Centre de Documentation Campus Montignies
Horaires :
Lundi : 8h-18h30
Mardi : 8h-17h30
Mercredi 9h-16h30
Jeudi : 8h30-18h30
Vendredi : 8h30-12h30 et 13h-14h30
Votre centre de documentation sera exceptionnellement fermé de 12h30 à 13h ce lundi 18 novembre.
Egalement, il sera fermé de 12h30 à 13h30 ce mercredi 20 novembre.
Lundi : 8h-18h30
Mardi : 8h-17h30
Mercredi 9h-16h30
Jeudi : 8h30-18h30
Vendredi : 8h30-12h30 et 13h-14h30
Votre centre de documentation sera exceptionnellement fermé de 12h30 à 13h ce lundi 18 novembre.
Egalement, il sera fermé de 12h30 à 13h30 ce mercredi 20 novembre.
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Auteur Jenny Pouyez |
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Analyse de l'effet de la molécule leucyl-Leucine-O-Méthyle sur la perméabilité lysosomale et la prolifération de cellules cancéreuses mammaires in vitro / Kimberley Bouvier
Titre : Analyse de l'effet de la molécule leucyl-Leucine-O-Méthyle sur la perméabilité lysosomale et la prolifération de cellules cancéreuses mammaires in vitro Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Kimberley Bouvier, Auteur ; Marielle Boonen, Directeur de la recherche ; Jenny Pouyez, Directeur de la recherche Année de publication : 2018 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66072 Analyse de l'effet de la molécule leucyl-Leucine-O-Méthyle sur la perméabilité lysosomale et la prolifération de cellules cancéreuses mammaires in vitro [TFE / Mémoire] / Kimberley Bouvier, Auteur ; Marielle Boonen, Directeur de la recherche ; Jenny Pouyez, Directeur de la recherche . - 2018.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66072 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Caractérisation du gène UGT72A2 codant pour une glycosyltransférase associée au stress oxydatif chez le peuplier / Nicolas Leurquin
Titre : Caractérisation du gène UGT72A2 codant pour une glycosyltransférase associée au stress oxydatif chez le peuplier Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Nicolas Leurquin, Auteur ; Jenny Pouyez, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie Année de publication : 2020 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : Agronomie AIBT Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Résumé : Dans une optique d’amélioration de la qualité du bois, le laboratoire de Biotechnologie Végétale de l’ULB a débuté des recherches visant à mieux comprendre le rôle des glycosyltransférases dans la formation des parois secondaires lignifiées. Ainsi, des chercheurs ont isolé le gène UGT72A2 chez l’hybride Populus tremula x alba. Ce gène est phylogénétiquement proche des gènes de la sous-famille UGT72E qui codent pour des glycosyltransférases impliquées dans la glycosylation des monolignols chez Arabidopsis thaliana.
Afin d’étudier le rôle de UGT72A2, des lignées transgéniques sur-exprimant (sous le contrôle du promoteur CaMV35S - lignées OE) et d’autres sous-exprimant UGT72A2 (par interférence ARN - lignées RNAi) ont été produites. Une première caractérisation de UGT72A2 a montré que les lignées sous-exprimant le gène présentaient un jaunissement précoce des feuilles, pouvant être associé à un phénomène de stress oxydatif caractérisé par la présence de dérivés réactifs de l’oxygène (ROS) dans la plante.
Afin de confirmer ce phénomène de stress oxydatif et de comprendre l’implication de UGT72A2 dans la résistance à ce type de stress, différentes manipulations ont été réalisées sur des lignées RNAi, OE et des lignées de type sauvage (WT). Un dosage des chlorophylles, des phéophytines et des caroténoïdes a d’abord permis de confirmer que le jaunissement précoce des lignées RNAi était associé à une diminution des pigments foliaires. Ensuite, différents marqueurs de stress oxydatif ont été étudiés. Ainsi, l’augmentation de la peroxydation des lipides et l’augmentation de la quantité de protéasome 20S dans les feuilles semblent confirmer un stress oxydatif plus élevé dans les lignées RNAi que dans les lignées OE et WT. Un dosage des anthocyanes, molécules antioxydantes, a également été réalisé. La baisse de la concentration en anthocyanes dans les lignées RNAi montre une diminution de la capacité antioxydante dans ces lignées. Il semblerait donc que la sous-expression de UGT72A2 induise un stress oxydatif dans la plante.
