Optimiser la détection du Streptococcus pyogenes : évaluation du nouveau milieu chromogène « CHROMagarTM StrepA » / Koukab Mahrous

Public ISBD Titre : Optimiser la détection du Streptococcus pyogenes : évaluation du nouveau milieu chromogène « CHROMagarTM StrepA » Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Koukab Mahrous ; Françoise Motte, Directeur de la recherche ; Manuel Constant, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2024 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : L’objectif de cette étude est d’évaluer le milieu chromogène CHROMagar™ StrepA pour la détection du Streptococcus pyogenes (SGA), une bactérie pathogène majeure qui produit plusieurs facteurs de virulence et est responsable d’un large éventail d’infections, allant de la pharyngite à des maladies plus sévères comme les infections invasives. Une identification rapide et précise de cette bactérie est essentielle pour un traitement rapide et efficace. Cette étude a comparé la performance du CHROMagar™ StrepA avec des méthodes de culture traditionnelles (milieu COL-S) et des tests rapides (OSOM® Strep A Test). Le CHROMagar™ StrepA utilise la méthode chromogène pour différencier les souches de streptocoques pathogènes facilitant ainsi l’identification visuelle des colonies. L’étude s’est déroulée en trois étapes distinctes. La première étape était l’analyse du milieu chromogène en utilisant des souches pures d’identification connues. La deuxième étape consistait à comparer le milieu chromogène à la méthode classique utilisée. Enfin, la troisième étape était l’intégration du milieu chromogène dans la routine pour tous les frottis de gorge reçus au laboratoire. Les résultats indiquent que le CHROMagar™ StrepA offre une sensibilité, une spécificité, une valeur prédictive positive (VPP) et une valeur prédictive négative (VPN) de 100%, démontrant une grande fiabilité pour la détection du SGA. De plus, l’étude a montré une concordance totale entre les méthodes traditionnelles et le milieu chromogène pour l’identification des streptocoques du groupe A. Cependant, certains isolats, comme le Streptococcus dysgalactiae, ont montré des résultats faussement négatifs, révélant une sensibilité réduite pour ces souches. De plus, le milieu n’a pas réussi à différencier tous les pathogènes de la gorge, comme Streptococcus constellatus et Streptococcus anginosus, indiquant des limitations dans certaines conditions cliniques. En conclusion, le milieu chromogène CHROMagar™ StrepA offre une alternative efficace aux méthodes traditionnelles pour la détection de Streptococcus pyogenes, avec des avantages notables en termes de spécificité et de simplicité d’interprétation. Note de contenu : TABLE DES MATIÈRES PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE ..............................................................................................5 INTRODUCTION ..........................................................................................................................6 CONTEXTE THÉORIQUE ...............................................................................................................7 Streptocoque du groupe A .................................................................................................................. 7 1 Propriétés bactériologiques ............................................................................................................................. 7 2 Propriétés biochimiques .................................................................................................................................. 8 3 Structure antigénique et facteurs de virulence ............................................................................................... 9 4 Écologie - Rôle pathogène – Épidémiologie ................................................................................................... 12 4.1 Les Infections suppurées ...................................................................................................................... 13 4.1.1 L’angine et la pharyngite .................................................................................................................. 13 4.1.2 La cellulite cutanée .......................................................................................................................... 14 4.2 Manifestations toxiniques .................................................................................................................... 15 4.2.1 La scarlatine ..................................................................................................................................... 15 4.2.2 Le syndrome de choc toxique streptococcique ............................................................................... 16 4.3 Complications post-streptococciques .................................................................................................. 17 4.3.1 Le rhumatisme articulaire aigu (RAA) .............................................................................................. 17 5 Traitement ..................................................................................................................................................... 18 6 Méthodes classiques de détection du Streptocoque A ................................................................................. 18 6.1 Le type d’hémolyse .............................................................................................................................. 18 6.2 Le test rapide d'agglutination au latex « PASTOREX® Strep » .............................................................. 19 6.3 Le test rapide antigénique « OSOM® Strep A » .................................................................................... 21 6.4 Polymerase chain reaction (PCR) ......................................................................................................... 22 OBJECTIFS ET STRATÉGIES ......................................................................................................... 23 1 Matériel et méthodes .................................................................................................................................... 