Dépouillements

Métabolomique et spectrométrie de masse : de nouvelles perspectives en analyse biomédicale / Juan Manuel Chao De La Barca in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) Titre : Métabolomique et spectrométrie de masse : de nouvelles perspectives en analyse biomédicale Type de document : texte imprimé Auteurs : Juan Manuel Chao De La Barca, Auteur ; Delphine Mirebeau-Prunier, Auteur ; Valérie Moal, Auteur Année de publication : 2015 Langues : Français (fre) Mots-clés : métabolomique  métabolome  spectrométrie de masse  méthodes statistiques Résumé : La métabolomique désigne l’approche intégrative consistant à analyser de façon globale l’ensemble des petites molécules (métabolites) d’un système biologique (appelé « métabolome »). L’objectif principal de la métabolomique en médecine est la découverte de biomarqueurs métaboliques des maladies. La spectrométrie de masse (MS) couplée à la chromatographie en phase gazeuse ou liquide fait partie des techniques analytiques majeures utilisées en métabolomique. Cela étant, l’approche holistique requise par la métabolomique nécessite de très bonnes performances analytiques (colonne chromatographique et équipement de MS) et des stratégies de validation non conventionnelles. Le déroulement de l’analyse métabolomique peut être articulé en trois parties : préparation des échantillons, acquisition des données de MS et traitement associé, et enfin analyse statistique. Le traitement des données « brutes » (obtenues après l’acquisition en MS) est requis afin de normaliser les conditions chromatographiques, et de mener à bien la quantification des signaux de MS. Ces signaux résultant du traitement peuvent être identifiés ultérieurement. L’analyse statistique comprend typiquement des méthodes supervisées et non supervisées. Les méthodes supervisées tirent parti de la connaissance préalable de la variable-réponse (par exemple, cas/témoin) pour construire le modèle explicatif, tandis que les méthodes non-supervisées n’utilisent pas cette information. Lorsque l’étude est axée sur un sous-ensemble particulier de métabolites, une analyse métabolomique ciblée peut être une alternative intéressante à l’approche holistique, dans la mesure où elle peut donner accès à une quantification absolue et peut revenir moins cher. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66363 [article] Métabolomique et spectrométrie de masse : de nouvelles perspectives en analyse biomédicale [texte imprimé] / Juan Manuel Chao De La Barca, Auteur ; Delphine Mirebeau-Prunier, Auteur ; Valérie Moal, Auteur . - 2015. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) Mots-clés : métabolomique  métabolome  spectrométrie de masse  méthodes statistiques Résumé : La métabolomique désigne l’approche intégrative consistant à analyser de façon globale l’ensemble des petites molécules (métabolites) d’un système biologique (appelé « métabolome »). L’objectif principal de la métabolomique en médecine est la découverte de biomarqueurs métaboliques des maladies. La spectrométrie de masse (MS) couplée à la chromatographie en phase gazeuse ou liquide fait partie des techniques analytiques majeures utilisées en métabolomique. Cela étant, l’approche holistique requise par la métabolomique nécessite de très bonnes performances analytiques (colonne chromatographique et équipement de MS) et des stratégies de validation non conventionnelles. Le déroulement de l’analyse métabolomique peut être articulé en trois parties : préparation des échantillons, acquisition des données de MS et traitement associé, et enfin analyse statistique. Le traitement des données « brutes » (obtenues après l’acquisition en MS) est requis afin de normaliser les conditions chromatographiques, et de mener à bien la quantification des signaux de MS. Ces signaux résultant du traitement peuvent être identifiés ultérieurement. L’analyse statistique comprend typiquement des méthodes supervisées et non supervisées. Les méthodes supervisées tirent parti de la connaissance préalable de la variable-réponse (par exemple, cas/témoin) pour construire le modèle explicatif, tandis que les méthodes non-supervisées n’utilisent pas cette information. Lorsque l’étude est axée sur un sous-ensemble particulier de métabolites, une analyse métabolomique ciblée peut être une alternative intéressante à l’approche holistique, dans la mesure où elle peut donner accès à une quantification absolue et peut revenir moins cher. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66363

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Spectrométrie de masse et dépistage néonatal / Roselyne Garnotel in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 107-111 Titre : Spectrométrie de masse et dépistage néonatal Type de document : texte imprimé Auteurs : Roselyne Garnotel, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : 107-111 Langues : Français (fre) Mots-clés : dépistage néonatal  spectrométrie de masse en tandem  maladie héréditaire du métabolisme Résumé : La spectrométrie de masse permet le dépistage de nombreuses maladies héréditaires du métabolisme à partir d’une seule tache de sang déposé sur carton. Il est possible de réaliser le dépistage néonatal d’aminoacidopathies, d’aciduries organiques, de déficits de la β-oxydation des acides gras et des maladies lysosomales. Le dépistage néonatal utilisant la spectrométrie de masse en tandem n’est pas encore réalisé en France en 2014. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66364 [article] Spectrométrie de masse et dépistage néonatal [texte imprimé] / Roselyne Garnotel, Auteur . - 2015 . - 107-111. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 107-111 Mots-clés : dépistage néonatal  spectrométrie de masse en tandem  maladie héréditaire du métabolisme Résumé : La spectrométrie de masse permet le dépistage de nombreuses maladies héréditaires du métabolisme à partir d’une seule tache de sang déposé sur carton. Il est possible de réaliser le dépistage néonatal d’aminoacidopathies, d’aciduries organiques, de déficits de la β-oxydation des acides gras et des maladies lysosomales. Le dépistage néonatal utilisant la spectrométrie de masse en tandem n’est pas encore réalisé en France en 2014. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66364

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Place de la spectrométrie de masse en bactériologie / Jean-Philippe Lavigne in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 113-125 Titre : Place de la spectrométrie de masse en bactériologie Type de document : texte imprimé Auteurs : Jean-Philippe Lavigne, Auteur ; Philippe Riegel, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : 113-125 Langues : Français (fre) Mots-clés : bactériologie  spectrométrie de masse  Maldi-TOF MS, PCR/ESI-MS  technique iPlex MassArray Résumé : Récemment, différentes avancées ont été développées dans les laboratoires gérant la bactériologie dans le but de raccourcir le délai de rendu de résultats. Ces nouvelles technologies sont très prometteuses car elles permettent l’identification rapide de nombreuses bactéries, notamment celles dont la croissance est difficile ou des bactéries émergentes. Elles permettent également d’évaluer les épidémies. La spectrométrie de masse (Maldi-TOF MS) s’inscrit dans cette évolution de la bactériologie. Cette technologie précise et fiable permet d’identifier les bactéries, les champignons, les moisissures et les mycobactéries. Elle est peu coûteuse et rapide, permettant de fournir des résultats 24 heures plus tôt que les techniques traditionnelles. La gamme d’applications du Maldi-TOF MS n’a cessé de croître de l’identification rapide des espèces à des études de protéomique permettant de détecter la résistance des bactéries aux antibiotiques ou des facteurs de virulence. Le but de cette revue est de faire un état des lieux des offres actuelles de spectrométrie de masse en bactériologie, de préciser la place de cette technologie dans la routine et de présenter ses champs d’applications futurs. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66365 [article] Place de la spectrométrie de masse en bactériologie [texte imprimé] / Jean-Philippe Lavigne, Auteur ; Philippe Riegel, Auteur . - 2015 . - 113-125. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 113-125 Mots-clés : bactériologie  spectrométrie de masse  Maldi-TOF MS, PCR/ESI-MS  technique iPlex MassArray Résumé : Récemment, différentes avancées ont été développées dans les laboratoires gérant la bactériologie dans le but de raccourcir le délai de rendu de résultats. Ces nouvelles technologies sont très prometteuses car elles permettent l’identification rapide de nombreuses bactéries, notamment celles dont la croissance est difficile ou des bactéries émergentes. Elles permettent également d’évaluer les épidémies. La spectrométrie de masse (Maldi-TOF MS) s’inscrit dans cette évolution de la bactériologie. Cette technologie précise et fiable permet d’identifier les bactéries, les champignons, les moisissures et les mycobactéries. Elle est peu coûteuse et rapide, permettant de fournir des résultats 24 heures plus tôt que les techniques traditionnelles. La gamme d’applications du Maldi-TOF MS n’a cessé de croître de l’identification rapide des espèces à des études de protéomique permettant de détecter la résistance des bactéries aux antibiotiques ou des facteurs de virulence. Le but de cette revue est de faire un état des lieux des offres actuelles de spectrométrie de masse en bactériologie, de préciser la place de cette technologie dans la routine et de présenter ses champs d’applications futurs. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66365

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Spectrométrie de masse et diagnostic des maladies héréditaires du métabolisme / Gilbert Briand in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 93-106 Titre : Spectrométrie de masse et diagnostic des maladies héréditaires du métabolisme Type de document : texte imprimé Auteurs : Gilbert Briand, Auteur ; Stéphanie Lemaire-Ewing, Auteur ; Fabienne Parente, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : 93-106 Langues : Français (fre) Mots-clés : maladies héréditaires du métabolisme  spectrométrie de masse en tandem  chromatographie phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse Résumé : La spectrométrie de masse en tandem est utilisée pour le diagnostic et le suivi des maladies héréditaires du métabolisme pour le profil des acylcarnitines et couplée à la chromatographie liquide à l’exploration du métabolisme de la créatine, des acides aminés et biliaires. La chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse reste la méthode de référence pour l’analyse des acides organiques urinaires et des stérols. Ces techniques sont également utilisées pour réaliser des tests fonctionnels « in vitro ». Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66366 [article] Spectrométrie de masse et diagnostic des maladies héréditaires du métabolisme [texte imprimé] / Gilbert Briand, Auteur ; Stéphanie Lemaire-Ewing, Auteur ; Fabienne Parente, Auteur . - 2015 . - 93-106. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 93-106 Mots-clés : maladies héréditaires du métabolisme  spectrométrie de masse en tandem  chromatographie phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse Résumé : La spectrométrie de masse en tandem est utilisée pour le diagnostic et le suivi des maladies héréditaires du métabolisme pour le profil des acylcarnitines et couplée à la chromatographie liquide à l’exploration du métabolisme de la créatine, des acides aminés et biliaires. La chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse reste la méthode de référence pour l’analyse des acides organiques urinaires et des stérols. Ces techniques sont également utilisées pour réaliser des tests fonctionnels « in vitro ». Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66366

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Le dosage de la vitamine D : considérations pré-analytiques et analytiques / Caroline Le Goff in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) Titre : Le dosage de la vitamine D : considérations pré-analytiques et analytiques Type de document : texte imprimé Auteurs : Caroline Le Goff, Auteur ; Jean-Claude Souberbielle, Auteur ; Edgard Delvin, Auteur Année de publication : 2015 Langues : Français (fre) Mots-clés : vitamine D  cholécalciférol  ergocalciférol  25(OH)D  spectrométrie de masse  immuno-essais Résumé : L’augmentation constante de demandes de dosage de 25-hydroxyvitamine D sérique au cours des dernières années, a incité les fabricants de réactifs à commercialiser différentes méthodes automatisées ou semi-automatisées, qui malheureusement n’étant pas totalement harmonisées, produisent des résultats difficilement interprétables. La chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem a plus récemment été mise à contribution. Cette approche permet de doser et de distinguer non seulement les deux formes de 25-hydroxyvitamine D, mais aussi de mesurer d’autres métabolites. Cette approche cependant demande aussi une harmonisation pour amenuiser les différences entre les différentes approches analytiques. Afin de répondre à cette exigence, l’Office of dietary supplements, du National institutes of health (NIH) Américain, du CDC (Center for disease control and prevention) à Atlanta, du National institute of standards and technology (NIST) et du laboratoire de référence pour la vitamine D de l’Université de Gand ont uni leurs expertises pour développer un programme de standardisation. Le présent article revoit les grandes lignes et les problèmes des dosages automatisés et semi-automatisés de la 25-hydroxyvitamine D, de la préparation de l’échantillon à la phase analytique, ainsi que celles par spectrométrie de masse. Il traite aussi de la problématique des seuils de décision cliniques et des possibilités de dosages sur des liquides biologiques divers. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66367 [article] Le dosage de la vitamine D : considérations pré-analytiques et analytiques [texte imprimé] / Caroline Le Goff, Auteur ; Jean-Claude Souberbielle, Auteur ; Edgard Delvin, Auteur . - 2015. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) Mots-clés : vitamine D  cholécalciférol  ergocalciférol  25(OH)D  spectrométrie de masse  immuno-essais Résumé : L’augmentation constante de demandes de dosage de 25-hydroxyvitamine D sérique au cours des dernières années, a incité les fabricants de réactifs à commercialiser différentes méthodes automatisées ou semi-automatisées, qui malheureusement n’étant pas totalement harmonisées, produisent des résultats difficilement interprétables. La chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem a plus récemment été mise à contribution. Cette approche permet de doser et de distinguer non seulement les deux formes de 25-hydroxyvitamine D, mais aussi de mesurer d’autres métabolites. Cette approche cependant demande aussi une harmonisation pour amenuiser les différences entre les différentes approches analytiques. Afin de répondre à cette exigence, l’Office of dietary supplements, du National institutes of health (NIH) Américain, du CDC (Center for disease control and prevention) à Atlanta, du National institute of standards and technology (NIST) et du laboratoire de référence pour la vitamine D de l’Université de Gand ont uni leurs expertises pour développer un programme de standardisation. Le présent article revoit les grandes lignes et les problèmes des dosages automatisés et semi-automatisés de la 25-hydroxyvitamine D, de la préparation de l’échantillon à la phase analytique, ainsi que celles par spectrométrie de masse. Il traite aussi de la problématique des seuils de décision cliniques et des possibilités de dosages sur des liquides biologiques divers. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66367