Pour finir, une série de manipulations a permis d’évaluer la résistance des différentes lignées de peupliers à un stress oxydatif provoqué par l’antimycine A et le méthyl viologène, deux herbicides qui engendrent la production de ROS respectivement au niveau des mitochondries et des chloroplastes. Étonnement, la lignée RNAi la plus proche du WT (pour l’antimycine A) et la lignée exprimant le moins UGT72A2 (pour le méthyl viologène) ont montré une meilleure résistance au stress oxydatif.
Les manipulations effectuées ont ainsi confirmé les résultats des analyses antérieures et renforcé l'hypothèse de l'implication de UGT72A2 dans le phénomène de résistance au stress oxydatif. Ces recherches ouvrent dès lors la voie à d’autres expériences qui permettront de déterminer les facteurs régulant l’expression de UGT72A2.Note de contenu : Table des matières
Remerciements
Présentation du lieu de stage
Introduction .............................................................................................................................. 10
1 Introduction théorique .............................................................................................. 11
1.1 Le peuplier .................................................................................................................. 11
1.1.1 Interférence par ARN .......................................................................................... 12
1.1.2 Production de peupliers sur-exprimant UGT72A2 ............................................. 14
1.1.3 Techniques de transformation génétique .......................................................... 14
1.2 Les glycosyltransférases ............................................................................................. 15
1.3 Le stress oxydatif ........................................................................................................ 19
1.4 Analyses des lignées de peupliers transgéniques sous-exprimant UGT72A2 ........... 22
2 Objectifs du travail de fin d’études ............................................................................ 25
3 Matériel et méthodes ................................................................................................ 26
3.1 Calcul du niveau d’expression de UGT72A2 chez les peupliers transgéniques OE500 .................................................................................................................................... 27
3.1.1 Extraction de l’ARN ............................................................................................. 27
3.1.2 Dosage au NanodropTM ....................................................................................... 28
3.1.3 Vérification de l’intégrité de l’ARN par électrophorèse ..................................... 28
3.1.4 Transcription inverse .......................................................................................... 29
3.1.5 PCR-quantitative (qPCR) ..................................................................................... 29
3.2 Dosage de la chlorophylle, de la phéophytine et des caroténoïdes .......................... 30
3.3 Analyse de la peroxydation des lipides et dosage des anthocyanes ......................... 31
3.4 Quantification du protéasome 20S ............................................................................ 32
3.5 Mesure de l’activité PAL ............................................................................................. 33
3.6 Analyse de la résistance au stress oxydatif ................................................................ 34
3.6.1 Analyse de la résistance à l’antimycine A ........................................................... 35
3.6.2 Analyse de la résistance au méthyl viologène .................................................... 36
3.6.3 Inhibition de l’alternative oxydase ..................................................................... 37
3.7 Tests GUS ................................................................................................................... 38
4 Résultats et discussions ............................................................................................. 40
4.1 Analyse phénotypique des lignées sur-exprimant UGT72A2 .................................... 40
4.2 Calcul du degré d’expression de UGT72A2 chez les peupliers transgéniques OE500 ….. ............................................................................................................................... 40
4.3 Dosage de la chlorophylle, de la phéophytine et des caroténoïdes dans des feuilles de peupliers âgés de 4 mois ....................................................................................... 45
4.3.1 Dosage des chlorophylles a et b ......................................................................... 45
4.3.2 Dosage des phéophytines ................................................................................... 47
4.3.3 Dosage des caroténoïdes .................................................................................... 48
4.4 Analyse de la peroxydation des lipides et dosage des anthocyanes dans des feuilles de peupliers âgés de 4 mois ....................................................................................... 49
4.5 Quantification du protéasome 20S dans des feuilles de peupliers âgés de 4 mois .. 51
4.6 Mesure de l’activité PAL des feuilles de peupliers âgés de 4 mois ............................ 52
4.7 Analyse de la résistance au stress oxydatif des feuilles de peupliers âgés de 5 mois .................................................................................................................................... 53
4.7.1 Analyse de la résistance à l’Antimycine A ........................................................... 53
4.7.2 Analyse de la résistance au méthyl viologène (MV) et méthyl viologène + SHAM (MVS) ................................................................................................................... 56
Conclusion et perspectives ....................................................................................................... 63
Bibliographie ............................................................................................................................ 65
AnnexesPermalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=89177 Caractérisation du gène UGT72A2 codant pour une glycosyltransférase associée au stress oxydatif chez le peuplier [TFE / Mémoire] / Nicolas Leurquin, Auteur ; Jenny Pouyez, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie, 2020.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Agronomie AIBT Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Résumé : Dans une optique d’amélioration de la qualité du bois, le laboratoire de Biotechnologie Végétale de l’ULB a débuté des recherches visant à mieux comprendre le rôle des glycosyltransférases dans la formation des parois secondaires lignifiées. Ainsi, des chercheurs ont isolé le gène UGT72A2 chez l’hybride Populus tremula x alba. Ce gène est phylogénétiquement proche des gènes de la sous-famille UGT72E qui codent pour des glycosyltransférases impliquées dans la glycosylation des monolignols chez Arabidopsis thaliana.
