Impact des premiers mois de la pandémie de Covid-19 sur la circulation des virus respiratoires / Eric Farfour in Annales de Biologie Clinique, Vol.81 N°4 (juillet 2023)

Public ISBD [article]  inAnnales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 403-409 Titre : Impact des premiers mois de la pandémie de Covid-19 sur la circulation des virus respiratoires Type de document : texte imprimé Auteurs : Eric Farfour ; Lamia Rouabah ; Pauline Bargain ; Marion Lecuru ; Colas Tcherakian ; Benjamin Maneglier Année de publication : 2023 Article en page(s) : p. 403-409 Note générale : https://doi.org/10.1684/abc.2023.1827 Langues : Français (fre) Mots-clés : influenza  grippe  rhinovirus  VRS  parainfluenza  coronavirus  metapneumovirus  enterovirus  adenovirus  bocavirus  SARS-CoV-2 Résumé : Objectifs : La pandémie de SARS-CoV-2 a eu un impact sur la détection des virus respiratoires saisonniers. Nous avons évalué rétrospectivement l’évolution de la détection de dix virus dans deux hôpitaux situés en région parisienne. Méthodes : Tous les patients positifs pour un virus respiratoire dans deux hôpitaux de septembre 2016 à août 2021 ont été rétrospectivement inclus. Le taux de RT-PCR positifs pour chaque virus a été calculé pour la saison 2020-2021 et la saison 2019-2020 par rapport à une ligne de base de trois saisons, soit 2016-2017, 2017-2018 et 2018-2019. Résultats : Au total, 7 835 patients ont été testés positifs pour au moins 1 virus respiratoire de septembre 2016 à août 2021. La détection du virus respiratoire chute considérablement en semaine 11 de 2020, tout comme le nombre de RT-PCR effectuées. Ensuite, trois tendances ont été identifiées : a) une quasi-disparition pour la grippe ; b) un retard de dix semaines dans l’épidémie saisonnière de VRS ; c) une persistance de la circulation avec une activité variable pour les autres virus. Par rapport à une ligne de base de trois saisons (2016-2019), le taux de patients positifs a été plus faible au cours de la saison 2020-2021 pour le coronavirus (4,51 % vs. 1,26 %, P < 0,0001), l’adénovirus (1,93 % vs. 1,34 %, P = 0,14), le bocavirus (0,58 % contre 0,11 %, P = 0,08) et l’entérovirus (0,28 % contre 0,0 %, P = 0,12). En revanche, le taux de patients positifs pour le métapneumovirus (1,92 % vs. 2,83 %, P = 0,03) et les virus parainfluenza (2,17 % vs. 2,99 %, P = 0,06) a augmenté. Conclusions : La baisse de détection de virus respiratoires détectés pourrait être liée à la baisse du nombre de tests effectués et à la mise en place des mesures barrières. Ensuite, tous les virus, à l’exception de la grippe, sont détectés, ce qui suggère un impact de la forte adhésion à la vaccination antigrippale. Malgré la baisse du nombre de tests effectués, le taux de patients positifs pour les virus parainfluenza et métapneumovirus a augmenté, suggérant une circulation active de ces virus. Dans l’ensemble, ces résultats suggèrent une circulation persistante des virus respiratoires saisonnier. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113998 [article] Impact des premiers mois de la pandémie de Covid-19 sur la circulation des virus respiratoires [texte imprimé] / Eric Farfour ; Lamia Rouabah ; Pauline Bargain ; Marion Lecuru ; Colas Tcherakian ; Benjamin Maneglier . - 2023 . - p. 403-409. https://doi.org/10.1684/abc.2023.1827 Langues : Français (fre) in Annales de Biologie Clinique > Vol.81 N°4 (juillet 2023) . - p. 403-409 Mots-clés : influenza  grippe  rhinovirus  VRS  parainfluenza  coronavirus  metapneumovirus  enterovirus  adenovirus  bocavirus  SARS-CoV-2 Résumé : Objectifs : La pandémie de SARS-CoV-2 a eu un impact sur la détection des virus respiratoires saisonniers. Nous avons évalué rétrospectivement l’évolution de la détection de dix virus dans deux hôpitaux situés en région parisienne. Méthodes : Tous les patients positifs pour un virus respiratoire dans deux hôpitaux de septembre 2016 à août 2021 ont été rétrospectivement inclus. Le taux de RT-PCR positifs pour chaque virus a été calculé pour la saison 2020-2021 et la saison 2019-2020 par rapport à une ligne de base de trois saisons, soit 2016-2017, 2017-2018 et 2018-2019. Résultats : Au total, 7 835 patients ont été testés positifs pour au moins 1 virus respiratoire de septembre 2016 à août 2021. La détection du virus respiratoire chute considérablement en semaine 11 de 2020, tout comme le nombre de RT-PCR effectuées. Ensuite, trois tendances ont été identifiées : a) une quasi-disparition pour la grippe ; b) un retard de dix semaines dans l’épidémie saisonnière de VRS ; c) une persistance de la circulation avec une activité variable pour les autres virus. Par rapport à une ligne de base de trois saisons (2016-2019), le taux de patients positifs a été plus faible au cours de la saison 2020-2021 pour le coronavirus (4,51 % vs. 1,26 %, P < 0,0001), l’adénovirus (1,93 % vs. 1,34 %, P = 0,14), le bocavirus (0,58 % contre 0,11 %, P = 0,08) et l’entérovirus (0,28 % contre 0,0 %, P = 0,12). En revanche, le taux de patients positifs pour le métapneumovirus (1,92 % vs. 2,83 %, P = 0,03) et les virus parainfluenza (2,17 % vs. 2,99 %, P = 0,06) a augmenté. Conclusions : La baisse de détection de virus respiratoires détectés pourrait être liée à la baisse du nombre de tests effectués et à la mise en place des mesures barrières. Ensuite, tous les virus, à l’exception de la grippe, sont détectés, ce qui suggère un impact de la forte adhésion à la vaccination antigrippale. Malgré la baisse du nombre de tests effectués, le taux de patients positifs pour les virus parainfluenza et métapneumovirus a augmenté, suggérant une circulation active de ces virus. Dans l’ensemble, ces résultats suggèrent une circulation persistante des virus respiratoires saisonnier. Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=113998

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