Centre de Documentation Campus Montignies
Horaires :
Lundi : 8h-18h30
Mardi : 8h-17h30
Mercredi 9h-16h30
Jeudi : 8h30-18h30
Vendredi : 8h30-12h30 et 13h-14h30
Votre centre de documentation sera exceptionnellement fermé de 12h30 à 13h ce lundi 18 novembre.
Egalement, il sera fermé de 12h30 à 13h30 ce mercredi 20 novembre.
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Détail de l'auteur
Auteur Salah Eddine Lali |
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Titre : Comparaison de deux kits pour la détection du génome de Chlamydia trachomatis / Neisseria gonorrhoeae : Abbott RealTime CT/NG Assay et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Alperen Karacaoglan ; Barbara Marchetti, Directeur de la recherche ; Salah Eddine Lali, Directeur de publication, rédacteur en chef Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2023 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteurLe fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur . Langues : Français (fre) Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : 4
Table des matières
Introduction ...........................................................................................................................6
Partie théorique
IST : Généralités......................................................................................................................7
Cibles analytiques ...................................................................................................................8
Neisseria gonorrhoeae ........................................................................................................8
Epidémiologie..................................................................................................................8
Pouvoir pathogène ..........................................................................................................9
Prélèvements ..................................................................................................................9
Résistances ....................................................................................................................10
Culture ..........................................................................................................................10
Prophylaxie ...................................................................................................................10
Traitement ....................................................................................................................11
Chlamydia trachomatis .....................................................................................................11
Epidémiologie................................................................................................................12
Pouvoir pathogène ........................................................................................................12
Prélèvement ..................................................................................................................13
Résistance .....................................................................................................................14
Culture ..........................................................................................................................14
Prophylaxie ...................................................................................................................14
Traitement ....................................................................................................................14
Méthode d’analyse ...............................................................................................................15
Via les kits Abbott mSample Preparation SystemDNA et Abbott RealTime CT/NG Assay .....15
Extraction d’ADN et ajout de mix PCR ...............................................................................16
Réactifs .........................................................................................................................16
Principe .........................................................................................................................16
PCR ...................................................................................................................................17
Réactifs .........................................................................................................................17
Principe .........................................................................................................................18
Informations pratiques .....................................................................................................19
Pour 48 échantillons ......................................................................................................19
Via les kits STARMag 96x4 Universal et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay ..................20
Extraction d’ADN et ajout de mix PCR ...............................................................................21
5
Réactifs .........................................................................................................................21
Principe .........................................................................................................................22
PCR ...................................................................................................................................22
Réactifs .........................................................................................................................22
Principe .........................................................................................................................24
Informations pratiques .....................................................................................................25
Tests utilisés pour l’analyse pratique ....................................................................................26
Objectif et stratégie ..............................................................................................................29
Partie pratique
Résultats et discussions ........................................................................................................30
Comparatifs du kit Abbott CT/NG RealTime Assay et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay
.........................................................................................................................................30
Taux d’invalide ..............................................................................................................30
Tests pour l’analyse du kit Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay ......................................32
Spécificité : ....................................................................................................................33
Sensibilité : ....................................................................................................................33
Linéarité : ......................................................................................................................34
Intra-run : ......................................................................................................................38
Inter-run: .......................................................................................................................39
Prévalence de positifs à Trichomonas Vaginalis et Mycoplasma génitalium : .................39
Discussion .........................................................................................................................40
Conclusion ............................................................................................................................43
Glossaire...............................................................................................................................44
Abréviations ..................................................................................................................44
Définitions .....................................................................................................................44
Bibliographie ........................................................................................................................46
Annexes................................................................................................................................50
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=112110 Comparaison de deux kits pour la détection du génome de Chlamydia trachomatis / Neisseria gonorrhoeae : Abbott RealTime CT/NG Assay et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay [TFE / Mémoire] / Alperen Karacaoglan ; Barbara Marchetti, Directeur de la recherche ; Salah Eddine Lali, Directeur de publication, rédacteur en chef . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2023.
