 4.6 Discussion concernant le pourcentage d’agrégats plaquettaires ................................................... 48 4.7 Résultats des caractéristiques plaquettaires ................................................................................... 49 4.8 Discussion concernant les caractéristiques plaquettaires .............................................................. 52 5. Conclusion générale........................................................................................................................... 54 Liste des figures ....................................................................................................................................... 55 Liste des tableaux .................................................................................................................................... 56 Abréviations ............................................................................................................................................ 57 Bibliographie ........................................................................................................................................... 58 Annexes ................................................................................................................................................... 61 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=79992

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Etude des pressions exercées par l’artisanat sur les populations de Pupu Niau (Cyclomorpha flava) dans le contexte socio-économique et environnemental de l’atoll de Niau / CAROLINE BELJOUANI

Public ISBD Titre : Etude des pressions exercées par l’artisanat sur les populations de Pupu Niau (Cyclomorpha flava) dans le contexte socio-économique et environnemental de l’atoll de Niau Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : CAROLINE BELJOUANI, Auteur ; Gaël Gilbert, Directeur de publication, rédacteur en chef Année de publication : 2017 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : Agronomie  TA  Erasmus  Polynésie française  Pae Tai Pae Uta Index. décimale : TFE TA TFE Technologie animalière Résumé : La Polynésie Française est le berceau d’une grande richesse en espèces à l’endémisme fort et à la diversité importante. C’est Cyclomorpha flava une espèce endémique de l’ouest de l’archipel des Tuamotu qui est étudiée dans ce travail. Gastéropode terrestre de 7mm appartenant à la famille des Assimineidae, on le trouve en abondance sur le petit atoll surélevé de Niau, où il est énormément utilisé dans l’artisanat local. Cet atoll appartient à la commune de Fakarava qui est une réserve de biosphère de l’UNESCO. Voyant les populations d’escargots de leur atoll décroître, les habitants de Niau on introduit une demande dans le cadre de cette réserve biosphère afin que l’espèce Cyclomorpha flava soit l’objet d’une étude. Cet ainsi que nous avons été amenés à étudier les pressions exercées par l’artisanat sur les populations de Cyclomorpha flava dans le contexte socio-économique de l’atoll de Niau. Etant donné que l’espèce n’avait jamais été étudiée auparavant il a fallu élargir nos recherches. Une mission de trois semaines sur l’atoll a permis d’étudier la biologie de cette espèce jamais étudiée auparavant, ainsi que la pression exercée par les ramasseuses sur la population d’escargots. Son utilisation dans l’artisanat et sa valeur socio-économiques ont eux aussi fait l’objet d’investigations poussées. Il est apparu que de nombreuses menaces pesaient sur l’espèce. La plus importante d’entre elle est le brulis pratiqué pour l’entretient des cocoteraies. Détruisant définitivement l’espèce et son habitat, il ne laisse aucune chance de recolonisation aux populations survivantes. En général, toute modification de l’environnement de cet escargot est désastreuse et la création de remblais ne déroge pas à la règle. Le ramassage des escargots destiné à la création de pièces d’artisanat n’est pas le plus gros problème. L’exportation sur Papeete de bouteilles remplies de coquilles d’escargots est quant-à-elle beaucoup plus menaçante pour l’espèce. L’avenir de l’espèce peut être sécurisé par des actions d’envergure raisonnable mais rapide. La mise en place d’un broyeur composteur et la réintroduction des chevaux à Niau pourrait permettre de réduire considérablement l’écobuage. Une organisation des artisans permettant de vendre leurs créations artisanales à Papeete où la demande est importante permettrait quant-à-elle la réduction des exportations de coquilles brutes. Il est important de continuer à effectuer des études à Niau. L’atoll qui renferme de nombreuses richesses en termes de biodiversité, mais comme partout dans notre monde il est menacé par nos habitudes de consommation. Note de contenu : Table des matières Remerciements ...................................................................................................................... Contexte général ................................................................................................................. 5 1 Introduction générale .............................................................................................. 8 1.1 Réserve de biosphère .................................................................................................. 8 1.2 Niau, un Atoll surélevé au lagon fermé ............................................................... 10 1.3 Gastéropodes terrestres ........................................................................................... 12 1.4 Cyclomorpha flava ....................................................................................................... 14 1.5 SIG GPS et QGIS des outils indispensables de géolocalisation, utilisés dans le cadre de ce travail ....................................................................................... 15 2 Matériel et méthode ............................................................................................... 17 2.1 Mise en place ................................................................................................................. 17 2.2 Relevés de terrain pour la biologie de Pupu Niau ........................................... 18 2.2.1 Préparation de mission ..................................................................................................... 18 2.2.2 Méthodologie de récolte des données sur le terrain ............................................ 20 2.3 Evaluation des CPUE et de la pression de collecte .......................................... 22 2.3.1 Entretiens avec les « mamans » ..................................................................................... 22 2.3.2 Suivi de deux heures de ramassage ............................................................................. 23 2.4 Evaluation de la valeur socio-économique de Pupu Niau ............................ 24 2.4.1 Entretiens avec les mamans ............................................................................................ 24 2.4.2 Prix de vente .......................................................................................................................... 25 2.4.3 Comparaison avec d'autres filières de l’atoll ........................................................... 25 2.5 Réalisation de cartes et traitement des données ............................................ 26 3 Résultats et Discussion .......................................................................................... 27 3.1 Biologie de Pupu Niau................................................................................................ 27 3.1.1 Distribution de la population sur l’atoll ..................................................................... 27 3.1.2 La mortalité de la population ......................................................................................... 30 3.1.3 Les tailles ................................................................................................................................ 33 3.1.4 Les couleurs ........................................................................................................................... 35 3.1.5 Alimentation et Reproduction........................................................................................ 36 3.2 CPUE et pression de collecte ................................................................................... 37 3.2.1 Entretiens avec les mamans ............................................................................................ 37 3.2.2 Suivi de deux heures de ramassage ............................................................................. 39 3.3 Valeur socio-économique ......................................................................................... 42 3.3.1 Entretiens avec les “Mamans” ........................................................................................ 42 3.3.2 Comparaison avec l’artisanat tahitien ........................................................................ 49 3.3.3 Comparaison avec d'autres filières de l’atoll ........................................................... 50 Conclusion générale et perspectives ......................................................................... 51 Listes des figures, tableaux et photos ....................................................................... 53 Bibliographie ..................................................................................................................... 55 Annexes ................................................................................................................................ 58 Résumé ................................................................................................................................. 60 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65897 Etude des pressions exercées par l’artisanat sur les populations de Pupu Niau (Cyclomorpha flava) dans le contexte socio-économique et environnemental de l’atoll de Niau [TFE / Mémoire] / CAROLINE BELJOUANI, Auteur ; Gaël Gilbert, Directeur de publication, rédacteur en chef . - 2017. Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : Agronomie  TA  Erasmus  Polynésie française  Pae Tai Pae Uta Index. décimale : TFE TA TFE Technologie animalière Résumé : La Polynésie Française est le berceau d’une grande richesse en espèces à l’endémisme fort et à la diversité importante. C’est Cyclomorpha flava une espèce endémique de l’ouest de l’archipel des Tuamotu qui est étudiée dans ce travail. Gastéropode terrestre de 7mm appartenant à la famille des Assimineidae, on le trouve en abondance sur le petit atoll surélevé de Niau, où il est énormément utilisé dans l’artisanat local. Cet atoll appartient à la commune de Fakarava qui est une réserve de biosphère de l’UNESCO. Voyant les populations d’escargots de leur atoll décroître, les habitants de Niau on introduit une demande dans le cadre de cette réserve biosphère afin que l’espèce Cyclomorpha flava soit l’objet d’une étude. Cet ainsi que nous avons été amenés à étudier les pressions exercées par l’artisanat sur les populations de Cyclomorpha flava dans le contexte socio-économique de l’atoll de Niau. Etant donné que l’espèce n’avait jamais été étudiée auparavant il a fallu élargir nos recherches. Une mission de trois semaines sur l’atoll a permis d’étudier la biologie de cette espèce jamais étudiée auparavant, ainsi que la pression exercée par les ramasseuses sur la population d’escargots. Son utilisation dans l’artisanat et sa valeur socio-économiques ont eux aussi fait l’objet d’investigations poussées. Il est apparu que de nombreuses menaces pesaient sur l’espèce. La plus importante d’entre elle est le brulis pratiqué pour l’entretient des cocoteraies. Détruisant définitivement l’espèce et son habitat, il ne laisse aucune chance de recolonisation aux populations survivantes. En général, toute modification de l’environnement de cet escargot est désastreuse et la création de remblais ne déroge pas à la règle. Le ramassage des escargots destiné à la création de pièces d’artisanat n’est pas le plus gros problème. L’exportation sur Papeete de bouteilles remplies de coquilles d’escargots est quant-à-elle beaucoup plus menaçante pour l’espèce. L’avenir de l’espèce peut être sécurisé par des actions d’envergure raisonnable mais rapide. La mise en place d’un broyeur composteur et la réintroduction des chevaux à Niau pourrait permettre de réduire considérablement l’écobuage. Une organisation des artisans permettant de vendre leurs créations artisanales à Papeete où la demande est importante permettrait quant-à-elle la réduction des exportations de coquilles brutes. Il est important de continuer à effectuer des études à Niau. L’atoll qui renferme de nombreuses richesses en termes de biodiversité, mais comme partout dans notre monde il est menacé par nos habitudes de consommation. Note de contenu : Table des matières Remerciements ...................................................................................................................... Contexte général ................................................................................................................. 5 1 Introduction générale .............................................................................................. 8 1.1 Réserve de biosphère .................................................................................................. 8 1.2 Niau, un Atoll surélevé au lagon fermé ............................................................... 10 1.3 Gastéropodes terrestres ........................................................................................... 12 1.4 Cyclomorpha flava ....................................................................................................... 14 1.5 SIG GPS et QGIS des outils indispensables de géolocalisation, utilisés dans le cadre de ce travail ....................................................................................... 15 2 Matériel et méthode ............................................................................................... 17 2.1 Mise en place ................................................................................................................. 17 2.2 Relevés de terrain pour la biologie de Pupu Niau ........................................... 18 2.2.1 Préparation de mission ..................................................................................................... 18 2.2.2 Méthodologie de récolte des données sur le terrain ............................................ 20 2.3 Evaluation des CPUE et de la pression de collecte .......................................... 22 2.3.1 Entretiens avec les « mamans » ..................................................................................... 22 2.3.2 Suivi de deux heures de ramassage ............................................................................. 23 2.4 Evaluation de la valeur socio-économique de Pupu Niau ............................ 24 2.4.1 Entretiens avec les mamans ............................................................................................ 24 2.4.2 Prix de vente .......................................................................................................................... 25 2.4.3 Comparaison avec d'autres filières de l’atoll ........................................................... 25 2.5 Réalisation de cartes et traitement des données ............................................ 26 3 Résultats et Discussion .......................................................................................... 27 3.1 Biologie de Pupu Niau................................................................................................ 27 3.1.1 Distribution de la population sur l’atoll ..................................................................... 