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13 résultat(s) recherche sur le mot-clé 'plasmide'
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Construction génétique de la protéine C-GFP du virus BVDV / Virginie Coorens
Titre : Construction génétique de la protéine C-GFP du virus BVDV Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Virginie Coorens, Année de publication : 2016 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : Biologie médicale ASBL Culture in vivo Nivelles virus BVD flaviviridae génome viral cycle du virus traduction du génome du virus infection virale transmission virale vaccination transfection passage des cellules microscopie a fluorescence PCR électrophorèse sur gel d'agarose midiprep plasmide plasmide vecteur ligation bactéries compétentes transformation bactérienne miniprep Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Remerciements....................................................................................................................................... 3
Présentation de l’ASBL Culture in vivo .............................................................................................. 7
Introduction ........................................................................................................................................... 9
Partie théorique ................................................................................................................................... 11
1) Historique ................................................................................................................................. 11
2) Caractéristiques d’un virus .................................................................................................... 11
3) Structure du virus BVD .......................................................................................................... 12
3.1) Famille des Flaviviridae .................................................................................................... 12
3.2) Génome viral ..................................................................................................................... 14
3.3) Cycle du virus .................................................................................................................... 15
3.4) Traduction du génome du virus BVD................................................................................ 16
4) Description du virus BVD ....................................................................................................... 17
4.1) Différentes étapes d’une infection virale ........................................................................... 18
4.2) Transmission ..................................................................................................................... 18
4.3) Différence entre un animal infecté de manière permanente et transitoire ......................... 20
5) Diagnostic ................................................................................................................................. 20
6) Prévention ................................................................................................................................ 23
6.1) Prise en charge des bovins ..................................................................................................... 23
6.2) Vaccination ............................................................................................................................ 23
7) Présentation des plasmides utilisés ........................................................................................ 25
Partie pratique ..................................................................................................................................... 27
1) Objectif et stratégie ................................................................................................................. 27
2) Matériel et méthodes ............................................................................................................... 28
2.1) Techniques associées à la culture cellulaire ...................................................................... 28
a) Passage des cellules ............................................................................................................... 28
b) Transfection ........................................................................................................................... 28
c) Microscopie à fluorescence ................................................................................................... 29
2.2) Techniques associées à la biologie moléculaire ................................................................ 29
a) Midiprep ................................................................................................................................ 29
b) PCR : Polymerase Chain Reaction ........................................................................................ 29
c) Electrophorèse sur gel d’agarose ........................................................................................... 31
d) Préparation du plasmide vecteur pEGFP-N1 par BamHI et HindIII ..................................... 32
Vérification de la double digestion du plasmide pEGFP-N1 ................................................ 32
Préparation du plasmide vecteur ........................................................................................... 32
e) Concentration du plasmide vecteur pEFGP-N1 .................................................................... 32
f) Ligation ................................................................................................................................. 32
g) Préparation des bactéries compétentes .................................................................................. 32
h) Transformation bactérienne ................................................................................................... 32
i) Miniprep ................................................................................................................................ 33
3) Résultats ................................................................................................................................... 34
a) Stratégie de la construction génétique ................................................................................... 34
b) Vérification du plasmide pEGFP-N1 .................................................................................... 36
Transfection des cellules COS-7 ........................................................................................... 36
Electrophorèse sur gel d’agarose ........................................................................................... 36
Spectrophotométrie ............................................................................................................... 37
c) Amplification de l’insert (gène C) par PCR .......................................................................... 38
d) Double digestion du plasmide pEGFP-N1 par BamHI et HindIII ......................................... 39
e) Préparation du plasmide vecteur pEGFP-N1 par les enzymes de restriction BamHI et HindIII ………………………………………………………………………………………………………………………………………….40
f) Double digestion du produit PCR par BamHI et HindIII .......................................................... 41
g) Digestion enzymatique du produit PCR par BamHI et HindIII ............................................ 43
h) Ligation ................................................................................................................................. 44
i) Transformation bactérienne ................................................................................................... 45
j) Criblage par miniprep ............................................................................................................ 45
k) Transfection ........................................................................................................................... 49
4) Discussion ................................................................................................................................. 50
Conclusion et perspectives .................................................................................................................. 53
Annexes ................................................................................................................................................ 55
Annexe 1 : Carte du plasmide pEGFP-N1 ............................................................................ 55
Annexe 2 : Mode opératoire ................................................................................................... 56
Annexe 3 : Préparation de différentes solutions ................................................................... 64
Liste des figures ................................................................................................................................... 67
Liste des tableaux ................................................................................................................................ 69
Liste des abréviations .......................................................................................................................... 71
Bibliographie ........................................................................................................................................ 73Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65664 Construction génétique de la protéine C-GFP du virus BVDV [TFE / Mémoire] / Virginie Coorens, . - 2016.
