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Sélection de bactéries antagonistes à certains pathogènes du blé / Emilie Quertinmont
Titre : Sélection de bactéries antagonistes à certains pathogènes du blé Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Emilie Quertinmont, Auteur ; Jonathan Scauflaire, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie Année de publication : 2022 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : Université Catholique de Louvain Index. décimale : TFE Technologie animalière TFE Technologie animalière Résumé : La prise de conscience écologique, les contaminations environnementales et les effets secondaires relatifs aux pesticides poussent les chercheurs à trouver des alternatives naturelles à leur utilisation. Dans le cadre de ce travail de fin d’études, ce sont des bactéries antagonistes à différents pathogènes de Triticum aestivum qui sont recherchées. Les bactéries Gram négatives testées sont des Bacillus et Bacillus mycoides. Les Pantoea et
Pseudomonas sont, quant à elles, Gram négatives. Cette céréale est en effet touchée par de nombreux agents phytopathogènes tels que Fusarium graminearum, Zymoseptica tritici, Pythium aphanidermatum, Tapesia yallundae et Gaeumannomyces graminis tritici.
Pour cela, des expériences in vitro sont réalisées afin de déterminer les Bacillus mycoides les plus efficaces contre P. aphanidermatum, T. yallundae et G. graminis tritici.
Ensuite, différentes expériences in vivo sont mises en place. Tout d’abord afin de déterminer les bactéries les plus efficaces contre la germination de spores de F. graminearum. Ensuite, définir celles qui ont le meilleur effet antagoniste contre la septoriose lors de manipulations sur des feuilles détachées de blé. De plus, un surnageant de Pantoea agglomerans est produit afin de récupérer les métabolites actifs contre Z. tritici. Finalement des tests d’évaluation de la germination de grains de blé enrobés de bactéries déposés, ou non, sur du mycélium de F. graminearum sont réalisés.
Ces expériences ont permis de démontrer que certaines bactéries présentent un effet contre ces agents phytopathogènes lors des expérimentations. Concernant les B. mycoides, aucun ne présente d’effet contre T. yallundae et G. graminis tritici. Cependant, un ralentissement de la croissance de P. aphanidermatum a bien été prouvé lors de la présence des souches bactériennes CR12B5 et VDM052.
Toutes les bactéries testées dans le cas de la germination de spores de F. graminearum se sont montrées efficaces bien que certaines souches, comme P. poae CF10PS4, le soient plus que d’autres. Les tests sur feuilles détachées n’ont pas apporté de résultats concluants. Seule une souche de bactéries, B. mycoides 18AB5, a montré un effet puisqu’elle augmente la zone touchée par le pathogène.
Des métabolites actifs de P. agglomerans ont été produits et pourront être analysés par la suite.
Les souches B. mycoides A11Bb5 et P. agglomerans Pa19 ont montré une augmentation du taux de germination des grains de blé lorsque ceux-ci sont déposés dans du mycélium de F. graminearum.
Finalement, différentes bactéries sont efficaces concernant le taux de germination des grains de blé et la taille des germes. Ce sont les souches B. mycoides AS7B10, P. agglomerans Pa10 et P. poae DR10PS5 qui ont augmenté le taux de germination. Le taille des germes a été augmentée par les bactéries P. poae CE10PS1, B. velezensis CR11B2 et B. mycoides AS7B10. Ces découvertes prouvent bel et bien que l’utilisation de bactéries peut être bénéfique dans l’optique du biocontrôle et la croissance des plantes.Note de contenu : Table des matières
Remerciements ....................................................................................................................................... 4
Introduction générale ............................................................................................................................. 8
Contexte général ................................................................................................................................... 10
1. Présentation du lieu de stage ................................................................................................... 10
2. La problématique des pesticides .............................................................................................. 11
2.1. Définition........................................................................................................................... 11
2.2. Effets secondaires à l’exposition aux pesticides ............................................................... 11
2.3. Contamination environnementale .................................................................................... 12
2.4. L’écotoxicité ...................................................................................................................... 13
3. Le biocontrôle ........................................................................................................................... 13
4. Le blé ......................................................................................................................................... 15
4.1. Contexte général ............................................................................................................... 15
4.2. Alimentation animale........................................................................................................ 16
4.3. L’agriculture biologique .................................................................................................... 17
4.4. Phénologie du froment ..................................................................................................... 18
4.5. Culture du blé.................................................................................................................... 19
5. Les maladies du blé ................................................................................................................... 20
5.1. La fusariose ....................................................................................................................... 20
5.2. La septoriose ..................................................................................................................... 20
5.3. Le pythium ........................................................................................................................ 22
5.4. Le piétin verse ................................................................................................................... 22
5.5. Le piétin échaudage .......................................................................................................... 23
6. Les bactéries.............................................................................................................................. 25
6.1. Les Paenibacillus ............................................................................................................... 26
Classification ............................................................................................................................. 26
Caractéristiques ........................................................................................................................ 26
Intérêts ...................................................................................................................................... 26
6.2. Les Bacillus ........................................................................................................................ 26
Caractéristiques ........................................................................................................................ 26
Intérêts ...................................................................................................................................... 26
6.3. Les Bacillus mycoides ........................................................................................................ 27
Caractéristiques ........................................................................................................................ 27
Intérêts ...................................................................................................................................... 27
6.4. Les Pseudomonas.............................................................................................................. 27
Caractéristiques ........................................................................................................................ 27
