Analyse rétrospective des performances du test de détection rapide antigénique du SARS-CoV-2 comparé au test de référence RT-PCR / Mathieu Bernard in Annales de Biologie Clinique, Vol. 79, n°2 (Mars-Avril 2021)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > Vol. 79, n°2 (Mars-Avril 2021) . - p. 168-175 Titre : Analyse rétrospective des performances du test de détection rapide antigénique du SARS-CoV-2 comparé au test de référence RT-PCR Type de document : texte imprimé Auteurs : Mathieu Bernard ; Gina Cosentino ; Laura Pieri ; Pierre Zachary ; Michael Buser ; Laurent Kbaier ; Jean-Marc Giannoli Année de publication : 2021 Article en page(s) : p. 168-175 Note générale : DOI : 10.1684/abc.2021.1641 Langues : Français (fre) Mots-clés : SARS-CoV-2  RT-PCR  diagnostic  test de détection rapide antigénique  sensibilité  spécificité  symptômes  valeur de Cycles Treshold Résumé : ntroduction : Découvert en 2019 dans la région de Wuhan en Chine, le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) s’est rapidement imposé comme un agent pathogène majeur de morbi-mortalité. Aujourd’hui, la France a mis en place une stratégie de lutte contre ce virus. Elle repose essentiellement sur la réalisation massive de tests virologiques RT-PCR afin d’isoler les patients positifs. Récemment, des tests antigéniques ont été mis à disposition pour aider au diagnostic. Nous avons réalisé une étude rétrospective pour déterminer la sensibilité des tests antigéniques par rapport à la méthode de référence RT-PCR. Méthode : Entre le 7 décembre 2020 et le 31 janvier 2021, chaque patient venant dans nos laboratoires pour un test RT-PCR a été incorporé dans notre étude. Sur 271 649 patients, 4 881 avaient effectué un test antigénique (TDR) dans les 24 heures précédentes. En comparant les données des résultats des deux tests, nous avons déterminé la sensibilité et la spécificité des tests antigéniques. Pour notre analyse, nous avons inclus la durée des symptômes et/ou les valeurs de Cycles threshold (Ct) dans nos paramètres. Résultats : La sensibilité des TDRs comparée à toutes les RT-PCR positives est de 56 %. Nous montrons une corrélation positive entre la durée des symptômes et la diminution de la charge virale nasopharyngée. À partir de ces données, nous avons pu déterminer que la sensibilité des TDRs diminue très rapidement après l’apparition des symptômes contrairement à la charge virale estimée en RT-PCR. En effet, 24 heures après l’apparition des symptômes la sensibilité des TDRs passe de 74 % à 60 %. En incluant les valeurs de Ct dans nos paramètres, nous avons montré que malgré une charge virale élevée et des symptômes datant de moins de 7 jours, la sensibilité des TDRs est de 66 %. Malgré les difficultés inhérentes au taux élevé de patients asymptomatiques parmi les porteurs de SARS-CoV-2, nous avons estimé une spécificité des TDR de 93 %. Conclusions : Les performances en termes de sensibilité et de spécificité du TDR évaluées sur le terrain sont inférieures à celles rapportées par les fabricants, ce qui soulève plusieurs questions. Quel est l’impact de résultats rendus faussement négatifs pour les patients ayant une charge virale élevée ? Les mesures appliquées sont-elles suffisantes pour prévenir l’épidémie ? Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=95673 [article] Analyse rétrospective des performances du test de détection rapide antigénique du SARS-CoV-2 comparé au test de référence RT-PCR [texte imprimé] / Mathieu Bernard ; Gina Cosentino ; Laura Pieri ; Pierre Zachary ; Michael Buser ; Laurent Kbaier ; Jean-Marc Giannoli . - 2021 . - p. 168-175. DOI : 10.1684/abc.2021.1641 Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > Vol. 79, n°2 (Mars-Avril 2021) . - p. 168-175 Mots-clés : SARS-CoV-2  RT-PCR  diagnostic  test de détection rapide antigénique  sensibilité  spécificité  symptômes  valeur de Cycles Treshold Résumé : ntroduction : Découvert en 2019 dans la région de Wuhan en Chine, le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) s’est rapidement imposé comme un agent pathogène majeur de morbi-mortalité. Aujourd’hui, la France a mis en place une stratégie de lutte contre ce virus. Elle repose essentiellement sur la réalisation massive de tests virologiques RT-PCR afin d’isoler les patients positifs. Récemment, des tests antigéniques ont été mis à disposition pour aider au diagnostic. Nous avons réalisé une étude rétrospective pour déterminer la sensibilité des tests antigéniques par rapport à la méthode de référence RT-PCR. Méthode : Entre le 7 décembre 2020 et le 31 janvier 2021, chaque patient venant dans nos laboratoires pour un test RT-PCR a été incorporé dans notre étude. Sur 271 649 patients, 4 881 avaient effectué un test antigénique (TDR) dans les 24 heures précédentes. En comparant les données des résultats des deux tests, nous avons déterminé la sensibilité et la spécificité des tests antigéniques. Pour notre analyse, nous avons inclus la durée des symptômes et/ou les valeurs de Cycles threshold (Ct) dans nos paramètres. Résultats : La sensibilité des TDRs comparée à toutes les RT-PCR positives est de 56 %. Nous montrons une corrélation positive entre la durée des symptômes et la diminution de la charge virale nasopharyngée. À partir de ces données, nous avons pu déterminer que la sensibilité des TDRs diminue très rapidement après l’apparition des symptômes contrairement à la charge virale estimée en RT-PCR. En effet, 24 heures après l’apparition des symptômes la sensibilité des TDRs passe de 74 % à 60 %. En incluant les valeurs de Ct dans nos paramètres, nous avons montré que malgré une charge virale élevée et des symptômes datant de moins de 7 jours, la sensibilité des TDRs est de 66 %. Malgré les difficultés inhérentes au taux élevé de patients asymptomatiques parmi les porteurs de SARS-CoV-2, nous avons estimé une spécificité des TDR de 93 %. Conclusions : Les performances en termes de sensibilité et de spécificité du TDR évaluées sur le terrain sont inférieures à celles rapportées par les fabricants, ce qui soulève plusieurs questions. Quel est l’impact de résultats rendus faussement négatifs pour les patients ayant une charge virale élevée ? Les mesures appliquées sont-elles suffisantes pour prévenir l’épidémie ? Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=95673

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