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Exemplaires (1)
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T_4524 | T_2011_3 | Revue | Tournai | Soins infirmiers (T) | Disponible |

[article]
Titre : |
La comparaison et le typage microbien en 2022 |
Type de document : |
texte imprimé |
Auteurs : |
Jean-Winoc Decousser, Auteur |
Année de publication : |
2022 |
Article en page(s) : |
p. 369-373 |
Langues : |
Français (fre) |
Catégories : |
Alpha M:Micro-organisme ; M:Microbiologie ; S:Séquençage du génome ; T:Technique de laboratoire ; T:Typage microbien
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Résumé : |
Pour ce second volet, nous allons aborder les techniques de typage et de comparaison de souches microbiennes disponibles et utilisées en 2022. Historiquement, la comparaison des souches ou isolats a concerné très majoritairement les bactéries : les techniques, nombreuses quoique le plus souvent artisanales (dites « maison »), étaient relativement faciles d’accès. Leur interprétation était néanmoins difficile et leurs résultats variables selon les laboratoires. Certaines approches étaient pourtant standardisées, certains fabricants de réactifs de laboratoire commercialisant des trousses prêtes à l’emploi voire des solutions complètement intégrées. Concernant les virus, la comparaison des isolats viraux a très longtemps été réservée aux centres de référence qui utilisaient la technique de séquençage d’un gène ou d’une partie précise du génome viral. La pandémie de SARS–CoV-21 a démocratisé le séquençage donc le typage des isolats et les comparaisons inter-échantillons des séquences d’intérêt. Pour les champignons et les parasites, les difficultés de réalisation et d’interprétation ont conduit à réserver cette activité aux centres hyperspécialisés et notamment aux centres nationaux de référence. Ce domaine de la microbiologie a connu sa révolution au début des années 2000 avec l’apparition, le développement puis la diffusion des techniques de séquençage de nouvelle génération (Next generation sequencing [NGS]) [1]. Ces techniques permettent de séquencer en même temps une grande quantité de matériel génétique pour ensuite reconstruire tout ou partie du génome des micro-organismes. La « déferlante » du NGS a tout emporté sur son passage et, au moins pour les bactéries, a remplacé la quasi-totalité des autres méthodes de comparaison des souches. Nous aurons l’occasion dans un prochain article de revenir sur la révolution technique apportée par le NGS.
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Permalink : |
http://cdocs.helha.be/pmbtournai/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=51877 |
in Hygiènes > Vol. XXX, n°6 (Décembre 2022) . - p. 369-373
[article] La comparaison et le typage microbien en 2022 [texte imprimé] / Jean-Winoc Decousser, Auteur . - 2022 . - p. 369-373. Langues : Français ( fre) in Hygiènes > Vol. XXX, n°6 (Décembre 2022) . - p. 369-373
Catégories : |
Alpha M:Micro-organisme ; M:Microbiologie ; S:Séquençage du génome ; T:Technique de laboratoire ; T:Typage microbien
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Résumé : |
Pour ce second volet, nous allons aborder les techniques de typage et de comparaison de souches microbiennes disponibles et utilisées en 2022. Historiquement, la comparaison des souches ou isolats a concerné très majoritairement les bactéries : les techniques, nombreuses quoique le plus souvent artisanales (dites « maison »), étaient relativement faciles d’accès. Leur interprétation était néanmoins difficile et leurs résultats variables selon les laboratoires. Certaines approches étaient pourtant standardisées, certains fabricants de réactifs de laboratoire commercialisant des trousses prêtes à l’emploi voire des solutions complètement intégrées. Concernant les virus, la comparaison des isolats viraux a très longtemps été réservée aux centres de référence qui utilisaient la technique de séquençage d’un gène ou d’une partie précise du génome viral. La pandémie de SARS–CoV-21 a démocratisé le séquençage donc le typage des isolats et les comparaisons inter-échantillons des séquences d’intérêt. Pour les champignons et les parasites, les difficultés de réalisation et d’interprétation ont conduit à réserver cette activité aux centres hyperspécialisés et notamment aux centres nationaux de référence. Ce domaine de la microbiologie a connu sa révolution au début des années 2000 avec l’apparition, le développement puis la diffusion des techniques de séquençage de nouvelle génération (Next generation sequencing [NGS]) [1]. Ces techniques permettent de séquencer en même temps une grande quantité de matériel génétique pour ensuite reconstruire tout ou partie du génome des micro-organismes. La « déferlante » du NGS a tout emporté sur son passage et, au moins pour les bactéries, a remplacé la quasi-totalité des autres méthodes de comparaison des souches. Nous aurons l’occasion dans un prochain article de revenir sur la révolution technique apportée par le NGS.
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Permalink : |
http://cdocs.helha.be/pmbtournai/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=51877 |
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Exemplaires (1)
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T009837 | HYG | Revue | Tournai | Soins infirmiers (T) | Exclu du prêt |

