Centre de Documentation Campus Montignies
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Auteur Pierre-Yves NOERENS |
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Détection de pathogènes dans les selles: jusqu'où l'automatisation est-elle possible ? / Pierre-Yves NOERENS
Titre : Détection de pathogènes dans les selles: jusqu'où l'automatisation est-elle possible ? Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Pierre-Yves NOERENS, Auteur Année de publication : 2016 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale CNDG Gosselies selle automatisation campylobacter parasitologie virologie rotavirus adénovirus identification chimiluminescence ETI-MAX ELISA Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Présentation générale du lieu de stage : ................................................................................................... 1
Présentation du laboratoire : .................................................................................................................... 2
Introduction ............................................................................................................................................. 3
Partie théorique........................................................................................................................................ 5
Chapitre I : Description des agents pathogènes traités ............................................................................ 7
1.1. Bactériologie : Le Campylobacter : ........................................................................................ 7
1.2. Parasitologie : .......................................................................................................................... 8
1.2.1. Le Cryptosporidium parvum : ......................................................................................... 8
1.2.2. L’Entamoeba histolytica : ................................................................................................ 9
1.2.3. Le Giardia lamblia ou Giardia intestinalis : ................................................................. 10
1.2.4. Le Blastocystis hominis : ............................................................................................... 11
1.3. Virologie : Rotavirus et adénovirus : ..................................................................................... 12
1.3.1. Introduction : ................................................................................................................. 12
1.3.2. Généralités sur les virus : .............................................................................................. 12
1.3.3. Rotavirus : ..................................................................................................................... 13
1.3.3.1. Généralités et structure : ........................................................................................ 13
1.3.3.2. Mode de transmission : .......................................................................................... 14
1.3.3.3. Cycle viral : ........................................................................................................... 14
1.3.3.4. Epidémiologie, tropisme et lieu d’infection : ........................................................ 15
1.3.3.5. Symptômes et risque de l’infection : ..................................................................... 16
1.3.3.6. Prévention de l’infection : ..................................................................................... 16
1.3.3.7. Traitement : ........................................................................................................... 16
1.3.4. Adénovirus humain (HAdVs) : ..................................................................................... 17
1.3.4.1. Généralités et structure : ........................................................................................ 17
1.3.4.2. Mode de transmission : .......................................................................................... 18
1.3.4.3. Cycle viral : ........................................................................................................... 19
1.3.4.4. Epidémiologie, tropisme et lieu d’infection : ........................................................ 20
1.3.4.5. Symptômes et risque de l’infection : ..................................................................... 20
1.3.4.6. Prévention de l’infection : ..................................................................................... 20
1.3.4.7. Traitement : ........................................................................................................... 20
Partie pratique........................................................................................................................................ 21
Chapitre II : Matériel et méthode .......................................................................................................... 23
2.1. Aperçu des méthodes d’identification en routine à la CNDG : ............................................. 23
2.2. Description des méthodes de routine : ................................................................................... 23
2.2.1. Méthode d’identification du Campylobacter : ............................................................... 23
2.2.2. Méthode d’identification des rotavirus et adénovirus : ................................................. 24
2.2.3. Méthode d’identification des parasites : ........................................................................ 25
2.3. Description des nouvelles méthodes évaluées : ..................................................................... 26
2.3.1. Le Liaison® Analyzer : ................................................................................................. 27
2.3.1.1. Composition du Liaison® : ................................................................................... 27
2.3.1.2. Matériel pour une analyse sur Liaison® : .............................................................. 28
2.3.1.3. La chimiluminescence : ......................................................................................... 29
2.3.1.4. Principe de fonctionnement du Liaison® : ............................................................ 31
2.3.1.5. Mode opératoire : .................................................................................................. 31
2.3.2. L’ETI-Max 3000® : ...................................................................................................... 34
2.3.2.1. Composition de l’ETI-Max : ................................................................................. 34
2.3.2.2. Matériel pour une analyse sur ETI-Max : .............................................................. 35
2.3.2.3. L’ELISA : .............................................................................................................. 35
2.3.2.4. Principe de fonctionnement de l’ETI-Max : .......................................................... 36
2.3.2.5. Mode opératoire : .................................................................................................. 36
Chapitre III : Résultats et interprétation ................................................................................................ 39
3.1. But de cette étude : ................................................................................................................ 39
3.2. L’échantillonnage : ................................................................................................................ 39
3.3. Analyse des populations et des échantillons : ....................................................................... 40
3.3.1. Pour le Campylobacter : ................................................................................................ 40
3.3.2. Pour les rotavirus et adénovirus : .................................................................................. 41
3.3.3. Pour les parasites : ......................................................................................................... 42
3.4. Rappel et définitions : ............................................................................................................ 43
3.4.1. La sensibilité d’un test : ................................................................................................. 43
3.4.2. La spécificité d’un test : ................................................................................................ 43
3.4.3. La valeur prédictive positive ou VPP : .......................................................................... 43
3.4.4. La valeur prédictive négative ou VPN : ........................................................................ 43
3.5. Résultats et interprétations : .................................................................................................. 44
3.5.1. Pour le Campylobacter : ................................................................................................ 44
3.5.2. Pour le rotavirus et l’adénovirus : ................................................................................. 47
3.5.3. Pour les parasites : ......................................................................................................... 50
3.5.3.1. Blastocystis hominis : ............................................................................................ 50
3.5.3.2. Entamoeba : ........................................................................................................... 53
3.5.3.3. Giardia : ................................................................................................................ 55
3.5.3.4. Cryptosporidium parvum : .................................................................................... 56
3.6. Discussion : ........................................................................................................................... 58
Conclusion ..............................................................................................................................61Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65683 Détection de pathogènes dans les selles: jusqu'où l'automatisation est-elle possible ? [TFE / Mémoire] / Pierre-Yves NOERENS, Auteur . - 2016.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale CNDG Gosselies selle automatisation campylobacter parasitologie virologie rotavirus adénovirus identification chimiluminescence ETI-MAX ELISA Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Présentation générale du lieu de stage : ................................................................................................... 1
Présentation du laboratoire : .................................................................................................................... 2
Introduction ............................................................................................................................................. 3
Partie théorique........................................................................................................................................ 5
Chapitre I : Description des agents pathogènes traités ............................................................................ 7
1.1. Bactériologie : Le Campylobacter : ........................................................................................ 7
1.2. Parasitologie : .......................................................................................................................... 8
1.2.1. Le Cryptosporidium parvum : ......................................................................................... 8
1.2.2. L’Entamoeba histolytica : ................................................................................................ 9
1.2.3. Le Giardia lamblia ou Giardia intestinalis : ................................................................. 10
1.2.4. Le Blastocystis hominis : ............................................................................................... 11
1.3. Virologie : Rotavirus et adénovirus : ..................................................................................... 12
1.3.1. Introduction : ................................................................................................................. 12
1.3.2. Généralités sur les virus : .............................................................................................. 12
1.3.3. Rotavirus : ..................................................................................................................... 13
1.3.3.1. Généralités et structure : ........................................................................................ 13
1.3.3.2. Mode de transmission : .......................................................................................... 14
1.3.3.3. Cycle viral : ........................................................................................................... 14
1.3.3.4. Epidémiologie, tropisme et lieu d’infection : ........................................................ 15
1.3.3.5. Symptômes et risque de l’infection : ..................................................................... 16
1.3.3.6. Prévention de l’infection : ..................................................................................... 16
1.3.3.7. Traitement : ........................................................................................................... 16
1.3.4. Adénovirus humain (HAdVs) : ..................................................................................... 17
1.3.4.1. Généralités et structure : ........................................................................................ 17
1.3.4.2. Mode de transmission : .......................................................................................... 18
1.3.4.3. Cycle viral : ........................................................................................................... 19
1.3.4.4. Epidémiologie, tropisme et lieu d’infection : ........................................................ 20
1.3.4.5. Symptômes et risque de l’infection : ..................................................................... 20
1.3.4.6. Prévention de l’infection : ..................................................................................... 20
1.3.4.7. Traitement : ........................................................................................................... 20
Partie pratique........................................................................................................................................ 21
Chapitre II : Matériel et méthode .......................................................................................................... 23
2.1. Aperçu des méthodes d’identification en routine à la CNDG : ............................................. 23
2.2. Description des méthodes de routine : ................................................................................... 23
2.2.1. Méthode d’identification du Campylobacter : ............................................................... 23
2.2.2. Méthode d’identification des rotavirus et adénovirus : ................................................. 24
2.2.3. Méthode d’identification des parasites : ........................................................................ 25
2.3. Description des nouvelles méthodes évaluées : ..................................................................... 26
2.3.1. Le Liaison® Analyzer : ................................................................................................. 27
2.3.1.1. Composition du Liaison® : ................................................................................... 27
2.3.1.2. Matériel pour une analyse sur Liaison® : .............................................................. 28
2.3.1.3. La chimiluminescence : ......................................................................................... 29
2.3.1.4. Principe de fonctionnement du Liaison® : ............................................................ 31
2.3.1.5. Mode opératoire : .................................................................................................. 31
2.3.2. L’ETI-Max 3000® : ...................................................................................................... 34
2.3.2.1. Composition de l’ETI-Max : ................................................................................. 34
2.3.2.2. Matériel pour une analyse sur ETI-Max : .............................................................. 35
2.3.2.3. L’ELISA : .............................................................................................................. 35
2.3.2.4. Principe de fonctionnement de l’ETI-Max : .......................................................... 36
2.3.2.5. Mode opératoire : .................................................................................................. 36
Chapitre III : Résultats et interprétation ................................................................................................ 39
3.1. But de cette étude : ................................................................................................................ 39
3.2. L’échantillonnage : ................................................................................................................ 39
3.3. Analyse des populations et des échantillons : ....................................................................... 40
3.3.1. Pour le Campylobacter : ................................................................................................ 40
3.3.2. Pour les rotavirus et adénovirus : .................................................................................. 41
3.3.3. Pour les parasites : ......................................................................................................... 42
3.4. Rappel et définitions : ............................................................................................................ 43
3.4.1. La sensibilité d’un test : ................................................................................................. 43
3.4.2. La spécificité d’un test : ................................................................................................ 43
3.4.3. La valeur prédictive positive ou VPP : .......................................................................... 43
3.4.4. La valeur prédictive négative ou VPN : ........................................................................ 43
3.5. Résultats et interprétations : .................................................................................................. 44
3.5.1. Pour le Campylobacter : ................................................................................................ 44
3.5.2. Pour le rotavirus et l’adénovirus : ................................................................................. 47
3.5.3. Pour les parasites : ......................................................................................................... 50
3.5.3.1. Blastocystis hominis : ............................................................................................ 50
3.5.3.2. Entamoeba : ........................................................................................................... 53
3.5.3.3. Giardia : ................................................................................................................ 55
3.5.3.4. Cryptosporidium parvum : .................................................................................... 56
3.6. Discussion : ........................................................................................................................... 58
Conclusion ..............................................................................................................................61Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65683 Exemplaires
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