[article]
| Titre : |
Étude in silico d’une mutation : application à la mutation fonctionnelle G12D du gène KRAS, retrouvée dans les cancers bronchiques non à petites cellules |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Noria Bouras ; Fatima Zohra El Kebir ; Tewfik Sahraoui ; Florence de Fraipont ; Ahlam Megaïz ; Abdelkader Bousahba |
| Année de publication : |
2019 |
| Article en page(s) : |
p.287-294 |
| Langues : |
Français (fre) |
| Mots-clés : |
Mutation Tumeurs des bronches |
| Résumé : |
La biologie a connu un essor fulgurant durant le XXe siècle et a été profondément bouleversée au cours de la dernière décennie par le passage à l’ère post-génomique, la généralisation de la biologie à haut débit et l’avènement d’une discipline relativement jeune, la bioinformatique. Cette dernière, qui englobe la collecte, l’organisation et l’analyse de données biologiques au moyen d’outils informatiques, est rapidement devenue indissociable des études relatives à la compréhension du génome. Les différentes mutations qui peuvent affecter nos gènes sont responsables d’un changement de la séquence protéique et sont susceptibles d’affecter par exemple la stabilité de la protéine, son adressage intracellulaire, sa maturation, son assemblage dans une structure multimérique, les sites essentiels à son activité enzymatique ou à l’interaction avec des ligands. Ainsi, un certain nombre de développements bioinformatiques ont permis de mettre en place des outils de prédiction in silico de la structure d’une protéine et de l’impact des mutations sur la structure des protéines. Dans notre étude, nous avons exploré in silico trois logiciels analytiques de prédiction et de modélisation, en choisissant comme modèle d’étude la mutation G12D qui affecte l’oncogène KRAS (V-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog), retrouvée fréquemment chez les patients atteints de cancers broncho-pulmonaires non à petites cellules originaires de l’ouest algérien. Ce travail nous a permis d’intégrer ces outils bioinformatiques au sein de notre laboratoire de biologie du développement et de la différenciation de l’université Oran 1 Ahmed Benbella, en Algérie. Ainsi, nous avons pu conclure que, même si la mutation trouvée est donnée comme tolérée et sans effet délétère sur la protéine Ras entière, la conséquence de cette mutation faux-sens dépend principalement de la position de l’acide aminé muté dans la protéine et de ses propriétés chimiques. En effet, la protéine Ras mutée montre une forte affinité avec la molécule GTP. |
| Permalink : |
./index.php?lvl=notice_display&id=80025 |
in Annales de Biologie Clinique > Vol. 77, n° 3 (Mai-juin 2019) . - p.287-294
[article] Étude in silico d’une mutation : application à la mutation fonctionnelle G12D du gène KRAS, retrouvée dans les cancers bronchiques non à petites cellules [texte imprimé] / Noria Bouras ; Fatima Zohra El Kebir ; Tewfik Sahraoui ; Florence de Fraipont ; Ahlam Megaïz ; Abdelkader Bousahba . - 2019 . - p.287-294. Langues : Français ( fre) in Annales de Biologie Clinique > Vol. 77, n° 3 (Mai-juin 2019) . - p.287-294
| Mots-clés : |
Mutation Tumeurs des bronches |
| Résumé : |
La biologie a connu un essor fulgurant durant le XXe siècle et a été profondément bouleversée au cours de la dernière décennie par le passage à l’ère post-génomique, la généralisation de la biologie à haut débit et l’avènement d’une discipline relativement jeune, la bioinformatique. Cette dernière, qui englobe la collecte, l’organisation et l’analyse de données biologiques au moyen d’outils informatiques, est rapidement devenue indissociable des études relatives à la compréhension du génome. Les différentes mutations qui peuvent affecter nos gènes sont responsables d’un changement de la séquence protéique et sont susceptibles d’affecter par exemple la stabilité de la protéine, son adressage intracellulaire, sa maturation, son assemblage dans une structure multimérique, les sites essentiels à son activité enzymatique ou à l’interaction avec des ligands. Ainsi, un certain nombre de développements bioinformatiques ont permis de mettre en place des outils de prédiction in silico de la structure d’une protéine et de l’impact des mutations sur la structure des protéines. Dans notre étude, nous avons exploré in silico trois logiciels analytiques de prédiction et de modélisation, en choisissant comme modèle d’étude la mutation G12D qui affecte l’oncogène KRAS (V-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog), retrouvée fréquemment chez les patients atteints de cancers broncho-pulmonaires non à petites cellules originaires de l’ouest algérien. Ce travail nous a permis d’intégrer ces outils bioinformatiques au sein de notre laboratoire de biologie du développement et de la différenciation de l’université Oran 1 Ahmed Benbella, en Algérie. Ainsi, nous avons pu conclure que, même si la mutation trouvée est donnée comme tolérée et sans effet délétère sur la protéine Ras entière, la conséquence de cette mutation faux-sens dépend principalement de la position de l’acide aminé muté dans la protéine et de ses propriétés chimiques. En effet, la protéine Ras mutée montre une forte affinité avec la molécule GTP. |
| Permalink : |
./index.php?lvl=notice_display&id=80025 |
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Étude in silico d’une mutation : application à la mutation fonctionnelle G12D du gène KRAS, retrouvée dans les cancers bronchiques non à petites cellules in Annales de Biologie Clinique, Vol. 77, n° 3 (Mai-juin 2019)