Exemplaires (2)
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M006086 | REV | Revue | Mouscron | Soins Infirmiers (M) | Disponible |
T009201 | REV | Revue | Tournai | Soins infirmiers (T) | Disponible |

(2015)
Titre : |
L'homme microbiotique |
Type de document : |
texte imprimé |
Auteurs : |
Patrice Debré, Auteur |
Editeur : |
Paris : Odile Jacob |
Année de publication : |
2015 |
Importance : |
279 p. |
ISBN/ISSN/EAN : |
978-2-7381-3337-3 |
Catégories : |
Alpha A:Alimentation ; A:Allergie ; B:Bactérie ; F:Flore intestinale ; I:Immunologie ; M:Micro-organisme ; M:Microbiologie ; M:Microbiote ; S:Système immunitaire
|
Résumé : |
« Ce livre présente pour la première fois les mille et une facettes de la vie en commun de l homme et des microbes. Le microbiote est l une des plus fascinantes énigmes du vivant. Tenter d en révéler quelques-uns des aspects, c est entrer au coeur du mystère, c est dévoiler que l homme n est pas seul mais qu il doit aux multitudes de bactéries, qui vivent pour lui et avec lui, d avoir franchi les milliards d années qui le séparent de leur première rencontre. Au-delà, il y a, pour celui qui observe, l extraordinaire aventure du système immunitaire, qui apprend par les micro-organismes qu il tolère à résister à ceux qui lui sont dangereux. J ai souhaité donner une autre vision des microbes, de ceux qui, étrangers et nôtres, nous habitent et sans lesquels nous ne pourrions vivre. Notre futur dépend de cet indispensable partenariat. » P. D. |
Permalink : |
http://cdocs.helha.be/pmbtournai/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=29570 |
L'homme microbiotique [texte imprimé] / Patrice Debré, Auteur . - Paris : Odile Jacob, 2015 . - 279 p. ISBN : 978-2-7381-3337-3
Catégories : |
Alpha A:Alimentation ; A:Allergie ; B:Bactérie ; F:Flore intestinale ; I:Immunologie ; M:Micro-organisme ; M:Microbiologie ; M:Microbiote ; S:Système immunitaire
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Résumé : |
« Ce livre présente pour la première fois les mille et une facettes de la vie en commun de l homme et des microbes. Le microbiote est l une des plus fascinantes énigmes du vivant. Tenter d en révéler quelques-uns des aspects, c est entrer au coeur du mystère, c est dévoiler que l homme n est pas seul mais qu il doit aux multitudes de bactéries, qui vivent pour lui et avec lui, d avoir franchi les milliards d années qui le séparent de leur première rencontre. Au-delà, il y a, pour celui qui observe, l extraordinaire aventure du système immunitaire, qui apprend par les micro-organismes qu il tolère à résister à ceux qui lui sont dangereux. J ai souhaité donner une autre vision des microbes, de ceux qui, étrangers et nôtres, nous habitent et sans lesquels nous ne pourrions vivre. Notre futur dépend de cet indispensable partenariat. » P. D. |
Permalink : |
http://cdocs.helha.be/pmbtournai/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=29570 |
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Exemplaires (1)
|
M004243 | 616.90/007 | Livre | Mouscron | Soins Infirmiers (M) | Disponible |

Exemplaires (1)
|
T006390 | INF | Revue | Tournai | Soins infirmiers (T) | Disponible |
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