Comparaison de deux kits pour la détection du génome de Chlamydia trachomatis / Neisseria gonorrhoeae : Abbott RealTime CT/NG Assay et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay / Alperen Karacaoglan

Public ISBD Titre : Comparaison de deux kits pour la détection du génome de Chlamydia trachomatis / Neisseria gonorrhoeae : Abbott RealTime CT/NG Assay et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Alperen Karacaoglan ; Barbara Marchetti, Directeur de la recherche ; Salah Eddine Lali, Directeur de publication, rédacteur en chef Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2023 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteurLe fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur . Langues : Français (fre) Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : 4 Table des matières Introduction ...........................................................................................................................6 Partie théorique IST : Généralités......................................................................................................................7 Cibles analytiques ...................................................................................................................8 Neisseria gonorrhoeae ........................................................................................................8 Epidémiologie..................................................................................................................8 Pouvoir pathogène ..........................................................................................................9 Prélèvements ..................................................................................................................9 Résistances ....................................................................................................................10 Culture ..........................................................................................................................10 Prophylaxie ...................................................................................................................10 Traitement ....................................................................................................................11 Chlamydia trachomatis .....................................................................................................11 Epidémiologie................................................................................................................12 Pouvoir pathogène ........................................................................................................12 Prélèvement ..................................................................................................................13 Résistance .....................................................................................................................14 Culture ..........................................................................................................................14 Prophylaxie ...................................................................................................................14 Traitement ....................................................................................................................14 Méthode d’analyse ...............................................................................................................15 Via les kits Abbott mSample Preparation SystemDNA et Abbott RealTime CT/NG Assay .....15 Extraction d’ADN et ajout de mix PCR ...............................................................................16 Réactifs .........................................................................................................................16 Principe .........................................................................................................................16 PCR ...................................................................................................................................17 Réactifs .........................................................................................................................17 Principe .........................................................................................................................18 Informations pratiques .....................................................................................................19 Pour 48 échantillons ......................................................................................................19 Via les kits STARMag 96x4 Universal et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay ..................20 Extraction d’ADN et ajout de mix PCR ...............................................................................21 5 Réactifs .........................................................................................................................21 Principe .........................................................................................................................22 PCR ...................................................................................................................................22 Réactifs .........................................................................................................................22 Principe .........................................................................................................................24 Informations pratiques .....................................................................................................25 Tests utilisés pour l’analyse pratique ....................................................................................26 Objectif et stratégie ..............................................................................................................29 Partie pratique Résultats et discussions ........................................................................................................30 Comparatifs du kit Abbott CT/NG RealTime Assay et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay .........................................................................................................................................30 Taux d’invalide ..............................................................................................................30 Tests pour l’analyse du kit Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay ......................................32 Spécificité : ....................................................................................................................33 Sensibilité : ....................................................................................................................33 Linéarité : ......................................................................................................................34 Intra-run : ......................................................................................................................38 Inter-run: .......................................................................................................................39 Prévalence de positifs à Trichomonas Vaginalis et Mycoplasma génitalium : .................39 Discussion .........................................................................................................................40 Conclusion ............................................................................................................................43 Glossaire...............................................................................................................................44 Abréviations ..................................................................................................................44 Définitions .....................................................................................................................44 Bibliographie ........................................................................................................................46 Annexes................................................................................................................................50 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=112110 Comparaison de deux kits pour la détection du génome de Chlamydia trachomatis / Neisseria gonorrhoeae : Abbott RealTime CT/NG Assay et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay [TFE / Mémoire] / Alperen Karacaoglan ; Barbara Marchetti, Directeur de la recherche ; Salah Eddine Lali, Directeur de publication, rédacteur en chef . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2023. Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteurLe fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur . Langues : Français (fre) Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : 4 Table des matières Introduction ...........................................................................................................................6 Partie théorique IST : Généralités......................................................................................................................7 Cibles analytiques ...................................................................................................................8 Neisseria gonorrhoeae ........................................................................................................8 Epidémiologie..................................................................................................................8 Pouvoir pathogène ..........................................................................................................9 Prélèvements ..................................................................................................................9 Résistances ....................................................................................................................10 Culture ..........................................................................................................................10 Prophylaxie ...................................................................................................................10 Traitement ....................................................................................................................11 Chlamydia trachomatis .....................................................................................................11 Epidémiologie................................................................................................................12 Pouvoir pathogène ........................................................................................................12 Prélèvement ..................................................................................................................13 Résistance .....................................................................................................................14 Culture ..........................................................................................................................14 Prophylaxie ...................................................................................................................14 Traitement ....................................................................................................................14 Méthode d’analyse ...............................................................................................................15 Via les kits Abbott mSample Preparation SystemDNA et Abbott RealTime CT/NG Assay .....15 Extraction d’ADN et ajout de mix PCR ...............................................................................16 Réactifs .........................................................................................................................16 Principe .........................................................................................................................16 PCR ...................................................................................................................................17 Réactifs .........................................................................................................................17 Principe .........................................................................................................................18 Informations pratiques .....................................................................................................19 Pour 48 échantillons ......................................................................................................19 Via les kits STARMag 96x4 Universal et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay ..................20 Extraction d’ADN et ajout de mix PCR ...............................................................................21 5 Réactifs .........................................................................................................................21 Principe .........................................................................................................................22 PCR ...................................................................................................................................22 Réactifs .........................................................................................................................22 Principe .........................................................................................................................24 Informations pratiques .....................................................................................................25 Tests utilisés pour l’analyse pratique ....................................................................................26 Objectif et stratégie ..............................................................................................................29 Partie pratique Résultats et discussions ........................................................................................................30 Comparatifs du kit Abbott CT/NG RealTime Assay et Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay .........................................................................................................................................30 Taux d’invalide ..............................................................................................................30 Tests pour l’analyse du kit Seegene Allplex CT/NG/MG/TV Assay ......................................32 Spécificité : ....................................................................................................................33 Sensibilité : ....................................................................................................................33 Linéarité : ......................................................................................................................34 Intra-run : ......................................................................................................................38 Inter-run: .......................................................................................................................39 Prévalence de positifs à Trichomonas Vaginalis et Mycoplasma génitalium : .................39 Discussion .........................................................................................................................40 Conclusion ............................................................................................................................43 Glossaire...............................................................................................................................44 Abréviations ..................................................................................................................44 Définitions .....................................................................................................................44 Bibliographie ........................................................................................................................46 Annexes................................................................................................................................50 Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=112110

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