Développement des analyses moléculaires par PCR digitale pour la pratique clinique : positionnement, applications actuelles et perspectives / Jérôme Alexandre Denis in Annales de Biologie Clinique, Vol. 77, n° 6 (Novembre-décembre 2019)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > Vol. 77, n° 6 (Novembre-décembre 2019) . - p.619-337 Titre : Développement des analyses moléculaires par PCR digitale pour la pratique clinique : positionnement, applications actuelles et perspectives Type de document : texte imprimé Auteurs : Jérôme Alexandre Denis ; Frederic Fina ; Nasrin Sarafan-Vasseur ; Anne-Sophie Alary ; Pierre-Jean Lamy ; Juliette Nectoux ; Alexandre Perrier Année de publication : 2019 Article en page(s) : p.619-337 Note générale : DOI : 10.1684/abc.2019.1502 Langues : Français (fre) Mots-clés : ADN tumoral circulant  Biopsie liquide  Hématologie  ONCOLOGIE  Réaction de polymérisation en chaîne  PCR digitale  ADN circulant fœtal  syndrome de McCune-Albright Résumé : Cet article propose la seconde partie du travail sur la PCR digitale (PCRd) mené par le groupe de travail “PCRd” de la Société française de biologie clinique. La première partie du document reprend les avantages et les limites de la PCRd pour la recherche de différentes anomalies moléculaires telles que les mutations ponctuelles, les variants du nombre de copie, la méthylation de l’ADN, l’analyse de l’ARN ou encore une application plus innovante, la PCRd en cellule unique. Cette synthèse permet de proposer un positionnement de la PCRd par rapport aux autres technologies disponibles dans un laboratoire de biologie médicale. Dans une seconde partie, les principales applications actuelles de la PCRd seront abordées incluant l’oncologie des tumeurs solides et les biopsies liquides, l’oncohématologie et le suivi des traitements des hémopathies par greffe de cellules souches hématopoïétiques. Nous détaillerons également le diagnostic prénatal non invasif et le diagnostic de maladie génétique en mosaïque, en prenant l’exemple du syndrome de McCune-Albright. Ces différents exemples d’applications ont été rédigés conjointement par plusieurs spécialistes français du domaine qui ont mis en œuvre ces techniques dans leur laboratoire. En résumé, cet article offre une vision actualisée du positionnement de la PCRd par rapport à d’autres technologies existantes, afin de répondre au mieux aux attentes de la médecine de précision. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=82927 [article] Développement des analyses moléculaires par PCR digitale pour la pratique clinique : positionnement, applications actuelles et perspectives [texte imprimé] / Jérôme Alexandre Denis ; Frederic Fina ; Nasrin Sarafan-Vasseur ; Anne-Sophie Alary ; Pierre-Jean Lamy ; Juliette Nectoux ; Alexandre Perrier . - 2019 . - p.619-337. DOI : 10.1684/abc.2019.1502 Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > Vol. 77, n° 6 (Novembre-décembre 2019) . - p.619-337 Mots-clés : ADN tumoral circulant  Biopsie liquide  Hématologie  ONCOLOGIE  Réaction de polymérisation en chaîne  PCR digitale  ADN circulant fœtal  syndrome de McCune-Albright Résumé : Cet article propose la seconde partie du travail sur la PCR digitale (PCRd) mené par le groupe de travail “PCRd” de la Société française de biologie clinique. La première partie du document reprend les avantages et les limites de la PCRd pour la recherche de différentes anomalies moléculaires telles que les mutations ponctuelles, les variants du nombre de copie, la méthylation de l’ADN, l’analyse de l’ARN ou encore une application plus innovante, la PCRd en cellule unique. Cette synthèse permet de proposer un positionnement de la PCRd par rapport aux autres technologies disponibles dans un laboratoire de biologie médicale. Dans une seconde partie, les principales applications actuelles de la PCRd seront abordées incluant l’oncologie des tumeurs solides et les biopsies liquides, l’oncohématologie et le suivi des traitements des hémopathies par greffe de cellules souches hématopoïétiques. Nous détaillerons également le diagnostic prénatal non invasif et le diagnostic de maladie génétique en mosaïque, en prenant l’exemple du syndrome de McCune-Albright. Ces différents exemples d’applications ont été rédigés conjointement par plusieurs spécialistes français du domaine qui ont mis en œuvre ces techniques dans leur laboratoire. En résumé, cet article offre une vision actualisée du positionnement de la PCRd par rapport à d’autres technologies existantes, afin de répondre au mieux aux attentes de la médecine de précision. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=82927

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Développement des analyses moléculaires par PCR digitale pour la pratique clinique : principes, mise en œuvre pratique et recommandations / Jérôme Alexandre Denis in Annales de Biologie Clinique, 76/5 (septembre-octobre 2018)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > 76/5 (septembre-octobre 2018) . - p. 505-523 Titre : Développement des analyses moléculaires par PCR digitale pour la pratique clinique : principes, mise en œuvre pratique et recommandations Type de document : texte imprimé Auteurs : Jérôme Alexandre Denis ; Juliette Nectoux ; Pierre-Jean Lamy Année de publication : 2018 Article en page(s) : p. 505-523 Langues : Français (fre) Mots-clés : PCR digitale  recommandations  PCR quantitative  PCR en temps réel  microfluidique  gouttelette  micro-compartiments Résumé : La PCR digitale (PCRd) est une technologie de 3e génération qui complète la PCR classique en point final et la PCR en temps réel. Elle a été développée afin de combler certaines limites des techniques classiques d’amplification, en particulier la détection de faibles quantités d’acides nucléiques et/ou d’un variant en faible proportion par rapport à un autre. Cette technologie est actuellement en plein développement du fait de sa très grande sensibilité avec des applications majeures en biologie médicale. C’est tout particulièrement le cas pour des applications cliniques visant à détecter des altérations génétiques ou épigénétiques ou des variations de nombre de copies spécifiques d’acides nucléiques au sein d’échantillons contenant de faibles concentrations d’acides nucléiques d’intérêt. La PCRd trouve donc son utilité dans des domaines aussi variés que le diagnostic prénatal non invasif (DPNI), la transplantation d’organe ou l’oncologie, en particulier pour les biopsies liquides. Toutefois, cette technique nécessite une bonne formation des utilisateurs et la prise en compte de certaines précautions. Une mauvaise connaissance de cette technique peut en effet conduire à de nombreuses erreurs dans la réalisation de l’analyse et dans l’interprétation des résultats. Dans cette revue, nous présentons tout d’abord le contexte d’émergence de cette technologie, en décrivant en particulier son principe et les principaux facteurs pouvant influencer la qualité de l’analyse. Dans un second temps, nous proposerons un certain nombre de recommandations pratiques pour la mise en place d’un test basé sur la PCRd dans un laboratoire de biologie médicale au regard des exigences de qualité. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=77313 [article] Développement des analyses moléculaires par PCR digitale pour la pratique clinique : principes, mise en œuvre pratique et recommandations [texte imprimé] / Jérôme Alexandre Denis ; Juliette Nectoux ; Pierre-Jean Lamy . - 2018 . - p. 505-523. Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > 76/5 (septembre-octobre 2018) . - p. 505-523 Mots-clés : PCR digitale  recommandations  PCR quantitative  PCR en temps réel  microfluidique  gouttelette  micro-compartiments Résumé : La PCR digitale (PCRd) est une technologie de 3e génération qui complète la PCR classique en point final et la PCR en temps réel. Elle a été développée afin de combler certaines limites des techniques classiques d’amplification, en particulier la détection de faibles quantités d’acides nucléiques et/ou d’un variant en faible proportion par rapport à un autre. Cette technologie est actuellement en plein développement du fait de sa très grande sensibilité avec des applications majeures en biologie médicale. C’est tout particulièrement le cas pour des applications cliniques visant à détecter des altérations génétiques ou épigénétiques ou des variations de nombre de copies spécifiques d’acides nucléiques au sein d’échantillons contenant de faibles concentrations d’acides nucléiques d’intérêt. La PCRd trouve donc son utilité dans des domaines aussi variés que le diagnostic prénatal non invasif (DPNI), la transplantation d’organe ou l’oncologie, en particulier pour les biopsies liquides. Toutefois, cette technique nécessite une bonne formation des utilisateurs et la prise en compte de certaines précautions. Une mauvaise connaissance de cette technique peut en effet conduire à de nombreuses erreurs dans la réalisation de l’analyse et dans l’interprétation des résultats. Dans cette revue, nous présentons tout d’abord le contexte d’émergence de cette technologie, en décrivant en particulier son principe et les principaux facteurs pouvant influencer la qualité de l’analyse. Dans un second temps, nous proposerons un certain nombre de recommandations pratiques pour la mise en place d’un test basé sur la PCRd dans un laboratoire de biologie médicale au regard des exigences de qualité. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=77313

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