Intérêts ...................................................................................................................................... 27
6.5. Les Pantoea ....................................................................................................................... 28
Caractéristiques ........................................................................................................................ 28
Intérêts ...................................................................................................................................... 28
7. Expériences réalisées ................................................................................................................ 29
7.1. Projet antagoniste ............................................................................................................. 29
7.2. Objectifs ............................................................................................................................ 29
7.3. Les bactéries...................................................................................................................... 30
7.4. Détermination de l’activité de B. mycoïdes contre des champignons phytopathogènes 30
7.5. Test de germination de Fusarium graminearum .............................................................. 30
7.6. Test sur feuilles détachées de la septoriose (Zymoseptica tritici) .................................... 30
7.7. Prodution d’un surnageant de Pantoea agglomerans antagoniste à Z. tritici.................. 31
7.8. Evaluation de la germination de grains enrobés de bactéries déposés dans le mycélium
de Fusarium graminearum............................................................................................................ 31
7.9. Evaluation de grains enrobés de bactéries ....................................................................... 31
7.10. Les grains....................................................................................................................... 31
Matériels et méthodes.......................................................................................................................... 32
1. Détermination de l’activité de B. mycoïdes contre des champignons phytopathogènes ........ 32
Bactéries testées ........................................................................................................................... 33
2. Test de germination de Fusarium graminearum ...................................................................... 33
Bactéries testées ........................................................................................................................... 34
3. Test sur feuilles détachées de la septoriose (Zymoseptica tritici) ............................................ 34
Bactéries testées ........................................................................................................................... 36
4. Production d’un surnageant de Pantoea agglomerans antagoniste à Z. tritici ........................ 36
Bactéries testées ........................................................................................................................... 37
5. Evaluation de la germination de grains enrobés de bactéries déposés dans le mycélium de
Fusarium graminearum .................................................................................................................... 38
Bactéries testées ........................................................................................................................... 38
6. Evaluation de grains enrobés de bactéries ............................................................................... 39
Bactéries testées ........................................................................................................................... 40
Résultats et discussion .......................................................................................................................... 41
1. Détermination de l’activité de B. mycoïdes contre des champignons phytopathogènes ........ 41
2. Test de germination de F. graminearum .................................................................................. 43
3. Test sur feuilles détachées de la septoriose (Zymoseptica tritici) ............................................ 48
4. Production d’un surnageant de Pantoea agglomerans à Z. tritici ............................................ 51
5. Evaluation de la germination de grains enrobés de bactéries déposés dans le mycélium de
Fusarium graminearum .................................................................................................................... 52
6. Evaluation de grains enrobés de bactéries ............................................................................... 53
Conclusion générale .............................................................................................................................. 55
Abréviations .......................................................................................................................................... 57
Liste des figures .................................................................................................................................... 58
Liste des tableaux.................................................................................................................................. 60
Bibliographie ......................................................................................................................................... 62
Tables des annexes ............................................................................................................................... 67
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=106165 Sélection de bactéries antagonistes à certains pathogènes du blé [TFE / Mémoire] / Emilie Quertinmont, Auteur ; Jonathan Scauflaire, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie, 2022.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Université Catholique de Louvain Index. décimale : TFE Technologie animalière TFE Technologie animalière Résumé : La prise de conscience écologique, les contaminations environnementales et les effets secondaires relatifs aux pesticides poussent les chercheurs à trouver des alternatives naturelles à leur utilisation. Dans le cadre de ce travail de fin d’études, ce sont des bactéries antagonistes à différents pathogènes de Triticum aestivum qui sont recherchées. Les bactéries Gram négatives testées sont des Bacillus et Bacillus mycoides. Les Pantoea et
Pseudomonas sont, quant à elles, Gram négatives. Cette céréale est en effet touchée par de nombreux agents phytopathogènes tels que Fusarium graminearum, Zymoseptica tritici, Pythium aphanidermatum, Tapesia yallundae et Gaeumannomyces graminis tritici.
Pour cela, des expériences in vitro sont réalisées afin de déterminer les Bacillus mycoides les plus efficaces contre P. aphanidermatum, T. yallundae et G. graminis tritici.
Ensuite, différentes expériences in vivo sont mises en place. Tout d’abord afin de déterminer les bactéries les plus efficaces contre la germination de spores de F. graminearum. Ensuite, définir celles qui ont le meilleur effet antagoniste contre la septoriose lors de manipulations sur des feuilles détachées de blé. De plus, un surnageant de Pantoea agglomerans est produit afin de récupérer les métabolites actifs contre Z. tritici. Finalement des tests d’évaluation de la germination de grains de blé enrobés de bactéries déposés, ou non, sur du mycélium de F. graminearum sont réalisés.
Ces expériences ont permis de démontrer que certaines bactéries présentent un effet contre ces agents phytopathogènes lors des expérimentations. Concernant les B. mycoides, aucun ne présente d’effet contre T. yallundae et G. graminis tritici. Cependant, un ralentissement de la croissance de P. aphanidermatum a bien été prouvé lors de la présence des souches bactériennes CR12B5 et VDM052.
Toutes les bactéries testées dans le cas de la germination de spores de F. graminearum se sont montrées efficaces bien que certaines souches, comme P. poae CF10PS4, le soient plus que d’autres. Les tests sur feuilles détachées n’ont pas apporté de résultats concluants. Seule une souche de bactéries, B. mycoides 18AB5, a montré un effet puisqu’elle augmente la zone touchée par le pathogène.
Des métabolites actifs de P. agglomerans ont été produits et pourront être analysés par la suite.
Les souches B. mycoides A11Bb5 et P. agglomerans Pa19 ont montré une augmentation du taux de germination des grains de blé lorsque ceux-ci sont déposés dans du mycélium de F. graminearum.
