Sélection de bactéries à potentiel antagoniste pour le biocontrôle des maladies en froment / Corentin Laurent

Public ISBD Titre : Sélection de bactéries à potentiel antagoniste pour le biocontrôle des maladies en froment Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Corentin Laurent, Auteur ; Anne Tetelain, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie Année de publication : 2021 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : UCLouvain  Université Catholique de Louvain-la-Neuve. Laboratoire de recherche de l’unité de phytopathologie  FYMY  Froment : maladies  biocontrôle Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Note de contenu : Table des matières 1 Présentation du lieu de stage .............................................................................................. 6 2 Introduction générale .......................................................................................................... 6 2.1 Les origines du projet Antagonist ............................................................................... 6 2.2 Le projet Antagonist ................................................................................................... 7 3 Contexte général ................................................................................................................. 9 3.1 Biocontrôle ................................................................................................................. 9 3.2 Septoriose ................................................................................................................. 10 3.3 Fusariose ................................................................................................................... 12 3.4 Agents de biocontrôle ............................................................................................... 13 3.4.1 Pseudomonas ...................................................................................................... 13 3.4.2 Bacillus ............................................................................................................... 15 3.4.3 Paenibacillus ...................................................................................................... 16 4 Objectifs et stratégie ......................................................................................................... 17 5 Matériel et méthodes ........................................................................................................ 18 5.1 Protocoles pour la caractérisation des bactéries ....................................................... 18 5.1.1 PCR et PCR sur colonies .................................................................................... 18 5.1.1.1 Matériel ....................................................................................................... 18 5.1.1.2 Méthode ...................................................................................................... 18 5.1.2 Extraction et purification sur gel ........................................................................ 19 5.1.2.1 Matériel ....................................................................................................... 19 5.1.2.2 Méthode ...................................................................................................... 19 5.1.3 Purification de l’ADN ........................................................................................ 20 5.1.3.1 Matériel ....................................................................................................... 20 5.1.3.2 Méthode ...................................................................................................... 20 5.1.4 Tests enzymatiques ............................................................................................ 22 5.1.4.1 Préparation du milieu CMC (Cellulose Carboxymethyl) Agar .................. 22 5.1.4.2 Préparation du milieu Colloïdal Chitine (CC)-agar .................................... 23 5.1.4.3 Préparation du milieu Skim Milk Agar ....................................................... 24 5.1.5 Production de sidérophore .................................................................................. 24 5.2 Protocoles des tests in planta ................................................................................... 25 5.2.1 Inoculation de Zymoseptoria tritici sur des plantes de froment ......................... 25 5.2.1.1 Matériel ....................................................................................................... 25 5.2.1.2 Méthode ...................................................................................................... 25 5.2.1.3 Matériel ....................................................................................................... 25 5.2.1.4 Méthode ...................................................................................................... 26 5.2.2 Inoculation de bactéries ...................................................................................... 26 5.2.3 Test de germination ............................................................................................ 26 5.2.3.1 Matériel ....................................................................................................... 27 5.2.3.2 Méthode ...................................................................................................... 27 6 Résultats et discussion ...................................................................................................... 27 6.1 Pseudomonas ............................................................................................................ 28 6.2 Bacillus ..................................................................................................................... 30 6.3 Paenibacillus ............................................................................................................ 33 Conclusion générale (et perspectives) ...................................................................................... 34 7 Liste de figures ................................................................................................................. 35 8 Table des illustrations ....................................................................................................... 35 9 Bibliographie .................................................................................................................... 36 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=99939 Sélection de bactéries à potentiel antagoniste pour le biocontrôle des maladies en froment [TFE / Mémoire] / Corentin Laurent, Auteur ; Anne Tetelain, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie, 2021. Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : UCLouvain  Université Catholique de Louvain-la-Neuve. Laboratoire de recherche de l’unité de phytopathologie  FYMY  Froment : maladies  biocontrôle Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Note de contenu : Table des matières 1 Présentation du lieu de stage .............................................................................................. 6 2 Introduction générale .......................................................................................................... 6 2.1 Les origines du projet Antagonist ............................................................................... 6 2.2 Le projet Antagonist ................................................................................................... 7 3 Contexte général ................................................................................................................. 9 3.1 Biocontrôle ................................................................................................................. 9 3.2 Septoriose ................................................................................................................. 10 3.3 Fusariose ................................................................................................................... 12 3.4 Agents de biocontrôle ............................................................................................... 13 3.4.1 Pseudomonas ...................................................................................................... 13 3.4.2 Bacillus ............................................................................................................... 15 3.4.3 Paenibacillus ...................................................................................................... 16 4 Objectifs et stratégie ......................................................................................................... 17 5 Matériel et méthodes ........................................................................................................ 18 5.1 Protocoles pour la caractérisation des bactéries ....................................................... 18 5.1.1 PCR et PCR sur colonies .................................................................................... 18 5.1.1.1 Matériel ....................................................................................................... 18 5.1.1.2 Méthode ...................................................................................................... 18 5.1.2 Extraction et purification sur gel ........................................................................ 19 5.1.2.1 Matériel ....................................................................................................... 19 5.1.2.2 Méthode ...................................................................................................... 19 5.1.3 Purification de l’ADN ........................................................................................ 20 5.1.3.1 Matériel ....................................................................................................... 20 5.1.3.2 Méthode ...................................................................................................... 20 5.1.4 Tests enzymatiques ............................................................................................ 22 5.1.4.1 Préparation du milieu CMC (Cellulose Carboxymethyl) Agar .................. 22 5.1.4.2 Préparation du milieu Colloïdal Chitine (CC)-agar .................................... 23 5.1.4.3 Préparation du milieu Skim Milk Agar ....................................................... 24 5.1.5 Production de sidérophore .................................................................................. 24 5.2 Protocoles des tests in planta ................................................................................... 25 5.2.1 Inoculation de Zymoseptoria tritici sur des plantes de froment ......................... 25 5.2.1.1 Matériel ....................................................................................................... 25 5.2.1.2 Méthode ...................................................................................................... 25 5.2.1.3 Matériel ....................................................................................................... 25 5.2.1.4 Méthode ...................................................................................................... 26 5.2.2 Inoculation de bactéries ...................................................................................... 26 5.2.3 Test de germination ............................................................................................ 26 5.2.3.1 Matériel ....................................................................................................... 27 5.2.3.2 Méthode ...................................................................................................... 27 6 Résultats et discussion ...................................................................................................... 27 6.1 Pseudomonas ............................................................................................................ 28 6.2 Bacillus ..................................................................................................................... 30 6.3 Paenibacillus ............................................................................................................ 33 Conclusion générale (et perspectives) ...................................................................................... 34 7 Liste de figures ................................................................................................................. 35 8 Table des illustrations ....................................................................................................... 35 9 Bibliographie .................................................................................................................... 36 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=99939

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