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Étude du statut de méthylation de MGMT par pyroséquençage avec la trousse therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen). Vérification de la méthode / Alexandra Luquain in Annales de Biologie Clinique, 73/6 (Novembre - Décembre 2015)
[article]
Titre : Étude du statut de méthylation de MGMT par pyroséquençage avec la trousse therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen). Vérification de la méthode Type de document : texte imprimé Auteurs : Alexandra Luquain, Auteur ; Sandrine Magnin, Auteur ; David Guenat, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : 665-670 Langues : Français (fre) Mots-clés : MGMT méthylation pyroséquençage vérification sur site validation de méthode norme ISO 15189 Résumé : La méthylation du promoteur du gène MGMT, codant l’enzyme ubiquitaire O6-méthylguanine-méthyltransférase, est un marqueur théranostique de bon pronostic des glioblastomes traités par chimiothérapie alkylante (témozolomide, Temodal®). Parmi les techniques d’analyse de méthylation, le pyroséquençage est une méthode quantitative reproductible et sensible. L’objectif de notre étude, menée dans le cadre de l’accréditation de la plateforme hospitalière de génétique moléculaire des cancers de Besançon, était de vérifier les performances de la trousse commerciale de pyroséquençage therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen) en termes de répétabilité, reproductibilité, limite du blanc (LOB), limite de détection (LOD), linéarité et contamination selon le guide SH GTA 04 du Cofrac. Les tests de répétabilité montrent une moyenne de méthylation de 3,22 % [écart type (SD) = 0,41, coefficient de variation (CV) = 12,75 %] pour le témoin non méthylé et de 70,16 % (SD = 2,20, CV = 3,14 %) pour le témoin méthylé. L’évaluation de la fidélité confirme l’efficacité du test avec une moyenne de méthylation du témoin non méthylé de 1,39 % (SD = 0,25, CV = 18,25 %) et de 94,03 % (SD = 2,56, CV = 2,73 %) pour le témoin méthylé. La LOB et la LOD sont respectivement de 3,43 % et 6,22 % de méthylation. Un coefficient de régression de 0,983 confirme la linéarité du test.Aucune contamination n’a été observée. Plus de 40 % des glioblastomes étudiés en 2013 dans notre laboratoire ont présenté un gène MGMT méthylé. Nos résultats indiquent que la trousse therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen) présente des performances conformes aux exigences de qualité de la norme NF EN ISO 15189 pour l’analyse du statut de méthylation de MGMT dans les glioblastomes. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66358
in Annales de Biologie Clinique > 73/6 (Novembre - Décembre 2015) . - 665-670[article] Étude du statut de méthylation de MGMT par pyroséquençage avec la trousse therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen). Vérification de la méthode [texte imprimé] / Alexandra Luquain, Auteur ; Sandrine Magnin, Auteur ; David Guenat, Auteur . - 2015 . - 665-670.