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Langues : Français (fre)
Mots-clés : Biologie médicale ASBL Culture in vivo Nivelles virus BVD flaviviridae génome viral cycle du virus traduction du génome du virus infection virale transmission virale vaccination transfection passage des cellules microscopie a fluorescence PCR électrophorèse sur gel d'agarose midiprep plasmide plasmide vecteur ligation bactéries compétentes transformation bactérienne miniprep Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Remerciements....................................................................................................................................... 3
Présentation de l’ASBL Culture in vivo .............................................................................................. 7
Introduction ........................................................................................................................................... 9
Partie théorique ................................................................................................................................... 11
1) Historique ................................................................................................................................. 11
2) Caractéristiques d’un virus .................................................................................................... 11
3) Structure du virus BVD .......................................................................................................... 12
3.1) Famille des Flaviviridae .................................................................................................... 12
3.2) Génome viral ..................................................................................................................... 14
3.3) Cycle du virus .................................................................................................................... 15
3.4) Traduction du génome du virus BVD................................................................................ 16
4) Description du virus BVD ....................................................................................................... 17
4.1) Différentes étapes d’une infection virale ........................................................................... 18
4.2) Transmission ..................................................................................................................... 18
4.3) Différence entre un animal infecté de manière permanente et transitoire ......................... 20
5) Diagnostic ................................................................................................................................. 20
6) Prévention ................................................................................................................................ 23
6.1) Prise en charge des bovins ..................................................................................................... 23
6.2) Vaccination ............................................................................................................................ 23
7) Présentation des plasmides utilisés ........................................................................................ 25
Partie pratique ..................................................................................................................................... 27
1) Objectif et stratégie ................................................................................................................. 27
2) Matériel et méthodes ............................................................................................................... 28
2.1) Techniques associées à la culture cellulaire ...................................................................... 28
a) Passage des cellules ............................................................................................................... 28
b) Transfection ........................................................................................................................... 28
c) Microscopie à fluorescence ................................................................................................... 29
2.2) Techniques associées à la biologie moléculaire ................................................................ 29
a) Midiprep ................................................................................................................................ 29
b) PCR : Polymerase Chain Reaction ........................................................................................ 29
c) Electrophorèse sur gel d’agarose ........................................................................................... 31
d) Préparation du plasmide vecteur pEGFP-N1 par BamHI et HindIII ..................................... 32
Vérification de la double digestion du plasmide pEGFP-N1 ................................................ 32
Préparation du plasmide vecteur ........................................................................................... 32
e) Concentration du plasmide vecteur pEFGP-N1 .................................................................... 32
f) Ligation ................................................................................................................................. 32
g) Préparation des bactéries compétentes .................................................................................. 32
h) Transformation bactérienne ................................................................................................... 32
i) Miniprep ................................................................................................................................ 33
3) Résultats ................................................................................................................................... 34
a) Stratégie de la construction génétique ................................................................................... 34
b) Vérification du plasmide pEGFP-N1 .................................................................................... 36
Transfection des cellules COS-7 ........................................................................................... 36
Electrophorèse sur gel d’agarose ........................................................................................... 36
Spectrophotométrie ............................................................................................................... 37
c) Amplification de l’insert (gène C) par PCR .......................................................................... 38
d) Double digestion du plasmide pEGFP-N1 par BamHI et HindIII ......................................... 39
e) Préparation du plasmide vecteur pEGFP-N1 par les enzymes de restriction BamHI et HindIII ………………………………………………………………………………………………………………………………………….40
f) Double digestion du produit PCR par BamHI et HindIII .......................................................... 41
g) Digestion enzymatique du produit PCR par BamHI et HindIII ............................................ 43
h) Ligation ................................................................................................................................. 44
i) Transformation bactérienne ................................................................................................... 45
j) Criblage par miniprep ............................................................................................................ 45
k) Transfection ........................................................................................................................... 49
4) Discussion ................................................................................................................................. 50
Conclusion et perspectives .................................................................................................................. 53
Annexes ................................................................................................................................................ 55
Annexe 1 : Carte du plasmide pEGFP-N1 ............................................................................ 55
Annexe 2 : Mode opératoire ................................................................................................... 56
Annexe 3 : Préparation de différentes solutions ................................................................... 64
Liste des figures ................................................................................................................................... 67
Liste des tableaux ................................................................................................................................ 69
Liste des abréviations .......................................................................................................................... 71
Bibliographie ........................................................................................................................................ 73Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65664 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Rôle du plasmide de la souche Bacillus amyloliquefaciens S499 dans les interactions au sein de la rhizosphère / BRIEUC VAN HASSEL
Titre : Rôle du plasmide de la souche Bacillus amyloliquefaciens S499 dans les interactions au sein de la rhizosphère Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : BRIEUC VAN HASSEL, Auteur Année de publication : 2016 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : AGRONOMIE AIBT Gembloux Agro-Biotech plasmide rhizosphère Bacillus amyloliquefaciens S499 Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Note de contenu : Table des matières
Remerciements ........................................................................................................................ 3
Table des matières ................................................................................................................... 4
Introduction générale ............................................................................................................... 7
1. Contexte général .............................................................................................................. 9
1.1. La rhizosphère .......................................................................................................... 9
1.2. Les PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) ................................................. 9
1.2.1. Mécanismes d’aide à la croissance d’espèces végétales ............................... 10
1.2.1.1. Mécanismes directs ................................................................................ 11
1.2.1.2. Mécanismes indirects ............................................................................. 11
1.3. Les Bacillus et leurs lipopeptides............................................................................ 13
1.3.1. Les surfactines ................................................................................................ 15
1.3.2. L’iturine........................................................................................................... 16
1.3.3. La fengycine .................................................................................................... 17
1.4. Bacillus amyloliquefaciens...................................................................................... 18
1.4.1. La souche FZB42 ............................................................................................. 19
1.4.2. La souche S499 ............................................................................................... 20
2. Objectifs et stratégie ...................................................................................................... 21
3. Matériel .......................................................................................................................... 23
3.1. Centrifugeuse ......................................................................................................... 23
3.2. Spectromètre UV-visible ........................................................................................ 23
3.3. SpectraMax ............................................................................................................. 24
3.4. Acquity class H UPLC Waters .................................................................................. 24
3.5. Sonicateur............................................................................................................... 25
3.6. NanoDrop 2000 ...................................................................................................... 26
3.7. StepOnePlus REAL-Time PCR System ..................................................................... 26
3.8. La souche 14A ......................................................................................................... 27 3.9. Graines de tomate (Solanum lycopersicum) et de tabac (Nicotiana tabacum) ..... 28
3.10. Fusarium oxysporum et Cladosporum cucumerinum ........................................ 28
4. Résultats ......................................................................................................................... 29
4.1. Influence du plasmide de la souche S499 (pS499) sur la colonisation et la production de lipopeptides in planta ................................................................................. 29
4.1.1. Tests sur tabac ................................................................................................ 29
4.1.2. Tests sur tomate ............................................................................................. 31
5
4.2. Croissance et production de lipopeptides ex vivo sur milieu « exudats recomposés » ..................................................................................................................... 36
4.2.1. Tests sur LB .................................................................................................... 36
4.2.2. Tests sur RE .................................................................................................... 37
4.3. Influence du plasmide sur les propriétés antagonistes de S499 ........................... 40
4.3.1. Antagonismes sur milieu LBA ......................................................................... 40
4.3.2. Antagonismes sur milieu REA ........................................................................ 43
5. Discussion ....................................................................................................................... 46
5.1. Implication du plasmide dans la colonisation de la rhizosphère ........................... 46
5.2. Implication du plasmide dans la production de lipopeptides ................................ 47
Conclusion et perspectives .................................................................................................... 49
Abréviations ........................................................................................................................... 50
Liste des figures ..................................................................................................................... 51
Liste des tableaux ................................................................................................................... 53
Bibliographie .......................................................................................................................... 54
Annexes .................................................................................................................................. 55Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65738 Rôle du plasmide de la souche Bacillus amyloliquefaciens S499 dans les interactions au sein de la rhizosphère [TFE / Mémoire] / BRIEUC VAN HASSEL, Auteur . - 2016.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur
Langues : Français (fre)
Mots-clés : AGRONOMIE AIBT Gembloux Agro-Biotech plasmide rhizosphère Bacillus amyloliquefaciens S499 Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Note de contenu : Table des matières
Remerciements ........................................................................................................................ 3
Table des matières ................................................................................................................... 4
Introduction générale ............................................................................................................... 7
1. Contexte général .............................................................................................................. 9
1.1. La rhizosphère .......................................................................................................... 9
1.2. Les PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) ................................................. 9
1.2.1. Mécanismes d’aide à la croissance d’espèces végétales ............................... 10
1.2.1.1. Mécanismes directs ................................................................................ 11
1.2.1.2. Mécanismes indirects ............................................................................. 11
1.3. Les Bacillus et leurs lipopeptides............................................................................ 13
1.3.1. Les surfactines ................................................................................................ 15
1.3.2. L’iturine........................................................................................................... 16
1.3.3. La fengycine .................................................................................................... 17
1.4. Bacillus amyloliquefaciens...................................................................................... 18
1.4.1. La souche FZB42 ............................................................................................. 19
1.4.2. La souche S499 ............................................................................................... 20
2. Objectifs et stratégie ...................................................................................................... 21
3. Matériel .......................................................................................................................... 23
3.1. Centrifugeuse ......................................................................................................... 23
3.2. Spectromètre UV-visible ........................................................................................ 23
3.3. SpectraMax ............................................................................................................. 24
3.4. Acquity class H UPLC Waters .................................................................................. 24
3.5. Sonicateur............................................................................................................... 25
3.6. NanoDrop 2000 ...................................................................................................... 26
3.7. StepOnePlus REAL-Time PCR System ..................................................................... 26
3.8. La souche 14A ......................................................................................................... 27 3.9. Graines de tomate (Solanum lycopersicum) et de tabac (Nicotiana tabacum) ..... 28
3.10. Fusarium oxysporum et Cladosporum cucumerinum ........................................ 28
4. Résultats ......................................................................................................................... 29
4.1. Influence du plasmide de la souche S499 (pS499) sur la colonisation et la production de lipopeptides in planta ................................................................................. 29
4.1.1. Tests sur tabac ................................................................................................ 29
4.1.2. Tests sur tomate ............................................................................................. 31
5
4.2. Croissance et production de lipopeptides ex vivo sur milieu « exudats recomposés » ..................................................................................................................... 36
4.2.1. Tests sur LB .................................................................................................... 36
4.2.2. Tests sur RE .................................................................................................... 37
4.3. Influence du plasmide sur les propriétés antagonistes de S499 ........................... 40
4.3.1. Antagonismes sur milieu LBA ......................................................................... 40
4.3.2. Antagonismes sur milieu REA ........................................................................ 43
5. Discussion ....................................................................................................................... 46
5.1. Implication du plasmide dans la colonisation de la rhizosphère ........................... 46
5.2. Implication du plasmide dans la production de lipopeptides ................................ 47
Conclusion et perspectives .................................................................................................... 49
Abréviations ........................................................................................................................... 50
Liste des figures ..................................................................................................................... 51
Liste des tableaux ................................................................................................................... 53
Bibliographie .......................................................................................................................... 54
Annexes .................................................................................................................................. 55Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65738 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Bases moléculaires de la pathogénicité des Salmonella in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses, SPECIAL MARS (1992)
[article]
Titre : Bases moléculaires de la pathogénicité des Salmonella Type de document : texte imprimé Année de publication : 1992 Article en page(s) : 310 - 324 Mots-clés : SALMONELLOSE VIRULENCE GENETIQUE REGULATION PLASMIDE Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=67043
in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses > SPECIAL MARS (1992) . - 310 - 324[article] Bases moléculaires de la pathogénicité des Salmonella [texte imprimé] . - 1992 . - 310 - 324.