27 3.1.2 La mortalité de la population ......................................................................................... 30 3.1.3 Les tailles ................................................................................................................................ 33 3.1.4 Les couleurs ........................................................................................................................... 35 3.1.5 Alimentation et Reproduction........................................................................................ 36 3.2 CPUE et pression de collecte ................................................................................... 37 3.2.1 Entretiens avec les mamans ............................................................................................ 37 3.2.2 Suivi de deux heures de ramassage ............................................................................. 39 3.3 Valeur socio-économique ......................................................................................... 42 3.3.1 Entretiens avec les “Mamans” ........................................................................................ 42 3.3.2 Comparaison avec l’artisanat tahitien ........................................................................ 49 3.3.3 Comparaison avec d'autres filières de l’atoll ........................................................... 50 Conclusion générale et perspectives ......................................................................... 51 Listes des figures, tableaux et photos ....................................................................... 53 Bibliographie ..................................................................................................................... 55 Annexes ................................................................................................................................ 58 Résumé ................................................................................................................................. 60 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65897

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Etude du second messager di-GMP cyclique dans la croissance de Bruxella abortus / Antoine Gerodez

Public ISBD Titre : Etude du second messager di-GMP cyclique dans la croissance de Bruxella abortus Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Antoine Gerodez, Auteur ; Gaël Gilbert, Directeur de la recherche Année de publication : 2018 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66083 Etude du second messager di-GMP cyclique dans la croissance de Bruxella abortus [TFE / Mémoire] / Antoine Gerodez, Auteur ; Gaël Gilbert, Directeur de la recherche . - 2018. Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66083

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Étude des systèmes de réponse aux stress d’enveloppe chez Brucella abortus / Marine Van Der Gucht

Public ISBD Titre : Étude des systèmes de réponse aux stress d’enveloppe chez Brucella abortus Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Marine Van Der Gucht, Auteur ; Gaël Gilbert, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2021 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : Université de Namur  BRUCELLOSE BOVINE  Brucella abortus Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Brucella abortus est un pathogène intracellulaire facultativement extracellulaire provoquant la brucellose chez les bovins et entrainant des avortements. Une fois l’animal testé positif, tout le troupeau est abattu. Cela engendre donc des pertes économiques importantes dans les pays endémiques. De surcroit, lors de l’évolution, les bactéries ont développé des mécanismes, des systèmes de réponse afin de survivre et de proliférer dans un environnement représentant un stress pour elles, notamment un stress perturbant l’enveloppe bactérienne. Il est donc important d’étudier ces systèmes afin d’approfondir les connaissances sur la bactérie pour ainsi mieux contrôler les infections et les pertes économiques que cela engendre. Ce travail de fin d’étude aborde l’éventuelle intervention du système à deux composants, BvrR/BvrS dans la réponse aux stress d’enveloppe chez B. abortus et la caractérisation d’une potentielle interaction entre les protéines ExoR et BvrS. Afin d’y parvenir, une surexpression de ces deux protéines a été réalisée chez B. abortus. Les mutants de surexpression ont ensuite été déposés sur un milieu avec et sans stress d’enveloppe afin d’observer une éventuelle différence de croissance. Ces protéines ont également été fusionnées à des protéines fluorescentes afin d’être visualisées au microscope à fluorescence permettant l’étude de la localisation de ces protéines et d’une éventuelle co-localisation de celles-ci, qui pourrait indiquer une potentielle interaction entre ces deux protéines. Il a premièrement été démontré que la surexpression de BvrS induisait des différences de croissance des clones lorsqu’ils sont soumis à un stress d’enveloppe, ce qui atteste que BvrS joue un rôle dans la réponse de la bactérie face à ce type de stress ou du moins qu’il perturbe sa croissance. La surexpression d’ExoR semble quant à elle montrer une légère amélioration de croissance, celle-ci n’étant cependant pas confirmée par les CFU obtenus. La localisation et la co-localisation des protéines n’ont pas pu être mises en évidence car aucune fluorescence n’a été obtenue. Les hypothèses qui ont alors été émises est que l’expression des protéines par la bactérie est peut-être trop faible pour observer une fluorescence ou qu’il y a un problème au niveau des constructions. Pour vérifier cela, une surexpression des protéines de fusion a été testée. Cependant, les transformations n’étant pas concluantes, la seconde hypothèse émise est que les protéines surexprimées sont peut-être toxiques pour la bactérie. Le bilan de ce travail démontre donc que le système BvrS/BvrR serait impliqué dans la réponse au stress d’enveloppe chez B. abortus. L’interaction avec ExoR n’ayant pas pu être mise en évidence, des méthodes sont proposées afin d’y remédier. L’utilisation d’un plasmide inductible d’une part permettra d’exprimer les protéines à un moment voulu, réglant le problème de toxicité. D’autre part, le remplacement génomique du promoteur de BvrS et d’ExoR par un promoteur plus fort permettra de surexprimer la protéine d’un point de vue génomique. Note de contenu : Tables des matières Remerciements .................................................................................................................... Présentation du lieu de stage ............................................................................................. 8 Introduction générale ........................................................................................................ 9 I. Partie théorique ........................................................................................................11 1. Généralités....................................................................................................................... 11 2. Mode d’infection cellulaire de Brucella spp..................................................................... 13 2.1. Cycle de vie intracellulaire de Brucella spp. .................................................................................14 3. Les systèmes de réponse aux stress d’enveloppe chez Escherichia coli ........................... 15 3.1. Les systèmes dépendant d’un facteur sigma..................................................................................16 3.2. Les systèmes à deux composants (TCS)........................................................................................17 4. Le système BvrR/BvrS .................................................................................................... 