Langues : Français (fre)
in Annales de Biologie Clinique > 73/6 (Novembre - Décembre 2015) . - 665-670
Mots-clés : MGMT méthylation pyroséquençage vérification sur site validation de méthode norme ISO 15189 Résumé : La méthylation du promoteur du gène MGMT, codant l’enzyme ubiquitaire O6-méthylguanine-méthyltransférase, est un marqueur théranostique de bon pronostic des glioblastomes traités par chimiothérapie alkylante (témozolomide, Temodal®). Parmi les techniques d’analyse de méthylation, le pyroséquençage est une méthode quantitative reproductible et sensible. L’objectif de notre étude, menée dans le cadre de l’accréditation de la plateforme hospitalière de génétique moléculaire des cancers de Besançon, était de vérifier les performances de la trousse commerciale de pyroséquençage therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen) en termes de répétabilité, reproductibilité, limite du blanc (LOB), limite de détection (LOD), linéarité et contamination selon le guide SH GTA 04 du Cofrac. Les tests de répétabilité montrent une moyenne de méthylation de 3,22 % [écart type (SD) = 0,41, coefficient de variation (CV) = 12,75 %] pour le témoin non méthylé et de 70,16 % (SD = 2,20, CV = 3,14 %) pour le témoin méthylé. L’évaluation de la fidélité confirme l’efficacité du test avec une moyenne de méthylation du témoin non méthylé de 1,39 % (SD = 0,25, CV = 18,25 %) et de 94,03 % (SD = 2,56, CV = 2,73 %) pour le témoin méthylé. La LOB et la LOD sont respectivement de 3,43 % et 6,22 % de méthylation. Un coefficient de régression de 0,983 confirme la linéarité du test.Aucune contamination n’a été observée. Plus de 40 % des glioblastomes étudiés en 2013 dans notre laboratoire ont présenté un gène MGMT méthylé. Nos résultats indiquent que la trousse therascreen®MGMT Pyro® (Qiagen) présente des performances conformes aux exigences de qualité de la norme NF EN ISO 15189 pour l’analyse du statut de méthylation de MGMT dans les glioblastomes. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66358 Réservation
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Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Armoires à volets Disponible
DisponiblePrognostic significance of MGMT methylation and expression of MGMT, P53, EGFR, MDM2 and PTEN in globlastoma multiforme / Sarra Limam in Annales de Biologie Clinique, Vol. 77, n° 3 (Mai-juin 2019)
[article]
Titre : Prognostic significance of MGMT methylation and expression of MGMT, P53, EGFR, MDM2 and PTEN in globlastoma multiforme Titre original : Signification pronostique de la méthylation de MGMT et l’expression de protéines MGMT, P53, EGFR, MDM2 et PTEN dans le glioblastome multiforme Type de document : texte imprimé Auteurs : Sarra Limam ; Mohamed Tahar Yacoubi ; Moncef Mokni ; Boulbaba Selmi ; Sarra Mestiri ; Nihed Abdessayed ; Nabiha Missaoui Année de publication : 2019 Article en page(s) : p. 307-317 Langues : Français (fre) Mots-clés : Glioblastome histochimie Méthylation Pronostic Résumé : L’étude a examiné le pattern méthylation du promoteur MGMT et l’expression des protéines MGMT, P53, EGFR, MDM2 et PTEN dans les glioblastomes multiformes (GBM) et a évalué leur signification pronostique. Nous avons réalisé une étude rétrospective de 80 GBM. L’expression de MGMT ainsi que de P53, EGFR, MDM2 et PTEN a été étudiée par immunohistochimie. La méthylation du promoteur MGMT a été étudiée par PCR spécifique de méthylation de l’ADN modifié au bisulfite. Vingt-cinq GBM ont montré une expression de MGMT. La méthylation du promoteur MGMT a été détectée dans 35,1 % des cas. Aucune concordance significative n’a été identifiée entre la méthylation du promoteur MGMT et l’expression de MGMT (κ = -0,047, p = 0,11). La méthylation du promoteur MGMT était associée significativement à l’expression de PTEN (p = 0,001) : aucune autre association significative n’a été identifiée avec tous les paramètres cliniques ni avec l’expression de P53, EGFR et MDM2 (p > 0,05). La récidive tumorale était significativement associée au promoteur MGMT non méthylé (p = 0,01) mais pas à l’expression de MGMT (p = 0,51). La survie sans récidive était significativement meilleure chez les patients présentant un promoteur MGMT méthylé (log rank, p < 0,0001) et une expression de PTEN (log rank, p = 0,025) mais pas avec une expression de MGMT (log rank, p = 0,308). De plus, à l’aide d’une analyse univariée, la méthylation du promoteur MGMT (p = 0,001) et l’expression de PTEN (p = 0,044) étaient associées de manière significative à la RFS. En analyse multivariée, seule la méthylation du promoteur MGMT était associée de manière significative à la RFS (p = 0,003). Ensemble, nos résultats confirment que l’expression de MGMT ne reflète pas l’état de méthylation du promoteur MGMT. En outre, la méthylation du MGMT reste un marqueur pronostique utile des GBM chez les patients tunisiens. L’expression de PTEN pourrait être un marqueur pronostique potentiel de cette tumeur. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=80031
in Annales de Biologie Clinique > Vol. 77, n° 3 (Mai-juin 2019) . - p. 307-317[article] Prognostic significance of MGMT methylation and expression of MGMT, P53, EGFR, MDM2 and PTEN in globlastoma multiforme = Signification pronostique de la méthylation de MGMT et l’expression de protéines MGMT, P53, EGFR, MDM2 et PTEN dans le glioblastome multiforme [texte imprimé] / Sarra Limam ; Mohamed Tahar Yacoubi ; Moncef Mokni ; Boulbaba Selmi ; Sarra Mestiri ; Nihed Abdessayed ; Nabiha Missaoui . - 2019 . - p. 307-317.