Finalement, différentes bactéries sont efficaces concernant le taux de germination des grains de blé et la taille des germes. Ce sont les souches B. mycoides AS7B10, P. agglomerans Pa10 et P. poae DR10PS5 qui ont augmenté le taux de germination. Le taille des germes a été augmentée par les bactéries P. poae CE10PS1, B. velezensis CR11B2 et B. mycoides AS7B10. Ces découvertes prouvent bel et bien que l’utilisation de bactéries peut être bénéfique dans l’optique du biocontrôle et la croissance des plantes.Note de contenu : Table des matières
Remerciements ....................................................................................................................................... 4
Introduction générale ............................................................................................................................. 8
Contexte général ................................................................................................................................... 10
1. Présentation du lieu de stage ................................................................................................... 10
2. La problématique des pesticides .............................................................................................. 11
2.1. Définition........................................................................................................................... 11
2.2. Effets secondaires à l’exposition aux pesticides ............................................................... 11
2.3. Contamination environnementale .................................................................................... 12
2.4. L’écotoxicité ...................................................................................................................... 13
3. Le biocontrôle ........................................................................................................................... 13
4. Le blé ......................................................................................................................................... 15
4.1. Contexte général ............................................................................................................... 15
4.2. Alimentation animale........................................................................................................ 16
4.3. L’agriculture biologique .................................................................................................... 17
4.4. Phénologie du froment ..................................................................................................... 18
4.5. Culture du blé.................................................................................................................... 19
5. Les maladies du blé ................................................................................................................... 20
5.1. La fusariose ....................................................................................................................... 20
5.2. La septoriose ..................................................................................................................... 20
5.3. Le pythium ........................................................................................................................ 22
5.4. Le piétin verse ................................................................................................................... 22
5.5. Le piétin échaudage .......................................................................................................... 23
6. Les bactéries.............................................................................................................................. 25
6.1. Les Paenibacillus ............................................................................................................... 26
Classification ............................................................................................................................. 26
Caractéristiques ........................................................................................................................ 26
Intérêts ...................................................................................................................................... 26
6.2. Les Bacillus ........................................................................................................................ 26
Caractéristiques ........................................................................................................................ 26
Intérêts ...................................................................................................................................... 26
6.3. Les Bacillus mycoides ........................................................................................................ 27
Caractéristiques ........................................................................................................................ 27
Intérêts ...................................................................................................................................... 27
6.4. Les Pseudomonas.............................................................................................................. 27
Caractéristiques ........................................................................................................................ 27
Intérêts ...................................................................................................................................... 27
6.5. Les Pantoea ....................................................................................................................... 28
Caractéristiques ........................................................................................................................ 28
Intérêts ...................................................................................................................................... 28
7. Expériences réalisées ................................................................................................................ 29
7.1. Projet antagoniste ............................................................................................................. 29
7.2. Objectifs ............................................................................................................................ 29
7.3. Les bactéries...................................................................................................................... 30
7.4. Détermination de l’activité de B. mycoïdes contre des champignons phytopathogènes 30
7.5. Test de germination de Fusarium graminearum .............................................................. 30
7.6. Test sur feuilles détachées de la septoriose (Zymoseptica tritici) .................................... 30
7.7. Prodution d’un surnageant de Pantoea agglomerans antagoniste à Z. tritici.................. 31
7.8. Evaluation de la germination de grains enrobés de bactéries déposés dans le mycélium
de Fusarium graminearum............................................................................................................ 31
7.9. Evaluation de grains enrobés de bactéries ....................................................................... 31
7.10. Les grains....................................................................................................................... 31
Matériels et méthodes.......................................................................................................................... 32
1. Détermination de l’activité de B. mycoïdes contre des champignons phytopathogènes ........ 32
Bactéries testées ........................................................................................................................... 33
2. Test de germination de Fusarium graminearum ...................................................................... 33
Bactéries testées ........................................................................................................................... 34
3. Test sur feuilles détachées de la septoriose (Zymoseptica tritici) ............................................ 34
Bactéries testées ........................................................................................................................... 36
4. Production d’un surnageant de Pantoea agglomerans antagoniste à Z. tritici ........................ 36
Bactéries testées ........................................................................................................................... 37
5. Evaluation de la germination de grains enrobés de bactéries déposés dans le mycélium de
Fusarium graminearum .................................................................................................................... 38
Bactéries testées ........................................................................................................................... 38
6. Evaluation de grains enrobés de bactéries ............................................................................... 39
Bactéries testées ........................................................................................................................... 40
Résultats et discussion .......................................................................................................................... 41
1. Détermination de l’activité de B. mycoïdes contre des champignons phytopathogènes ........ 41
2. Test de germination de F. graminearum .................................................................................. 43
3. Test sur feuilles détachées de la septoriose (Zymoseptica tritici) ............................................ 48
4. Production d’un surnageant de Pantoea agglomerans à Z. tritici ............................................ 51
5. Evaluation de la germination de grains enrobés de bactéries déposés dans le mycélium de
Fusarium graminearum .................................................................................................................... 52
6. Evaluation de grains enrobés de bactéries ............................................................................... 53
Conclusion générale .............................................................................................................................. 55
Abréviations .......................................................................................................................................... 57
Liste des figures .................................................................................................................................... 58
Liste des tableaux.................................................................................................................................. 60
Bibliographie ......................................................................................................................................... 62
Tables des annexes ............................................................................................................................... 67
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=106165 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Sélection de bactéries à potentiel antagoniste pour le biocontrôle des maladies en froment / Corentin Laurent
Titre : Sélection de bactéries à potentiel antagoniste pour le biocontrôle des maladies en froment Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Corentin Laurent, Auteur ; Anne Tetelain, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie Année de publication : 2021 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : UCLouvain Université Catholique de Louvain-la-Neuve. Laboratoire de recherche de l’unité de phytopathologie FYMY Froment : maladies biocontrôle Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Note de contenu : Table des matières
1 Présentation du lieu de stage .............................................................................................. 6
2 Introduction générale .......................................................................................................... 6
2.1 Les origines du projet Antagonist ............................................................................... 6
2.2 Le projet Antagonist ................................................................................................... 7
3 Contexte général ................................................................................................................. 9
3.1 Biocontrôle ................................................................................................................. 9
3.2 Septoriose ................................................................................................................. 10
3.3 Fusariose ................................................................................................................... 12
3.4 Agents de biocontrôle ............................................................................................... 13
3.4.1 Pseudomonas ...................................................................................................... 13
3.4.2 Bacillus ............................................................................................................... 15