in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses > SPECIAL MARS (1992) . - 310 - 324
Mots-clés : SALMONELLOSE VIRULENCE GENETIQUE REGULATION PLASMIDE Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=67043 Exemplaires (1)
Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Réserve Consultable sur demande auprès des documentalistes
Exclu du prêtBeta-lactamase plasmidique (AmpC) chez un Proteus mirabilis en Tunisie in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses, 6 (1999)
[article]
Titre : Beta-lactamase plasmidique (AmpC) chez un Proteus mirabilis en Tunisie Type de document : texte imprimé Année de publication : 1999 Article en page(s) : 415 - 417 Mots-clés : ANTIBIOTIQUES RESISTANCE AUX BETA LACTAMINES PLASMIDE Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=69679
in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses > 6 (1999) . - 415 - 417[article] Beta-lactamase plasmidique (AmpC) chez un Proteus mirabilis en Tunisie [texte imprimé] . - 1999 . - 415 - 417.
in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses > 6 (1999) . - 415 - 417
Mots-clés : ANTIBIOTIQUES RESISTANCE AUX BETA LACTAMINES PLASMIDE Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=69679 Réservation
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Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Réserve Empruntable sur demande auprès des documentalistes
DisponibleBIOLOGIE MOLECULAIRE : Concepts - Techniques - Applications / BRODEUR Joëlle. et TOUSSAINT Martin
Titre : BIOLOGIE MOLECULAIRE : Concepts - Techniques - Applications Type de document : texte imprimé Auteurs : BRODEUR Joëlle. et TOUSSAINT Martin, Année de publication : 2007 Mots-clés : BIOLOGIE MOLECULAIRE ADN ARN PROTEINES ENZYMES MUTATIONS CLONAGE MOLECULAIRE GEL AGAROSE E COLI PLASMIDE PCR SONDES NUCLEIQUES SEQUENCAGE ADN EXTRACTION Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=64508 BIOLOGIE MOLECULAIRE : Concepts - Techniques - Applications [texte imprimé] / BRODEUR Joëlle. et TOUSSAINT Martin, . - 2007.Réservation
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Cote Support Localisation Section Disponibilité BIO 0153 Livre Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Réserve Empruntable sur demande auprès des documentalistes
DisponibleCaracteristics of the antibiotic resistance plasmid in Salmonella thyphi isolated in Tunis in 1990 in Annales de Biologie Clinique, 2 (1994)
PermalinkComprendre l'antibiorésistance en décryptant ses mécanismes moléculaires / Jean-Yves MADEC in Le Point vétérinaire Expert Canin, 344 (Avril 2014)
PermalinkMutagenesis of the nopM and nopL genes of Sinorhizobium fredii HH103 / DAHL Ellen
PermalinkPlasmid - mediated extended spectrum beta - lactamases in MMI / Médecine et Maladies Infectieuses, HORS SERIE JUIN (1992)
PermalinkProduction et purification de l'intégrase du VIH-1 en vue d'études enzymatiques et structurales. / TENAGLIA Sara
Permalink