Langues : Français (fre)
in Annales de Biologie Clinique > Vol. 77, n° 3 (Mai-juin 2019) . - p. 307-317
Mots-clés : Glioblastome histochimie Méthylation Pronostic Résumé : L’étude a examiné le pattern méthylation du promoteur MGMT et l’expression des protéines MGMT, P53, EGFR, MDM2 et PTEN dans les glioblastomes multiformes (GBM) et a évalué leur signification pronostique. Nous avons réalisé une étude rétrospective de 80 GBM. L’expression de MGMT ainsi que de P53, EGFR, MDM2 et PTEN a été étudiée par immunohistochimie. La méthylation du promoteur MGMT a été étudiée par PCR spécifique de méthylation de l’ADN modifié au bisulfite. Vingt-cinq GBM ont montré une expression de MGMT. La méthylation du promoteur MGMT a été détectée dans 35,1 % des cas. Aucune concordance significative n’a été identifiée entre la méthylation du promoteur MGMT et l’expression de MGMT (κ = -0,047, p = 0,11). La méthylation du promoteur MGMT était associée significativement à l’expression de PTEN (p = 0,001) : aucune autre association significative n’a été identifiée avec tous les paramètres cliniques ni avec l’expression de P53, EGFR et MDM2 (p > 0,05). La récidive tumorale était significativement associée au promoteur MGMT non méthylé (p = 0,01) mais pas à l’expression de MGMT (p = 0,51). La survie sans récidive était significativement meilleure chez les patients présentant un promoteur MGMT méthylé (log rank, p < 0,0001) et une expression de PTEN (log rank, p = 0,025) mais pas avec une expression de MGMT (log rank, p = 0,308). De plus, à l’aide d’une analyse univariée, la méthylation du promoteur MGMT (p = 0,001) et l’expression de PTEN (p = 0,044) étaient associées de manière significative à la RFS. En analyse multivariée, seule la méthylation du promoteur MGMT était associée de manière significative à la RFS (p = 0,003). Ensemble, nos résultats confirment que l’expression de MGMT ne reflète pas l’état de méthylation du promoteur MGMT. En outre, la méthylation du MGMT reste un marqueur pronostique utile des GBM chez les patients tunisiens. L’expression de PTEN pourrait être un marqueur pronostique potentiel de cette tumeur. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=80031 Réservation
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Cote Support Localisation Section Disponibilité Revue Revue Centre de Documentation HELHa Campus Montignies Armoires à volets Disponible
DisponibleInfluence of genetics and epigenetics on the process of muscle hypertrophy: a systematic review / Myriam Dianora Fajardo Colorado in Science & motricité, 121 (Mars 2023)
[article]
Titre : Influence of genetics and epigenetics on the process of muscle hypertrophy: a systematic review Titre original : Influence de la génétique et de l’épigénétique sur le processus d’hypertrophie musculaire : une revue systématique Type de document : texte imprimé Auteurs : Myriam Dianora Fajardo Colorado ; Rodney Correa Jaramillo ; Luis Fernando González Arango Année de publication : 2023 Article en page(s) : p. 59-72 Langues : Français (fre) Mots-clés : sport MSTN ADN méthylation Résumé : L’hypertrophie musculaire est l’augmentation de la taille du diamètre transversal des fibres musculaires. Bien que les mécanismes et les voies de signalisation qui régulent l’hypertrophie soient connus, on ne sait pas encore très bien dans quelle mesure la génétique et l’épigénétique contribuent à ce processus ; si les deux mécanismes participent conjointement ou si l’influence d’un événement est plus grande que celle de l’autre. Par conséquent, cette étude visait à examiner de manière approfondie la littérature et à tenter de déterminer le rôle des gènes et des mécanismes épigénétiques dans la régulation de l’hypertrophie musculaire associée à l’activité physique et/ou sportive. À cette fin, les bases de données Scopus et ScienceDirect ont été examinées, et les moteurs de recherche PubMed et Google Scholar ont été utilisés, où 25 articles répondaient aux critères d’inclusion. Les résultats ont démontré qu’il existe plusieurs gènes régulateurs de l’hypertrophie musculaire tels que MSTN, PGC-1 α, STARS, JunB, entre autres, ainsi que des polymorphismes génétiques, et une participation importante de la méthylation de l’ADN, qui ensemble contrôleraient les voies de signalisation et les réseaux de gènes importants pour le développement de ce processus. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113252
in Science & motricité > 121 (Mars 2023) . - p. 59-72[article] Influence of genetics and epigenetics on the process of muscle hypertrophy: a systematic review = Influence de la génétique et de l’épigénétique sur le processus d’hypertrophie musculaire : une revue systématique [texte imprimé] / Myriam Dianora Fajardo Colorado ; Rodney Correa Jaramillo ; Luis Fernando González Arango . - 2023 . - p. 59-72.
Langues : Français (fre)
in Science & motricité > 121 (Mars 2023) . - p. 59-72
Mots-clés : sport MSTN ADN méthylation Résumé : L’hypertrophie musculaire est l’augmentation de la taille du diamètre transversal des fibres musculaires. Bien que les mécanismes et les voies de signalisation qui régulent l’hypertrophie soient connus, on ne sait pas encore très bien dans quelle mesure la génétique et l’épigénétique contribuent à ce processus ; si les deux mécanismes participent conjointement ou si l’influence d’un événement est plus grande que celle de l’autre. Par conséquent, cette étude visait à examiner de manière approfondie la littérature et à tenter de déterminer le rôle des gènes et des mécanismes épigénétiques dans la régulation de l’hypertrophie musculaire associée à l’activité physique et/ou sportive. À cette fin, les bases de données Scopus et ScienceDirect ont été examinées, et les moteurs de recherche PubMed et Google Scholar ont été utilisés, où 25 articles répondaient aux critères d’inclusion. Les résultats ont démontré qu’il existe plusieurs gènes régulateurs de l’hypertrophie musculaire tels que MSTN, PGC-1 α, STARS, JunB, entre autres, ainsi que des polymorphismes génétiques, et une participation importante de la méthylation de l’ADN, qui ensemble contrôleraient les voies de signalisation et les réseaux de gènes importants pour le développement de ce processus. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113252 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Nouveaux marqueurs développés pour le dépistage des cancers liés aux HPV / Valentine Marie Ferré in RFL : Revue Francophone des Laboratoires, 558 (janvier 2024)
[article]
Titre : Nouveaux marqueurs développés pour le dépistage des cancers liés aux HPV Type de document : texte imprimé Auteurs : Valentine Marie Ferré ; Julie Brousseau ; Charlotte Charpentier ; Hélène Péré Année de publication : 2024 Article en page(s) : p. 46-58 Note générale : https://doi.org/10.1016/S1773-035X(24)00048-0 Langues : Français (fre) Mots-clés : cancer dépistage méthylation papillomavirus sérologie Résumé : Les papillomavirus humains à haut risque oncogène (HPV-HR) sont des virus à tropisme muqueux dont la persistance est responsable du développement de cancers. Un HPV-HR est retrouvé dans près de 100 % des cas de cancer du col, 90 % des cancers anaux, 50 % des cancers génitaux et 30 % des cancers ORL. Les oncoprotéines E6 et E7 des HPV-HR, l’intégration du génome viral et des mécanisme épigénétiques participent à la mise en place du processus carcinogène. Parmi les marqueurs biologiques associés à la présence de lésions précancéreuses ou cancéreuses, on retrouve la détection et le typage des HPV-HR, le double immunomarquage pl6/Ki67, l’analyse de méthylation des gènes viraux ou cellulaires, l’intégration du génome viral ou encore la sérologie dirigée contre les oncoprotéines virales. Néanmoins, tous ces marqueurs n’ont pas la même performance et celle-ci varie en fonction du type de cancer. Pour celui du col, la détection des HPV-HR a un rôle central dans le dépistage et les autres biomarqueurs, notamment de méthylation, doivent encore être évalués et bénéficier de processus d’automatisation avant de trouver leur place dans l’algorithme de dépistage. Pour le cancer de l’anus, le typage de l’HPV16 a récemment intégré l’algorithme de dépistage tandis que la méthylation et la sérologie doivent encore bénéficier de validations cliniques pour confirmer leur intérêt. Les cancers ORL liés aux HPV ne bénéficient pas, à ce jour, de biomarqueurs pertinents de dépistage. Les nouveaux développés présentent souvent une très bonne sensibilité, mais une spécificité insuffisante pour envisager leur utilisation dans le cadre d’une stratégie de dépistage. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=115543
in RFL : Revue Francophone des Laboratoires > 558 (janvier 2024) . - p. 46-58[article] Nouveaux marqueurs développés pour le dépistage des cancers liés aux HPV [texte imprimé] / Valentine Marie Ferré ; Julie Brousseau ; Charlotte Charpentier ; Hélène Péré . - 2024 . - p. 46-58.
https://doi.org/10.1016/S1773-035X(24)00048-0
Langues : Français (fre)
in RFL : Revue Francophone des Laboratoires > 558 (janvier 2024) . - p. 46-58
Mots-clés : cancer dépistage méthylation papillomavirus sérologie Résumé : Les papillomavirus humains à haut risque oncogène (HPV-HR) sont des virus à tropisme muqueux dont la persistance est responsable du développement de cancers. Un HPV-HR est retrouvé dans près de 100 % des cas de cancer du col, 90 % des cancers anaux, 50 % des cancers génitaux et 30 % des cancers ORL. Les oncoprotéines E6 et E7 des HPV-HR, l’intégration du génome viral et des mécanisme épigénétiques participent à la mise en place du processus carcinogène. Parmi les marqueurs biologiques associés à la présence de lésions précancéreuses ou cancéreuses, on retrouve la détection et le typage des HPV-HR, le double immunomarquage pl6/Ki67, l’analyse de méthylation des gènes viraux ou cellulaires, l’intégration du génome viral ou encore la sérologie dirigée contre les oncoprotéines virales. Néanmoins, tous ces marqueurs n’ont pas la même performance et celle-ci varie en fonction du type de cancer. Pour celui du col, la détection des HPV-HR a un rôle central dans le dépistage et les autres biomarqueurs, notamment de méthylation, doivent encore être évalués et bénéficier de processus d’automatisation avant de trouver leur place dans l’algorithme de dépistage. Pour le cancer de l’anus, le typage de l’HPV16 a récemment intégré l’algorithme de dépistage tandis que la méthylation et la sérologie doivent encore bénéficier de validations cliniques pour confirmer leur intérêt. Les cancers ORL liés aux HPV ne bénéficient pas, à ce jour, de biomarqueurs pertinents de dépistage. Les nouveaux développés présentent souvent une très bonne sensibilité, mais une spécificité insuffisante pour envisager leur utilisation dans le cadre d’une stratégie de dépistage. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=115543 Réservation
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