18 4.1. Rôle et fonctionnement du système BvrR/BvrS ............................................................................19 4.2. Interaction d’ExoR avec le système BvrR/BvrS ? .........................................................................20 5. La double recombinaison homologue.............................................................................. 21 II. Partie pratique ......................................................................................................24 1. Objectifs et stratégie........................................................................................................ 24 2. Matériel ........................................................................................................................... 24 2.1. Les constructions ...........................................................................................................................24 2.2. Les plasmides ................................................................................................................................27 2.2.1. Le pNPTS 138 ..........................................................................................................................29 2.2.2. Le pBBR ...................................................................................................................................30 2.2.3. Le pGem ...................................................................................................................................31 2.2.4. Le pMR10.................................................................................................................................32 2.3. Les enzymes de restriction ............................................................................................................32 2.4. Les souches bactériennes...............................................................................................................34 2.4.1. Escherichia coli.........................................................................................................................34 2.4.1.1. DH10B ............................................................................................................................35 2.4.1.2. S17-1 ...............................................................................................................................35 2.4.2. Brucella abortus 544 .................................................................................................................35 3. Méthodes ......................................................................................................................... 36 3.1. La PCR ..........................................................................................................................................36 3.1.1. La PCR préparatrice..................................................................................................................37 3.1.2. La PCR jointive ........................................................................................................................37 3.1.3. La PCR de diagnostic ...............................................................................................................38 3.2. Électrophorèse ...............................................................................................................................39 3.3. La purification ...............................................................................................................................39 3.4. La restriction..................................................................................................................................40 3.5. La ligation......................................................................................................................................41 3.6. La transformation ..........................................................................................................................41 3.6.1. La transformation par choc thermique ......................................................................................41 3.7. Sélection des transformants : test blanc/bleu .................................................................................42 3.8. Extraction d’ADN plasmidique .....................................................................................................43 3.9. La conjugaison...............................................................................................................................43 3.10. La microscopie à fluorescence.......................................................................................................44 3.10.1. Principe ................................................................................................................................45 3.11. Le western blot ..............................................................................................................................46 3.11.1. Principe ................................................................................................................................47 4. Résultats et discussion ..................................................................................................... 49 4.1. Surexpression d’ExoR et BvrS ......................................................................................................49 4.2. Construction des protéines de fusion .............................................................................................54 4.3. Transformation en DH10B ............................................................................................................56 4.4. PCR de diagnostic des thermolysats..............................................................................................58 4.5. Observation au microscope à fluorescence....................................................................................59 4.6. Western blot ..................................................................................................................................63 4.7. Surexpression des protéines de fusion ...........................................................................................65 4.8. Amplification des séquences d’intérêt...........................................................................................65 Conclusion générale et perspectives..................................................................................69 Glossaire ..........................................................................................................................71 Liste des abréviations........................................................................................................74 Liste des tableaux .............................................................................................................77 Bibliographie....................................................................................................................78 Annexes............................................................................................................................82 Résumé.............................................................................................................................91 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=100370 Étude des systèmes de réponse aux stress d’enveloppe chez Brucella abortus [TFE / Mémoire] / Marine Van Der Gucht, Auteur ; Gaël Gilbert, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2021. Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : Université de Namur  BRUCELLOSE BOVINE  Brucella abortus Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Brucella abortus est un pathogène intracellulaire facultativement extracellulaire provoquant la brucellose chez les bovins et entrainant des avortements. Une fois l’animal testé positif, tout le troupeau est abattu. Cela engendre donc des pertes économiques importantes dans les pays endémiques. De surcroit, lors de l’évolution, les bactéries ont développé des mécanismes, des systèmes de réponse afin de survivre et de proliférer dans un environnement représentant un stress pour elles, notamment un stress perturbant l’enveloppe bactérienne. Il est donc important d’étudier ces systèmes afin d’approfondir les connaissances sur la bactérie pour ainsi mieux contrôler les infections et les pertes économiques que cela engendre. Ce travail de fin d’étude aborde l’éventuelle intervention du système à deux composants, BvrR/BvrS dans la réponse aux stress d’enveloppe chez B. abortus et la caractérisation d’une potentielle interaction entre les protéines ExoR et BvrS. Afin d’y parvenir, une surexpression de ces deux protéines a été réalisée chez B. abortus. Les mutants de surexpression ont ensuite été déposés sur un milieu avec et sans stress d’enveloppe afin d’observer une éventuelle différence de croissance. Ces protéines ont également été fusionnées à des protéines fluorescentes afin d’être visualisées au microscope à fluorescence permettant l’étude de la localisation de ces protéines et d’une éventuelle co-localisation de celles-ci, qui pourrait indiquer une potentielle interaction entre ces deux protéines. Il a premièrement été démontré que la surexpression de BvrS induisait des différences de croissance des clones lorsqu’ils sont soumis à un stress d’enveloppe, ce qui atteste que BvrS joue un rôle dans la réponse de la bactérie face à ce type de stress ou du moins qu’il perturbe sa croissance. La surexpression d’ExoR semble quant à elle montrer une légère amélioration de croissance, celle-ci n’étant cependant pas confirmée par les CFU obtenus. La localisation et la co-localisation des protéines n’ont pas pu être mises en évidence car aucune fluorescence n’a été obtenue. Les hypothèses qui ont alors été émises est que l’expression des protéines par la bactérie est peut-être trop faible pour observer une fluorescence ou qu’il y a un problème au niveau des constructions. Pour vérifier cela, une surexpression des protéines de fusion a été testée. Cependant, les transformations n’étant pas concluantes, la seconde hypothèse émise est que les protéines surexprimées sont peut-être toxiques pour la bactérie. Le bilan de ce travail démontre donc que le système BvrS/BvrR serait impliqué dans la réponse au stress d’enveloppe chez B. abortus. L’interaction avec ExoR n’ayant pas pu être mise en évidence, des méthodes sont proposées afin d’y remédier. L’utilisation d’un plasmide inductible d’une part permettra d’exprimer les protéines à un moment voulu, réglant le problème de toxicité. D’autre part, le remplacement génomique du promoteur de BvrS et d’ExoR par un promoteur plus fort permettra de surexprimer la protéine d’un point de vue génomique. Note de contenu : Tables des matières Remerciements .................................................................................................................... Présentation du lieu de stage ............................................................................................. 8 Introduction générale ........................................................................................................ 9 I. Partie théorique ........................................................................................................11 1. Généralités....................................................................................................................... 11 2. Mode d’infection cellulaire de Brucella spp..................................................................... 13 2.1. Cycle de vie intracellulaire de Brucella spp. .................................................................................14 3. Les systèmes de réponse aux stress d’enveloppe chez Escherichia coli ........................... 15 3.1. Les systèmes dépendant d’un facteur sigma..................................................................................16 3.2. Les systèmes à deux composants (TCS)........................................................................................17 4. Le système BvrR/BvrS .................................................................................................... 18 4.1. Rôle et fonctionnement du système BvrR/BvrS ............................................................................19 4.2. Interaction d’ExoR avec le système BvrR/BvrS ? .........................................................................20 5. La double recombinaison homologue.............................................................................. 21 II. Partie pratique ......................................................................................................24 1. Objectifs et stratégie........................................................................................................ 24 2. Matériel ........................................................................................................................... 24 2.1. Les constructions ...........................................................................................................................24 2.2. Les plasmides ................................................................................................................................27 2.2.1. Le pNPTS 138 ..........................................................................................................................29 2.2.2. Le pBBR ...................................................................................................................................30 2.2.3. Le pGem ...................................................................................................................................31 2.2.4. Le pMR10.................................................................................................................................32 2.3. Les enzymes de restriction ............................................................................................................32 2.4. Les souches bactériennes...............................................................................................................34 2.4.1. Escherichia coli.........................................................................................................................34 2.4.1.1. DH10B ............................................................................................................................35 2.4.1.2. S17-1 ...............................................................................................................................35 2.4.2. Brucella abortus 544 .................................................................................................................35 3. Méthodes ......................................................................................................................... 