Centre de Documentation Campus Montignies
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Revue | Revue | Centre de Documentation HELHa Campus Montignies | Armoires à volets | Disponible Disponible |
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L’analyse en composantes principales donne des résultats comparables à ceux d’une stratégie booléenne élaborée pour simplifier l’évaluation de la maladie résiduelle mesurable chez les patients atteints de leucémie lymphoïde chronique / Victor-Emmanuel Brett in Annales de Biologie Clinique, Vol.81 N°4 (juillet 2023)
[article]
Titre : L’analyse en composantes principales donne des résultats comparables à ceux d’une stratégie booléenne élaborée pour simplifier l’évaluation de la maladie résiduelle mesurable chez les patients atteints de leucémie lymphoïde chronique Type de document : texte imprimé Auteurs : Victor-Emmanuel Brett ; Marie-Sarah Dilhuydy ; Nicolas Lechevalier ; And-nan Adjibabi ; François-Xavier Gros ; Édouard Forcade ; Rémi Letestu ; Jean-Philippe Vial Année de publication : 2023 Article en page(s) : p. 379-387 Note générale : https://doi.org/10.1684/abc.2023.1826 Langues : Français (fre) Mots-clés : leucémie lymphoïde chronique maladie résiduelle mesurable cytométrie de flux analyse en composantes principales Résumé : Introduction : La maladie résiduelle détectable (MRD) prend une importance croissante dans la LLC pour sa signification pronostique en termes de survie sans progression et globale. Les méthodes standardisées d’évaluation de la MRD LLC sont basées sur la cytométrie de flux et la RT-qPCR. Nous présentons ici un test à neuf couleurs en ajoutant le marqueur ROR-1, recommandé par l’Initiative européenne de recherche (ERIC) sur la LLC ; la sensibilité est d’au moins 10-5.
Matériels et méthodes : Nous avons utilisé 54 échantillons pour développer une nouvelle méthode d’analyse en composantes principales (ACP) basée sur le mode de présentation « radar » de Kaluza©. L’acquisition a été réalisée sur un cytomètre en flux Navios (Beckman Coulter©). Résultats : Nous avons confirmé la linéarité de notre méthode et évalué les limites de spécificité (1.3×10-6) et de détection (3.6×10-6). En comparaison avec la méthode booléenne, la sensibilité, la spécificité et les valeurs prédictives positives et négatives de notre méthode ACP étaient de 100 %. Lorsque la MRD était détectable, les tests PCA et Boolean étaient corrélés (r2 = 0,99).
Conclusion : Nous présentons ici une nouvelle méthode, facile et rapide basée sur l’ACP pour la détection de la MRD dans la LLC, avec une sensibilité comparable à celle de la méthode consensuelle.Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113995
in Annales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 379-387[article] L’analyse en composantes principales donne des résultats comparables à ceux d’une stratégie booléenne élaborée pour simplifier l’évaluation de la maladie résiduelle mesurable chez les patients atteints de leucémie lymphoïde chronique [texte imprimé] / Victor-Emmanuel Brett ; Marie-Sarah Dilhuydy ; Nicolas Lechevalier ; And-nan Adjibabi ; François-Xavier Gros ; Édouard Forcade ; Rémi Letestu ; Jean-Philippe Vial . - 2023 . - p. 379-387.
https://doi.org/10.1684/abc.2023.1826
Langues : Français (fre)
in Annales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 379-387
Mots-clés : leucémie lymphoïde chronique maladie résiduelle mesurable cytométrie de flux analyse en composantes principales Résumé : Introduction : La maladie résiduelle détectable (MRD) prend une importance croissante dans la LLC pour sa signification pronostique en termes de survie sans progression et globale. Les méthodes standardisées d’évaluation de la MRD LLC sont basées sur la cytométrie de flux et la RT-qPCR. Nous présentons ici un test à neuf couleurs en ajoutant le marqueur ROR-1, recommandé par l’Initiative européenne de recherche (ERIC) sur la LLC ; la sensibilité est d’au moins 10-5.
Matériels et méthodes : Nous avons utilisé 54 échantillons pour développer une nouvelle méthode d’analyse en composantes principales (ACP) basée sur le mode de présentation « radar » de Kaluza©. L’acquisition a été réalisée sur un cytomètre en flux Navios (Beckman Coulter©). Résultats : Nous avons confirmé la linéarité de notre méthode et évalué les limites de spécificité (1.3×10-6) et de détection (3.6×10-6). En comparaison avec la méthode booléenne, la sensibilité, la spécificité et les valeurs prédictives positives et négatives de notre méthode ACP étaient de 100 %. Lorsque la MRD était détectable, les tests PCA et Boolean étaient corrélés (r2 = 0,99).