23 1.1 Matériel ................................................................................................................................................ 23 1.2 Méthodes ............................................................................................................................................. 24 1.2.1 Mise en évidence des streptocoques pathogènes sur le milieu chromogène ................................. 24 1.2.2 La composition du milieu CHROMagar™ StrepA ............................................................................. 26 1.2.3 L’aspect des colonies sur le milieu chromogène « CHROMagar™ StrepA » ..................................... 26 2 Résultats et discussion ................................................................................................................................... 27 2.1 Population étudiée ............................................................................................................................... 27 2.2 Phase 1 ................................................................................................................................................. 29 2.3 Phase 2 ................................................................................................................................................. 33 2.4 Phase 2 et 3 .......................................................................................................................................... 36 2.4.1 Comparaison entre les méthodes de routine et le milieu chromogène pour l’identification des bactéries pathogènes du genre Streptococcus .............................................................................................. 36 ➢ Comparaison entre le milieu chromogène StrepA et le milieu COL-S pour une population de 101 individus : .................................................................................................................................................. 36 ➢ Comparaison entre le milieu chromogène StrepA et le milieu COL-S ainsi que le test rapide Strep A pour une population de 81 individus : ...................................................................................................... 38 2.4.2 Évaluation de la capacité du milieu chromogène StrepA pour la culture de différentes espèces de Streptocoques ................................................................................................................................................ 40 2.4.3 Comparaison des germes identifiés dans le frottis de gorge et épidémiologie des deux dernières années 45 CONCLUSION ............................................................................................................................ 48 BIBLIOGRAPHIE ........................................................................................................................ 49 ANNEXES.................................................................................................................................. 53 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=119416 Optimiser la détection du Streptococcus pyogenes : évaluation du nouveau milieu chromogène « CHROMagarTM StrepA » [TFE / Mémoire] / Koukab Mahrous ; Françoise Motte, Directeur de la recherche ; Manuel Constant, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2024. Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : L’objectif de cette étude est d’évaluer le milieu chromogène CHROMagar™ StrepA pour la détection du Streptococcus pyogenes (SGA), une bactérie pathogène majeure qui produit plusieurs facteurs de virulence et est responsable d’un large éventail d’infections, allant de la pharyngite à des maladies plus sévères comme les infections invasives. Une identification rapide et précise de cette bactérie est essentielle pour un traitement rapide et efficace. Cette étude a comparé la performance du CHROMagar™ StrepA avec des méthodes de culture traditionnelles (milieu COL-S) et des tests rapides (OSOM® Strep A Test). Le CHROMagar™ StrepA utilise la méthode chromogène pour différencier les souches de streptocoques pathogènes facilitant ainsi l’identification visuelle des colonies. L’étude s’est déroulée en trois étapes distinctes. La première étape était l’analyse du milieu chromogène en utilisant des souches pures d’identification connues. La deuxième étape consistait à comparer le milieu chromogène à la méthode classique utilisée. Enfin, la troisième étape était l’intégration du milieu chromogène dans la routine pour tous les frottis de gorge reçus au laboratoire. Les résultats indiquent que le CHROMagar™ StrepA offre une sensibilité, une spécificité, une valeur prédictive positive (VPP) et une valeur prédictive négative (VPN) de 100%, démontrant une grande fiabilité pour la détection du SGA. De plus, l’étude a montré une concordance totale entre les méthodes traditionnelles et le milieu chromogène pour l’identification des streptocoques du groupe A. Cependant, certains isolats, comme le Streptococcus dysgalactiae, ont montré des résultats faussement négatifs, révélant une sensibilité réduite pour ces souches. De plus, le milieu n’a pas réussi à différencier tous les pathogènes de la gorge, comme Streptococcus constellatus et Streptococcus anginosus, indiquant des limitations dans certaines conditions cliniques. En conclusion, le milieu chromogène CHROMagar™ StrepA offre une alternative efficace aux méthodes traditionnelles pour la détection de Streptococcus pyogenes, avec des avantages notables en termes de spécificité et de simplicité d’interprétation. Note de contenu : TABLE DES MATIÈRES PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE ..............................................................................................5 INTRODUCTION ..........................................................................................................................6 CONTEXTE THÉORIQUE ...............................................................................................................7 Streptocoque du groupe A .................................................................................................................. 7 1 Propriétés bactériologiques ............................................................................................................................. 7 2 Propriétés biochimiques .................................................................................................................................. 8 3 Structure antigénique et facteurs de virulence ............................................................................................... 9 4 Écologie - Rôle pathogène – Épidémiologie ................................................................................................... 12 4.1 Les Infections suppurées ...................................................................................................................... 13 4.1.1 L’angine et la pharyngite .................................................................................................................. 13 4.1.2 La cellulite cutanée .......................................................................................................................... 14 4.2 Manifestations toxiniques .................................................................................................................... 15 4.2.1 La scarlatine ..................................................................................................................................... 15 4.2.2 Le syndrome de choc toxique streptococcique ............................................................................... 16 4.3 Complications post-streptococciques .................................................................................................. 17 4.3.1 Le rhumatisme articulaire aigu (RAA) .............................................................................................. 17 5 Traitement ..................................................................................................................................................... 18 6 Méthodes classiques de détection du Streptocoque A ................................................................................. 18 6.1 Le type d’hémolyse .............................................................................................................................. 18 6.2 Le test rapide d'agglutination au latex « PASTOREX® Strep » .............................................................. 19 6.3 Le test rapide antigénique « OSOM® Strep A » .................................................................................... 21 6.4 Polymerase chain reaction (PCR) ......................................................................................................... 22 OBJECTIFS ET STRATÉGIES ......................................................................................................... 23 1 Matériel et méthodes .................................................................................................................................... 23 1.1 Matériel ................................................................................................................................................ 23 1.2 Méthodes ............................................................................................................................................. 24 1.2.1 Mise en évidence des streptocoques pathogènes sur le milieu chromogène ................................. 24 1.2.2 La composition du milieu CHROMagar™ StrepA ............................................................................. 26 1.2.3 L’aspect des colonies sur le milieu chromogène « CHROMagar™ StrepA » ..................................... 26 2 Résultats et discussion ................................................................................................................................... 27 2.1 Population étudiée ............................................................................................................................... 27 2.2 Phase 1 ................................................................................................................................................. 29 2.3 Phase 2 ................................................................................................................................................. 33 2.4 Phase 2 et 3 .......................................................................................................................................... 36 2.4.1 Comparaison entre les méthodes de routine et le milieu chromogène pour l’identification des bactéries pathogènes du genre Streptococcus .............................................................................................. 36 ➢ Comparaison entre le milieu chromogène StrepA et le milieu COL-S pour une population de 101 individus : .................................................................................................................................................. 36 ➢ Comparaison entre le milieu chromogène StrepA et le milieu COL-S ainsi que le test rapide Strep A pour une population de 81 individus : ...................................................................................................... 38 2.4.2 Évaluation de la capacité du milieu chromogène StrepA pour la culture de différentes espèces de Streptocoques ................................................................................................................................................ 40 2.4.3 Comparaison des germes identifiés dans le frottis de gorge et épidémiologie des deux dernières années 45 CONCLUSION ............................................................................................................................ 48 BIBLIOGRAPHIE ........................................................................................................................ 49 ANNEXES.................................................................................................................................. 53 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=119416

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