36 3.1. La PCR ..........................................................................................................................................36 3.1.1. La PCR préparatrice..................................................................................................................37 3.1.2. La PCR jointive ........................................................................................................................37 3.1.3. La PCR de diagnostic ...............................................................................................................38 3.2. Électrophorèse ...............................................................................................................................39 3.3. La purification ...............................................................................................................................39 3.4. La restriction..................................................................................................................................40 3.5. La ligation......................................................................................................................................41 3.6. La transformation ..........................................................................................................................41 3.6.1. La transformation par choc thermique ......................................................................................41 3.7. Sélection des transformants : test blanc/bleu .................................................................................42 3.8. Extraction d’ADN plasmidique .....................................................................................................43 3.9. La conjugaison...............................................................................................................................43 3.10. La microscopie à fluorescence.......................................................................................................44 3.10.1. Principe ................................................................................................................................45 3.11. Le western blot ..............................................................................................................................46 3.11.1. Principe ................................................................................................................................47 4. Résultats et discussion ..................................................................................................... 49 4.1. Surexpression d’ExoR et BvrS ......................................................................................................49 4.2. Construction des protéines de fusion .............................................................................................54 4.3. Transformation en DH10B ............................................................................................................56 4.4. PCR de diagnostic des thermolysats..............................................................................................58 4.5. Observation au microscope à fluorescence....................................................................................59 4.6. Western blot ..................................................................................................................................63 4.7. Surexpression des protéines de fusion ...........................................................................................65 4.8. Amplification des séquences d’intérêt...........................................................................................65 Conclusion générale et perspectives..................................................................................69 Glossaire ..........................................................................................................................71 Liste des abréviations........................................................................................................74 Liste des tableaux .............................................................................................................77 Bibliographie....................................................................................................................78 Annexes............................................................................................................................82 Résumé.............................................................................................................................91 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=100370

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Evaluation de la biodisponibilité des HAPs en sol de friches industrielles : mise au point et essais sur échantillons / EMILIE MARIT

Public ISBD Titre : Evaluation de la biodisponibilité des HAPs en sol de friches industrielles : mise au point et essais sur échantillons Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : EMILIE MARIT, Auteur ; Gaël Gilbert, Directeur de publication, rédacteur en chef Année de publication : 2017 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : Agronomie  AIBT  Gembloux Agro-Bio Tech Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Résumé : Ce travail se décompose en deux phases. la première partie consiste à adapter la méthode d'évaluation de la biodisponibilité de HAPs dans des sols de friches industrielles exposée dans la thèse de Barnier (2009), aux conditions du laboratoire. Pour ce faire, deux paramètres ont été optimisés : le temps de contact entre le sol et le Ténax® (afin que tous les HAPs biodisponibles soient adsorbés par le Ténax®) ainsi que le temps de désorption des HAPs du Ténax® (nombre de lavages à l'hexane et temps d'extraction aux ultrasons). La seconde partie du travail vise à étudier l'impact de différents amendements sur la biodisponibilité des HAPs de friches industrielles. Pour cela, quatre types d'amendements ont été testés: des exsudats racinaires de Medicago sativa L. et de Trifolium pratense L. ainsi qu'un amendement de racines broyées de Medicago sativa L. et de Trifolium pratense L. . Les sols amendés ont été mis à incuber à une température de 28°C, pour une durée de 14 et 28 jours. Afin de mesurer les effets de ces amendements, différents tests ont été effectués tels que la mesure de CO2 émis par le sol et la mesure de la biodisponibilité des HAPs Note de contenu : PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE ................................................................................ 6 INTRODUCTION ............................................................................................................ 7 PARTIE THÉORIQUE ...................................................................................................... 8 1. LES HYDROCARBURES AROMATIQUES POLYCYCLIQUES ............................................................. 8 1.1. Description ......................................................................................................... 8 1.2. Propriétés ........................................................................................................... 9 1.3. Formation des HAPs ......................................................................................... 10 1.4. Effet.................................................................................................................. 10 2. LES SOLS ..................................................................................................................... 11 2.1. Les fractions du sol .......................................................................................... 11 2.2. Persistance des HAPs dans le sol ..................................................................... 12 3. TECHNIQUES GÉNÉRALES DE REMÉDIATION ......................................................................... 12 3.1. La bioremédiation ............................................................................................ 13 3.1.1. Définition ................................................................................................. 13 3.1.2. La biodisponibilité des polluants ............................................................. 13 3.1.3. Les types de bioremédiation ................................................................... 14 3.1.3.1. La biostimulation ................................................................................. 14 3.1.3.2. Le bioventing ....................................................................................... 15 3.1.3.3. Le landfarming ..................................................................................... 15 3.1.3.4. Le composting ...................................................................................... 16 3.1.3.5. La bioaugmentation ............................................................................. 16 3.1.4. Micro-organismes utilisés lors de la bioremédiation .............................. 16 3.1.5. Types de métabolismes ........................................................................... 16 3.1.6. Facteurs influençant la bioremédiation .................................................. 17 3.2. La phytoremédiation ....................................................................................... 17 3.2.1. La phytostimulation ................................................................................. 18 3.2.2. La phytostabilisation ................................................................................ 18 3.2.3. La phytoextraction ................................................................................... 18 3.2.4. La phytovolatilisation .............................................................................. 19 3.2.5. La phytodégradation ............................................................................... 19 3.2.6. Les avantages de la phytoremédiation.................................................... 19 3.2.7. Les inconvénients de la phytoremédiation ............................................. 19 PARTIE PRATIQUE ....................................................................................................... 20 1. OBJECTIFS ................................................................................................................... 20 1.1. Mise en place d'une méthode de dosage de la biodisponibilité des HAPs ...... 20 1.2. Etude de l'effet de différents amendements sur la biodisponibilité des HAPs 20 2. MATÉRIELS ET MÉTHODES ............................................................................................... 21 2.1. Mise en place d'une méthode de dosage de la biodiponibilité des HAPs ........ 21 2.1.1. Matériels utilisés ..................................................................................... 21 2.1.2. Protocole ................................................................................................. 22 2.1.3. Optimisation de la désorption des HAPs du Ténax® (nombre de lavages à l’hexane et extraction aux ultra-sons) ..................................................................... 24 2.1.4. Temps de contact entre le sol et le Ténax® ............................................ 24 2.1.4.1. Analyse à l'HPLC ................................................................................... 25 2.1.4.2. Principe ................................................................................................ 25 2.1.4.3. paramètres .......................................................................................... 27 2.2. Etude de l'effet de différents amendements sur la biodisponibilité des HAPs 29 2.2.1. Matériel utilisé ......................................................................................... 29 2.2.2. Analyses expérimentales ......................................................................... 30 2.2.2.1. Respirométrie ...................................................................................... 31 2.2.2.2. Humidité résiduelle ............................................................................. 32 2.2.2.3. Biodisponibilité des HAPs .................................................................... 33 2.2.3. Protocole ................................................................................................. 33 2.2.3.1. Amendements testés ........................................................................... 33 2.2.3.2. Mise en place de l'incubation .............................................................. 34 3. ANALYSE DES RÉSULTATS ................................................................................................ 36 3.1. Mise en place d'une méthode de dosage de la biodiponibilité des HAPs ........ 36 3.1.1. Optimisation de la désorption des HAPs du Ténax® (nombre de lavages à l’hexane et extraction aux ultra-sons) ..................................................................... 36 3.1.2. Temps de contact entre le sol et le Ténax® ............................................ 37 3.2. Etude de l'effet de différents amendements sur la biodisponibilité des HAPs 44 3.2.1. La respirométrie ...................................................................................... 44 3.2.1.1. Influence du temps d'incubation ......................................................... 44 3.2.1.2. Influence du type d'amendement ....................................................... 44 3.2.2. Humidité résiduelle ................................................................................. 45 3.2.3. Biodisponibilité des HAPs ........................................................................ 45 3.2.3.1. Influence de la durée d'incubation ...................................................... 45 3.2.3.2. Influence du type d'amendements ..................................................... 52 3.2.3.3. Conclusion ........................................................................................... 53 CONCLUSION GÉNÉRALE ET PERSPECTIVE ................................................................... 54 LISTE DES ABRÉVIATIONS ............................................................................................ 55 TABLE DES TABLEAUX ................................................................................................. 56 TABLE DES ILLUSTRATIONS ......................................................................................... 57 BIBLIOGRAPHIE .......................................................................................................... 59 ANNEXES .................................................................................................................... Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65879 Evaluation de la biodisponibilité des HAPs en sol de friches industrielles : mise au point et essais sur échantillons [TFE / Mémoire] / EMILIE MARIT, Auteur ; Gaël Gilbert, Directeur de publication, rédacteur en chef . - 2017. Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : Agronomie  AIBT  Gembloux Agro-Bio Tech Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Résumé : Ce travail se décompose en deux phases. la première partie consiste à adapter la méthode d'évaluation de la biodisponibilité de HAPs dans des sols de friches industrielles exposée dans la thèse de Barnier (2009), aux conditions du laboratoire. Pour ce faire, deux paramètres ont été optimisés : le temps de contact entre le sol et le Ténax® (afin que tous les HAPs biodisponibles soient adsorbés par le Ténax®) ainsi que le temps de désorption des HAPs du Ténax® (nombre de lavages à l'hexane et temps d'extraction aux ultrasons). La seconde partie du travail vise à étudier l'impact de différents amendements sur la biodisponibilité des HAPs de friches industrielles. Pour cela, quatre types d'amendements ont été testés: des exsudats racinaires de Medicago sativa L. et de Trifolium pratense L. ainsi qu'un amendement de racines broyées de Medicago sativa L. et de Trifolium pratense L. . Les sols amendés ont été mis à incuber à une température de 28°C, pour une durée de 14 et 28 jours. Afin de mesurer les effets de ces amendements, différents tests ont été effectués tels que la mesure de CO2 émis par le sol et la mesure de la biodisponibilité des HAPs Note de contenu : PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE ................................................................................ 6 INTRODUCTION ............................................................................................................ 7 PARTIE THÉORIQUE ...................................................................................................... 8 1. LES HYDROCARBURES AROMATIQUES POLYCYCLIQUES ............................................................. 