Conclusion : Nous présentons ici une nouvelle méthode, facile et rapide basée sur l’ACP pour la détection de la MRD dans la LLC, avec une sensibilité comparable à celle de la méthode consensuelle.Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113995 Réservation
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Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Armoires à volets Disponible
DisponibleValeurs de référence de la calprotectine méconiale (immuno-dosage Liaison® XL) / Charlotte Oris in Annales de Biologie Clinique, Vol.81 N°4 (juillet 2023)
[article]
Titre : Valeurs de référence de la calprotectine méconiale (immuno-dosage Liaison® XL) Type de document : texte imprimé Auteurs : Charlotte Oris ; Maguelone Pons ; Emmanuelle Rochette ; Marie Tadrent ; Julie Durif ; Bruno Pereira Année de publication : 2023 Article en page(s) : p. 388-394 Note générale : https://doi.org/10.1684/abc.2023.1831 Langues : Français (fre) Mots-clés : calprotectine fécale méconium nouveau-né Liaison XL® Résumé : Dans le cadre du diagnostic de maladies inflammatoires chroniques de l’intestin, chez l’adulte et l’enfant de plus de 4 ans, le seuil de normalité de la calprotectine fécale est fixé à 50 μg/g de selles. Les concentrations de calprotectine sont décrites comme physiologiquement supérieures chez les enfants plus jeunes, particulièrement durant la première année de vie. L’objectif de notre étude était de définir, pour la première fois, des valeurs de référence de la calprotectine méconiale dosée chez le nouveau-né avec une technique automatisée (Liaison®XL, DiaSorin). Une étude prospective a été menée à la Maternité du CHU de Clermont-Ferrand, avec inclusion de nouveau-nés à terme sans atteinte digestive. Les dosages de calprotectine ont été réalisés sur le Liaison®XL utilisé en routine dans le service de Biochimie. Au sein de notre cohorte (n = 132 nouveau-nés), l’intervalle du 2,5e au 97,5epercentile allait de 21 à 855 μg/g de méconium. À l’exception du sexe du nouveau-né, aucune différence significative des concentrations de calprotectine n’a été retrouvée pour les facteurs maternels et néonataux étudiés. Au-delà des valeurs de référence, la forte variabilité inter-individuelle du biomarqueur doit être prise en compte dans l’interprétation d’un dosage de calprotectine méconiale réalisé chez le nouveau-né. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113996
in Annales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 388-394[article] Valeurs de référence de la calprotectine méconiale (immuno-dosage Liaison® XL) [texte imprimé] / Charlotte Oris ; Maguelone Pons ; Emmanuelle Rochette ; Marie Tadrent ; Julie Durif ; Bruno Pereira . - 2023 . - p. 388-394.
https://doi.org/10.1684/abc.2023.1831
Langues : Français (fre)
in Annales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 388-394
Mots-clés : calprotectine fécale méconium nouveau-né Liaison XL® Résumé : Dans le cadre du diagnostic de maladies inflammatoires chroniques de l’intestin, chez l’adulte et l’enfant de plus de 4 ans, le seuil de normalité de la calprotectine fécale est fixé à 50 μg/g de selles. Les concentrations de calprotectine sont décrites comme physiologiquement supérieures chez les enfants plus jeunes, particulièrement durant la première année de vie. L’objectif de notre étude était de définir, pour la première fois, des valeurs de référence de la calprotectine méconiale dosée chez le nouveau-né avec une technique automatisée (Liaison®XL, DiaSorin). Une étude prospective a été menée à la Maternité du CHU de Clermont-Ferrand, avec inclusion de nouveau-nés à terme sans atteinte digestive. Les dosages de calprotectine ont été réalisés sur le Liaison®XL utilisé en routine dans le service de Biochimie. Au sein de notre cohorte (n = 132 nouveau-nés), l’intervalle du 2,5e au 97,5epercentile allait de 21 à 855 μg/g de méconium. À l’exception du sexe du nouveau-né, aucune différence significative des concentrations de calprotectine n’a été retrouvée pour les facteurs maternels et néonataux étudiés. Au-delà des valeurs de référence, la forte variabilité inter-individuelle du biomarqueur doit être prise en compte dans l’interprétation d’un dosage de calprotectine méconiale réalisé chez le nouveau-né. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113996 Réservation