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Dosages des stéroïdes par spectrométrie de masse / Diane Dufour-Rainfray in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) Titre : Dosages des stéroïdes par spectrométrie de masse Type de document : texte imprimé Auteurs : Diane Dufour-Rainfray, Auteur ; Valérie Moal, Auteur ; Lucie Cloix, Auteur Année de publication : 2015 Langues : Français (fre) Mots-clés : LC-MS/MS  cortisol  11-désoxycortisol  17-hydroxyprogestérone  testostérone Résumé : Le dosage des stéroïdes, initialement développé en radio-immunoanalyse, a été facilité par le développement des techniques d’immunoanalyse automatisées. Cependant, certaines hormones demeurent difficilement détectables en raison de leur faible concentration sanguine, de leur homologie de structure ou de la présence de molécules interférentes. La spectrométrie de masse couplée à la chromatographie liquide (LC-MS/MS) peut être considérée comme une alternative aux immunodosages. Cette approche permet le dosage simultané de plusieurs paramètres grâce à sa sélectivité amenée par le détecteur du spectromètre de masse et par la dimension séparative de la chromatographie liquide. De plus, le recours à l’UHPLC (ultra high performance liquid chromatography) permet d’améliorer la sélectivité et la sensibilité tout en limitant les volumes d’échantillons nécessaires au dosage. Les coffrets de dosage standardisés viennent progressivement compléter les techniques « maison » développées dans les laboratoires, élargissant ainsi le panel des stéroïdes dosés simultanément sur un même échantillon. Enfin, les méthodes de dosages, incluant une étape d’extraction préalable, permettent l’utilisation d’échantillons biologiques variés. Aussi, plusieurs indications cliniques peuvent tirer bénéfice de cette approche par spectrométrie de masse, notamment lorsque les concentrations des hormones recherchées sont faibles, lorsque plusieurs stéroïdes doivent être identifiés, lorsque le volume de matrice biologique est faible. Cependant, cette technologie nécessite un investissement financier important ainsi que des personnels qualifiés. De plus, certains stéroïdes sont difficiles à quantifier par spectrométrie de masse. C’est donc vraisemblablement par la complémentarité des techniques d’immunoanalyse et de spectrométrie de masse que nous répondrons le mieux aux questions cliniques posées par les stéroïdes. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66368 [article] Dosages des stéroïdes par spectrométrie de masse [texte imprimé] / Diane Dufour-Rainfray, Auteur ; Valérie Moal, Auteur ; Lucie Cloix, Auteur . - 2015. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) Mots-clés : LC-MS/MS  cortisol  11-désoxycortisol  17-hydroxyprogestérone  testostérone Résumé : Le dosage des stéroïdes, initialement développé en radio-immunoanalyse, a été facilité par le développement des techniques d’immunoanalyse automatisées. Cependant, certaines hormones demeurent difficilement détectables en raison de leur faible concentration sanguine, de leur homologie de structure ou de la présence de molécules interférentes. La spectrométrie de masse couplée à la chromatographie liquide (LC-MS/MS) peut être considérée comme une alternative aux immunodosages. Cette approche permet le dosage simultané de plusieurs paramètres grâce à sa sélectivité amenée par le détecteur du spectromètre de masse et par la dimension séparative de la chromatographie liquide. De plus, le recours à l’UHPLC (ultra high performance liquid chromatography) permet d’améliorer la sélectivité et la sensibilité tout en limitant les volumes d’échantillons nécessaires au dosage. Les coffrets de dosage standardisés viennent progressivement compléter les techniques « maison » développées dans les laboratoires, élargissant ainsi le panel des stéroïdes dosés simultanément sur un même échantillon. Enfin, les méthodes de dosages, incluant une étape d’extraction préalable, permettent l’utilisation d’échantillons biologiques variés. Aussi, plusieurs indications cliniques peuvent tirer bénéfice de cette approche par spectrométrie de masse, notamment lorsque les concentrations des hormones recherchées sont faibles, lorsque plusieurs stéroïdes doivent être identifiés, lorsque le volume de matrice biologique est faible. Cependant, cette technologie nécessite un investissement financier important ainsi que des personnels qualifiés. De plus, certains stéroïdes sont difficiles à quantifier par spectrométrie de masse. C’est donc vraisemblablement par la complémentarité des techniques d’immunoanalyse et de spectrométrie de masse que nous répondrons le mieux aux questions cliniques posées par les stéroïdes. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66368

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Quelques considérations sur la LC-MS/MS et le suivi thérapeutique pharmacologique / Franck Saint-Marcoux in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 49-53 Titre : Quelques considérations sur la LC-MS/MS et le suivi thérapeutique pharmacologique Type de document : texte imprimé Auteurs : Franck Saint-Marcoux, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : 49-53 Langues : Français (fre) Mots-clés : suivi thérapeutique pharmacologie  liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (LC-MS/MS)  pharmacologie-toxicologie Résumé : Le suivi thérapeutique pharmacologique (STP) peut se définir comme un acte qui comprend une étape de mesure de la concentration d’un médicament, une interprétation de cette concentration et un ajustement individuel de la posologie. Depuis une quinzaine d’années, les laboratoires de pharmacologie-toxicologie ont peu à peu introduit la LC-MS/MS (liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry) dans leur pratique quotidienne. Cet article discute de la place qu’occupe désormais cette technologie dans les activités de routine ayant trait au STP. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66369 [article] Quelques considérations sur la LC-MS/MS et le suivi thérapeutique pharmacologique [texte imprimé] / Franck Saint-Marcoux, Auteur . - 2015 . - 49-53. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 49-53 Mots-clés : suivi thérapeutique pharmacologie  liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (LC-MS/MS)  pharmacologie-toxicologie Résumé : Le suivi thérapeutique pharmacologique (STP) peut se définir comme un acte qui comprend une étape de mesure de la concentration d’un médicament, une interprétation de cette concentration et un ajustement individuel de la posologie. Depuis une quinzaine d’années, les laboratoires de pharmacologie-toxicologie ont peu à peu introduit la LC-MS/MS (liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry) dans leur pratique quotidienne. Cet article discute de la place qu’occupe désormais cette technologie dans les activités de routine ayant trait au STP. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66369

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Spectrométrie de masse et protéomique clinique / Bruno Baudin in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 39-48 Titre : Spectrométrie de masse et protéomique clinique Type de document : texte imprimé Auteurs : Bruno Baudin, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : 39-48 Langues : Français (fre) Mots-clés : spectrométrie de masse  protéomique  électrophorèse bidimensionnelle  Maldi-TOF  ESI-MS/MS  modifications post-traductionnelles Résumé : L’analyse protéomique a tenu ses promesses en proposant de nouveaux marqueurs des maladies et de nouvelles cibles thérapeutiques ; des progrès techniques constants la rendent de plus en plus performante. Ces progrès passent par le développement de spectromètres de masse plus précis sur la mesure de la masse, plus résolutifs sur la séparation des ions, plus sensibles sur leur détection, plus adaptés à la quantification des pics, ainsi que des appareils automatisés et conçus pour la protéomique à haut débit. Le Maldi-TOF garde une place importante en protéomique, tant pour les équipes à faible budget, que pour les laboratoires développant la quantification et le haut débit en mode TOF/TOF. La source ESI est facilement couplée à la nanoLC, méthode de choix pour le séquençage en stratégie « bottom up » avec des quadripôles (Q), des TOF ou encore des trappes d’ions en tandem. L’analyse des modifications post-traductionnelles devient possible sur la plupart des configurations de couplage MS/MS. Finalement, l’électrophorèse garde sa place comme méthode séparative performante, et la chromatographie est la source de développements constants. La protéomique a encore de beaux jours devant elle grâce aux progrès techniques multiples dont elle fait l’objet. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66370 [article] Spectrométrie de masse et protéomique clinique [texte imprimé] / Bruno Baudin, Auteur . - 2015 . - 39-48. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 39-48 Mots-clés : spectrométrie de masse  protéomique  électrophorèse bidimensionnelle  Maldi-TOF  ESI-MS/MS  modifications post-traductionnelles Résumé : L’analyse protéomique a tenu ses promesses en proposant de nouveaux marqueurs des maladies et de nouvelles cibles thérapeutiques ; des progrès techniques constants la rendent de plus en plus performante. Ces progrès passent par le développement de spectromètres de masse plus précis sur la mesure de la masse, plus résolutifs sur la séparation des ions, plus sensibles sur leur détection, plus adaptés à la quantification des pics, ainsi que des appareils automatisés et conçus pour la protéomique à haut débit. Le Maldi-TOF garde une place importante en protéomique, tant pour les équipes à faible budget, que pour les laboratoires développant la quantification et le haut débit en mode TOF/TOF. La source ESI est facilement couplée à la nanoLC, méthode de choix pour le séquençage en stratégie « bottom up » avec des quadripôles (Q), des TOF ou encore des trappes d’ions en tandem. L’analyse des modifications post-traductionnelles devient possible sur la plupart des configurations de couplage MS/MS. Finalement, l’électrophorèse garde sa place comme méthode séparative performante, et la chromatographie est la source de développements constants. La protéomique a encore de beaux jours devant elle grâce aux progrès techniques multiples dont elle fait l’objet. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66370