Afin d’étudier le rôle de UGT72A2, des lignées transgéniques sur-exprimant (sous le contrôle du promoteur CaMV35S - lignées OE) et d’autres sous-exprimant UGT72A2 (par interférence ARN - lignées RNAi) ont été produites. Une première caractérisation de UGT72A2 a montré que les lignées sous-exprimant le gène présentaient un jaunissement précoce des feuilles, pouvant être associé à un phénomène de stress oxydatif caractérisé par la présence de dérivés réactifs de l’oxygène (ROS) dans la plante.
Afin de confirmer ce phénomène de stress oxydatif et de comprendre l’implication de UGT72A2 dans la résistance à ce type de stress, différentes manipulations ont été réalisées sur des lignées RNAi, OE et des lignées de type sauvage (WT). Un dosage des chlorophylles, des phéophytines et des caroténoïdes a d’abord permis de confirmer que le jaunissement précoce des lignées RNAi était associé à une diminution des pigments foliaires. Ensuite, différents marqueurs de stress oxydatif ont été étudiés. Ainsi, l’augmentation de la peroxydation des lipides et l’augmentation de la quantité de protéasome 20S dans les feuilles semblent confirmer un stress oxydatif plus élevé dans les lignées RNAi que dans les lignées OE et WT. Un dosage des anthocyanes, molécules antioxydantes, a également été réalisé. La baisse de la concentration en anthocyanes dans les lignées RNAi montre une diminution de la capacité antioxydante dans ces lignées. Il semblerait donc que la sous-expression de UGT72A2 induise un stress oxydatif dans la plante.
Pour finir, une série de manipulations a permis d’évaluer la résistance des différentes lignées de peupliers à un stress oxydatif provoqué par l’antimycine A et le méthyl viologène, deux herbicides qui engendrent la production de ROS respectivement au niveau des mitochondries et des chloroplastes. Étonnement, la lignée RNAi la plus proche du WT (pour l’antimycine A) et la lignée exprimant le moins UGT72A2 (pour le méthyl viologène) ont montré une meilleure résistance au stress oxydatif.