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Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Armoires à volets Disponible
DisponibleConversation entre un biologiste médical et une intelligence artificielle sur les biomarqueurs du cancer de la prostate / Pierre-Jean Lamy in Annales de Biologie Clinique, Vol.81 N°4 (juillet 2023)
[article]
Titre : Conversation entre un biologiste médical et une intelligence artificielle sur les biomarqueurs du cancer de la prostate : lecture critique Type de document : texte imprimé Auteurs : Pierre-Jean Lamy Année de publication : 2023 Article en page(s) : p. 395-402 Note générale : https://doi.org/10.1684/abc.2023.1829 Langues : Français (fre) Mots-clés : intelligence artificielle biologie médicale biomarqueurs prostate cancer Résumé : L’intelligence artificielle est de plus en plus utilisée dans le domaine de la médecine comme aide au diagnostic notamment dans l’analyse d’image et plus généralement dans le traitement des données. De nombreux outils sont développés en biologie médicale mais certains plus généralistes peuvent être une aide afin d’améliorer la diffusion de ‘information médicale. Afin de tester la capacité d’un outil de conversation automatisé à répondre à des questions sur un sujet de biologie médicale comme les biomarqueurs du cancer de la prostate nous avons interrogé ChatGPT une intelligence artificielle dédiée à l’optimisation des modèles de langage pour dialoguer et nous avons analysé ses réponses. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113997
in Annales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 395-402[article] Conversation entre un biologiste médical et une intelligence artificielle sur les biomarqueurs du cancer de la prostate : lecture critique [texte imprimé] / Pierre-Jean Lamy . - 2023 . - p. 395-402.
https://doi.org/10.1684/abc.2023.1829
Langues : Français (fre)
in Annales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 395-402
Mots-clés : intelligence artificielle biologie médicale biomarqueurs prostate cancer Résumé : L’intelligence artificielle est de plus en plus utilisée dans le domaine de la médecine comme aide au diagnostic notamment dans l’analyse d’image et plus généralement dans le traitement des données. De nombreux outils sont développés en biologie médicale mais certains plus généralistes peuvent être une aide afin d’améliorer la diffusion de ‘information médicale. Afin de tester la capacité d’un outil de conversation automatisé à répondre à des questions sur un sujet de biologie médicale comme les biomarqueurs du cancer de la prostate nous avons interrogé ChatGPT une intelligence artificielle dédiée à l’optimisation des modèles de langage pour dialoguer et nous avons analysé ses réponses. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113997 Réservation
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Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Armoires à volets Disponible
DisponibleImpact des premiers mois de la pandémie de Covid-19 sur la circulation des virus respiratoires / Eric Farfour in Annales de Biologie Clinique, Vol.81 N°4 (juillet 2023)
[article]
Titre : Impact des premiers mois de la pandémie de Covid-19 sur la circulation des virus respiratoires Type de document : texte imprimé Auteurs : Eric Farfour ; Lamia Rouabah ; Pauline Bargain ; Marion Lecuru ; Colas Tcherakian ; Benjamin Maneglier Année de publication : 2023 Article en page(s) : p. 403-409 Note générale : https://doi.org/10.1684/abc.2023.1827 Langues : Français (fre) Mots-clés : influenza grippe rhinovirus VRS parainfluenza coronavirus metapneumovirus enterovirus adenovirus bocavirus SARS-CoV-2 Résumé : Objectifs : La pandémie de SARS-CoV-2 a eu un impact sur la détection des virus respiratoires saisonniers. Nous avons évalué rétrospectivement l’évolution de la détection de dix virus dans deux hôpitaux situés en région parisienne.
Méthodes : Tous les patients positifs pour un virus respiratoire dans deux hôpitaux de septembre 2016 à août 2021 ont été rétrospectivement inclus. Le taux de RT-PCR positifs pour chaque virus a été calculé pour la saison 2020-2021 et la saison 2019-2020 par rapport à une ligne de base de trois saisons, soit 2016-2017, 2017-2018 et 2018-2019.
Résultats : Au total, 7 835 patients ont été testés positifs pour au moins 1 virus respiratoire de septembre 2016 à août 2021. La détection du virus respiratoire chute considérablement en semaine 11 de 2020, tout comme le nombre de RT-PCR effectuées. Ensuite, trois tendances ont été identifiées : a) une quasi-disparition pour la grippe ; b) un retard de dix semaines dans l’épidémie saisonnière de VRS ; c) une persistance de la circulation avec une activité variable pour les autres virus. Par rapport à une ligne de base de trois saisons (2016-2019), le taux de patients positifs a été plus faible au cours de la saison 2020-2021 pour le coronavirus (4,51 % vs. 1,26 %, P < 0,0001), l’adénovirus (1,93 % vs. 1,34 %, P = 0,14), le bocavirus (0,58 % contre 0,11 %, P = 0,08) et l’entérovirus (0,28 % contre 0,0 %, P = 0,12). En revanche, le taux de patients positifs pour le métapneumovirus (1,92 % vs. 2,83 %, P = 0,03) et les virus parainfluenza (2,17 % vs. 2,99 %, P = 0,06) a augmenté.
Conclusions : La baisse de détection de virus respiratoires détectés pourrait être liée à la baisse du nombre de tests effectués et à la mise en place des mesures barrières. Ensuite, tous les virus, à l’exception de la grippe, sont détectés, ce qui suggère un impact de la forte adhésion à la vaccination antigrippale. Malgré la baisse du nombre de tests effectués, le taux de patients positifs pour les virus parainfluenza et métapneumovirus a augmenté, suggérant une circulation active de ces virus. Dans l’ensemble, ces résultats suggèrent une circulation persistante des virus respiratoires saisonnier.Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113998
in Annales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 403-409[article] Impact des premiers mois de la pandémie de Covid-19 sur la circulation des virus respiratoires [texte imprimé] / Eric Farfour ; Lamia Rouabah ; Pauline Bargain ; Marion Lecuru ; Colas Tcherakian ; Benjamin Maneglier . - 2023 . - p. 403-409.
https://doi.org/10.1684/abc.2023.1827
Langues : Français (fre)
in Annales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 403-409
Mots-clés : influenza grippe rhinovirus VRS parainfluenza coronavirus metapneumovirus enterovirus adenovirus bocavirus SARS-CoV-2 Résumé : Objectifs : La pandémie de SARS-CoV-2 a eu un impact sur la détection des virus respiratoires saisonniers. Nous avons évalué rétrospectivement l’évolution de la détection de dix virus dans deux hôpitaux situés en région parisienne.
Méthodes : Tous les patients positifs pour un virus respiratoire dans deux hôpitaux de septembre 2016 à août 2021 ont été rétrospectivement inclus. Le taux de RT-PCR positifs pour chaque virus a été calculé pour la saison 2020-2021 et la saison 2019-2020 par rapport à une ligne de base de trois saisons, soit 2016-2017, 2017-2018 et 2018-2019.
Résultats : Au total, 7 835 patients ont été testés positifs pour au moins 1 virus respiratoire de septembre 2016 à août 2021. La détection du virus respiratoire chute considérablement en semaine 11 de 2020, tout comme le nombre de RT-PCR effectuées. Ensuite, trois tendances ont été identifiées : a) une quasi-disparition pour la grippe ; b) un retard de dix semaines dans l’épidémie saisonnière de VRS ; c) une persistance de la circulation avec une activité variable pour les autres virus. Par rapport à une ligne de base de trois saisons (2016-2019), le taux de patients positifs a été plus faible au cours de la saison 2020-2021 pour le coronavirus (4,51 % vs. 1,26 %, P < 0,0001), l’adénovirus (1,93 % vs. 1,34 %, P = 0,14), le bocavirus (0,58 % contre 0,11 %, P = 0,08) et l’entérovirus (0,28 % contre 0,0 %, P = 0,12). En revanche, le taux de patients positifs pour le métapneumovirus (1,92 % vs. 2,83 %, P = 0,03) et les virus parainfluenza (2,17 % vs. 2,99 %, P = 0,06) a augmenté.
Conclusions : La baisse de détection de virus respiratoires détectés pourrait être liée à la baisse du nombre de tests effectués et à la mise en place des mesures barrières. Ensuite, tous les virus, à l’exception de la grippe, sont détectés, ce qui suggère un impact de la forte adhésion à la vaccination antigrippale. Malgré la baisse du nombre de tests effectués, le taux de patients positifs pour les virus parainfluenza et métapneumovirus a augmenté, suggérant une circulation active de ces virus. Dans l’ensemble, ces résultats suggèrent une circulation persistante des virus respiratoires saisonnier.Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113998 Réservation
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Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Armoires à volets Disponible
DisponibleL’hormone anti-mullërienne pour le diagnostic du syndrome des ovaires polykystiques / Khansa Chaabouni in Annales de Biologie Clinique, Vol.81 N°4 (juillet 2023)
[article]
Titre : L’hormone anti-mullërienne pour le diagnostic du syndrome des ovaires polykystiques Type de document : texte imprimé Auteurs : Khansa Chaabouni ; Rihab Makhlouf ; Fatma Khanfir ; CHema Mezghani ; Aida Elleuch ; Houda Ben Ayed ; Mohamed Abid Année de publication : 2023 Article en page(s) : p. 410-416 Note générale : https://doi.org/10.1684/abc.2023.1830 Langues : Français (fre) Mots-clés : syndrome des ovaires polykystiques hormone anti-müllérienne seuil diagnostic Résumé : Introduction : Le syndrome des ovaires polykystiques (SOPK) est le trouble endocrinien le plus fréquent des femmes en âge de procréer. L’hormone anti-müllérienne (AMH) a été proposée comme un test utile pour identifier les femmes atteintes du SOPK. L’objectif était de déterminer une valeur seuil d’AMH pour le diagnostic du SOPK.
Méthodes : Il s’agissait d’une étude transversale sur deux ans, incluant des femmes en âge de procréer, atteintes du SOPK selon les critères de Rotterdam 2003. Le groupe témoin de femmes en bonne santé était apparié selon l’âge. Le dosage de l’AMH a été réalisé à l’aide d’un immunodosage par électrochimiluminescence. Les niveaux d’AMH ont été comparés et évalués avec l’analyse de la courbe ROC (receiver operating characteristic).
Résultats : Au total, 65 femmes atteintes du SOPK et 65 témoins ont été incluses. L’indice de masse corporelle n’était pas statistiquement different entre les deux groupes. Le taux d’AMH étaient significativement plus élevé chez les femmes atteintes du SOPK (p = < 0,001). Les concentrations d’AMH entre les phénotypes du SOPK n’étaient pas statistiquement différentes. Un seuil de 25,1 pmol/L (3,5 ng/mL) pourrait discriminer les femmes SOPK des témoins avec une sensibilité de 74 % et une spécificité de 72,3 %. L’aire sous la courbe était de 0,811 (IC à 9 % : 0,73 à 0,88).
Conclusions : Notre étude suggère que l’AMH a un bon potentiel diagnostique en complément des critères de Rotterdam pour le diagnostic du SOPK chez les femmes en âge de procréer d’origine tunisienne.Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113999
in Annales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 410-416[article] L’hormone anti-mullërienne pour le diagnostic du syndrome des ovaires polykystiques [texte imprimé] / Khansa Chaabouni ; Rihab Makhlouf ; Fatma Khanfir ; CHema Mezghani ; Aida Elleuch ; Houda Ben Ayed ; Mohamed Abid . - 2023 . - p. 410-416.
https://doi.org/10.1684/abc.2023.1830
Langues : Français (fre)
in Annales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 410-416
Mots-clés : syndrome des ovaires polykystiques hormone anti-müllérienne seuil diagnostic Résumé : Introduction : Le syndrome des ovaires polykystiques (SOPK) est le trouble endocrinien le plus fréquent des femmes en âge de procréer. L’hormone anti-müllérienne (AMH) a été proposée comme un test utile pour identifier les femmes atteintes du SOPK. L’objectif était de déterminer une valeur seuil d’AMH pour le diagnostic du SOPK.
Méthodes : Il s’agissait d’une étude transversale sur deux ans, incluant des femmes en âge de procréer, atteintes du SOPK selon les critères de Rotterdam 2003. Le groupe témoin de femmes en bonne santé était apparié selon l’âge. Le dosage de l’AMH a été réalisé à l’aide d’un immunodosage par électrochimiluminescence. Les niveaux d’AMH ont été comparés et évalués avec l’analyse de la courbe ROC (receiver operating characteristic).
Résultats : Au total, 65 femmes atteintes du SOPK et 65 témoins ont été incluses. L’indice de masse corporelle n’était pas statistiquement different entre les deux groupes. Le taux d’AMH étaient significativement plus élevé chez les femmes atteintes du SOPK (p = < 0,001). Les concentrations d’AMH entre les phénotypes du SOPK n’étaient pas statistiquement différentes. Un seuil de 25,1 pmol/L (3,5 ng/mL) pourrait discriminer les femmes SOPK des témoins avec une sensibilité de 74 % et une spécificité de 72,3 %. L’aire sous la courbe était de 0,811 (IC à 9 % : 0,73 à 0,88).
Conclusions : Notre étude suggère que l’AMH a un bon potentiel diagnostique en complément des critères de Rotterdam pour le diagnostic du SOPK chez les femmes en âge de procréer d’origine tunisienne.Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113999 Réservation
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