Centre de Documentation Campus Montignies
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Lundi : 8h-18h30
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Mercredi 9h-16h30
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Vendredi : 8h-16h30
Attention, votre centre de documentation sera fermé du 27/04 au 12/05 inclus.
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Comparaison de la méthode de diffusion sur gélose et la méthode des microdilutions ou Sensititre® pour la sensibilité des Bacilles Gram négatif au Céfidérocol. / Boris Joseph Nganwoua Wonkam
Titre : Comparaison de la méthode de diffusion sur gélose et la méthode des microdilutions ou Sensititre® pour la sensibilité des Bacilles Gram négatif au Céfidérocol. Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Boris Joseph Nganwoua Wonkam, Auteur ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2021 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : gélose microdilutions Sensititre® Bacilles Gram négatif Céfidérocol CHU DINANT-GODINNE Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE..............................................................5
INTRODUCTION GENERALE.........................................................................6
I. PARTIE THEORIQUE......................................................................7
1 Les bactéries ....................................................................................................................... 8
2 Les antibiotiques ................................................................................................................ 9
3 Classification et mécanismes d’action des antibiotiques ................................................... 9
3.1 Classification.............................................................................................................. 9
3.2 Mécanisme d’action des antibiotiques ....................................................................... 9
3.2.1 Inhibition de la synthèse de la paroi..................................................................... 9
3.2.1.1 Les β-lactamines ........................................................................................... 9
3.2.1.2 Glycopeptides ............................................................................................. 14
3.2.1.3 Fosfomycine................................................................................................ 14
3.2.1.4 Le Céfidérocol ............................................................................................ 12
3.2.2 Inhibition de la synthèse et/ou le fonctionnement de l’ADN bactérien ............. 15
3.2.3 Inhibition de la synthèse des protéines............................................................... 15
3.2.4 Inhibition agissant au niveau de la membrane ................................................... 15
3.3 La résistance aux antibiotiques ................................................................................ 15
3.3.1 Epidémiologie .................................................................................................... 15
3.3.2 Les principaux mécanismes de résistance.......................................................... 17
3.3.2.1 L’inactivation enzymatique ........................................................................ 17
3.3.2.2 Modification de la cible .............................................................................. 19
3.3.2.2.1 Diminution de l’affinité pour la β-lactamine.......................................... 19
3.3.2.2.2 Hyperproduction de la cible ................................................................... 19
3.3.3 Modification de la perméabilité ......................................................................... 19
3.3.4 La pompe à efflux .............................................................................................. 20
3.4 Détermination de la sensibilité d’une bactérie à un antibiotique ............................. 21
3.4.1 Antibiogramme et CMI ...................................................................................... 21
3.4.2 Les méthodes de détermination de la CMI......................................................... 21
3.4.2.1 La méthode de dilution en milieu liquide ................................................... 21
3.4.2.2 La méthode de diffusion sur gélose ou méthode des disques ..................... 22
3.4.2.3 CMI en milieu gélosé par la méthode des E-test® ..................................... 23
3.4.2.4 La méthode de dilution sur Agar ................................................................ 24
4 Objectifs du travail et Stratégies ...................................................................................... 24
4
II. PARTIE PRATIQUE.................................................................................25
1 Identification des souches par MALDI-TOF ................................................................... 26
2 Détermination de la CMI par la méthode par microdilution Sensititre®......................... 27
2.1 Principe..................................................................................................................... 27
2.2 Préparation des échantillons..................................................................................... 27
2.3 Matériels et Appareils .............................................................................................. 28
2.4 Méthode.................................................................................................................... 29
3 La méthode de diffusion en gélose ou méthode des disques............................................ 30
3.1 Principe..................................................................................................................... 30
3.2 Matériels et réactifs utilisés...................................................................................... 30
3.3 Méthode.................................................................................................................... 31
4 Résultats ........................................................................................................................... 32
4.1 Méthode des microdilutions ou Sensititre®............................................................. 32
4.2 Méthode de diffusion sur gélose .............................................................................. 33
4.3 Comparaison entre la méthode des microdilutions et la méthode de diffusion en gélose
.............................................................................................................................................. 34
5 Discussion ........................................................................................................................ 36
6 Difficultés rencontrées ..................................................................................................... 38
CONCLUSION ........................................................................................................................ 39
RESUME.................................................................................................................................. 40
GLOSSAIRE ............................................................................................................................ 41
LISTE DES FIGURES............................................................................................................. 42
LISTE DES TABLEAUX ........................................................................................................ 43
LISTE DES ABREVIATIONS ................................................................................................ 44
BIBLIOGRAPHIES ................................................................................................................. 45
ANNEXES ............................................................................................................................... 49
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=100299 Comparaison de la méthode de diffusion sur gélose et la méthode des microdilutions ou Sensititre® pour la sensibilité des Bacilles Gram négatif au Céfidérocol. [TFE / Mémoire] / Boris Joseph Nganwoua Wonkam, Auteur ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2021.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur
Langues : Français (fre)
Mots-clés : gélose microdilutions Sensititre® Bacilles Gram négatif Céfidérocol CHU DINANT-GODINNE Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE..............................................................5
INTRODUCTION GENERALE.........................................................................6
I. PARTIE THEORIQUE......................................................................7
1 Les bactéries ....................................................................................................................... 8
2 Les antibiotiques ................................................................................................................ 9
3 Classification et mécanismes d’action des antibiotiques ................................................... 9
3.1 Classification.............................................................................................................. 9
3.2 Mécanisme d’action des antibiotiques ....................................................................... 9
3.2.1 Inhibition de la synthèse de la paroi..................................................................... 9
3.2.1.1 Les β-lactamines ........................................................................................... 9
3.2.1.2 Glycopeptides ............................................................................................. 14
3.2.1.3 Fosfomycine................................................................................................ 14
3.2.1.4 Le Céfidérocol ............................................................................................ 12
3.2.2 Inhibition de la synthèse et/ou le fonctionnement de l’ADN bactérien ............. 15
3.2.3 Inhibition de la synthèse des protéines............................................................... 15
3.2.4 Inhibition agissant au niveau de la membrane ................................................... 15
3.3 La résistance aux antibiotiques ................................................................................ 15
3.3.1 Epidémiologie .................................................................................................... 15
3.3.2 Les principaux mécanismes de résistance.......................................................... 17
3.3.2.1 L’inactivation enzymatique ........................................................................ 17
3.3.2.2 Modification de la cible .............................................................................. 19
3.3.2.2.1 Diminution de l’affinité pour la β-lactamine.......................................... 19
3.3.2.2.2 Hyperproduction de la cible ................................................................... 19
3.3.3 Modification de la perméabilité ......................................................................... 19
3.3.4 La pompe à efflux .............................................................................................. 20
3.4 Détermination de la sensibilité d’une bactérie à un antibiotique ............................. 21
3.4.1 Antibiogramme et CMI ...................................................................................... 21
3.4.2 Les méthodes de détermination de la CMI......................................................... 21
3.4.2.1 La méthode de dilution en milieu liquide ................................................... 21
3.4.2.2 La méthode de diffusion sur gélose ou méthode des disques ..................... 22
3.4.2.3 CMI en milieu gélosé par la méthode des E-test® ..................................... 23
3.4.2.4 La méthode de dilution sur Agar ................................................................ 24
4 Objectifs du travail et Stratégies ...................................................................................... 24
4
II. PARTIE PRATIQUE.................................................................................25
1 Identification des souches par MALDI-TOF ................................................................... 26
2 Détermination de la CMI par la méthode par microdilution Sensititre®......................... 27
2.1 Principe..................................................................................................................... 27
2.2 Préparation des échantillons..................................................................................... 27
2.3 Matériels et Appareils .............................................................................................. 28
2.4 Méthode.................................................................................................................... 29
3 La méthode de diffusion en gélose ou méthode des disques............................................ 30
3.1 Principe..................................................................................................................... 30
3.2 Matériels et réactifs utilisés...................................................................................... 30
3.3 Méthode.................................................................................................................... 31
4 Résultats ........................................................................................................................... 32
4.1 Méthode des microdilutions ou Sensititre®............................................................. 32
4.2 Méthode de diffusion sur gélose .............................................................................. 33
4.3 Comparaison entre la méthode des microdilutions et la méthode de diffusion en gélose
.............................................................................................................................................. 34
5 Discussion ........................................................................................................................ 36
6 Difficultés rencontrées ..................................................................................................... 38
CONCLUSION ........................................................................................................................ 39
RESUME.................................................................................................................................. 40
GLOSSAIRE ............................................................................................................................ 41
LISTE DES FIGURES............................................................................................................. 42
LISTE DES TABLEAUX ........................................................................................................ 43
LISTE DES ABREVIATIONS ................................................................................................ 44
BIBLIOGRAPHIES ................................................................................................................. 45
ANNEXES ............................................................................................................................... 49
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=100299 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Comparaison de méthodes de détermination de sensibilité à la colistine chez les entérobactéries, les Pseudomonas et les Acinetobacter. / Yves Van Wijnsberghe
Titre : Comparaison de méthodes de détermination de sensibilité à la colistine chez les entérobactéries, les Pseudomonas et les Acinetobacter. Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Yves Van Wijnsberghe, Auteur ; Julie Schmitz, Directeur de la recherche Année de publication : 2017 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale CHU Dinant-Godinne UCL Namur CNR microbiologie Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Présentation du lieu de stage......................................................................................................... 4
Introduction théorique .................................................................................................................. 5
Notions générales ..................................................................................................................... 5
Qu’est-ce qu’un bacille Gram négatif ? ....................................................................................... 5
Les entérobactéries................................................................................................................ 6
Les bacilles Gram négatif non fermentants .............................................................................. 6
Les bactéries multi-résistantes ................................................................................................... 7
Définition d’un antibiotique.................................................................................................... 7
Historique ............................................................................................................................. 7
Les enjeux ............................................................................................................................. 8
Mécanismes d’actions des antibiotiques ..................................................................................... 9
Mécanismes de défense bactérienne.........................................................................................10
Acquisition de résistance ..........................................................................................................12
La séquence d’insertion (IS) ...................................................................................................12
Le transposon .......................................................................................................................12
Le système : intégrons - gènes casettes ..................................................................................14
Concentration Minimale Inhibitrice (CMI) ..................................................................................14
Concentration minimale bactéricide (CMB) ................................................................................14
Le rapport CMB/CMI ................................................................................................................14
La colistine ...............................................................................................................................15
Mécanismes d’actions de la colistine .........................................................................................16
Mécanismes de résistance à la colistine .....................................................................................17 Résistance à la colistine acquise par mutation ........................................................................17
Les gènes dépendant des deux composantes PmrA-PmrB et PhoP-PhoQ..................................18
Les gènes non liés aux composantes PhoPQ et PmrAB ............................................................21
Les résistances acquises par transmission de plasmide ...............................................................22
Les plasmides véhiculant les gènes de résistances...................................................................24
Méthodes de détermination des résistances et des sensibilités bactériennes à la colistine ...........24
Méthode du Sensititre™ (Thermo Scientific) ...........................................................................25
Méthode UMIC (Biocentric) ...................................................................................................25
Méthode MIC-Strip (Merlin) ..................................................................................................26
L’origine des souches................................................................................................................26
Détermination de l’espèce bactérienne (Maldi-TOF) ...............................................................27
Page | 2
Détermination de sensibilité à la colistine chez les bacilles Gram négatif pathogènes
Les souches American type culture collection (ATCC)..................................................................29
Que sont-elles ? ....................................................................................................................29
La souche de collection .............................................................................................................30
Validation technique .............................................................................................................30
Validation clinique ................................................................................................................32
But du stage ................................................................................................................................34
Matériel & méthodes ...................................................................................................................34
Les souches..............................................................................................................................34
Mise en culture des souches bactériennes d’intérêts ..............................................................36
Méthode Sensititre™ (Thermo Scientific) ...................................................................................36
Mode opératoire ..................................................................................................................36
Matériel & stockage ..............................................................................................................37
Méthode MIC-STRIP .................................................................................................................37
Mode opératoire ..................................................................................................................37
Matériel & stockage ..............................................................................................................38
Méthode UMIC ........................................................................................................................38
Mode opératoire ..................................................................................................................38
Matériel & stockage ..............................................................................................................38
Protocole généralisé .................................................................................................................39
Résultats .....................................................................................................................................40
Validation technique ................................................................................................................40
Validation clinique....................................................................................................................41
Méthode MIC-Strip (Merlin) ..................................................................................................41
Méthode UMIC (Biocentric) ...................................................................................................42
Comparaison de la méthode UMIC à la méthode MIC-Strip .....................................................44
Discussion....................................................................................................................................44
Validation technique ................................................................................................................44
Validation clinique....................................................................................................................44
Méthode MIC-Strip (Merlin) ..................................................................................................44
Méthode UMIC (Biocentric) ...................................................................................................47
Comparaison de la méthode UMIC à la méthode MIC-Strip .....................................................48
Conclusion ...................................................................................................................................49
Liste des tableaux.........................................................................................................................51
Liste des figures ...........................................................................................................................52
Page | 3
Détermination de sensibilité à la colistine chez les bacilles Gram négatif pathogènes
Liste des abréviations ...................................................................................................................53
Bibliographie ...............................................................................................................................54
Annexes ......................................................................................................................................58
Validation technique résultats bruts ..........................................................................................58
ATCC Escherichia coli ............................................................................................................58
ATCC Pseudomonas aeruginosa 27853 ...................................................................................59
Souche de collection S08-56 ..................................................................................................61Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65863 Comparaison de méthodes de détermination de sensibilité à la colistine chez les entérobactéries, les Pseudomonas et les Acinetobacter. [TFE / Mémoire] / Yves Van Wijnsberghe, Auteur ; Julie Schmitz, Directeur de la recherche . - 2017.
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Mots-clés : biologie médicale CHU Dinant-Godinne UCL Namur CNR microbiologie Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : Table des matières
Présentation du lieu de stage......................................................................................................... 4
Introduction théorique .................................................................................................................. 5
Notions générales ..................................................................................................................... 5
Qu’est-ce qu’un bacille Gram négatif ? ....................................................................................... 5
Les entérobactéries................................................................................................................ 6
Les bacilles Gram négatif non fermentants .............................................................................. 6
Les bactéries multi-résistantes ................................................................................................... 7
Définition d’un antibiotique.................................................................................................... 7
Historique ............................................................................................................................. 7
Les enjeux ............................................................................................................................. 8
Mécanismes d’actions des antibiotiques ..................................................................................... 9
Mécanismes de défense bactérienne.........................................................................................10
Acquisition de résistance ..........................................................................................................12
La séquence d’insertion (IS) ...................................................................................................12
Le transposon .......................................................................................................................12
Le système : intégrons - gènes casettes ..................................................................................14
Concentration Minimale Inhibitrice (CMI) ..................................................................................14
Concentration minimale bactéricide (CMB) ................................................................................14
Le rapport CMB/CMI ................................................................................................................14
La colistine ...............................................................................................................................15
Mécanismes d’actions de la colistine .........................................................................................16
Mécanismes de résistance à la colistine .....................................................................................17 Résistance à la colistine acquise par mutation ........................................................................17
Les gènes dépendant des deux composantes PmrA-PmrB et PhoP-PhoQ..................................18
Les gènes non liés aux composantes PhoPQ et PmrAB ............................................................21
Les résistances acquises par transmission de plasmide ...............................................................22
Les plasmides véhiculant les gènes de résistances...................................................................24
Méthodes de détermination des résistances et des sensibilités bactériennes à la colistine ...........24
Méthode du Sensititre™ (Thermo Scientific) ...........................................................................25
Méthode UMIC (Biocentric) ...................................................................................................25
Méthode MIC-Strip (Merlin) ..................................................................................................26
L’origine des souches................................................................................................................26
Détermination de l’espèce bactérienne (Maldi-TOF) ...............................................................27
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Détermination de sensibilité à la colistine chez les bacilles Gram négatif pathogènes
Les souches American type culture collection (ATCC)..................................................................29
Que sont-elles ? ....................................................................................................................29
La souche de collection .............................................................................................................30
Validation technique .............................................................................................................30
Validation clinique ................................................................................................................32
But du stage ................................................................................................................................34
Matériel & méthodes ...................................................................................................................34
Les souches..............................................................................................................................34
Mise en culture des souches bactériennes d’intérêts ..............................................................36
Méthode Sensititre™ (Thermo Scientific) ...................................................................................36
Mode opératoire ..................................................................................................................36
Matériel & stockage ..............................................................................................................37
Méthode MIC-STRIP .................................................................................................................37
Mode opératoire ..................................................................................................................37
Matériel & stockage ..............................................................................................................38
Méthode UMIC ........................................................................................................................38
Mode opératoire ..................................................................................................................38
Matériel & stockage ..............................................................................................................38
Protocole généralisé .................................................................................................................39
Résultats .....................................................................................................................................40
Validation technique ................................................................................................................40
Validation clinique....................................................................................................................41
Méthode MIC-Strip (Merlin) ..................................................................................................41
Méthode UMIC (Biocentric) ...................................................................................................42
Comparaison de la méthode UMIC à la méthode MIC-Strip .....................................................44
Discussion....................................................................................................................................44
Validation technique ................................................................................................................44
Validation clinique....................................................................................................................44
Méthode MIC-Strip (Merlin) ..................................................................................................44
Méthode UMIC (Biocentric) ...................................................................................................47
Comparaison de la méthode UMIC à la méthode MIC-Strip .....................................................48
Conclusion ...................................................................................................................................49
Liste des tableaux.........................................................................................................................51
Liste des figures ...........................................................................................................................52
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Détermination de sensibilité à la colistine chez les bacilles Gram négatif pathogènes
Liste des abréviations ...................................................................................................................53
Bibliographie ...............................................................................................................................54
Annexes ......................................................................................................................................58
Validation technique résultats bruts ..........................................................................................58
ATCC Escherichia coli ............................................................................................................58
ATCC Pseudomonas aeruginosa 27853 ...................................................................................59
Souche de collection S08-56 ..................................................................................................61Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65863 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Evaluation des paramètres biologiques du stress oxydatif et du statut inflammatoire dans des populations spécifiques / Gilles DRUGMAND
Titre : Evaluation des paramètres biologiques du stress oxydatif et du statut inflammatoire dans des populations spécifiques Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Gilles DRUGMAND, Auteur Année de publication : 2014 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : BIOLOGIE MÉDICALE CHU DINANT-GODINNE STRESS OXYDATIF STATUT INFLAMMATOIRE HPLC IMMUNOESSAIS CHIMILUMINESCENCE REFLECTROMETRIE BNII ARCHITECT FUSION HYBORG ADAMS ELISA IL-6 CRP Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65384 Evaluation des paramètres biologiques du stress oxydatif et du statut inflammatoire dans des populations spécifiques [TFE / Mémoire] / Gilles DRUGMAND, Auteur . - 2014.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : BIOLOGIE MÉDICALE CHU DINANT-GODINNE STRESS OXYDATIF STATUT INFLAMMATOIRE HPLC IMMUNOESSAIS CHIMILUMINESCENCE REFLECTROMETRIE BNII ARCHITECT FUSION HYBORG ADAMS ELISA IL-6 CRP Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65384 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Mise au point et suivi biologique d’un composé monoclonal : application clinique / GIUSEPPE BORDENGA
Titre : Mise au point et suivi biologique d’un composé monoclonal : application clinique Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : GIUSEPPE BORDENGA, Auteur Année de publication : 2014 Langues : Français (fre) Mots-clés : BIOLOGIE MÉDICALE CHU DINANT-GODINNE UCL NAMUR COMPOSE MONOCLONAL GAMMAPATHIE ELECTROPHORESE IMMUNOFIXATION NEPHELOMETRIE Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65370 Mise au point et suivi biologique d’un composé monoclonal : application clinique [TFE / Mémoire] / GIUSEPPE BORDENGA, Auteur . - 2014.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : BIOLOGIE MÉDICALE CHU DINANT-GODINNE UCL NAMUR COMPOSE MONOCLONAL GAMMAPATHIE ELECTROPHORESE IMMUNOFIXATION NEPHELOMETRIE Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65370 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire