Analyse rétrospective des performances du test de détection rapide antigénique du SARS-CoV-2 comparé au test de référence RT-PCR / Mathieu Bernard in Annales de Biologie Clinique, Vol. 79, n°2 (Mars-Avril 2021)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > Vol. 79, n°2 (Mars-Avril 2021) . - p. 168-175 Titre : Analyse rétrospective des performances du test de détection rapide antigénique du SARS-CoV-2 comparé au test de référence RT-PCR Type de document : texte imprimé Auteurs : Mathieu Bernard ; Gina Cosentino ; Laura Pieri ; Pierre Zachary ; Michael Buser ; Laurent Kbaier ; Jean-Marc Giannoli Année de publication : 2021 Article en page(s) : p. 168-175 Note générale : DOI : 10.1684/abc.2021.1641 Langues : Français (fre) Mots-clés : SARS-CoV-2  RT-PCR  diagnostic  test de détection rapide antigénique  sensibilité  spécificité  symptômes  valeur de Cycles Treshold Résumé : ntroduction : Découvert en 2019 dans la région de Wuhan en Chine, le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) s’est rapidement imposé comme un agent pathogène majeur de morbi-mortalité. Aujourd’hui, la France a mis en place une stratégie de lutte contre ce virus. Elle repose essentiellement sur la réalisation massive de tests virologiques RT-PCR afin d’isoler les patients positifs. Récemment, des tests antigéniques ont été mis à disposition pour aider au diagnostic. Nous avons réalisé une étude rétrospective pour déterminer la sensibilité des tests antigéniques par rapport à la méthode de référence RT-PCR. Méthode : Entre le 7 décembre 2020 et le 31 janvier 2021, chaque patient venant dans nos laboratoires pour un test RT-PCR a été incorporé dans notre étude. Sur 271 649 patients, 4 881 avaient effectué un test antigénique (TDR) dans les 24 heures précédentes. En comparant les données des résultats des deux tests, nous avons déterminé la sensibilité et la spécificité des tests antigéniques. Pour notre analyse, nous avons inclus la durée des symptômes et/ou les valeurs de Cycles threshold (Ct) dans nos paramètres. Résultats : La sensibilité des TDRs comparée à toutes les RT-PCR positives est de 56 %. Nous montrons une corrélation positive entre la durée des symptômes et la diminution de la charge virale nasopharyngée. À partir de ces données, nous avons pu déterminer que la sensibilité des TDRs diminue très rapidement après l’apparition des symptômes contrairement à la charge virale estimée en RT-PCR. En effet, 24 heures après l’apparition des symptômes la sensibilité des TDRs passe de 74 % à 60 %. En incluant les valeurs de Ct dans nos paramètres, nous avons montré que malgré une charge virale élevée et des symptômes datant de moins de 7 jours, la sensibilité des TDRs est de 66 %. Malgré les difficultés inhérentes au taux élevé de patients asymptomatiques parmi les porteurs de SARS-CoV-2, nous avons estimé une spécificité des TDR de 93 %. Conclusions : Les performances en termes de sensibilité et de spécificité du TDR évaluées sur le terrain sont inférieures à celles rapportées par les fabricants, ce qui soulève plusieurs questions. Quel est l’impact de résultats rendus faussement négatifs pour les patients ayant une charge virale élevée ? Les mesures appliquées sont-elles suffisantes pour prévenir l’épidémie ? Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=95673 [article] Analyse rétrospective des performances du test de détection rapide antigénique du SARS-CoV-2 comparé au test de référence RT-PCR [texte imprimé] / Mathieu Bernard ; Gina Cosentino ; Laura Pieri ; Pierre Zachary ; Michael Buser ; Laurent Kbaier ; Jean-Marc Giannoli . - 2021 . - p. 168-175. DOI : 10.1684/abc.2021.1641 Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > Vol. 79, n°2 (Mars-Avril 2021) . - p. 168-175 Mots-clés : SARS-CoV-2  RT-PCR  diagnostic  test de détection rapide antigénique  sensibilité  spécificité  symptômes  valeur de Cycles Treshold Résumé : ntroduction : Découvert en 2019 dans la région de Wuhan en Chine, le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) s’est rapidement imposé comme un agent pathogène majeur de morbi-mortalité. Aujourd’hui, la France a mis en place une stratégie de lutte contre ce virus. Elle repose essentiellement sur la réalisation massive de tests virologiques RT-PCR afin d’isoler les patients positifs. Récemment, des tests antigéniques ont été mis à disposition pour aider au diagnostic. Nous avons réalisé une étude rétrospective pour déterminer la sensibilité des tests antigéniques par rapport à la méthode de référence RT-PCR. Méthode : Entre le 7 décembre 2020 et le 31 janvier 2021, chaque patient venant dans nos laboratoires pour un test RT-PCR a été incorporé dans notre étude. Sur 271 649 patients, 4 881 avaient effectué un test antigénique (TDR) dans les 24 heures précédentes. En comparant les données des résultats des deux tests, nous avons déterminé la sensibilité et la spécificité des tests antigéniques. Pour notre analyse, nous avons inclus la durée des symptômes et/ou les valeurs de Cycles threshold (Ct) dans nos paramètres. Résultats : La sensibilité des TDRs comparée à toutes les RT-PCR positives est de 56 %. Nous montrons une corrélation positive entre la durée des symptômes et la diminution de la charge virale nasopharyngée. À partir de ces données, nous avons pu déterminer que la sensibilité des TDRs diminue très rapidement après l’apparition des symptômes contrairement à la charge virale estimée en RT-PCR. En effet, 24 heures après l’apparition des symptômes la sensibilité des TDRs passe de 74 % à 60 %. En incluant les valeurs de Ct dans nos paramètres, nous avons montré que malgré une charge virale élevée et des symptômes datant de moins de 7 jours, la sensibilité des TDRs est de 66 %. Malgré les difficultés inhérentes au taux élevé de patients asymptomatiques parmi les porteurs de SARS-CoV-2, nous avons estimé une spécificité des TDR de 93 %. Conclusions : Les performances en termes de sensibilité et de spécificité du TDR évaluées sur le terrain sont inférieures à celles rapportées par les fabricants, ce qui soulève plusieurs questions. Quel est l’impact de résultats rendus faussement négatifs pour les patients ayant une charge virale élevée ? Les mesures appliquées sont-elles suffisantes pour prévenir l’épidémie ? Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=95673

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Recommandations pour la mise en place et le suivi des contrôles de qualité dans les laboratoires de biologie médicale / Jean-Marc Giannoli in Annales de Biologie Clinique, Vol. 77, n° 5 (Septembre-octobre 2019)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > Vol. 77, n° 5 (Septembre-octobre 2019) . - p. 577-597 Titre : Recommandations pour la mise en place et le suivi des contrôles de qualité dans les laboratoires de biologie médicale Type de document : texte imprimé Auteurs : Jean-Marc Giannoli ; Stéphanie Albarede ; Thierry Avellan ; et al. Année de publication : 2019 Article en page(s) : p. 577-597 Langues : Français (fre) Mots-clés : Association de biologie praticienne  Asqualab  Biologie Prospective  CTCB  LABAC  Probioqual  SFBC Résumé : Les recommandations formulées dans ce document sont issues de travaux menés conjointement par LABAC, la SFBC et la FAEEQ. Les différentes étapes de la mise en place des contrôles de qualité, basée sur l’analyse de risque, sont décrites. Les changements de lots réactifs ou de lots de contrôle interne de qualité (CIQ), la conduite à tenir en cas de CIQ non conforme, le choix des EEQ et leur interprétation sont abordés ainsi que la nouvelle problématique des analyses réalisées sur plusieurs automates dans le même laboratoire. Enfin le concept d’incertitude de mesure, la robustesse des méthodes ainsi que la particularité des EBMD et celle des tests unitaires simplifiés (TUS) sont traités. Ces recommandations ne prétendent pas répondre à tous les cas de figure envisageables au sein d’un laboratoire. La mise en œuvre d’une stratégie alternative argumentée et objective doit également pouvoir être envisagée. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=81922 [article] Recommandations pour la mise en place et le suivi des contrôles de qualité dans les laboratoires de biologie médicale [texte imprimé] / Jean-Marc Giannoli ; Stéphanie Albarede ; Thierry Avellan ; et al. . - 2019 . - p. 577-597. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > Vol. 77, n° 5 (Septembre-octobre 2019) . - p. 577-597 Mots-clés : Association de biologie praticienne  Asqualab  Biologie Prospective  CTCB  LABAC  Probioqual  SFBC Résumé : Les recommandations formulées dans ce document sont issues de travaux menés conjointement par LABAC, la SFBC et la FAEEQ. Les différentes étapes de la mise en place des contrôles de qualité, basée sur l’analyse de risque, sont décrites. Les changements de lots réactifs ou de lots de contrôle interne de qualité (CIQ), la conduite à tenir en cas de CIQ non conforme, le choix des EEQ et leur interprétation sont abordés ainsi que la nouvelle problématique des analyses réalisées sur plusieurs automates dans le même laboratoire. Enfin le concept d’incertitude de mesure, la robustesse des méthodes ainsi que la particularité des EBMD et celle des tests unitaires simplifiés (TUS) sont traités. Ces recommandations ne prétendent pas répondre à tous les cas de figure envisageables au sein d’un laboratoire. La mise en œuvre d’une stratégie alternative argumentée et objective doit également pouvoir être envisagée. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=81922

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Les rejets liquides des automates de biologie médicale ont-ils un effet microbicide propre qui permettrait de s’affranchir de leur traitement pour risque infectieux ? / Camille Kolenda in Annales de Biologie Clinique, Vol. 77, n° 3 (Mai-juin 2019)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > Vol. 77, n° 3 (Mai-juin 2019) . - p.295-305 Titre : Les rejets liquides des automates de biologie médicale ont-ils un effet microbicide propre qui permettrait de s’affranchir de leur traitement pour risque infectieux ? Type de document : texte imprimé Auteurs : Camille Kolenda ; Florence Morfin ; Frédéric Laurent ; Pascale Preynat-Boucher ; Linda Houhamdi ; Vanessa Escuret ; Jean-Marc Giannoli ; Alice Monteix Année de publication : 2019 Article en page(s) : p.295-305 Langues : Français (fre) Mots-clés : Laboratoire  Automate Résumé : Les rejets liquides des automates de biologie médicale sont écotoxiques par la présence de nombreux réactifs chimiques. Cette étude s’est intéressée à leur pouvoir microbicide intrinsèque envers une sélection d’agents infectieux classiquement retrouvés dans les prélèvements cliniques. L’objectif a été de déterminer si un traitement additionnel avant élimination est nécessaire. Nous avons ainsi évalué l’effet bactéricide de rejets de plusieurs automates vis-à-vis de quatre souches types appartenant à 4 espèces bactériennes représentatives des grands groupes de bactéries (Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa et Enterococcus faecalis) et virucide envers un virus nu résistant dans l’environnement (adénovirus). Les effets ont été quantifiés pour différentes durées d’exposition. Nos résultats ont montré que l’activité bactéricide était variable en fonction du couple automate/bactérie analysé (de l’absence totale d’activité à la stérilisation complète d’un fort inoculum bactérien). Les rejets étaient en revanche globalement inactifs sur l’adénovirus. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=80027 [article] Les rejets liquides des automates de biologie médicale ont-ils un effet microbicide propre qui permettrait de s’affranchir de leur traitement pour risque infectieux ? [texte imprimé] / Camille Kolenda ; Florence Morfin ; Frédéric Laurent ; Pascale Preynat-Boucher ; Linda Houhamdi ; Vanessa Escuret ; Jean-Marc Giannoli ; Alice Monteix . - 2019 . - p.295-305. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > Vol. 77, n° 3 (Mai-juin 2019) . - p.295-305 Mots-clés : Laboratoire  Automate Résumé : Les rejets liquides des automates de biologie médicale sont écotoxiques par la présence de nombreux réactifs chimiques. Cette étude s’est intéressée à leur pouvoir microbicide intrinsèque envers une sélection d’agents infectieux classiquement retrouvés dans les prélèvements cliniques. L’objectif a été de déterminer si un traitement additionnel avant élimination est nécessaire. Nous avons ainsi évalué l’effet bactéricide de rejets de plusieurs automates vis-à-vis de quatre souches types appartenant à 4 espèces bactériennes représentatives des grands groupes de bactéries (Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa et Enterococcus faecalis) et virucide envers un virus nu résistant dans l’environnement (adénovirus). Les effets ont été quantifiés pour différentes durées d’exposition. Nos résultats ont montré que l’activité bactéricide était variable en fonction du couple automate/bactérie analysé (de l’absence totale d’activité à la stérilisation complète d’un fort inoculum bactérien). Les rejets étaient en revanche globalement inactifs sur l’adénovirus. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=80027

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