Étude du statut de méthylation de MGMT par pyroséquençage avec la trousse therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen). Vérification de la méthode / Alexandra Luquain in Annales de Biologie Clinique, 73/6 (Novembre - Décembre 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/6 (Novembre - Décembre 2015) . - 665-670 Titre : Étude du statut de méthylation de MGMT par pyroséquençage avec la trousse therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen). Vérification de la méthode Type de document : texte imprimé Auteurs : Alexandra Luquain, Auteur ; Sandrine Magnin, Auteur ; David Guenat, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : 665-670 Langues : Français (fre) Mots-clés : MGMT  méthylation  pyroséquençage  vérification sur site  validation de méthode  norme ISO 15189 Résumé : La méthylation du promoteur du gène MGMT, codant l’enzyme ubiquitaire O6-méthylguanine-méthyltransférase, est un marqueur théranostique de bon pronostic des glioblastomes traités par chimiothérapie alkylante (témozolomide, Temodal®). Parmi les techniques d’analyse de méthylation, le pyroséquençage est une méthode quantitative reproductible et sensible. L’objectif de notre étude, menée dans le cadre de l’accréditation de la plateforme hospitalière de génétique moléculaire des cancers de Besançon, était de vérifier les performances de la trousse commerciale de pyroséquençage therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen) en termes de répétabilité, reproductibilité, limite du blanc (LOB), limite de détection (LOD), linéarité et contamination selon le guide SH GTA 04 du Cofrac. Les tests de répétabilité montrent une moyenne de méthylation de 3,22 % [écart type (SD) = 0,41, coefficient de variation (CV) = 12,75 %] pour le témoin non méthylé et de 70,16 % (SD = 2,20, CV = 3,14 %) pour le témoin méthylé. L’évaluation de la fidélité confirme l’efficacité du test avec une moyenne de méthylation du témoin non méthylé de 1,39 % (SD = 0,25, CV = 18,25 %) et de 94,03 % (SD = 2,56, CV = 2,73 %) pour le témoin méthylé. La LOB et la LOD sont respectivement de 3,43 % et 6,22 % de méthylation. Un coefficient de régression de 0,983 confirme la linéarité du test.Aucune contamination n’a été observée. Plus de 40 % des glioblastomes étudiés en 2013 dans notre laboratoire ont présenté un gène MGMT méthylé. Nos résultats indiquent que la trousse therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen) présente des performances conformes aux exigences de qualité de la norme NF EN ISO 15189 pour l’analyse du statut de méthylation de MGMT dans les glioblastomes. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66358 [article] Étude du statut de méthylation de MGMT par pyroséquençage avec la trousse therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen). Vérification de la méthode [texte imprimé] / Alexandra Luquain, Auteur ; Sandrine Magnin, Auteur ; David Guenat, Auteur . - 2015 . - 665-670. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/6 (Novembre - Décembre 2015) . - 665-670 Mots-clés : MGMT  méthylation  pyroséquençage  vérification sur site  validation de méthode  norme ISO 15189 Résumé : La méthylation du promoteur du gène MGMT, codant l’enzyme ubiquitaire O6-méthylguanine-méthyltransférase, est un marqueur théranostique de bon pronostic des glioblastomes traités par chimiothérapie alkylante (témozolomide, Temodal®). Parmi les techniques d’analyse de méthylation, le pyroséquençage est une méthode quantitative reproductible et sensible. L’objectif de notre étude, menée dans le cadre de l’accréditation de la plateforme hospitalière de génétique moléculaire des cancers de Besançon, était de vérifier les performances de la trousse commerciale de pyroséquençage therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen) en termes de répétabilité, reproductibilité, limite du blanc (LOB), limite de détection (LOD), linéarité et contamination selon le guide SH GTA 04 du Cofrac. Les tests de répétabilité montrent une moyenne de méthylation de 3,22 % [écart type (SD) = 0,41, coefficient de variation (CV) = 12,75 %] pour le témoin non méthylé et de 70,16 % (SD = 2,20, CV = 3,14 %) pour le témoin méthylé. L’évaluation de la fidélité confirme l’efficacité du test avec une moyenne de méthylation du témoin non méthylé de 1,39 % (SD = 0,25, CV = 18,25 %) et de 94,03 % (SD = 2,56, CV = 2,73 %) pour le témoin méthylé. La LOB et la LOD sont respectivement de 3,43 % et 6,22 % de méthylation. Un coefficient de régression de 0,983 confirme la linéarité du test.Aucune contamination n’a été observée. Plus de 40 % des glioblastomes étudiés en 2013 dans notre laboratoire ont présenté un gène MGMT méthylé. Nos résultats indiquent que la trousse therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen) présente des performances conformes aux exigences de qualité de la norme NF EN ISO 15189 pour l’analyse du statut de méthylation de MGMT dans les glioblastomes. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66358

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