8 1.1. Description ......................................................................................................... 8 1.2. Propriétés ........................................................................................................... 9 1.3. Formation des HAPs ......................................................................................... 10 1.4. Effet.................................................................................................................. 10 2. LES SOLS ..................................................................................................................... 11 2.1. Les fractions du sol .......................................................................................... 11 2.2. Persistance des HAPs dans le sol ..................................................................... 12 3. TECHNIQUES GÉNÉRALES DE REMÉDIATION ......................................................................... 12 3.1. La bioremédiation ............................................................................................ 13 3.1.1. Définition ................................................................................................. 13 3.1.2. La biodisponibilité des polluants ............................................................. 13 3.1.3. Les types de bioremédiation ................................................................... 14 3.1.3.1. La biostimulation ................................................................................. 14 3.1.3.2. Le bioventing ....................................................................................... 15 3.1.3.3. Le landfarming ..................................................................................... 15 3.1.3.4. Le composting ...................................................................................... 16 3.1.3.5. La bioaugmentation ............................................................................. 16 3.1.4. Micro-organismes utilisés lors de la bioremédiation .............................. 16 3.1.5. Types de métabolismes ........................................................................... 16 3.1.6. Facteurs influençant la bioremédiation .................................................. 17 3.2. La phytoremédiation ....................................................................................... 17 3.2.1. La phytostimulation ................................................................................. 18 3.2.2. La phytostabilisation ................................................................................ 18 3.2.3. La phytoextraction ................................................................................... 18 3.2.4. La phytovolatilisation .............................................................................. 19 3.2.5. La phytodégradation ............................................................................... 19 3.2.6. Les avantages de la phytoremédiation.................................................... 19 3.2.7. Les inconvénients de la phytoremédiation ............................................. 19 PARTIE PRATIQUE ....................................................................................................... 20 1. OBJECTIFS ................................................................................................................... 20 1.1. Mise en place d'une méthode de dosage de la biodisponibilité des HAPs ...... 20 1.2. Etude de l'effet de différents amendements sur la biodisponibilité des HAPs 20 2. MATÉRIELS ET MÉTHODES ............................................................................................... 21 2.1. Mise en place d'une méthode de dosage de la biodiponibilité des HAPs ........ 21 2.1.1. Matériels utilisés ..................................................................................... 21 2.1.2. Protocole ................................................................................................. 22 2.1.3. Optimisation de la désorption des HAPs du Ténax® (nombre de lavages à l’hexane et extraction aux ultra-sons) ..................................................................... 24 2.1.4. Temps de contact entre le sol et le Ténax® ............................................ 24 2.1.4.1. Analyse à l'HPLC ................................................................................... 25 2.1.4.2. Principe ................................................................................................ 25 2.1.4.3. paramètres .......................................................................................... 27 2.2. Etude de l'effet de différents amendements sur la biodisponibilité des HAPs 29 2.2.1. Matériel utilisé ......................................................................................... 29 2.2.2. Analyses expérimentales ......................................................................... 30 2.2.2.1. Respirométrie ...................................................................................... 31 2.2.2.2. Humidité résiduelle ............................................................................. 32 2.2.2.3. Biodisponibilité des HAPs .................................................................... 33 2.2.3. Protocole ................................................................................................. 33 2.2.3.1. Amendements testés ........................................................................... 33 2.2.3.2. Mise en place de l'incubation .............................................................. 34 3. ANALYSE DES RÉSULTATS ................................................................................................ 36 3.1. Mise en place d'une méthode de dosage de la biodiponibilité des HAPs ........ 36 3.1.1. Optimisation de la désorption des HAPs du Ténax® (nombre de lavages à l’hexane et extraction aux ultra-sons) ..................................................................... 36 3.1.2. Temps de contact entre le sol et le Ténax® ............................................ 37 3.2. Etude de l'effet de différents amendements sur la biodisponibilité des HAPs 44 3.2.1. La respirométrie ...................................................................................... 44 3.2.1.1. Influence du temps d'incubation ......................................................... 44 3.2.1.2. Influence du type d'amendement ....................................................... 44 3.2.2. Humidité résiduelle ................................................................................. 45 3.2.3. Biodisponibilité des HAPs ........................................................................ 45 3.2.3.1. Influence de la durée d'incubation ...................................................... 45 3.2.3.2. Influence du type d'amendements ..................................................... 52 3.2.3.3. Conclusion ........................................................................................... 53 CONCLUSION GÉNÉRALE ET PERSPECTIVE ................................................................... 54 LISTE DES ABRÉVIATIONS ............................................................................................ 55 TABLE DES TABLEAUX ................................................................................................. 56 TABLE DES ILLUSTRATIONS ......................................................................................... 57 BIBLIOGRAPHIE .......................................................................................................... 59 ANNEXES .................................................................................................................... Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65879

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