Centre de Documentation Campus Montignies
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Lundi : 8h-18h30
Mardi : 8h-18h30
Mercredi 9h-16h30
Jeudi : 8h-18h30
Vendredi : 8h-16h30
Votre centre de documentation fermera de 12h30 à 13h ce vendredi 28 juin et fermera à 14h30.
Dès ce lundi 1er juillet jusqu'au mercredi 10 juillet l'horaire du centre de documentation sera adapté :
Lundi 1er juillet : de 8h à 12h et de 12h30 à 16h
Mardi 2 juillet : de 8h à 12h15
Mercredi 3 juillet : de 9h à 12h et de 12h30 à 15h15
Jeudi 4 juillet : de 8h à 12h30 et de 13h à 18h30
Lundi 8 juillet : de 8h à 12h et de 12h30 à 16h
Mardi 9 juillet : de 8h à 12h15
Réouverture dès ce lundi 19 août.
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[article]
Titre : |
Automatisation en bactériologie : quel avenir ? Un exemple concret dans le cadre d’une consolidation de laboratoires universitaires |
Type de document : |
texte imprimé |
Auteurs : |
Georges Mascart ; Delphine Martiny ; Yvette Miendje |
Année de publication : |
2018 |
Article en page(s) : |
p. 365-372 |
Langues : |
Français (fre) |
Mots-clés : |
automatisation bactériologie microbiologie télébactériologie |
Résumé : |
La bactériologie est restée essentiellement manuelle pendant de nombreuses années. Après une automatisation partielle des hémocultures, des identifications et des sensibilités aux antibiotiques, de nouveaux développements technologiques faisant appel à la robotisation et la digitalisation d’images ouvrent de nouveaux horizons. Dans un contexte de pression économique et d’amélioration de la qualité, l’automatisation présente de multiples avantages en matière d’augmentation de productivité, de standardisation, de traçabilité et de rapidité dans le rendu des résultats. Par ailleurs, l’utilisation d’images digitalisées permet de s’engager dans la voie de la télé-bactériologie, particulièrement utile dans le cadre de la consolidation de laboratoire, car elle permet de dissocier géographiquement la manipulation stricte de la validation des résultats et de l’activité de conseil du microbiologiste. Les critères de choix du matériel sont revus en détail. Enfin nous relatons l’expérience vécue au laboratoire du LHUB-ULB qui s’est automatisé à l’occasion d’une fusion de laboratoires et a développé une expérience intéressante de télé-bactériologie. |
Permalink : |
./index.php?lvl=notice_display&id=77097 |
in Annales de Biologie Clinique > 76/4 (juillet-août 2018) . - p. 365-372
[article] Automatisation en bactériologie : quel avenir ? Un exemple concret dans le cadre d’une consolidation de laboratoires universitaires [texte imprimé] / Georges Mascart ; Delphine Martiny ; Yvette Miendje . - 2018 . - p. 365-372. Langues : Français ( fre) in Annales de Biologie Clinique > 76/4 (juillet-août 2018) . - p. 365-372
Mots-clés : |
automatisation bactériologie microbiologie télébactériologie |
Résumé : |
La bactériologie est restée essentiellement manuelle pendant de nombreuses années. Après une automatisation partielle des hémocultures, des identifications et des sensibilités aux antibiotiques, de nouveaux développements technologiques faisant appel à la robotisation et la digitalisation d’images ouvrent de nouveaux horizons. Dans un contexte de pression économique et d’amélioration de la qualité, l’automatisation présente de multiples avantages en matière d’augmentation de productivité, de standardisation, de traçabilité et de rapidité dans le rendu des résultats. Par ailleurs, l’utilisation d’images digitalisées permet de s’engager dans la voie de la télé-bactériologie, particulièrement utile dans le cadre de la consolidation de laboratoire, car elle permet de dissocier géographiquement la manipulation stricte de la validation des résultats et de l’activité de conseil du microbiologiste. Les critères de choix du matériel sont revus en détail. Enfin nous relatons l’expérience vécue au laboratoire du LHUB-ULB qui s’est automatisé à l’occasion d’une fusion de laboratoires et a développé une expérience intéressante de télé-bactériologie. |
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Titre : |
Détection de pathogènes dans les selles: jusqu'où l'automatisation est-elle possible ? |
Type de document : |
TFE / Mémoire |
Auteurs : |
Pierre-Yves NOERENS, Auteur |
Année de publication : |
2016 |
Note générale : |
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Langues : |
Français (fre) |
Mots-clés : |
biologie médicale CNDG Gosselies selle automatisation campylobacter parasitologie virologie rotavirus adénovirus identification chimiluminescence ETI-MAX ELISA |
Index. décimale : |
TFE Bio Med TFE Biologie médicale |
Note de contenu : |
Table des matières
Présentation générale du lieu de stage : ................................................................................................... 1
Présentation du laboratoire : .................................................................................................................... 2
Introduction ............................................................................................................................................. 3
Partie théorique........................................................................................................................................ 5
Chapitre I : Description des agents pathogènes traités ............................................................................ 7
1.1. Bactériologie : Le Campylobacter : ........................................................................................ 7
1.2. Parasitologie : .......................................................................................................................... 8
1.2.1. Le Cryptosporidium parvum : ......................................................................................... 8
1.2.2. L’Entamoeba histolytica : ................................................................................................ 9
1.2.3. Le Giardia lamblia ou Giardia intestinalis : ................................................................. 10
1.2.4. Le Blastocystis hominis : ............................................................................................... 11
1.3. Virologie : Rotavirus et adénovirus : ..................................................................................... 12
1.3.1. Introduction : ................................................................................................................. 12
1.3.2. Généralités sur les virus : .............................................................................................. 12
1.3.3. Rotavirus : ..................................................................................................................... 13
1.3.3.1. Généralités et structure : ........................................................................................ 13
1.3.3.2. Mode de transmission : .......................................................................................... 14
1.3.3.3. Cycle viral : ........................................................................................................... 14
1.3.3.4. Epidémiologie, tropisme et lieu d’infection : ........................................................ 15
1.3.3.5. Symptômes et risque de l’infection : ..................................................................... 16
1.3.3.6. Prévention de l’infection : ..................................................................................... 16
1.3.3.7. Traitement : ........................................................................................................... 16
1.3.4. Adénovirus humain (HAdVs) : ..................................................................................... 17
1.3.4.1. Généralités et structure : ........................................................................................ 17
1.3.4.2. Mode de transmission : .......................................................................................... 18
1.3.4.3. Cycle viral : ........................................................................................................... 19
1.3.4.4. Epidémiologie, tropisme et lieu d’infection : ........................................................ 20
1.3.4.5. Symptômes et risque de l’infection : ..................................................................... 20
1.3.4.6. Prévention de l’infection : ..................................................................................... 20
1.3.4.7. Traitement : ........................................................................................................... 20
Partie pratique........................................................................................................................................ 21
Chapitre II : Matériel et méthode .......................................................................................................... 23
2.1. Aperçu des méthodes d’identification en routine à la CNDG : ............................................. 23
2.2. Description des méthodes de routine : ................................................................................... 23
2.2.1. Méthode d’identification du Campylobacter : ............................................................... 23
2.2.2. Méthode d’identification des rotavirus et adénovirus : ................................................. 24
2.2.3. Méthode d’identification des parasites : ........................................................................ 25
2.3. Description des nouvelles méthodes évaluées : ..................................................................... 26
2.3.1. Le Liaison® Analyzer : ................................................................................................. 27
2.3.1.1. Composition du Liaison® : ................................................................................... 27
2.3.1.2. Matériel pour une analyse sur Liaison® : .............................................................. 28
2.3.1.3. La chimiluminescence : ......................................................................................... 29
2.3.1.4. Principe de fonctionnement du Liaison® : ............................................................ 31
2.3.1.5. Mode opératoire : .................................................................................................. 31
2.3.2. L’ETI-Max 3000® : ...................................................................................................... 34
2.3.2.1. Composition de l’ETI-Max : ................................................................................. 34
2.3.2.2. Matériel pour une analyse sur ETI-Max : .............................................................. 35
2.3.2.3. L’ELISA : .............................................................................................................. 35
2.3.2.4. Principe de fonctionnement de l’ETI-Max : .......................................................... 36
2.3.2.5. Mode opératoire : .................................................................................................. 36
Chapitre III : Résultats et interprétation ................................................................................................ 39
3.1. But de cette étude : ................................................................................................................ 39
3.2. L’échantillonnage : ................................................................................................................ 39
3.3. Analyse des populations et des échantillons : ....................................................................... 40
3.3.1. Pour le Campylobacter : ................................................................................................ 40
3.3.2. Pour les rotavirus et adénovirus : .................................................................................. 41
3.3.3. Pour les parasites : ......................................................................................................... 42
3.4. Rappel et définitions : ............................................................................................................ 43
3.4.1. La sensibilité d’un test : ................................................................................................. 43
3.4.2. La spécificité d’un test : ................................................................................................ 43
3.4.3. La valeur prédictive positive ou VPP : .......................................................................... 43
3.4.4. La valeur prédictive négative ou VPN : ........................................................................ 43
3.5. Résultats et interprétations : .................................................................................................. 44
3.5.1. Pour le Campylobacter : ................................................................................................ 44
3.5.2. Pour le rotavirus et l’adénovirus : ................................................................................. 47
3.5.3. Pour les parasites : ......................................................................................................... 50
3.5.3.1. Blastocystis hominis : ............................................................................................ 50
3.5.3.2. Entamoeba : ........................................................................................................... 53
3.5.3.3. Giardia : ................................................................................................................ 55
3.5.3.4. Cryptosporidium parvum : .................................................................................... 56
3.6. Discussion : ........................................................................................................................... 58
Conclusion ..............................................................................................................................61 |
Permalink : |
./index.php?lvl=notice_display&id=65683 |
Détection de pathogènes dans les selles: jusqu'où l'automatisation est-elle possible ? [TFE / Mémoire] / Pierre-Yves NOERENS, Auteur . - 2016. Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français ( fre)
Mots-clés : |
biologie médicale CNDG Gosselies selle automatisation campylobacter parasitologie virologie rotavirus adénovirus identification chimiluminescence ETI-MAX ELISA |
Index. décimale : |
TFE Bio Med TFE Biologie médicale |
Note de contenu : |
Table des matières
Présentation générale du lieu de stage : ................................................................................................... 1
Présentation du laboratoire : .................................................................................................................... 2
Introduction ............................................................................................................................................. 3
Partie théorique........................................................................................................................................ 5
Chapitre I : Description des agents pathogènes traités ............................................................................ 7
1.1. Bactériologie : Le Campylobacter : ........................................................................................ 7
1.2. Parasitologie : .......................................................................................................................... 8
1.2.1. Le Cryptosporidium parvum : ......................................................................................... 8
1.2.2. L’Entamoeba histolytica : ................................................................................................ 9
1.2.3. Le Giardia lamblia ou Giardia intestinalis : ................................................................. 10
1.2.4. Le Blastocystis hominis : ............................................................................................... 11
1.3. Virologie : Rotavirus et adénovirus : ..................................................................................... 12
1.3.1. Introduction : ................................................................................................................. 12
1.3.2. Généralités sur les virus : .............................................................................................. 12
1.3.3. Rotavirus : ..................................................................................................................... 13
1.3.3.1. Généralités et structure : ........................................................................................ 13
1.3.3.2. Mode de transmission : .......................................................................................... 14
1.3.3.3. Cycle viral : ........................................................................................................... 14
1.3.3.4. Epidémiologie, tropisme et lieu d’infection : ........................................................ 15
1.3.3.5. Symptômes et risque de l’infection : ..................................................................... 16
1.3.3.6. Prévention de l’infection : ..................................................................................... 16
1.3.3.7. Traitement : ........................................................................................................... 16
1.3.4. Adénovirus humain (HAdVs) : ..................................................................................... 17
1.3.4.1. Généralités et structure : ........................................................................................ 17
1.3.4.2. Mode de transmission : .......................................................................................... 18
1.3.4.3. Cycle viral : ........................................................................................................... 19
1.3.4.4. Epidémiologie, tropisme et lieu d’infection : ........................................................ 20
1.3.4.5. Symptômes et risque de l’infection : ..................................................................... 20
1.3.4.6. Prévention de l’infection : ..................................................................................... 20
1.3.4.7. Traitement : ........................................................................................................... 20
Partie pratique........................................................................................................................................ 21
Chapitre II : Matériel et méthode .......................................................................................................... 23
2.1. Aperçu des méthodes d’identification en routine à la CNDG : ............................................. 23
2.2. Description des méthodes de routine : ................................................................................... 23
2.2.1. Méthode d’identification du Campylobacter : ............................................................... 23
2.2.2. Méthode d’identification des rotavirus et adénovirus : ................................................. 24
2.2.3. Méthode d’identification des parasites : ........................................................................ 25
2.3. Description des nouvelles méthodes évaluées : ..................................................................... 26
2.3.1. Le Liaison® Analyzer : ................................................................................................. 27
2.3.1.1. Composition du Liaison® : ................................................................................... 27
2.3.1.2. Matériel pour une analyse sur Liaison® : .............................................................. 28
2.3.1.3. La chimiluminescence : ......................................................................................... 29
2.3.1.4. Principe de fonctionnement du Liaison® : ............................................................ 31
2.3.1.5. Mode opératoire : .................................................................................................. 31
2.3.2. L’ETI-Max 3000® : ...................................................................................................... 34
2.3.2.1. Composition de l’ETI-Max : ................................................................................. 34
2.3.2.2. Matériel pour une analyse sur ETI-Max : .............................................................. 35
2.3.2.3. L’ELISA : .............................................................................................................. 35
2.3.2.4. Principe de fonctionnement de l’ETI-Max : .......................................................... 36
2.3.2.5. Mode opératoire : .................................................................................................. 36
Chapitre III : Résultats et interprétation ................................................................................................ 39
3.1. But de cette étude : ................................................................................................................ 39
3.2. L’échantillonnage : ................................................................................................................ 39
3.3. Analyse des populations et des échantillons : ....................................................................... 40
3.3.1. Pour le Campylobacter : ................................................................................................ 40
3.3.2. Pour les rotavirus et adénovirus : .................................................................................. 41
3.3.3. Pour les parasites : ......................................................................................................... 42
3.4. Rappel et définitions : ............................................................................................................ 43
3.4.1. La sensibilité d’un test : ................................................................................................. 43
3.4.2. La spécificité d’un test : ................................................................................................ 43
3.4.3. La valeur prédictive positive ou VPP : .......................................................................... 43
3.4.4. La valeur prédictive négative ou VPN : ........................................................................ 43
3.5. Résultats et interprétations : .................................................................................................. 44
3.5.1. Pour le Campylobacter : ................................................................................................ 44
3.5.2. Pour le rotavirus et l’adénovirus : ................................................................................. 47
3.5.3. Pour les parasites : ......................................................................................................... 50
3.5.3.1. Blastocystis hominis : ............................................................................................ 50
3.5.3.2. Entamoeba : ........................................................................................................... 53
3.5.3.3. Giardia : ................................................................................................................ 55
3.5.3.4. Cryptosporidium parvum : .................................................................................... 56
3.6. Discussion : ........................................................................................................................... 58
Conclusion ..............................................................................................................................61 |
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