3.4.3 Paenibacillus ...................................................................................................... 16
4 Objectifs et stratégie ......................................................................................................... 17
5 Matériel et méthodes ........................................................................................................ 18
5.1 Protocoles pour la caractérisation des bactéries ....................................................... 18
5.1.1 PCR et PCR sur colonies .................................................................................... 18
5.1.1.1 Matériel ....................................................................................................... 18
5.1.1.2 Méthode ...................................................................................................... 18
5.1.2 Extraction et purification sur gel ........................................................................ 19
5.1.2.1 Matériel ....................................................................................................... 19
5.1.2.2 Méthode ...................................................................................................... 19
5.1.3 Purification de l’ADN ........................................................................................ 20
5.1.3.1 Matériel ....................................................................................................... 20
5.1.3.2 Méthode ...................................................................................................... 20
5.1.4 Tests enzymatiques ............................................................................................ 22
5.1.4.1 Préparation du milieu CMC (Cellulose Carboxymethyl) Agar .................. 22
5.1.4.2 Préparation du milieu Colloïdal Chitine (CC)-agar .................................... 23
5.1.4.3 Préparation du milieu Skim Milk Agar ....................................................... 24
5.1.5 Production de sidérophore .................................................................................. 24
5.2 Protocoles des tests in planta ................................................................................... 25
5.2.1 Inoculation de Zymoseptoria tritici sur des plantes de froment ......................... 25
5.2.1.1 Matériel ....................................................................................................... 25
5.2.1.2 Méthode ...................................................................................................... 25
5.2.1.3 Matériel ....................................................................................................... 25
5.2.1.4 Méthode ...................................................................................................... 26
5.2.2 Inoculation de bactéries ...................................................................................... 26
5.2.3 Test de germination ............................................................................................ 26
5.2.3.1 Matériel ....................................................................................................... 27
5.2.3.2 Méthode ...................................................................................................... 27
6 Résultats et discussion ...................................................................................................... 27
6.1 Pseudomonas ............................................................................................................ 28
6.2 Bacillus ..................................................................................................................... 30
6.3 Paenibacillus ............................................................................................................ 33
Conclusion générale (et perspectives) ...................................................................................... 34
7 Liste de figures ................................................................................................................. 35
8 Table des illustrations ....................................................................................................... 35
9 Bibliographie .................................................................................................................... 36Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=99939 Sélection de bactéries à potentiel antagoniste pour le biocontrôle des maladies en froment [TFE / Mémoire] / Corentin Laurent, Auteur ; Anne Tetelain, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie, 2021.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur
Langues : Français (fre)
Mots-clés : UCLouvain Université Catholique de Louvain-la-Neuve. Laboratoire de recherche de l’unité de phytopathologie FYMY Froment : maladies biocontrôle Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Note de contenu : Table des matières
1 Présentation du lieu de stage .............................................................................................. 6
2 Introduction générale .......................................................................................................... 6
2.1 Les origines du projet Antagonist ............................................................................... 6
2.2 Le projet Antagonist ................................................................................................... 7
3 Contexte général ................................................................................................................. 9
3.1 Biocontrôle ................................................................................................................. 9
3.2 Septoriose ................................................................................................................. 10
3.3 Fusariose ................................................................................................................... 12
3.4 Agents de biocontrôle ............................................................................................... 13
3.4.1 Pseudomonas ...................................................................................................... 13
3.4.2 Bacillus ............................................................................................................... 15
3.4.3 Paenibacillus ...................................................................................................... 16
4 Objectifs et stratégie ......................................................................................................... 17
5 Matériel et méthodes ........................................................................................................ 18
5.1 Protocoles pour la caractérisation des bactéries ....................................................... 18
5.1.1 PCR et PCR sur colonies .................................................................................... 18
5.1.1.1 Matériel ....................................................................................................... 18
5.1.1.2 Méthode ...................................................................................................... 18
5.1.2 Extraction et purification sur gel ........................................................................ 19
5.1.2.1 Matériel ....................................................................................................... 19
5.1.2.2 Méthode ...................................................................................................... 19
5.1.3 Purification de l’ADN ........................................................................................ 20
5.1.3.1 Matériel ....................................................................................................... 20
5.1.3.2 Méthode ...................................................................................................... 20
5.1.4 Tests enzymatiques ............................................................................................ 22
5.1.4.1 Préparation du milieu CMC (Cellulose Carboxymethyl) Agar .................. 22
5.1.4.2 Préparation du milieu Colloïdal Chitine (CC)-agar .................................... 23
5.1.4.3 Préparation du milieu Skim Milk Agar ....................................................... 24
5.1.5 Production de sidérophore .................................................................................. 24
5.2 Protocoles des tests in planta ................................................................................... 25
5.2.1 Inoculation de Zymoseptoria tritici sur des plantes de froment ......................... 25
5.2.1.1 Matériel ....................................................................................................... 25
5.2.1.2 Méthode ...................................................................................................... 25
5.2.1.3 Matériel ....................................................................................................... 25
5.2.1.4 Méthode ...................................................................................................... 26
5.2.2 Inoculation de bactéries ...................................................................................... 26
5.2.3 Test de germination ............................................................................................ 26
5.2.3.1 Matériel ....................................................................................................... 27
5.2.3.2 Méthode ...................................................................................................... 27
6 Résultats et discussion ...................................................................................................... 27
6.1 Pseudomonas ............................................................................................................ 28
6.2 Bacillus ..................................................................................................................... 30
6.3 Paenibacillus ............................................................................................................ 33
Conclusion générale (et perspectives) ...................................................................................... 34
7 Liste de figures ................................................................................................................. 35
8 Table des illustrations ....................................................................................................... 35
9 Bibliographie .................................................................................................................... 36Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=99939 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Séquençage et qPCR : comparaison de deux méthodes pour le développement et l’optimisation de tests génétiques / Maxime Kerff
Titre : Séquençage et qPCR : comparaison de deux méthodes pour le développement et l’optimisation de tests génétiques Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Maxime Kerff, Auteur ; Manuel Constant, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie Année de publication : 2023 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : Progenus Index. décimale : TFE Technologie animalière TFE Technologie animalière Résumé : Le séquençage capillaire et la PCR quantitative (qPCR) sont deux méthodes utilisées au sein du laboratoire Progenus de Gembloux pour dépister des mutations génétiques. Dans le cadre de ce TFE, ces deux méthodes sont comparées à travers le développement d’un test par séquençage et l’optimisation d’un autre test par qPCR. Le premier test vise à dépister une mutation chez le Maine Coon causant des troubles de la coagulation. De nombreuses étapes sont nécessaires pour parvenir à développer un test efficace avec la méthode du séquençage. Chacune d’entre elles est importante pour vérifier la bonne amplification du gène concerné, sa purification et enfin son séquençage afin d’analyser la séquence obtenue et rendre un verdict quant à l’état génétique de l’animal : sain, porteur ou atteint par la pathologie causée. Les réactifs nécessaires étant utilisés pour d’autres tests, la mise en place d’un développement par cette méthode représente un coût moindre pour l’entreprise.
L’optimisation d’un test au moyen de la qPCR est, quant à elle, beaucoup plus rapide. Le gène pour lequel un test est optimisé est ICHGR, un gène présent chez le Golden Retriever qui, lorsqu’il est défectueux, peut occasionner des problèmes d’ordre cutané. La qPCR apportant des résultats interprétables en moins de deux heures, elle semble idéale pour le dépistage d’échantillons. Le point noir de cette méthode réside dans le coût élevé de ses réactifs, principalement les sondes nécessaires à la récupération d’un signal faisant office de résultats.
Entre un temps d’attente plus long, mais un faible coût et une rapidité contrebalancée par un coût élevé, il peut être difficile de choisir. Il est donc important d’adapter le choix de la méthode à la réalité du terrain. Un séquençage peut s’effectuer sur des petites quantités d’échantillons demandant la même analyse puisque cette méthode, paraissant longue, possède de nombreux temps d’attente pouvant être utilisé pour réaliser des tâches annexes.
De plus, son faible coût est un argument de poids pour l’entreprise. La seconde méthode d’analyse, elle, est plutôt réservée aux analyses reprenant un
nombre conséquent d’échantillons pouvant aller jusqu’à plusieurs centaines. Ainsi, le coût important des réactifs sera équilibré par un nombre de résultats également élevé. La somme récupérée auprès des clients rapidement satisfaits remboursera ainsi les frais occasionnés.
Ainsi, ce TFE présente en détails le déroulé des tests développés et optimisés à l’aide de ces méthodes ainsi que leurs caractéristiques, avantages et inconvénients respectifs.Note de contenu : Table des matières
Introduction ...........................................................................................................................7
Contexte .............................................................................................................................7
Notions théoriques .............................................................................................................8
Composition de l’ADN .....................................................................................................8
Modifications de l’ADN .................................................................................................10
Polymer Chain Reaction « PCR » ...................................................................................11
PCR en temps réel « qPCR » ..........................................................................................13
Séquençage par la méthode de Sanger sur capillaire ....................................................16
Electrophorèse sur gel d’agarose ..................................................................................18
Matériel et méthodes ...........................................................................................................20
Extraction de l’ADN d’un échantillon ................................................................................20
Matériel ........................................................................................................................20
Protocole pour les échantillons sanguins ......................................................................20
Protocole pour les écouvillons salivaires .......................................................................21
Préparation de l’échantillon pour la PCR ...........................................................................21
Matériel ........................................................................................................................21
Protocole ......................................................................................................................22
Polymer Chain Reaction (PCR) ..........................................................................................22
Matériel ........................................................................................................................22
Protocole ......................................................................................................................22
Préparation d’un gel d’agarose .........................................................................................22
Matériel ........................................................................................................................22
Protocole ......................................................................................................................23
Purification de bandes de gel d’agarose ............................................................................24
Matériel ........................................................................................................................24
Protocole ......................................................................................................................24
Quantification d’ADN présent dans les échantillons ..........................................................24
Matériel ........................................................................................................................25
Protocole ......................................................................................................................25
Séquençage ......................................................................................................................25
Résultats et discussion..........................................................................................................26
Développement du test F11 par PCR et séquençage sur capillaire ....................................26
6
Optimisation du test ICHGR par la qPCR ...........................................................................34
Comparaison des méthodes .............................................................................................42
Réactifs .........................................................................................................................42
Méthode d’analyse .......................................................................................................42
Spécificités ....................................................................................................................43
Sensibilité .....................................................................................................................43
Temps ...........................................................................................................................44
Coût financier ...............................................................................................................44
Applications ..................................................................................................................44
Conclusion ............................................................................................................................45
Bibliographie ........................................................................................................................47
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=112610 Séquençage et qPCR : comparaison de deux méthodes pour le développement et l’optimisation de tests génétiques [TFE / Mémoire] / Maxime Kerff, Auteur ; Manuel Constant, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie, 2023.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Progenus Index. décimale : TFE Technologie animalière TFE Technologie animalière Résumé : Le séquençage capillaire et la PCR quantitative (qPCR) sont deux méthodes utilisées au sein du laboratoire Progenus de Gembloux pour dépister des mutations génétiques. Dans le cadre de ce TFE, ces deux méthodes sont comparées à travers le développement d’un test par séquençage et l’optimisation d’un autre test par qPCR. Le premier test vise à dépister une mutation chez le Maine Coon causant des troubles de la coagulation. De nombreuses étapes sont nécessaires pour parvenir à développer un test efficace avec la méthode du séquençage. Chacune d’entre elles est importante pour vérifier la bonne amplification du gène concerné, sa purification et enfin son séquençage afin d’analyser la séquence obtenue et rendre un verdict quant à l’état génétique de l’animal : sain, porteur ou atteint par la pathologie causée. Les réactifs nécessaires étant utilisés pour d’autres tests, la mise en place d’un développement par cette méthode représente un coût moindre pour l’entreprise.
L’optimisation d’un test au moyen de la qPCR est, quant à elle, beaucoup plus rapide. Le gène pour lequel un test est optimisé est ICHGR, un gène présent chez le Golden Retriever qui, lorsqu’il est défectueux, peut occasionner des problèmes d’ordre cutané. La qPCR apportant des résultats interprétables en moins de deux heures, elle semble idéale pour le dépistage d’échantillons. Le point noir de cette méthode réside dans le coût élevé de ses réactifs, principalement les sondes nécessaires à la récupération d’un signal faisant office de résultats.
Entre un temps d’attente plus long, mais un faible coût et une rapidité contrebalancée par un coût élevé, il peut être difficile de choisir. Il est donc important d’adapter le choix de la méthode à la réalité du terrain. Un séquençage peut s’effectuer sur des petites quantités d’échantillons demandant la même analyse puisque cette méthode, paraissant longue, possède de nombreux temps d’attente pouvant être utilisé pour réaliser des tâches annexes.
De plus, son faible coût est un argument de poids pour l’entreprise. La seconde méthode d’analyse, elle, est plutôt réservée aux analyses reprenant un
nombre conséquent d’échantillons pouvant aller jusqu’à plusieurs centaines. Ainsi, le coût important des réactifs sera équilibré par un nombre de résultats également élevé. La somme récupérée auprès des clients rapidement satisfaits remboursera ainsi les frais occasionnés.
Ainsi, ce TFE présente en détails le déroulé des tests développés et optimisés à l’aide de ces méthodes ainsi que leurs caractéristiques, avantages et inconvénients respectifs.Note de contenu : Table des matières
Introduction ...........................................................................................................................7
Contexte .............................................................................................................................7
Notions théoriques .............................................................................................................8
Composition de l’ADN .....................................................................................................8
Modifications de l’ADN .................................................................................................10
Polymer Chain Reaction « PCR » ...................................................................................11
PCR en temps réel « qPCR » ..........................................................................................13
Séquençage par la méthode de Sanger sur capillaire ....................................................16
Electrophorèse sur gel d’agarose ..................................................................................18
Matériel et méthodes ...........................................................................................................20
Extraction de l’ADN d’un échantillon ................................................................................20
Matériel ........................................................................................................................20
Protocole pour les échantillons sanguins ......................................................................20
Protocole pour les écouvillons salivaires .......................................................................21
Préparation de l’échantillon pour la PCR ...........................................................................21
Matériel ........................................................................................................................21
Protocole ......................................................................................................................22
Polymer Chain Reaction (PCR) ..........................................................................................22
Matériel ........................................................................................................................22
Protocole ......................................................................................................................22
Préparation d’un gel d’agarose .........................................................................................22
Matériel ........................................................................................................................22
Protocole ......................................................................................................................23
Purification de bandes de gel d’agarose ............................................................................24
Matériel ........................................................................................................................24
Protocole ......................................................................................................................24
Quantification d’ADN présent dans les échantillons ..........................................................24
Matériel ........................................................................................................................25
Protocole ......................................................................................................................25
Séquençage ......................................................................................................................25
Résultats et discussion..........................................................................................................26
Développement du test F11 par PCR et séquençage sur capillaire ....................................26
6
Optimisation du test ICHGR par la qPCR ...........................................................................34
Comparaison des méthodes .............................................................................................42
Réactifs .........................................................................................................................42
Méthode d’analyse .......................................................................................................42
Spécificités ....................................................................................................................43
Sensibilité .....................................................................................................................43
Temps ...........................................................................................................................44
Coût financier ...............................................................................................................44
Applications ..................................................................................................................44
Conclusion ............................................................................................................................45
Bibliographie ........................................................................................................................47
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=112610 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Suivi d’un cas de mise en contact dans un enclos en mixité entre Saki à face blanche (Pithecia pithecia) et Tamarin de Goeldi (Callimico goeldii) / Elisabeth Jourion
Titre : Suivi d’un cas de mise en contact dans un enclos en mixité entre Saki à face blanche (Pithecia pithecia) et Tamarin de Goeldi (Callimico goeldii) Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Elisabeth Jourion, Auteur ; Evelyne Collard, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie Année de publication : 2021 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : parc zoologique Fort-Mardyck Index. décimale : TFE Technologie animalière TFE Technologie animalière Résumé : Au parc zoologique Fort-Mardyck, il existe un enclos dans lequel nous pouvons observer un tamarin de Goeldi femelle et un mâle saki à face blanche cohabités
ensemble. C’est ce que l’on nomme une mixité d’espèces. Le 23 septembre 2020, ce duo s’est agrandi suite à l’arrivée d’un autre mâle saki à face blanche et d’un mâle tamarin de Goeldi, tous deux arrivés là sur conseils de l’EEP. Dans un premier temps séparés des résidents, un protocole de mise en contact a été
mis en place afin que les nouveaux individus puissent faire connaissance avec les occupants tout en douceur. Des suites de cette arrivée, plusieurs hypothèses ont été posées concernant la mise en contact. Premièrement, les tamarins de Goeldi étant de sexe opposé, les risques que cela se déroule mal sont moindres. Au contraire, concernant les sakis à face blanches qui eux, sont de même sexe, une rivalité peut s’installer entre ces deux individus. Deuxièmement, il est probable que les
comportements dits « négatifs » soient plus nombreux aux heures de repas puisque durant ces moments, la hiérarchie entre individus s’exprime plus. Afin de répondre à ces hypothèses, des observations éthologiques ad libitum ont été effectuées. Les résultats et discussions de celles-ci sont repris dans ce travail ainsi qu’une analyse réflexive de l’étude menée. Sont repris également les notions théoriques de mixité et de mise en contact et une description des deux espèces rencontrées lors de l’expérimentation.Note de contenu : Table des matières
INTRODUCTION .....................................................................................................................................3
PARTIE THÉORIQUE................................................................................................................................4
CHAPITRE 1 : PRÉSENTATION DU PARC ZOOLOGIQUE DE FORT-MARDYCK .................................................................4
1. Informations générales ...............................................................................................................4
2. Organisation de la structure .......................................................................................................5
CHAPITRE 2 : LE SAKI À FACE BLANCHE...............................................................................................................7
1. Informations générales ...............................................................................................................7
2. Ethogramme ...............................................................................................................................9
CHAPITRE 3 : LE TAMARIN DE GOELDI .............................................................................................................12
1. Informations générales .............................................................................................................12
2. Ethogramme .............................................................................................................................13
CHAPITRE 4 : MISE EN CONTACT ET MIXITÉ D’ESPÈCES ........................................................................................17
1. Mise en contact d’individus.......................................................................................................17
2. Mixité ........................................................................................................................................20
PARTIE PRATIQUE ................................................................................................................................27
CHAPITRE 1 : PRÉSENTATIONS ET MISE EN SITUATION .........................................................................................27
1. Présentation de l’enclos ............................................................................................................27
2. Présentation des primates ........................................................................................................30
3. Préparation de l'arrivée ............................................................................................................32
4. Arrivée des nouveaux-venus .....................................................................................................33
CHAPITRE 2 : OBSERVATIONS ÉTHOLOGIQUES ...................................................................................................33
1. Hypothèses................................................................................................................................33
2. Matériel et méthode .................................................................................................................34
3. Résultats et leurs discussions ....................................................................................................37
4. Conclusion de l’expérimentation...............................................................................................43
CHAPITRE 3 : ANALYSE RÉFLEXIVE...................................................................................................................44
1. Mise en contact.........................................................................................................................44
2. Observation éthologique...........................................................................................................49
CONCLUSION .......................................................................................................................................53
GLOSSAIRE ...........................................................................................................................................54
BIBLIOGRAPHIE....................................................................................................................................56
TABLE DES FIGURES .............................................................................................................................59
LISTE DES ANNEXES..............................................................................................................................60
ANNEXES .............................................................................................................................................61Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=101599 Suivi d’un cas de mise en contact dans un enclos en mixité entre Saki à face blanche (Pithecia pithecia) et Tamarin de Goeldi (Callimico goeldii) [TFE / Mémoire] / Elisabeth Jourion, Auteur ; Evelyne Collard, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie, 2021.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : parc zoologique Fort-Mardyck Index. décimale : TFE Technologie animalière TFE Technologie animalière Résumé : Au parc zoologique Fort-Mardyck, il existe un enclos dans lequel nous pouvons observer un tamarin de Goeldi femelle et un mâle saki à face blanche cohabités
ensemble. C’est ce que l’on nomme une mixité d’espèces. Le 23 septembre 2020, ce duo s’est agrandi suite à l’arrivée d’un autre mâle saki à face blanche et d’un mâle tamarin de Goeldi, tous deux arrivés là sur conseils de l’EEP. Dans un premier temps séparés des résidents, un protocole de mise en contact a été
mis en place afin que les nouveaux individus puissent faire connaissance avec les occupants tout en douceur. Des suites de cette arrivée, plusieurs hypothèses ont été posées concernant la mise en contact. Premièrement, les tamarins de Goeldi étant de sexe opposé, les risques que cela se déroule mal sont moindres. Au contraire, concernant les sakis à face blanches qui eux, sont de même sexe, une rivalité peut s’installer entre ces deux individus. Deuxièmement, il est probable que les
comportements dits « négatifs » soient plus nombreux aux heures de repas puisque durant ces moments, la hiérarchie entre individus s’exprime plus. Afin de répondre à ces hypothèses, des observations éthologiques ad libitum ont été effectuées. Les résultats et discussions de celles-ci sont repris dans ce travail ainsi qu’une analyse réflexive de l’étude menée. Sont repris également les notions théoriques de mixité et de mise en contact et une description des deux espèces rencontrées lors de l’expérimentation.Note de contenu : Table des matières
INTRODUCTION .....................................................................................................................................3
PARTIE THÉORIQUE................................................................................................................................4
CHAPITRE 1 : PRÉSENTATION DU PARC ZOOLOGIQUE DE FORT-MARDYCK .................................................................4
1. Informations générales ...............................................................................................................4
2. Organisation de la structure .......................................................................................................5
CHAPITRE 2 : LE SAKI À FACE BLANCHE...............................................................................................................7
1. Informations générales ...............................................................................................................7
2. Ethogramme ...............................................................................................................................9
CHAPITRE 3 : LE TAMARIN DE GOELDI .............................................................................................................12
1. Informations générales .............................................................................................................12
2. Ethogramme .............................................................................................................................13
CHAPITRE 4 : MISE EN CONTACT ET MIXITÉ D’ESPÈCES ........................................................................................17
1. Mise en contact d’individus.......................................................................................................17
2. Mixité ........................................................................................................................................20
PARTIE PRATIQUE ................................................................................................................................27
CHAPITRE 1 : PRÉSENTATIONS ET MISE EN SITUATION .........................................................................................27
1. Présentation de l’enclos ............................................................................................................27
2. Présentation des primates ........................................................................................................30
3. Préparation de l'arrivée ............................................................................................................32
4. Arrivée des nouveaux-venus .....................................................................................................33
CHAPITRE 2 : OBSERVATIONS ÉTHOLOGIQUES ...................................................................................................33
1. Hypothèses................................................................................................................................33
2. Matériel et méthode .................................................................................................................34
3. Résultats et leurs discussions ....................................................................................................37
4. Conclusion de l’expérimentation...............................................................................................43
CHAPITRE 3 : ANALYSE RÉFLEXIVE...................................................................................................................44
1. Mise en contact.........................................................................................................................44
2. Observation éthologique...........................................................................................................49
CONCLUSION .......................................................................................................................................53
GLOSSAIRE ...........................................................................................................................................54
BIBLIOGRAPHIE....................................................................................................................................56
TABLE DES FIGURES .............................................................................................................................59
LISTE DES ANNEXES..............................................................................................................................60
ANNEXES .............................................................................................................................................61Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=101599 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Suivi de populations de grenouilles rousses (Rana temporaria) en Wallonie : Travail de recensement en pratique / Ugo Delecour
Titre : Suivi de populations de grenouilles rousses (Rana temporaria) en Wallonie : Travail de recensement en pratique Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Ugo Delecour, Auteur ; Laetitia Giordano, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie Année de publication : 2022 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Index. décimale : TFE Technologie animalière TFE Technologie animalière Résumé : La grenouille rousse est connue de la science depuis des siècles. Elle fut d’une abondance sans pareil dans l’herpétofaune. Ses populations semblaient être durablement pérennes. Et pourtant son déclin actuel se remarque de plus en plus sans que l’on puisse se l’expliquer correctement. Dans un premier temps, ce travail présentera l’espèce dans l’état actuel des connaissances. Ensuite, le recensement de ses populations sur plusieurs zones en Wallonie
durant sa saison de reproduction au début du printemps 2021 servira de base pour discuter de leur état sur le terrain. Les résultats récoltés étant insuffisants, ce travail n’aura pas vocation à chiffrer concrètement les populations de l’espèce mais cherchera plutôt à interpeller sur le besoin urgent d’études supplémentaires à réaliser pour mieux comprendre et protéger la grenouille rousse dans nos régions.Note de contenu : Table des matières
Remerciements
Introduction .................................................................................................................................. 6
Présentation du lieu de stage ....................................................................................................... 7
I. Partie théorique ..................................................................................................................... 9
1. Différence entre les pingouins et les manchots ........................................................................... 9
2. Les espèces de manchots dans le monde ................................................................................... 10
3. Le manchot de Humboldt à l’état sauvage ................................................................................. 12
3.1 Classification ............................................................................................................................... 12
3.2 Description morphologique ........................................................................................................ 12
3.3 Habitat ........................................................................................................................................ 13
3.4 Alimentation ............................................................................................................................... 14
3.5 Reproduction .............................................................................................................................. 16
3.6 Thermorégulation ....................................................................................................................... 17
3.7 Mue ............................................................................................................................................. 18
3.8 Comportement social ................................................................................................................. 19
3.9 Statut et menaces ....................................................................................................................... 19
3.10 Conservation et protection de l’espèce...................................................................................... 20
4. Vie en captivité du manchot de Humboldt ................................................................................. 22
4.1 Alimentation ............................................................................................................................... 22
4.2 Reproduction .............................................................................................................................. 23
4.3 Enclos .......................................................................................................................................... 26
4.4 Sexage ......................................................................................................................................... 27
4.5 Identification ............................................................................................................................... 27
4.6 Contention .................................................................................................................................. 27
4.7 Enrichissement............................................................................................................................ 28
4.8 Nuisibles ...................................................................................................................................... 30
5. Pathologies.................................................................................................................................. 31
5.1 Aspergillose ................................................................................................................................. 31
5.2 Malaria ........................................................................................................................................ 34
5.3 Autres pathologies ...................................................................................................................... 37
II. Partie pratique ..................................................................................................................... 39
1. Individus ...................................................................................................................................... 39
2. Identification ............................................................................................................................... 39