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Langues : Français (fre)
Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : 4
Table des matières
Introduction ...........................................................................................................................6
Partie théorique
IST : Généralités......................................................................................................................7
Cibles analytiques ...................................................................................................................8
Neisseria gonorrhoeae ........................................................................................................8
Epidémiologie..................................................................................................................8
Pouvoir pathogène ..........................................................................................................9
Prélèvements ..................................................................................................................9
Résistances ....................................................................................................................10
Culture ..........................................................................................................................10
Prophylaxie ...................................................................................................................10
Traitement ....................................................................................................................11
Chlamydia trachomatis .....................................................................................................11
Epidémiologie................................................................................................................12
Pouvoir pathogène ........................................................................................................12
Prélèvement ..................................................................................................................13
Résistance .....................................................................................................................14
Culture ..........................................................................................................................14
Prophylaxie ...................................................................................................................14
Traitement ....................................................................................................................14
Méthode d’analyse ...............................................................................................................15
Via les kits Abbott mSample Preparation SystemDNA et Abbott RealTime CT/NG Assay .....15
Extraction d’ADN et ajout de mix PCR ...............................................................................16
Réactifs .........................................................................................................................16
Principe .........................................................................................................................16
PCR ...................................................................................................................................17
Réactifs .........................................................................................................................17
Principe .........................................................................................................................18
Informations pratiques .....................................................................................................19
Pour 48 échantillons ......................................................................................................19
Via les kits STARMag 96x4 Universal et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay ..................20
Extraction d’ADN et ajout de mix PCR ...............................................................................21
5
Réactifs .........................................................................................................................21
Principe .........................................................................................................................22
PCR ...................................................................................................................................22
Réactifs .........................................................................................................................22
Principe .........................................................................................................................24
Informations pratiques .....................................................................................................25
Tests utilisés pour l’analyse pratique ....................................................................................26
Objectif et stratégie ..............................................................................................................29
Partie pratique
Résultats et discussions ........................................................................................................30
Comparatifs du kit Abbott CT/NG RealTime Assay et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay
.........................................................................................................................................30
Taux d’invalide ..............................................................................................................30
Tests pour l’analyse du kit Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay ......................................32
Spécificité : ....................................................................................................................33
Sensibilité : ....................................................................................................................33
Linéarité : ......................................................................................................................34
Intra-run : ......................................................................................................................38
Inter-run: .......................................................................................................................39
Prévalence de positifs à Trichomonas Vaginalis et Mycoplasma génitalium : .................39
Discussion .........................................................................................................................40
Conclusion ............................................................................................................................43
Glossaire...............................................................................................................................44
Abréviations ..................................................................................................................44
Définitions .....................................................................................................................44
Bibliographie ........................................................................................................................46
Annexes................................................................................................................................50
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=112110 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire
Titre : Evaluation du kit "Osom® Trichomonas Rapid Test" pour la recherche de l'antigène du Trichomonas vaginalis sur les frottis génitaux. Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Nicolas PLATTEAU, Auteur ; Salah Eddine Lali, Directeur de la recherche Année de publication : 2015 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Hôpital Marie Curie antigène Trichomonas vaginalis // frottis génitaux kit "Osom® Trichomonas Rapid Test Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Résumé.
Ce travail de fin d'études vise à évaluer le kit "Osom® Trichomonas Rapid Test" afin de déterminer si la méthode de détection actuelle n'est pas devenue obsolète et si son remplacement ne devait-il pas être envisagé? Pour cela, nous allons comparer les qualités de chaque méthode de détection. Actuellement, en routine, la détection du Trichomonas s'effectue par l'observation de l'échantillon à l'état frais au microscope à contraste de phase. On distingue le protozoaire grâce à sa mobilité qu'il acquiert grâce à ses nombreux flagelles. Malheureusement, la grande fragilité du micro-organisme face aux changements de conditions baisse la sensibilité du test. La sensibilité du kit "Osom® Trichomonas Rapid Test", utilisant la technique de l'immunochromatographie, n'est pas affectée par ce problème. Cependant, cette technique ne comporte pas effectivement que des avantages. Nous avons donc cherché des éventuels interférents et dans quelle mesure affectent-ils les résultats !Note de contenu : Table des matières
Présentation du laboratoire. ................................................................................................................... 7
1. Introduction. .................................................................................................................................... 8
2. Partie théorique. ............................................................................................................................. 9
2.1. Description du protozoaire. .................................................................................................... 9
2.2. Mécanisme du métabolisme. ................................................................................................ 10
2.3. Localisations et signes cliniques. ........................................................................................... 12
2.4. Diagnostic. ............................................................................................................................. 13
2.5. Traitement. ............................................................................................................................ 15
3. Partie pratique. .............................................................................................................................. 16
3.1. Objectifs et stratégies............................................................................................................ 16
3.2. Obstacles rencontrés. ............................................................................................................ 16
3.3. Matériel. ................................................................................................................................ 17
3.3.1. Tube de transport, Copan® ESWAB................................................................................ 17
3.3.2. Le microscope à contraste de phase. ............................................................................ 19
3.3.3. URIGLASS®. ..................................................................................................................... 21
3.4. Fonctionnement du kit Osom®. ............................................................................................. 21
3.4.1. Osom® : Principe. ........................................................................................................... 21
3.4.2. Osom®: Réactifs et Matériel. ......................................................................................... 22
3.4.3. Osom® : Mode opératoire. ............................................................................................. 23
3.4.4. Interprétation des résultats du test. ............................................................................. 24
3.4.5. Osom® : limite de procédure. ........................................................................................ 25
3.5. Tableau Comparatif des méthodes de détection. ................................................................. 26
4. Résultats et discussion. ................................................................................................................. 27
4.1. Tableau des résultats. ........................................................................................................... 27
4.2. Discussion des résultats. ....................................................................................................... 29
4.3. Tableau sensibilité et spécificité. .......................................................................................... 30
4.4. Tests interférents kit Osom®. ................................................................................................. 31
4.4.1. Interférence à Staphylococcus aureus. ......................................................................... 31
4.4.1.1. Test interférent kit Osom®, mode opératoire. .......................................................... 31
4.4.1.2. Test interférent kit Osom®, tableau des résultats. .................................................... 32
4.4.2. Interférence au sang...................................................................................................... 32
6
4.4.2.1. Test interférent kit Osom®, mode opératoire. .......................................................... 32
4.4.2.2. Test interférent kit Osom®, tableau des résultats. .................................................... 33
5. Conclusion. .................................................................................................................................... 34
Glossaire. ............................................................................................................................................... 35
Liste des figures. .................................................................................................................................... 36
Abréviations. ......................................................................................................................................... 37
Bibliographie. ........................................................................................................................................ 38Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=64048 Evaluation du kit "Osom® Trichomonas Rapid Test" pour la recherche de l'antigène du Trichomonas vaginalis sur les frottis génitaux. [TFE / Mémoire] / Nicolas PLATTEAU, Auteur ; Salah Eddine Lali, Directeur de la recherche . - 2015.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale Hôpital Marie Curie antigène Trichomonas vaginalis // frottis génitaux kit "Osom® Trichomonas Rapid Test Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Résumé.