Les manipulations effectuées ont ainsi confirmé les résultats des analyses antérieures et renforcé l'hypothèse de l'implication de UGT72A2 dans le phénomène de résistance au stress oxydatif. Ces recherches ouvrent dès lors la voie à d’autres expériences qui permettront de déterminer les facteurs régulant l’expression de UGT72A2.Note de contenu : Table des matières
Remerciements
Présentation du lieu de stage
Introduction .............................................................................................................................. 10
1 Introduction théorique .............................................................................................. 11
1.1 Le peuplier .................................................................................................................. 11
1.1.1 Interférence par ARN .......................................................................................... 12
1.1.2 Production de peupliers sur-exprimant UGT72A2 ............................................. 14
1.1.3 Techniques de transformation génétique .......................................................... 14
1.2 Les glycosyltransférases ............................................................................................. 15
1.3 Le stress oxydatif ........................................................................................................ 19
1.4 Analyses des lignées de peupliers transgéniques sous-exprimant UGT72A2 ........... 22
2 Objectifs du travail de fin d’études ............................................................................ 25
3 Matériel et méthodes ................................................................................................ 26
3.1 Calcul du niveau d’expression de UGT72A2 chez les peupliers transgéniques OE500 .................................................................................................................................... 27
3.1.1 Extraction de l’ARN ............................................................................................. 27
3.1.2 Dosage au NanodropTM ....................................................................................... 28
3.1.3 Vérification de l’intégrité de l’ARN par électrophorèse ..................................... 28
3.1.4 Transcription inverse .......................................................................................... 29
3.1.5 PCR-quantitative (qPCR) ..................................................................................... 29
3.2 Dosage de la chlorophylle, de la phéophytine et des caroténoïdes .......................... 30
3.3 Analyse de la peroxydation des lipides et dosage des anthocyanes ......................... 31
3.4 Quantification du protéasome 20S ............................................................................ 32
3.5 Mesure de l’activité PAL ............................................................................................. 33
3.6 Analyse de la résistance au stress oxydatif ................................................................ 34
3.6.1 Analyse de la résistance à l’antimycine A ........................................................... 35
3.6.2 Analyse de la résistance au méthyl viologène .................................................... 36
3.6.3 Inhibition de l’alternative oxydase ..................................................................... 37
3.7 Tests GUS ................................................................................................................... 38
4 Résultats et discussions ............................................................................................. 40
4.1 Analyse phénotypique des lignées sur-exprimant UGT72A2 .................................... 40
4.2 Calcul du degré d’expression de UGT72A2 chez les peupliers transgéniques OE500 ….. ............................................................................................................................... 40
4.3 Dosage de la chlorophylle, de la phéophytine et des caroténoïdes dans des feuilles de peupliers âgés de 4 mois ....................................................................................... 45
4.3.1 Dosage des chlorophylles a et b ......................................................................... 45
4.3.2 Dosage des phéophytines ................................................................................... 47
4.3.3 Dosage des caroténoïdes .................................................................................... 48
4.4 Analyse de la peroxydation des lipides et dosage des anthocyanes dans des feuilles de peupliers âgés de 4 mois ....................................................................................... 49
4.5 Quantification du protéasome 20S dans des feuilles de peupliers âgés de 4 mois .. 51
4.6 Mesure de l’activité PAL des feuilles de peupliers âgés de 4 mois ............................ 52
4.7 Analyse de la résistance au stress oxydatif des feuilles de peupliers âgés de 5 mois .................................................................................................................................... 53
4.7.1 Analyse de la résistance à l’Antimycine A ........................................................... 53
4.7.2 Analyse de la résistance au méthyl viologène (MV) et méthyl viologène + SHAM (MVS) ................................................................................................................... 56
Conclusion et perspectives ....................................................................................................... 63
Bibliographie ............................................................................................................................ 65
AnnexesPermalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=89177 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Composition de panels d’immunophénotypage pour un cytomètre dix couleurs / Klára Kara
Titre : Composition de panels d’immunophénotypage pour un cytomètre dix couleurs Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Klára Kara, Auteur ; Mélanie DEKEYSER, Directeur de la recherche ; Quentin Delefortrie, Directeur de la recherche ; Jenny Pouyez, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2020 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Ces dernières décennies, au laboratoire d’hématologie, la cytométrie en flux est
devenue une technique indispensable pour le diagnostic et suivi de nombreuses
hémopathies et lymphomes, en complément à la numération et à la cytologie. Elle
permet d’obtenir des informations au niveau des cellules individuelles en termes de taille,
complexité cellulaire et marqueurs de surface.
Si au début, les possibilités étaient limitées avec des appareils à un seul laser,
désormais le potentiel est de plus en plus élargi grâce aux cytomètres multi-laser. La
découverte des «Clusters of Differentiation» et l’étoffement des connaissances quant à
leur rôle et présence ou absence dans les diverses pathologies a permis le développement
d’anticorps monoclonaux se liant à ces épitopes. Les anticorps peuvent désormais être
conjugués à un panel de fluorochromes particulièrement varié – permettant d’obtenir
des signaux fluorescents sur une gamme de longueurs d’onde plus étendue.