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Le prélèvement sanguin sur papier buvard : une révolution de la biologie médicale en marche ? / Christophe Hirtz in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 25-37 Titre : Le prélèvement sanguin sur papier buvard : une révolution de la biologie médicale en marche ? Type de document : texte imprimé Auteurs : Christophe Hirtz, Auteur ; Sylvain Lehmann, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : 25-37 Langues : Français (fre) Mots-clés : dried blood spot  pré-analytique  PCR  spectrométrie de masse  Elisa  multiplexe Résumé : L’analyse de sang déposé et séché sur un papier buvard (dried blood spot ou DBS) est utilisée depuis les années 1960 en analyse clinique, principalement dans le cadre du dépistage néonatal (test de Guthrie). Depuis lors, de nombreux analytes cliniques tels que les acides nucléiques, les petites molécules ou les lipides, ont été mesurés avec succès sur les DBS. Bien que cette méthode pré-analytique représente une alternative intéressante aux prélèvements sanguins classiques, son utilisation en routine est encore limitée. Nous passons ici en revue les applications du prélèvement sanguin sur DBS en analyse clinique et nous évaluerons sa place dans le futur, soutenue par les nouvelles méthodes d’analyse comme la spectrométrie de masse LC-MS. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66371 [article] Le prélèvement sanguin sur papier buvard : une révolution de la biologie médicale en marche ? [texte imprimé] / Christophe Hirtz, Auteur ; Sylvain Lehmann, Auteur . - 2015 . - 25-37. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 25-37 Mots-clés : dried blood spot  pré-analytique  PCR  spectrométrie de masse  Elisa  multiplexe Résumé : L’analyse de sang déposé et séché sur un papier buvard (dried blood spot ou DBS) est utilisée depuis les années 1960 en analyse clinique, principalement dans le cadre du dépistage néonatal (test de Guthrie). Depuis lors, de nombreux analytes cliniques tels que les acides nucléiques, les petites molécules ou les lipides, ont été mesurés avec succès sur les DBS. Bien que cette méthode pré-analytique représente une alternative intéressante aux prélèvements sanguins classiques, son utilisation en routine est encore limitée. Nous passons ici en revue les applications du prélèvement sanguin sur DBS en analyse clinique et nous évaluerons sa place dans le futur, soutenue par les nouvelles méthodes d’analyse comme la spectrométrie de masse LC-MS. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66371

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Préparation d’échantillon et bioanalyse en spectrométrie de masse / Emmanuel Bourgogne in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 11-23 Titre : Préparation d’échantillon et bioanalyse en spectrométrie de masse Type de document : texte imprimé Auteurs : Emmanuel Bourgogne, Auteur ; Michel Wagner, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : 11-23 Langues : Français (fre) Mots-clés : spectrométrie de masse  quantification  fluides biologiques  bioanalyse Résumé : L’analyse quantitative de composés d’intérêt clinique de basses masses moléculaires (< 1 000 Da) dans des fluides biologiques est actuellement effectuée le plus souvent par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS). L’analyse de ces composés dans les fluides biologiques (plasma, urine, salive, cheveux…) est une tâche difficile nécessitant une préparation d’échantillon préalable. Sans séparation chromatographique, divers interférents (e.g., composés endogènes de la matrice, espèces isobariques) co-éluent de fait avec les analytes d’intérêt, et risquent de dégrader les performances quantitatives d’une méthode en spectrométrie de masse. Une première section présentera les matrices et les différentes techniques de préparation d’échantillon actuellement utilisées en bioanalyse pour la quantification par spectrométrie de masse de petites molécules d’intérêt clinique dans des fluides biologiques. Dans une seconde section les buts de la préparation d’échantillon seront détaillés. Une troisième section discutera des stratégies de préparation d’échantillon injection directe ou après précipitation. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66372 [article] Préparation d’échantillon et bioanalyse en spectrométrie de masse [texte imprimé] / Emmanuel Bourgogne, Auteur ; Michel Wagner, Auteur . - 2015 . - 11-23. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 11-23 Mots-clés : spectrométrie de masse  quantification  fluides biologiques  bioanalyse Résumé : L’analyse quantitative de composés d’intérêt clinique de basses masses moléculaires (< 1 000 Da) dans des fluides biologiques est actuellement effectuée le plus souvent par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS). L’analyse de ces composés dans les fluides biologiques (plasma, urine, salive, cheveux…) est une tâche difficile nécessitant une préparation d’échantillon préalable. Sans séparation chromatographique, divers interférents (e.g., composés endogènes de la matrice, espèces isobariques) co-éluent de fait avec les analytes d’intérêt, et risquent de dégrader les performances quantitatives d’une méthode en spectrométrie de masse. Une première section présentera les matrices et les différentes techniques de préparation d’échantillon actuellement utilisées en bioanalyse pour la quantification par spectrométrie de masse de petites molécules d’intérêt clinique dans des fluides biologiques. Dans une seconde section les buts de la préparation d’échantillon seront détaillés. Une troisième section discutera des stratégies de préparation d’échantillon injection directe ou après précipitation. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66372

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Les applications de la spectrométrie de masse en biologie médicale en 2015 / Bourgogne in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 7-126 Titre : Les applications de la spectrométrie de masse en biologie médicale en 2015 Type de document : texte imprimé Auteurs : Bourgogne, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : 7-126 Langues : Français (fre) Mots-clés : fondements de la phydique  applications en biologie médicale  spectrométrie de masse  préparation de l'echantillon  bioanalyse  prélèvement sanguins sur papier buvard  protéomique clinique  considérations LC-MS/MS  toxicologie clinique et analytique des opiacés  dosage des stéroïdes par SM  dosage de la vitamine D  diagnostic des maladies héréditaires du métabolisme  dépistage néonatal  bactériologie Résumé : L’histoire de la spectrométrie de masse débute au crépuscule du XIXe siècle lorsque Sir Joseph J. Thompson, au laboratoire Cavendish de l’Université de Cambridge découvre l’électron en 1897. Cette découverte le mena au début du XXe siècle à construire le premier spectromètre de masse, appelé à l’époque le spectrographe parabolique (figure 1), qui lui permit de déterminer les rapports masse/charge ionique, qui lui valut en 1906 le prix Nobel de physique [1].Le professeur [...] Note de contenu : SOMMAIRE Éditorial Article R’évolution de la biologie médicale : la SFBC et Euromedlab’15 (p.5) Joëlle Goudable Introduction Article La spectrométrie de masse : des fondements de la physique à l’application en biologie médicale (p.7-9) Roselyne Garnotel, Edgard Delvin Synthèses Article Préparation d’échantillon et bioanalyse en spectrométrie de masse (p.11-23) Emmanuel Bourgogne, Michel Wagner Article Le prélèvement sanguin sur papier buvard : une révolution de la biologie médicale en marche ? (p.25-37) Christophe Hirtz, Sylvain Lehmann Article Spectrométrie de masse et protéomique clinique (p.39-48) Bruno Baudin Article Quelques considérations sur la LC-MS/MS et le suivi thérapeutique pharmacologique (p.49-53) Franck Saint-Marcoux Article Toxicologie clinique et analytique des opiacés, de la cocaïne et des amphétamines (p.54-69) Catherine Feliu, Aurélie Fouley, Hervé Millart, Claire Gozalo, Hélène Marty, Zoubir Djerada Article Dosages des stéroïdes par spectrométrie de masse (p.70-8) Diane Dufour-Rainfray, Valérie Moal, Lucie Cloix, Elisabeth Mathieu, Anne-Sophie Gauchez, Julie Brossaud, Jean-Benoît Corcuff, François Fraissinet, Christine Collet, Florence Boux de Casson, Denis Guilloteau, Patrick Emond, Pascal Reynier En accès libre Le dosage de la vitamine D : considérations pré-analytiques et analytiques (p.79-92) Caroline Le Goff, Jean-Claude Souberbielle, Edgard Delvin, Étienne Cavalier Article Spectrométrie de masse et diagnostic des maladies héréditaires du métabolisme (p.93-106) Gilbert Briand, Stéphanie Lemaire-Ewing, Fabienne Parente, Roselyne Garnotel Article Spectrométrie de masse et dépistage néonatal (p.107-11) Roselyne Garnotel Article Place de la spectrométrie de masse en bactériologie (p.113-25) Jean-Philippe Lavigne, Philippe Riegel Article Métabolomique et spectrométrie de masse : de nouvelles perspectives en analyse biomédicale (p.126-30) Juan Manuel Chao De La Barca, Delphine Mirebeau-Prunier, Valérie Moal, Pascal Reynier, Roselyne Garnotel, Gilles Simard Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=74242 [article] Les applications de la spectrométrie de masse en biologie médicale en 2015 [texte imprimé] / Bourgogne, Auteur . - 2015 . - 7-126. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 7-126 Mots-clés : fondements de la phydique  applications en biologie médicale  spectrométrie de masse  préparation de l'echantillon  bioanalyse  prélèvement sanguins sur papier buvard  protéomique clinique  considérations LC-MS/MS  toxicologie clinique et analytique des opiacés  dosage des stéroïdes par SM  dosage de la vitamine D  diagnostic des maladies héréditaires du métabolisme  dépistage néonatal  bactériologie Résumé : L’histoire de la spectrométrie de masse débute au crépuscule du XIXe siècle lorsque Sir Joseph J. Thompson, au laboratoire Cavendish de l’Université de Cambridge découvre l’électron en 1897. Cette découverte le mena au début du XXe siècle à construire le premier spectromètre de masse, appelé à l’époque le spectrographe parabolique (figure 1), qui lui permit de déterminer les rapports masse/charge ionique, qui lui valut en 1906 le prix Nobel de physique [1].Le professeur [...] Note de contenu : SOMMAIRE Éditorial Article R’évolution de la biologie médicale : la SFBC et Euromedlab’15 (p.5) Joëlle Goudable Introduction Article La spectrométrie de masse : des fondements de la physique à l’application en biologie médicale (p.7-9) Roselyne Garnotel, Edgard Delvin Synthèses Article Préparation d’échantillon et bioanalyse en spectrométrie de masse (p.11-23) Emmanuel Bourgogne, Michel Wagner Article Le prélèvement sanguin sur papier buvard : une révolution de la biologie médicale en marche ? (p.25-37) Christophe Hirtz, Sylvain Lehmann Article Spectrométrie de masse et protéomique clinique (p.39-48) Bruno Baudin Article Quelques considérations sur la LC-MS/MS et le suivi thérapeutique pharmacologique (p.49-53) Franck Saint-Marcoux Article Toxicologie clinique et analytique des opiacés, de la cocaïne et des amphétamines (p.54-69) Catherine Feliu, Aurélie Fouley, Hervé Millart, Claire Gozalo, Hélène Marty, Zoubir Djerada Article Dosages des stéroïdes par spectrométrie de masse (p.70-8) Diane Dufour-Rainfray, Valérie Moal, Lucie Cloix, Elisabeth Mathieu, Anne-Sophie Gauchez, Julie Brossaud, Jean-Benoît Corcuff, François Fraissinet, Christine Collet, Florence Boux de Casson, Denis Guilloteau, Patrick Emond, Pascal Reynier En accès libre Le dosage de la vitamine D : considérations pré-analytiques et analytiques (p.79-92) Caroline Le Goff, Jean-Claude Souberbielle, Edgard Delvin, Étienne Cavalier Article Spectrométrie de masse et diagnostic des maladies héréditaires du métabolisme (p.93-106) Gilbert Briand, Stéphanie Lemaire-Ewing, Fabienne Parente, Roselyne Garnotel Article Spectrométrie de masse et dépistage néonatal (p.107-11) Roselyne Garnotel Article Place de la spectrométrie de masse en bactériologie (p.113-25) Jean-Philippe Lavigne, Philippe Riegel Article Métabolomique et spectrométrie de masse : de nouvelles perspectives en analyse biomédicale (p.126-30) Juan Manuel Chao De La Barca, Delphine Mirebeau-Prunier, Valérie Moal, Pascal Reynier, Roselyne Garnotel, Gilles Simard Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=74242