3. Enclos .......................................................................................................................................... 41
3.1 Le bassin ...................................................................................................................................... 43
4. Alimentation ............................................................................................................................... 44
5. Reproduction .............................................................................................................................. 46
6. Prophylaxie ................................................................................................................................. 48
6.1 Aspergillose ................................................................................................................................. 48
6.2 Malaria ........................................................................................................................................ 48
6.3 Résumé des médicaments .......................................................................................................... 49
7. Contention .................................................................................................................................. 49
8. Pédagogie.................................................................................................................................... 51
Conclusion ................................................................................................................................... 52
Glossaire...................................................................................................................................... 53
Liste des figures .......................................................................................................................... 55
Liste des tableaux........................................................................................................................ 56
Bibliographie ............................................................................................................................... 57
Table des annexes ....................................................................................................................... 61
Résumé ....................................................................................................................................... 69
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=106149 Suivi de populations de grenouilles rousses (Rana temporaria) en Wallonie : Travail de recensement en pratique [TFE / Mémoire] / Ugo Delecour, Auteur ; Laetitia Giordano, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie, 2022.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Index. décimale : TFE Technologie animalière TFE Technologie animalière Résumé : La grenouille rousse est connue de la science depuis des siècles. Elle fut d’une abondance sans pareil dans l’herpétofaune. Ses populations semblaient être durablement pérennes. Et pourtant son déclin actuel se remarque de plus en plus sans que l’on puisse se l’expliquer correctement. Dans un premier temps, ce travail présentera l’espèce dans l’état actuel des connaissances. Ensuite, le recensement de ses populations sur plusieurs zones en Wallonie
durant sa saison de reproduction au début du printemps 2021 servira de base pour discuter de leur état sur le terrain. Les résultats récoltés étant insuffisants, ce travail n’aura pas vocation à chiffrer concrètement les populations de l’espèce mais cherchera plutôt à interpeller sur le besoin urgent d’études supplémentaires à réaliser pour mieux comprendre et protéger la grenouille rousse dans nos régions.Note de contenu : Table des matières
Remerciements
Introduction .................................................................................................................................. 6
Présentation du lieu de stage ....................................................................................................... 7
I. Partie théorique ..................................................................................................................... 9
1. Différence entre les pingouins et les manchots ........................................................................... 9
2. Les espèces de manchots dans le monde ................................................................................... 10
3. Le manchot de Humboldt à l’état sauvage ................................................................................. 12
3.1 Classification ............................................................................................................................... 12
3.2 Description morphologique ........................................................................................................ 12
3.3 Habitat ........................................................................................................................................ 13
3.4 Alimentation ............................................................................................................................... 14
3.5 Reproduction .............................................................................................................................. 16
3.6 Thermorégulation ....................................................................................................................... 17
3.7 Mue ............................................................................................................................................. 18
3.8 Comportement social ................................................................................................................. 19
3.9 Statut et menaces ....................................................................................................................... 19
3.10 Conservation et protection de l’espèce...................................................................................... 20
4. Vie en captivité du manchot de Humboldt ................................................................................. 22
4.1 Alimentation ............................................................................................................................... 22
4.2 Reproduction .............................................................................................................................. 23
4.3 Enclos .......................................................................................................................................... 26
4.4 Sexage ......................................................................................................................................... 27
4.5 Identification ............................................................................................................................... 27
4.6 Contention .................................................................................................................................. 27
4.7 Enrichissement............................................................................................................................ 28
4.8 Nuisibles ...................................................................................................................................... 30
5. Pathologies.................................................................................................................................. 31
5.1 Aspergillose ................................................................................................................................. 31
5.2 Malaria ........................................................................................................................................ 34
5.3 Autres pathologies ...................................................................................................................... 37
II. Partie pratique ..................................................................................................................... 39
1. Individus ...................................................................................................................................... 39
2. Identification ............................................................................................................................... 39
3. Enclos .......................................................................................................................................... 41
3.1 Le bassin ...................................................................................................................................... 43
4. Alimentation ............................................................................................................................... 44
5. Reproduction .............................................................................................................................. 46
6. Prophylaxie ................................................................................................................................. 48
6.1 Aspergillose ................................................................................................................................. 48
6.2 Malaria ........................................................................................................................................ 48
6.3 Résumé des médicaments .......................................................................................................... 49
7. Contention .................................................................................................................................. 49
8. Pédagogie.................................................................................................................................... 51
Conclusion ................................................................................................................................... 52
Glossaire...................................................................................................................................... 53
Liste des figures .......................................................................................................................... 55
Liste des tableaux........................................................................................................................ 56
Bibliographie ............................................................................................................................... 57
Table des annexes ....................................................................................................................... 61
Résumé ....................................................................................................................................... 69
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=106149 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Suivi du training médical chez les loutres géantes (pteronura brasiliensis) et chez les éléphants d’asie (elephas maximus) au zoo de la Palmyre / Clément Martin
PermalinkLe syndrome brachycéphale et la sélection génétique : rôles de l’ASV dans la prise en charge au cabinet et dans la sensibilisation de la clientèle / Clementine Duflo
PermalinkTechnicien en imagerie in vivo : Contribution à une étude préclinique sur la fibrose pulmonaire idiopathique / Adrien Decloux
PermalinkTests d’appétence auprès des cochons d’Inde (Cavia porcellus) de la salle de pratique animalière de la HELHa dans un but d’optimisation du training médical / Adèle Fleurus
PermalinkLe tétanos chez le chien et rôles de l’ASV lors de la prise en charge en hospitalisation / Jennie Vanderplancke
PermalinkLa transfusion sanguine chez le chat / Florine Demaret
PermalinkTranslocation du Bufo calamita dans le cadre du projet LIFE in Quarries / Lison Cowez
PermalinkUtilisation des bactéries associées au blé pour le protéger des maladies foliaires : du laboratoire au champ / Pauline Hervelle
PermalinkVérification et amélioration du système de maîtrise de la contamination par acrylamide / Cédric Van Bever
PermalinkVérification de l'intérêt de l'atmosphère protectrice de l'emballage et la conservation de pizzas fraîches / Jessica Kamche Fogang
PermalinkVirus du Syndrome Dysgénésique et Respiratoire du Porc (SDRP) : Méthodes virologiques et sérologiques de détection et évaluation de l’échantillonnage d’air / Maxime Keller
PermalinkZootechnie d’un enclos en mixité ratons-laveurs – mouffettes au Monde Sauvage d’Aywaille / Lucie Moscato
PermalinkZootechnie du Manchot de Humboldt (Spheniscus humboldti) / Abelia Bomans
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