Le laboratoire d’hématologie de la Clinique Notre-Dame de Grâce de Gosselies
vient d’acquérir un cytomètre Beckman Coulter Navios EX, trois lasers, permettant
l’exploration simultanée de douze paramètres. Les panels de marqueurs doivent être
adaptés: de cinq anticorps exploités à ce jour, désormais, dix peuvent être utilisés lors
d’une même analyse.
Le présent travail propose des nouveaux panels en tenant compte des
contraintes imposées et en se basant sur des propositions de publications scientifiques
récentes.Note de contenu : Table des matières
Clinique Notre-Dame de Grâce, Gosselies ......................................................................................... 7
Introduction générale ........................................................................................................................ 8
1 Cytofluorométrie en flux ............................................................................................................. 10
1.1 Principe de fonctionnement ................................................................................................... 11
Composant fluidique / hydrodynamique ........................................................................ 12
Composant optique ......................................................................................................... 13
Composant numérique .................................................................................................... 22
Tri des cellules ................................................................................................................. 24
1.2 Chevauchement spectral et compensation ............................................................................ 25
2 Beckman Coulter Navios EX ........................................................................................................ 27
3 Pathologies .................................................................................................................................. 29
3.1 Leucémie lymphoïde chronique (LLC) .................................................................................... 29
3.2 Lymphocytose B monoclonale (MBL) ..................................................................................... 33
3.3 Leucémie à tricholeucocytes (HCL) ........................................................................................ 33
4 Marqueurs utiles dans le cadre des syndromes lymphoprolifératifs B chroniques ................... 35
4.1 Altération du phénotypage à la suite d’un traitement .......................................................... 36
5 Objectif du travail de fin d’études et stratégie ........................................................................... 38
6 Matériel, méthode et hypothèses de travail .............................................................................. 40
6.1 Matériel nécessaire à l’immunophénotypage........................................................................ 40
6.2 Méthode d’immunophénotypage .......................................................................................... 41
6.3 Marqueurs de «Cluster of Differentiation» utilisés ............................................................... 43
6.4 Critères à prendre en compte lors de la création d’un panel de marqueurs......................... 51
Contrôle des résultats ..................................................................................................... 51
Le choix des anticorps ..................................................................................................... 52
Attribution des fluorochromes aux marqueurs .............................................................. 52
Densité d’expression des antigènes ................................................................................ 53
7 Résultats et discussion ................................................................................................................ 55
7.1 Proposition de panels pour l’appareil Navios EX ................................................................... 55
Proposition A, élaborée à partir de celle de Beckman Coulter ....................................... 55
Proposition B, élaborée sur base de celle du consortium EuroFlow .............................. 57
Proposition C, basée sur celle du Groupe d’Etude Immunologique des Leucémies....... 60
Proposition D: révision des panels actuels de la CNDG de cinq en dix couleurs ............ 63
Avantages globaux des propositions ............................................................................... 66
Inconvénients globaux des propositions ......................................................................... 66
Perspectives ..................................................................................................................................... 67
Glossaire ........................................................................................................................................... 69
Liste des figures ................................................................................................................................ 71
Abréviations ..................................................................................................................................... 72
Bibliographie .................................................................................................................................... 73
Annexe ............................................................................................................................................. 80Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=89137 Composition de panels d’immunophénotypage pour un cytomètre dix couleurs [TFE / Mémoire] / Klára Kara, Auteur ; Mélanie DEKEYSER, Directeur de la recherche ; Quentin Delefortrie, Directeur de la recherche ; Jenny Pouyez, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2020.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Ces dernières décennies, au laboratoire d’hématologie, la cytométrie en flux est
devenue une technique indispensable pour le diagnostic et suivi de nombreuses
hémopathies et lymphomes, en complément à la numération et à la cytologie. Elle
permet d’obtenir des informations au niveau des cellules individuelles en termes de taille,
complexité cellulaire et marqueurs de surface.
Si au début, les possibilités étaient limitées avec des appareils à un seul laser,
désormais le potentiel est de plus en plus élargi grâce aux cytomètres multi-laser. La
découverte des «Clusters of Differentiation» et l’étoffement des connaissances quant à
leur rôle et présence ou absence dans les diverses pathologies a permis le développement
d’anticorps monoclonaux se liant à ces épitopes. Les anticorps peuvent désormais être
conjugués à un panel de fluorochromes particulièrement varié – permettant d’obtenir
des signaux fluorescents sur une gamme de longueurs d’onde plus étendue.
Le laboratoire d’hématologie de la Clinique Notre-Dame de Grâce de Gosselies
vient d’acquérir un cytomètre Beckman Coulter Navios EX, trois lasers, permettant
l’exploration simultanée de douze paramètres. Les panels de marqueurs doivent être
adaptés: de cinq anticorps exploités à ce jour, désormais, dix peuvent être utilisés lors
d’une même analyse.
Le présent travail propose des nouveaux panels en tenant compte des
contraintes imposées et en se basant sur des propositions de publications scientifiques
récentes.Note de contenu : Table des matières
Clinique Notre-Dame de Grâce, Gosselies ......................................................................................... 7
Introduction générale ........................................................................................................................ 8
1 Cytofluorométrie en flux ............................................................................................................. 10
1.1 Principe de fonctionnement ................................................................................................... 11
Composant fluidique / hydrodynamique ........................................................................ 12
Composant optique ......................................................................................................... 13
Composant numérique .................................................................................................... 22
Tri des cellules ................................................................................................................. 24
1.2 Chevauchement spectral et compensation ............................................................................ 25
2 Beckman Coulter Navios EX ........................................................................................................ 27
3 Pathologies .................................................................................................................................. 29
3.1 Leucémie lymphoïde chronique (LLC) .................................................................................... 29
3.2 Lymphocytose B monoclonale (MBL) ..................................................................................... 33
3.3 Leucémie à tricholeucocytes (HCL) ........................................................................................ 33
4 Marqueurs utiles dans le cadre des syndromes lymphoprolifératifs B chroniques ................... 35
4.1 Altération du phénotypage à la suite d’un traitement .......................................................... 36
5 Objectif du travail de fin d’études et stratégie ........................................................................... 38
6 Matériel, méthode et hypothèses de travail .............................................................................. 40
6.1 Matériel nécessaire à l’immunophénotypage........................................................................ 40
6.2 Méthode d’immunophénotypage .......................................................................................... 41
6.3 Marqueurs de «Cluster of Differentiation» utilisés ............................................................... 43
6.4 Critères à prendre en compte lors de la création d’un panel de marqueurs......................... 51
Contrôle des résultats ..................................................................................................... 51
Le choix des anticorps ..................................................................................................... 52
Attribution des fluorochromes aux marqueurs .............................................................. 52
Densité d’expression des antigènes ................................................................................ 53
7 Résultats et discussion ................................................................................................................ 55
7.1 Proposition de panels pour l’appareil Navios EX ................................................................... 55
Proposition A, élaborée à partir de celle de Beckman Coulter ....................................... 55
Proposition B, élaborée sur base de celle du consortium EuroFlow .............................. 57
Proposition C, basée sur celle du Groupe d’Etude Immunologique des Leucémies....... 60
Proposition D: révision des panels actuels de la CNDG de cinq en dix couleurs ............ 63
Avantages globaux des propositions ............................................................................... 66
Inconvénients globaux des propositions ......................................................................... 66
Perspectives ..................................................................................................................................... 67
Glossaire ........................................................................................................................................... 69
Liste des figures ................................................................................................................................ 71
Abréviations ..................................................................................................................................... 72
Bibliographie .................................................................................................................................... 73
Annexe ............................................................................................................................................. 80Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=89137 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Contribution à l'amélioration des analyses séminologiques au Centre Médical de la Reproduction (CMR) du Grand Hôpital de charleroi (GHdC) / Sixtine Delair
Titre : Contribution à l'amélioration des analyses séminologiques au Centre Médical de la Reproduction (CMR) du Grand Hôpital de charleroi (GHdC) Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Sixtine Delair, Auteur ; Jenny Pouyez, Directeur de la recherche Année de publication : 2018 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66079 Contribution à l'amélioration des analyses séminologiques au Centre Médical de la Reproduction (CMR) du Grand Hôpital de charleroi (GHdC) [TFE / Mémoire] / Sixtine Delair, Auteur ; Jenny Pouyez, Directeur de la recherche . - 2018.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66079 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Contribution à la caractérisation de gènes codant pour des facteurs de transcription PLATZ chez le peuplier / Louis Verlaine
Titre : Contribution à la caractérisation de gènes codant pour des facteurs de transcription PLATZ chez le peuplier Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Louis Verlaine, Auteur ; Jenny Pouyez Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie Année de publication : 2021 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : laboratoire de biotechnologie végétale LBV PEUPLIER PLATZ Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Résumé : Les PLATZ sont des facteurs de transcription spécifiques aux plantes connus pour moduler diverses voies métaboliques au niveau cellulaire en lien avec des processus développementaux globaux tels que la prolifération cellulaire, l’accumulation de réserve ou encore la sénescence. Les résultats obtenus au préalable par le laboratoire d’accueil ont montré que certains gènes PLATZ (PLATZ5, PLATZ5 et PLATZ9) sont préférentiellement exprimés dans le xylème chez le peuplier. La différenciation des cellules qui composent le xylème nécessite une synthèse abondante des composés de la paroi, comme la cellulose, les hémicelluloses et la lignine. L’hypothèse de recherche est que ces PLATZ pourraient réguler la formation de la paroi secondaire, un processus développemental nécessitant un métabolisme très actif.
Dans un premier temps nous avons cherché à vérifier l’hypothèse selon laquelle les facteurs de transcription PLATZ sélectionnés chez le peuplier sont localisés dans le noyau. Pour cela nous avons réalisé des constructions GFP-PLATZ5 et GFP-PLATZ9 et localisé les polypeptides correspondants dans le noyau de cellules épidermiques de tabac, suite à une agroinfiltration. L’hypothèse est donc confirmée.
Dans une deuxième phase, nous nous sommes attelés à réaliser une série de constructions génétiques différentes visant à altérer l’expression de ces PLATZ chez le peuplier. Ces constructions visent i) à muter les gènes d’intérêt par la méthodologie CRISPR/cas9, ii) à inhiber les gènes régulés par ces facteurs de transcription en réalisant des constructions chimériques avec le motif SRDX, ou iii) à surexprimer les gènes sous le contrôle du promoteur CaMV35S.Note de contenu : Table des matières
Remerciements .................................................................................................................................... 3
Présentation du lieu de stage ................................................................................................................ 8
Introduction générale ........................................................................................................................... 9
1. Introduction théorique .................................................................................. 10
1.1. Le peuplier ............................................................................................... 10
1.2. Les PLATZ en général ............................................................................. 11
1.3. Lien entre les PLATZ et les ARN polymérases ........................................ 13
1.4. Caractérisation des PLATZ chez le peuplier ............................................. 16
1.5. Caractérisation des 6 PLATZ sélectionnés chez le peuplier ...................... 22
2. Objectif et stratégie ...................................................................................... 24
3. Matériel et méthodes .................................................................................... 25
3.1. Matériel biologique .................................................................................. 25
3.2. Clonage de gènes PLATZ du peuplier ....................................................... 25
3.3. Méthode Gateway .................................................................................... 28
3.4. Construction de CRISPR/Cas9 pour le peuplier ........................................ 30
4. Résultats ...................................................................................................... 33
4.1. Localisation des PLATZ de peuplier dans la cellule ................................. 33
4.2. Création de la construction CRISPR/Cas9 permettant de muter les gènes PtaPLATZ5 et PtaPLATZ9 ............................................................................................ 36
4.3. Constructions permettant de surexprimer PLATZ4, PtaPLATZ5 et PtaPLATZ9 et de réprimer les gènes régulés par PtaPLATZ9 ........................................ 38
5. Discussion et perspectives............................................................................ 39
5.1 Localisation des PtaPLATZ dans la cellule .................................................. 39
5.2. Production de lignées de peuplier mutantes sur-exprimant les PLATZ de peuplier avec ou sans domaine SRDX ........................................................................... 40
6. Références ................................................................................................... 42
Annexes ............................................................................................................................................ 45
Annexe 1 : Protocoles............................................................................................ 45
Annexe 2 : Arabidopsis thaliana ........................................................................... 48
Résumé ............................................................................................................................................. 52Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=99943 Contribution à la caractérisation de gènes codant pour des facteurs de transcription PLATZ chez le peuplier [TFE / Mémoire] / Louis Verlaine, Auteur ; Jenny Pouyez . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Agronomie, 2021.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur
Langues : Français (fre)
Mots-clés : laboratoire de biotechnologie végétale LBV PEUPLIER PLATZ Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Résumé : Les PLATZ sont des facteurs de transcription spécifiques aux plantes connus pour moduler diverses voies métaboliques au niveau cellulaire en lien avec des processus développementaux globaux tels que la prolifération cellulaire, l’accumulation de réserve ou encore la sénescence. Les résultats obtenus au préalable par le laboratoire d’accueil ont montré que certains gènes PLATZ (PLATZ5, PLATZ5 et PLATZ9) sont préférentiellement exprimés dans le xylème chez le peuplier. La différenciation des cellules qui composent le xylème nécessite une synthèse abondante des composés de la paroi, comme la cellulose, les hémicelluloses et la lignine. L’hypothèse de recherche est que ces PLATZ pourraient réguler la formation de la paroi secondaire, un processus développemental nécessitant un métabolisme très actif.
Dans un premier temps nous avons cherché à vérifier l’hypothèse selon laquelle les facteurs de transcription PLATZ sélectionnés chez le peuplier sont localisés dans le noyau. Pour cela nous avons réalisé des constructions GFP-PLATZ5 et GFP-PLATZ9 et localisé les polypeptides correspondants dans le noyau de cellules épidermiques de tabac, suite à une agroinfiltration. L’hypothèse est donc confirmée.
Dans une deuxième phase, nous nous sommes attelés à réaliser une série de constructions génétiques différentes visant à altérer l’expression de ces PLATZ chez le peuplier. Ces constructions visent i) à muter les gènes d’intérêt par la méthodologie CRISPR/cas9, ii) à inhiber les gènes régulés par ces facteurs de transcription en réalisant des constructions chimériques avec le motif SRDX, ou iii) à surexprimer les gènes sous le contrôle du promoteur CaMV35S.Note de contenu : Table des matières
Remerciements .................................................................................................................................... 3
Présentation du lieu de stage ................................................................................................................ 8
Introduction générale ........................................................................................................................... 9
1. Introduction théorique .................................................................................. 10
1.1. Le peuplier ............................................................................................... 10
1.2. Les PLATZ en général ............................................................................. 11
1.3. Lien entre les PLATZ et les ARN polymérases ........................................ 13
1.4. Caractérisation des PLATZ chez le peuplier ............................................. 16
1.5. Caractérisation des 6 PLATZ sélectionnés chez le peuplier ...................... 22
2. Objectif et stratégie ...................................................................................... 24
3. Matériel et méthodes .................................................................................... 25
3.1. Matériel biologique .................................................................................. 25
3.2. Clonage de gènes PLATZ du peuplier ....................................................... 25
3.3. Méthode Gateway .................................................................................... 28
3.4. Construction de CRISPR/Cas9 pour le peuplier ........................................ 30
4. Résultats ...................................................................................................... 33
4.1. Localisation des PLATZ de peuplier dans la cellule ................................. 33
4.2. Création de la construction CRISPR/Cas9 permettant de muter les gènes PtaPLATZ5 et PtaPLATZ9 ............................................................................................ 36
4.3. Constructions permettant de surexprimer PLATZ4, PtaPLATZ5 et PtaPLATZ9 et de réprimer les gènes régulés par PtaPLATZ9 ........................................ 38
5. Discussion et perspectives............................................................................ 39
5.1 Localisation des PtaPLATZ dans la cellule .................................................. 39
5.2. Production de lignées de peuplier mutantes sur-exprimant les PLATZ de peuplier avec ou sans domaine SRDX ........................................................................... 40
6. Références ................................................................................................... 42
Annexes ............................................................................................................................................ 45
Annexe 1 : Protocoles............................................................................................ 45
Annexe 2 : Arabidopsis thaliana ........................................................................... 48
Résumé ............................................................................................................................................. 52Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=99943 Exemplaires
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