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Toxicologie clinique et analytique des opiacés, de la cocaïne et des amphétamines / Catherine Feliu in Annales de Biologie Clinique, 73/1 (Janvier - Février 2015)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 54-69 Titre : Toxicologie clinique et analytique des opiacés, de la cocaïne et des amphétamines Type de document : texte imprimé Auteurs : Catherine Feliu, Auteur ; Aurélie Fouley, Auteur ; Hervé Millart, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : 54-69 Langues : Français (fre) Mots-clés : stupéfiants  sang  chromatographie en phase liquide  chromatographie en phase gazeuse  spectrométrie de masse Résumé : Les méthodes analytiques à disposition de l’analyste évoluent en permanence. La connaissance des limites des techniques mises en œuvre et la maîtrise de l’interprétation des résultats sont incontournables pour les cliniciens comme pour les biologistes. L’immunoanalyse garde une place importante dans l’examen toxicologique des différents milieux biologiques. Mais son usage impose systématiquement la confirmation par des techniques de référence de chromatographie couplée à des détecteurs de haute spécificité comme les spectromètres de masse. Les stupéfiants peuvent être recherchés dans plusieurs circonstances : conduite sous l’empire d’une substance stupéfiante, accident de la voie publique, soumission chimique, dopage, recherche des causes de la mort. Le sang total est la matrice biologique de choix pour la quantification des stupéfiants comme la cocaïne, les amphétamines, les opiacés et le cannabis. C’est en effet le seul milieu qui permet de mettre en évidence une association entre la concentration mesurée donnée et la prise récente d’une substance. La chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (GC-MS) est la méthode de référence pour le dosage des stupéfiants dans le sang total. Depuis quelques années, de nouvelles technologies sont mises à disposition des biologistes et des cliniciens. Il s’agit de la chromatographie liquide couplée à un spectromètre de masse (LC/MS) ou à un spectromètre de masse en tandem (LC/MS/MS). Cet article propose de décrire l’état de l’art sur les différentes techniques de confirmation par spectrométrie de masse utilisées pour la quantification des stupéfiants dits classiques à l’exception du cannabis. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=74670 [article] Toxicologie clinique et analytique des opiacés, de la cocaïne et des amphétamines [texte imprimé] / Catherine Feliu, Auteur ; Aurélie Fouley, Auteur ; Hervé Millart, Auteur . - 2015 . - 54-69. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 73/1 (Janvier - Février 2015) . - 54-69 Mots-clés : stupéfiants  sang  chromatographie en phase liquide  chromatographie en phase gazeuse  spectrométrie de masse Résumé : Les méthodes analytiques à disposition de l’analyste évoluent en permanence. La connaissance des limites des techniques mises en œuvre et la maîtrise de l’interprétation des résultats sont incontournables pour les cliniciens comme pour les biologistes. L’immunoanalyse garde une place importante dans l’examen toxicologique des différents milieux biologiques. Mais son usage impose systématiquement la confirmation par des techniques de référence de chromatographie couplée à des détecteurs de haute spécificité comme les spectromètres de masse. Les stupéfiants peuvent être recherchés dans plusieurs circonstances : conduite sous l’empire d’une substance stupéfiante, accident de la voie publique, soumission chimique, dopage, recherche des causes de la mort. Le sang total est la matrice biologique de choix pour la quantification des stupéfiants comme la cocaïne, les amphétamines, les opiacés et le cannabis. C’est en effet le seul milieu qui permet de mettre en évidence une association entre la concentration mesurée donnée et la prise récente d’une substance. La chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (GC-MS) est la méthode de référence pour le dosage des stupéfiants dans le sang total. Depuis quelques années, de nouvelles technologies sont mises à disposition des biologistes et des cliniciens. Il s’agit de la chromatographie liquide couplée à un spectromètre de masse (LC/MS) ou à un spectromètre de masse en tandem (LC/MS/MS). Cet article propose de décrire l’état de l’art sur les différentes techniques de confirmation par spectrométrie de masse utilisées pour la quantification des stupéfiants dits classiques à l’exception du cannabis. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=74670

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