Ce travail de fin d'études vise à évaluer le kit "Osom® Trichomonas Rapid Test" afin de déterminer si la méthode de détection actuelle n'est pas devenue obsolète et si son remplacement ne devait-il pas être envisagé? Pour cela, nous allons comparer les qualités de chaque méthode de détection. Actuellement, en routine, la détection du Trichomonas s'effectue par l'observation de l'échantillon à l'état frais au microscope à contraste de phase. On distingue le protozoaire grâce à sa mobilité qu'il acquiert grâce à ses nombreux flagelles. Malheureusement, la grande fragilité du micro-organisme face aux changements de conditions baisse la sensibilité du test. La sensibilité du kit "Osom® Trichomonas Rapid Test", utilisant la technique de l'immunochromatographie, n'est pas affectée par ce problème. Cependant, cette technique ne comporte pas effectivement que des avantages. Nous avons donc cherché des éventuels interférents et dans quelle mesure affectent-ils les résultats !Note de contenu : Table des matières
Présentation du laboratoire. ................................................................................................................... 7
1. Introduction. .................................................................................................................................... 8
2. Partie théorique. ............................................................................................................................. 9
2.1. Description du protozoaire. .................................................................................................... 9
2.2. Mécanisme du métabolisme. ................................................................................................ 10
2.3. Localisations et signes cliniques. ........................................................................................... 12
2.4. Diagnostic. ............................................................................................................................. 13
2.5. Traitement. ............................................................................................................................ 15
3. Partie pratique. .............................................................................................................................. 16
3.1. Objectifs et stratégies............................................................................................................ 16
3.2. Obstacles rencontrés. ............................................................................................................ 16
3.3. Matériel. ................................................................................................................................ 17
3.3.1. Tube de transport, Copan® ESWAB................................................................................ 17
3.3.2. Le microscope à contraste de phase. ............................................................................ 19
3.3.3. URIGLASS®. ..................................................................................................................... 21
3.4. Fonctionnement du kit Osom®. ............................................................................................. 21
3.4.1. Osom® : Principe. ........................................................................................................... 21
3.4.2. Osom®: Réactifs et Matériel. ......................................................................................... 22
3.4.3. Osom® : Mode opératoire. ............................................................................................. 23
3.4.4. Interprétation des résultats du test. ............................................................................. 24
3.4.5. Osom® : limite de procédure. ........................................................................................ 25
3.5. Tableau Comparatif des méthodes de détection. ................................................................. 26
4. Résultats et discussion. ................................................................................................................. 27
4.1. Tableau des résultats. ........................................................................................................... 27
4.2. Discussion des résultats. ....................................................................................................... 29
4.3. Tableau sensibilité et spécificité. .......................................................................................... 30
4.4. Tests interférents kit Osom®. ................................................................................................. 31
4.4.1. Interférence à Staphylococcus aureus. ......................................................................... 31
4.4.1.1. Test interférent kit Osom®, mode opératoire. .......................................................... 31
4.4.1.2. Test interférent kit Osom®, tableau des résultats. .................................................... 32
4.4.2. Interférence au sang...................................................................................................... 32
6
4.4.2.1. Test interférent kit Osom®, mode opératoire. .......................................................... 32
4.4.2.2. Test interférent kit Osom®, tableau des résultats. .................................................... 33
5. Conclusion. .................................................................................................................................... 34
Glossaire. ............................................................................................................................................... 35
Liste des figures. .................................................................................................................................... 36
Abréviations. ......................................................................................................................................... 37
Bibliographie. ........................................................................................................................................ 38Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=64048 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire
