Centre de Documentation Campus Montignies
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Lundi : 8h-18h30
Mardi : 8h-18h30
Mercredi 9h-16h30
Jeudi : 8h-18h30
Vendredi : 8h-16h30
Attention, votre centre de documentation sera fermé du 27/04 au 12/05 inclus.
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2 résultat(s) recherche sur le mot-clé 'laboratoire de biologie moléculaire.'
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Évaluation d’un rôle cytoplasmique des protéines DUX4 et DUX4c, impliquées dans la dystrophie musculaire FSHD, par l’étude de partenaires protéiques et ARN / Maëlle Sciot
Titre : Évaluation d’un rôle cytoplasmique des protéines DUX4 et DUX4c, impliquées dans la dystrophie musculaire FSHD, par l’étude de partenaires protéiques et ARN Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Maëlle Sciot, Auteur ; Frédérick COPPEE, Directeur de la recherche Année de publication : 2017 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Université de Mons laboratoire de biologie moléculaire. Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Remerciements
Présentation du lieu de stage
Introduction ........................................................................................................................ 9
Contexte théorique ............................................................................................................ 9
1. Muscle strié squelettique ............................................................................................ 9
1.1 Structure microscopique ..................................................................................... 9
1.2 Myoblastes ......................................................................................................... 10
2. FSHD .......................................................................................................................... 11
2.1 Signes cliniques .................................................................................................. 11
2.2 Traitement ......................................................................................................... 13
2.3 Cause génétique ................................................................................................ 13
2.3.1 La FSHD 1 ................................................................................................. 13
2.3.2 La FSHD 2 ................................................................................................. 14
2.3.3 Condition permissive : signal de polyadénylation en aval de D4Z4 ........ 16
3. Les gènes DUX4 ......................................................................................................... 17
4. Protéines partenaires de DUX4 et DUX4c ................................................................. 19
4.1 Protéines associées au cytosquelette ................................................................ 19
4.1.1 Desmine ................................................................................................... 19
4.1.2 Dynéine .................................................................................................... 20
4.2 Protéines associées aux ARN ............................................................................. 20
4.2.1 IGF2BP1 .................................................................................................... 21
5. Hypothèse du laboratoire sur le rôle cytoplasmique des protéines DUX ................. 23
Objectifs et stratégies....................................................................................................... 25
Matériel et méthode ........................................................................................................ 21
1.Culture cellulaire ........................................................................................................ 26
1.1 Culture de myoblastes in vitro ........................................................................... 26
1.2 Transfection de myoblastes immortalisés ......................................................... 27
1.3 Test mycoplasme ............................................................................................... 28
1.3.1 PCR ........................................................................................................... 28
1.3.2 Electrophorèse sur gel d’agarose ........................................................... 29
2. Immunofluorescence................................................................................................. 29
3. In situ PLA .................................................................................................................. 31
4. RT-qPCR ..................................................................................................................... 32
Résultats ........................................................................................................................... 34
1. Localisation des partenaires protéiques de DUX4 ................................................... 34
1.1 Localisation d’IGF2BP1 et de la dynéine dans les cellules musculaires saines . 34
1.1.1 Prolifération ............................................................................................. 34
1.1.2 Différenciation ......................................................................................... 34
1.2 Localisation d’IGF2BP1 et de la dynéine dans les cellules musculaires FSHD ... 36
1.2.1 Prolifération ............................................................................................. 36
1.2.2 Différenciation ......................................................................................... 36
2. Détermination du domaine d’interaction de DUX4 avec les partenaires protéiques IGF2BP1 et ILF3 .............................................................................................................. 38
2.1 IGF2BP1 .............................................................................................................. 39
2.1 ILF3 ..................................................................................................................... 40
3. Détermination des interactions protéiques (DUX4 et partenaires) dans les myotubes FSHD ............................................................................................................. 41
3.1 Interactions protéiques avec DUX4 endogène .................................................. 42
3.2 Interactions entre différentes protéines partenaires potentiels ...................... 43
4. Expression de H19, ARN lié à IGF2BP1, dans les cellules musculaires saines et FSHD ....................................................................................................................................... 44
5. Validation d’amorces permettant l’amplification d’ARNs liés à IGF2BP1 ................. 45
Discussion ......................................................................................................................... 48
1. Localisation des partenaires protéiques de DUX4 ................................................... 48
2. Détermination du domaine d’interaction de DUX4 avec les partenaires protéiques IGF2BP1 et ILF3 .............................................................................................................. 49
2.1 IGF2BP1 .............................................................................................................. 49
2.1 ILF3 ..................................................................................................................... 50
3. Détermination des interactions protéiques (DUX4 et partenaires) dans les myotubes FSHD ............................................................................................................. 50
3.1 Interactions protéiques avec DUX4 endogène .................................................. 51
3.2 Interactions entre différentes protéines partenaires potentiels ...................... 51
4. Expression de H19, ARN lié à IGF2BP1, dans les cellules musculaires saines et FSHD ....................................................................................................................................... 52
5. Validation d’amorces permettant l’amplification d’ARNs liés à IGF2BP1 .................... 53
Conclusion ......................................................................................................................... 55
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65852 Évaluation d’un rôle cytoplasmique des protéines DUX4 et DUX4c, impliquées dans la dystrophie musculaire FSHD, par l’étude de partenaires protéiques et ARN [TFE / Mémoire] / Maëlle Sciot, Auteur ; Frédérick COPPEE, Directeur de la recherche . - 2017.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale Université de Mons laboratoire de biologie moléculaire. Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Remerciements
Présentation du lieu de stage
Introduction ........................................................................................................................ 9
Contexte théorique ............................................................................................................ 9
1. Muscle strié squelettique ............................................................................................ 9
1.1 Structure microscopique ..................................................................................... 9
1.2 Myoblastes ......................................................................................................... 10
2. FSHD .......................................................................................................................... 11
2.1 Signes cliniques .................................................................................................. 11
2.2 Traitement ......................................................................................................... 13
2.3 Cause génétique ................................................................................................ 13
2.3.1 La FSHD 1 ................................................................................................. 13
2.3.2 La FSHD 2 ................................................................................................. 14
2.3.3 Condition permissive : signal de polyadénylation en aval de D4Z4 ........ 16
3. Les gènes DUX4 ......................................................................................................... 17
4. Protéines partenaires de DUX4 et DUX4c ................................................................. 19
4.1 Protéines associées au cytosquelette ................................................................ 19
4.1.1 Desmine ................................................................................................... 19
4.1.2 Dynéine .................................................................................................... 20
4.2 Protéines associées aux ARN ............................................................................. 20
4.2.1 IGF2BP1 .................................................................................................... 21
5. Hypothèse du laboratoire sur le rôle cytoplasmique des protéines DUX ................. 23
Objectifs et stratégies....................................................................................................... 25
Matériel et méthode ........................................................................................................ 21
1.Culture cellulaire ........................................................................................................ 26
1.1 Culture de myoblastes in vitro ........................................................................... 26
1.2 Transfection de myoblastes immortalisés ......................................................... 27
1.3 Test mycoplasme ............................................................................................... 28
1.3.1 PCR ........................................................................................................... 28
1.3.2 Electrophorèse sur gel d’agarose ........................................................... 29
2. Immunofluorescence................................................................................................. 29
3. In situ PLA .................................................................................................................. 31
4. RT-qPCR ..................................................................................................................... 32
Résultats ........................................................................................................................... 34
1. Localisation des partenaires protéiques de DUX4 ................................................... 34
1.1 Localisation d’IGF2BP1 et de la dynéine dans les cellules musculaires saines . 34
1.1.1 Prolifération ............................................................................................. 34
1.1.2 Différenciation ......................................................................................... 34
1.2 Localisation d’IGF2BP1 et de la dynéine dans les cellules musculaires FSHD ... 36
1.2.1 Prolifération ............................................................................................. 36
1.2.2 Différenciation ......................................................................................... 36
2. Détermination du domaine d’interaction de DUX4 avec les partenaires protéiques IGF2BP1 et ILF3 .............................................................................................................. 38
2.1 IGF2BP1 .............................................................................................................. 39
2.1 ILF3 ..................................................................................................................... 40
3. Détermination des interactions protéiques (DUX4 et partenaires) dans les myotubes FSHD ............................................................................................................. 41
3.1 Interactions protéiques avec DUX4 endogène .................................................. 42
3.2 Interactions entre différentes protéines partenaires potentiels ...................... 43
4. Expression de H19, ARN lié à IGF2BP1, dans les cellules musculaires saines et FSHD ....................................................................................................................................... 44
5. Validation d’amorces permettant l’amplification d’ARNs liés à IGF2BP1 ................. 45
Discussion ......................................................................................................................... 48
1. Localisation des partenaires protéiques de DUX4 ................................................... 48
2. Détermination du domaine d’interaction de DUX4 avec les partenaires protéiques IGF2BP1 et ILF3 .............................................................................................................. 49
2.1 IGF2BP1 .............................................................................................................. 49
2.1 ILF3 ..................................................................................................................... 50
3. Détermination des interactions protéiques (DUX4 et partenaires) dans les myotubes FSHD ............................................................................................................. 50
3.1 Interactions protéiques avec DUX4 endogène .................................................. 51
3.2 Interactions entre différentes protéines partenaires potentiels ...................... 51
4. Expression de H19, ARN lié à IGF2BP1, dans les cellules musculaires saines et FSHD ....................................................................................................................................... 52
5. Validation d’amorces permettant l’amplification d’ARNs liés à IGF2BP1 .................... 53
Conclusion ......................................................................................................................... 55
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65852 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Utilisation de la droplet digital PCR (ddPCR) pour l’analyse des mutations composites de BCR-ABL1 dans les leucémies myéloïdes chroniques résistantes et la détection de gènes de fusion dans le cancer du poumon. / Esra ACIKGOZ
Titre : Utilisation de la droplet digital PCR (ddPCR) pour l’analyse des mutations composites de BCR-ABL1 dans les leucémies myéloïdes chroniques résistantes et la détection de gènes de fusion dans le cancer du poumon. Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Esra ACIKGOZ, Auteur ; Pascal Vannuffel, Directeur de la recherche Année de publication : 2017 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Institut de Pathologie et de génétique laboratoire de biologie moléculaire. Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : TABLE DES MATIÈRES
PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE .............................................................................................. 9
INTRODUCTION GENERALE ........................................................................................................... 11
INTRODUCTION THÉORIQUE ......................................................................................................... 13
1. Les acides nucléiques .............................................................................................................. 13
1.1. Définition ........................................................................................................................... 13
1.2. Structure de l’ADN ............................................................................................................ 13
1.3. Le gène .............................................................................................................................. 14
2. Les mutations ............................................................................................................................ 14
3. Leucémie myéloïde chronique .................................................................................................. 17
3.1. Caractéristiques cliniques ................................................................................................. 17
3.2. Mécanisme moléculaire ..................................................................................................... 17
3.3. Traitement et mécanisme de résistance ............................................................................. 19
3.3.1. Mécanisme d’action................................................................................................... 19
3.3.2. Mécanisme de résistance ........................................................................................... 20
4. Cancer du poumon non à petites cellules .................................................................................. 21
4.1. Définition ........................................................................................................................... 21
4.2. Anatomopathologie............................................................................................................ 21
4.3. Analyse moléculaire .......................................................................................................... 22
4.3.1. Structure des gènes .................................................................................................... 22
4.3.2. Les oncogènes et leurs impacts ................................................................................. 23
4.3.2.1. Gène de fusion ROS1-SCL34A2 ........................................................................... 23
4.3.2.2. Gène de fusion EML4-ALK .................................................................................. 24
4.4. Traitement ......................................................................................................................... 25
5. Droplet Digital PCR ................................................................................................................. 27
5.1. Introduction ....................................................................................................................... 27
5.2. Appareillage ...................................................................................................................... 27
5.2.1. Composants du système ............................................................................................ 27
5.2.2. Principe du fonctionnement ....................................................................................... 28
5.2.2.1. Étape 1 : Préparation de l’échantillon .................................................................... 28
5.2.2.2. Étape 2 : Le générateur de gouttelettes .................................................................. 29
5.2.2.3. Étape 3 : La réaction PCR ..................................................................................... 30
5.2.2.4. Étape 4 : Lecture des gouttelettes .......................................................................... 31
5.2.2.5. Analyse des résultats ............................................................................................. 32
OBJECTIFS ET STRATÉGIES ............................................................................................................ 35
MATERIELS – METHODES ............................................................................................................... 37
1. Droplet Digital PCR .................................................................................................................. 37
1.1. Matériels et réactifs ........................................................................................................... 37
1.2. Méthodes ........................................................................................................................... 38
1.2.1. Méthode manuelle ..................................................................................................... 38
1.2.2. Méthode automatique ................................................................................................ 40
2. PCR en temps réelle (RQ-PCR) ................................................................................................ 41
2.1. Principe ................................................................................................................................. 41
2.2. Matériels ................................................................................................................................. 41
2.3. Méthode .................................................................................................................................. 42
RESULTATS ........................................................................................................................................ 43
1. Leucémie myéloïde chronique : le gène BCR-ABL1 ................................................................ 43
1.1. Localisation clonale de la mutation à pourcentage égal .................................................... 43
1.2. Localisation clonale de la mutation à pourcentage différent ............................................. 46
1.2. Essai sur des échantillons cliniques ................................................................................... 49
2. Cancer du poumon non à petites cellules : ROS1-SCL34A2 et ................................................ 52
2.1. Détection de translocations connues ...................................................................................... 52
Gène de fusion EML4-ALK .............................................................................................. 53
Gène de fusion ROS1-SCL34A2 ....................................................................................... 54
2.2. Détection de translocations non définies ........................................................................... 55
Gène de fusion EML4-ALK .............................................................................................. 55
Gène de fusion ROS1-SCL34A2 ....................................................................................... 56
2.3. Essai sur des échantillons cliniques ................................................................................... 57
CONCLUSION ..................................................................................................................................... 15
LISTE DES FIGURES .......................................................................................................................... 61
LISTE DES TABLEAUX ..................................................................................................................... 63
BIBLIOGRAPHIE ................................................................................................................................ 65Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65823 Utilisation de la droplet digital PCR (ddPCR) pour l’analyse des mutations composites de BCR-ABL1 dans les leucémies myéloïdes chroniques résistantes et la détection de gènes de fusion dans le cancer du poumon. [TFE / Mémoire] / Esra ACIKGOZ, Auteur ; Pascal Vannuffel, Directeur de la recherche . - 2017.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale Institut de Pathologie et de génétique laboratoire de biologie moléculaire. Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : TABLE DES MATIÈRES
PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE .............................................................................................. 9
INTRODUCTION GENERALE ........................................................................................................... 11
INTRODUCTION THÉORIQUE ......................................................................................................... 13
1. Les acides nucléiques .............................................................................................................. 13
1.1. Définition ........................................................................................................................... 13
1.2. Structure de l’ADN ............................................................................................................ 13
1.3. Le gène .............................................................................................................................. 14
2. Les mutations ............................................................................................................................ 14
3. Leucémie myéloïde chronique .................................................................................................. 17
3.1. Caractéristiques cliniques ................................................................................................. 17
3.2. Mécanisme moléculaire ..................................................................................................... 17
3.3. Traitement et mécanisme de résistance ............................................................................. 19
3.3.1. Mécanisme d’action................................................................................................... 19
3.3.2. Mécanisme de résistance ........................................................................................... 20
4. Cancer du poumon non à petites cellules .................................................................................. 21
4.1. Définition ........................................................................................................................... 21
4.2. Anatomopathologie............................................................................................................ 21
4.3. Analyse moléculaire .......................................................................................................... 22
4.3.1. Structure des gènes .................................................................................................... 22
4.3.2. Les oncogènes et leurs impacts ................................................................................. 23
4.3.2.1. Gène de fusion ROS1-SCL34A2 ........................................................................... 23
4.3.2.2. Gène de fusion EML4-ALK .................................................................................. 24
4.4. Traitement ......................................................................................................................... 25
5. Droplet Digital PCR ................................................................................................................. 27
5.1. Introduction ....................................................................................................................... 27
5.2. Appareillage ...................................................................................................................... 27
5.2.1. Composants du système ............................................................................................ 27
5.2.2. Principe du fonctionnement ....................................................................................... 28
5.2.2.1. Étape 1 : Préparation de l’échantillon .................................................................... 28
5.2.2.2. Étape 2 : Le générateur de gouttelettes .................................................................. 29
5.2.2.3. Étape 3 : La réaction PCR ..................................................................................... 30
5.2.2.4. Étape 4 : Lecture des gouttelettes .......................................................................... 31
5.2.2.5. Analyse des résultats ............................................................................................. 32
OBJECTIFS ET STRATÉGIES ............................................................................................................ 35
MATERIELS – METHODES ............................................................................................................... 37
1. Droplet Digital PCR .................................................................................................................. 37
1.1. Matériels et réactifs ........................................................................................................... 37
1.2. Méthodes ........................................................................................................................... 38
1.2.1. Méthode manuelle ..................................................................................................... 38
1.2.2. Méthode automatique ................................................................................................ 40
2. PCR en temps réelle (RQ-PCR) ................................................................................................ 41
2.1. Principe ................................................................................................................................. 41
2.2. Matériels ................................................................................................................................. 41
2.3. Méthode .................................................................................................................................. 42
RESULTATS ........................................................................................................................................ 43
1. Leucémie myéloïde chronique : le gène BCR-ABL1 ................................................................ 43
1.1. Localisation clonale de la mutation à pourcentage égal .................................................... 43
1.2. Localisation clonale de la mutation à pourcentage différent ............................................. 46
1.2. Essai sur des échantillons cliniques ................................................................................... 49
2. Cancer du poumon non à petites cellules : ROS1-SCL34A2 et ................................................ 52
2.1. Détection de translocations connues ...................................................................................... 52
Gène de fusion EML4-ALK .............................................................................................. 53
Gène de fusion ROS1-SCL34A2 ....................................................................................... 54
2.2. Détection de translocations non définies ........................................................................... 55
Gène de fusion EML4-ALK .............................................................................................. 55
Gène de fusion ROS1-SCL34A2 ....................................................................................... 56
2.3. Essai sur des échantillons cliniques ................................................................................... 57
CONCLUSION ..................................................................................................................................... 15
LISTE DES FIGURES .......................................................................................................................... 61
LISTE DES TABLEAUX ..................................................................................................................... 63
BIBLIOGRAPHIE ................................................................................................................................ 65Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65823 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire