Centre de Documentation Campus Montignies
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Auteur Nicolas Kesteman |
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Comparaison de 2 tests immunochromatographiques commerciaux pour l'identification de carbapénémases chez les Entérobactéries / Anne-Sophie Berger
Titre : Comparaison de 2 tests immunochromatographiques commerciaux pour l'identification de carbapénémases chez les Entérobactéries Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Anne-Sophie Berger, Auteur ; Pierre Bogaerts, Directeur de la recherche ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche Année de publication : 2018 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66071 Comparaison de 2 tests immunochromatographiques commerciaux pour l'identification de carbapénémases chez les Entérobactéries [TFE / Mémoire] / Anne-Sophie Berger, Auteur ; Pierre Bogaerts, Directeur de la recherche ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche . - 2018.
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Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66071 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Comparaison d'un kit immunochromatographique et d'une nouvelle technique d'amplification isotherme pour la recherche de Streptococcus pyogenes dans des frottis de gorge par rapport à la culture / Louise Ripet
Titre : Comparaison d'un kit immunochromatographique et d'une nouvelle technique d'amplification isotherme pour la recherche de Streptococcus pyogenes dans des frottis de gorge par rapport à la culture Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Louise Ripet, Auteur ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2019 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur. Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Saint Luc Bouge CHU Saint Luc Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Ce travail réalisé en collaboration avec la section bactériologie de la clinique Saint-Luc à Bouge, porte sur l’étude du Streptocoque du groupe A. Egalement désigné Streptococcus pyogenes, il s’agit d’une bactérie qui est retrouvée par portage chez l'homme au niveau de la peau et des muqueuses. Cette bactérie est responsable le plus fréquemment d'angines bactériennes qui bien que ne représentant que 20 % des cas d’angines, se révèlent être bien plus graves que les angines d’origine virale. C'est pourquoi la recherche de cette bactérie dans les frottis de gorge est essentielle afin de déterminer la nature de l'angine. Streptococcus pyogenes est détecté par différentes méthodes. Celle utilisée en routine au laboratoire est la détection par un test rapide basé sur le principe de l'immunochromatographie et la culture sur un milieu gélosé. Le premier objectif de ce travail de fin d'études était de comparer cette méthode à un autre test immunochromatographique provenant d'une autre firme afin de déterminer si celui-ci est plus ou moins performant que le test de détection actuel. Le second objectif était de valider et tester une nouvelle méthode de détection par amplification isotherme de façon à déterminer si cette nouvelle technique d'amplification a sa place dans un laboratoire d’analyses médicales et se positionner quant à l’utilisation de cette technique en remplacement de la culture qui est pour l'instant la méthode gold standard. Au terme de ce travail, il en est ressorti que le kit de détection actuellement utilisé par l’hôpital présente une meilleure fiabilité mais également que la technique d’amplification isotherme pourrait s’avérer être une alternative convaincante à la culture. Travail de fin d'études réalisé par Louise RIPET sous la direction de
• Nicolas Kesteman (HELHa) - Promoteur
• Julie Cadrobbi (St Luc) - Encadrante
• Kim Laffineur (St Luc) - Encadrante
• Philippe Martin (St Luc) - EncadranteNote de contenu : Introduction.................................................................................................................5
Mise en contexte...........................................................................................................7
Chapitre 1 – Les Streptocoques.......................................................................................................8
1.1 – Généralités.........................................................................................................................8
1.2 – Classification....................................................................................................................11
1.3 – Méthodes d'identification.................................................................................................13
1.4 – Streptococcus pyogenes...................................................................................................15
1.5 – Prévalence locale pour l'année 2018................................................................................18
Chapitre 2 – Mise en évidence du Streptococcus pyogenes..........................................................20
2.1 – Recherche de l'antigène....................................................................................................20
2.2 – Culture..............................................................................................................................21
2.3 – Analyses moléculaire.......................................................................................................21
Résultats et analyses..................................................................................................26
Chapitre 3 – Matériel et mode opératoire......................................................................................27
3.1 – Objectif de ce travail........................................................................................................27
3.2 – Matériel utilisé.................................................................................................................27
Chapitre 4 – Résultats et discussion..............................................................................................32
4.1 – Sensibilité, spécificité et valeur prédictive des deux tests rapides...................................32
4.2 – Réactivité croisée.............................................................................................................41
4.3 – Stabilité des échantillons..................................................................................................42
Conclusion..................................................................................................................45Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=79999 Comparaison d'un kit immunochromatographique et d'une nouvelle technique d'amplification isotherme pour la recherche de Streptococcus pyogenes dans des frottis de gorge par rapport à la culture [TFE / Mémoire] / Louise Ripet, Auteur ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2019.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez vous connecter pour accéder à votre compte lecteur.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : biologie médicale Saint Luc Bouge CHU Saint Luc Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Ce travail réalisé en collaboration avec la section bactériologie de la clinique Saint-Luc à Bouge, porte sur l’étude du Streptocoque du groupe A. Egalement désigné Streptococcus pyogenes, il s’agit d’une bactérie qui est retrouvée par portage chez l'homme au niveau de la peau et des muqueuses. Cette bactérie est responsable le plus fréquemment d'angines bactériennes qui bien que ne représentant que 20 % des cas d’angines, se révèlent être bien plus graves que les angines d’origine virale. C'est pourquoi la recherche de cette bactérie dans les frottis de gorge est essentielle afin de déterminer la nature de l'angine. Streptococcus pyogenes est détecté par différentes méthodes. Celle utilisée en routine au laboratoire est la détection par un test rapide basé sur le principe de l'immunochromatographie et la culture sur un milieu gélosé. Le premier objectif de ce travail de fin d'études était de comparer cette méthode à un autre test immunochromatographique provenant d'une autre firme afin de déterminer si celui-ci est plus ou moins performant que le test de détection actuel. Le second objectif était de valider et tester une nouvelle méthode de détection par amplification isotherme de façon à déterminer si cette nouvelle technique d'amplification a sa place dans un laboratoire d’analyses médicales et se positionner quant à l’utilisation de cette technique en remplacement de la culture qui est pour l'instant la méthode gold standard. Au terme de ce travail, il en est ressorti que le kit de détection actuellement utilisé par l’hôpital présente une meilleure fiabilité mais également que la technique d’amplification isotherme pourrait s’avérer être une alternative convaincante à la culture. Travail de fin d'études réalisé par Louise RIPET sous la direction de
• Nicolas Kesteman (HELHa) - Promoteur
• Julie Cadrobbi (St Luc) - Encadrante
• Kim Laffineur (St Luc) - Encadrante
• Philippe Martin (St Luc) - EncadranteNote de contenu : Introduction.................................................................................................................5
Mise en contexte...........................................................................................................7
Chapitre 1 – Les Streptocoques.......................................................................................................8
1.1 – Généralités.........................................................................................................................8
1.2 – Classification....................................................................................................................11
1.3 – Méthodes d'identification.................................................................................................13
1.4 – Streptococcus pyogenes...................................................................................................15
1.5 – Prévalence locale pour l'année 2018................................................................................18
Chapitre 2 – Mise en évidence du Streptococcus pyogenes..........................................................20
2.1 – Recherche de l'antigène....................................................................................................20
2.2 – Culture..............................................................................................................................21
2.3 – Analyses moléculaire.......................................................................................................21
Résultats et analyses..................................................................................................26
Chapitre 3 – Matériel et mode opératoire......................................................................................27
3.1 – Objectif de ce travail........................................................................................................27
3.2 – Matériel utilisé.................................................................................................................27
Chapitre 4 – Résultats et discussion..............................................................................................32
4.1 – Sensibilité, spécificité et valeur prédictive des deux tests rapides...................................32
4.2 – Réactivité croisée.............................................................................................................41
4.3 – Stabilité des échantillons..................................................................................................42
Conclusion..................................................................................................................45Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=79999 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Comparaison de la méthode de diffusion sur gélose et la méthode des microdilutions ou Sensititre® pour la sensibilité des Bacilles Gram négatif au Céfidérocol. / Boris Joseph Nganwoua Wonkam
Titre : Comparaison de la méthode de diffusion sur gélose et la méthode des microdilutions ou Sensititre® pour la sensibilité des Bacilles Gram négatif au Céfidérocol. Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Boris Joseph Nganwoua Wonkam, Auteur ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2021 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : gélose microdilutions Sensititre® Bacilles Gram négatif Céfidérocol CHU DINANT-GODINNE Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE..............................................................5
INTRODUCTION GENERALE.........................................................................6
I. PARTIE THEORIQUE......................................................................7
1 Les bactéries ....................................................................................................................... 8
2 Les antibiotiques ................................................................................................................ 9
3 Classification et mécanismes d’action des antibiotiques ................................................... 9
3.1 Classification.............................................................................................................. 9
3.2 Mécanisme d’action des antibiotiques ....................................................................... 9
3.2.1 Inhibition de la synthèse de la paroi..................................................................... 9
3.2.1.1 Les β-lactamines ........................................................................................... 9
3.2.1.2 Glycopeptides ............................................................................................. 14
3.2.1.3 Fosfomycine................................................................................................ 14
3.2.1.4 Le Céfidérocol ............................................................................................ 12
3.2.2 Inhibition de la synthèse et/ou le fonctionnement de l’ADN bactérien ............. 15
3.2.3 Inhibition de la synthèse des protéines............................................................... 15
3.2.4 Inhibition agissant au niveau de la membrane ................................................... 15
3.3 La résistance aux antibiotiques ................................................................................ 15
3.3.1 Epidémiologie .................................................................................................... 15
3.3.2 Les principaux mécanismes de résistance.......................................................... 17
3.3.2.1 L’inactivation enzymatique ........................................................................ 17
3.3.2.2 Modification de la cible .............................................................................. 19
3.3.2.2.1 Diminution de l’affinité pour la β-lactamine.......................................... 19
3.3.2.2.2 Hyperproduction de la cible ................................................................... 19
3.3.3 Modification de la perméabilité ......................................................................... 19
3.3.4 La pompe à efflux .............................................................................................. 20
3.4 Détermination de la sensibilité d’une bactérie à un antibiotique ............................. 21
3.4.1 Antibiogramme et CMI ...................................................................................... 21
3.4.2 Les méthodes de détermination de la CMI......................................................... 21
3.4.2.1 La méthode de dilution en milieu liquide ................................................... 21
3.4.2.2 La méthode de diffusion sur gélose ou méthode des disques ..................... 22
3.4.2.3 CMI en milieu gélosé par la méthode des E-test® ..................................... 23
3.4.2.4 La méthode de dilution sur Agar ................................................................ 24
4 Objectifs du travail et Stratégies ...................................................................................... 24
4
II. PARTIE PRATIQUE.................................................................................25
1 Identification des souches par MALDI-TOF ................................................................... 26
2 Détermination de la CMI par la méthode par microdilution Sensititre®......................... 27
2.1 Principe..................................................................................................................... 27
2.2 Préparation des échantillons..................................................................................... 27
2.3 Matériels et Appareils .............................................................................................. 28
2.4 Méthode.................................................................................................................... 29
3 La méthode de diffusion en gélose ou méthode des disques............................................ 30
3.1 Principe..................................................................................................................... 30
3.2 Matériels et réactifs utilisés...................................................................................... 30
3.3 Méthode.................................................................................................................... 31
4 Résultats ........................................................................................................................... 32
4.1 Méthode des microdilutions ou Sensititre®............................................................. 32
4.2 Méthode de diffusion sur gélose .............................................................................. 33
4.3 Comparaison entre la méthode des microdilutions et la méthode de diffusion en gélose
.............................................................................................................................................. 34
5 Discussion ........................................................................................................................ 36
6 Difficultés rencontrées ..................................................................................................... 38
CONCLUSION ........................................................................................................................ 39
RESUME.................................................................................................................................. 40
GLOSSAIRE ............................................................................................................................ 41
LISTE DES FIGURES............................................................................................................. 42
LISTE DES TABLEAUX ........................................................................................................ 43
LISTE DES ABREVIATIONS ................................................................................................ 44
BIBLIOGRAPHIES ................................................................................................................. 45
ANNEXES ............................................................................................................................... 49
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=100299 Comparaison de la méthode de diffusion sur gélose et la méthode des microdilutions ou Sensititre® pour la sensibilité des Bacilles Gram négatif au Céfidérocol. [TFE / Mémoire] / Boris Joseph Nganwoua Wonkam, Auteur ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2021.
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Mots-clés : gélose microdilutions Sensititre® Bacilles Gram négatif Céfidérocol CHU DINANT-GODINNE Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Note de contenu : PRÉSENTATION DU LIEU DE STAGE..............................................................5
INTRODUCTION GENERALE.........................................................................6
I. PARTIE THEORIQUE......................................................................7
1 Les bactéries ....................................................................................................................... 8
2 Les antibiotiques ................................................................................................................ 9
3 Classification et mécanismes d’action des antibiotiques ................................................... 9
3.1 Classification.............................................................................................................. 9
3.2 Mécanisme d’action des antibiotiques ....................................................................... 9
3.2.1 Inhibition de la synthèse de la paroi..................................................................... 9
3.2.1.1 Les β-lactamines ........................................................................................... 9
3.2.1.2 Glycopeptides ............................................................................................. 14
3.2.1.3 Fosfomycine................................................................................................ 14
3.2.1.4 Le Céfidérocol ............................................................................................ 12
3.2.2 Inhibition de la synthèse et/ou le fonctionnement de l’ADN bactérien ............. 15
3.2.3 Inhibition de la synthèse des protéines............................................................... 15
3.2.4 Inhibition agissant au niveau de la membrane ................................................... 15
3.3 La résistance aux antibiotiques ................................................................................ 15
3.3.1 Epidémiologie .................................................................................................... 15
3.3.2 Les principaux mécanismes de résistance.......................................................... 17
3.3.2.1 L’inactivation enzymatique ........................................................................ 17
3.3.2.2 Modification de la cible .............................................................................. 19
3.3.2.2.1 Diminution de l’affinité pour la β-lactamine.......................................... 19
3.3.2.2.2 Hyperproduction de la cible ................................................................... 19
3.3.3 Modification de la perméabilité ......................................................................... 19
3.3.4 La pompe à efflux .............................................................................................. 20
3.4 Détermination de la sensibilité d’une bactérie à un antibiotique ............................. 21
3.4.1 Antibiogramme et CMI ...................................................................................... 21
3.4.2 Les méthodes de détermination de la CMI......................................................... 21
3.4.2.1 La méthode de dilution en milieu liquide ................................................... 21
3.4.2.2 La méthode de diffusion sur gélose ou méthode des disques ..................... 22
3.4.2.3 CMI en milieu gélosé par la méthode des E-test® ..................................... 23
3.4.2.4 La méthode de dilution sur Agar ................................................................ 24
4 Objectifs du travail et Stratégies ...................................................................................... 24
4
II. PARTIE PRATIQUE.................................................................................25
1 Identification des souches par MALDI-TOF ................................................................... 26
2 Détermination de la CMI par la méthode par microdilution Sensititre®......................... 27
2.1 Principe..................................................................................................................... 27
2.2 Préparation des échantillons..................................................................................... 27
2.3 Matériels et Appareils .............................................................................................. 28
2.4 Méthode.................................................................................................................... 29
3 La méthode de diffusion en gélose ou méthode des disques............................................ 30
3.1 Principe..................................................................................................................... 30
3.2 Matériels et réactifs utilisés...................................................................................... 30
3.3 Méthode.................................................................................................................... 31
4 Résultats ........................................................................................................................... 32
4.1 Méthode des microdilutions ou Sensititre®............................................................. 32
4.2 Méthode de diffusion sur gélose .............................................................................. 33
4.3 Comparaison entre la méthode des microdilutions et la méthode de diffusion en gélose
.............................................................................................................................................. 34
5 Discussion ........................................................................................................................ 36
6 Difficultés rencontrées ..................................................................................................... 38
CONCLUSION ........................................................................................................................ 39
RESUME.................................................................................................................................. 40
GLOSSAIRE ............................................................................................................................ 41
LISTE DES FIGURES............................................................................................................. 42
LISTE DES TABLEAUX ........................................................................................................ 43
LISTE DES ABREVIATIONS ................................................................................................ 44
BIBLIOGRAPHIES ................................................................................................................. 45
ANNEXES ............................................................................................................................... 49
Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=100299 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Détection moléculaire d’Aspergillus spp. et de Pneumocystis jirovecii à l’aide de l’ELITe InGenius / Bérénice Veraghen
Titre : Détection moléculaire d’Aspergillus spp. et de Pneumocystis jirovecii à l’aide de l’ELITe InGenius Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Bérénice Veraghen, Auteur ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche Editeur : Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale Année de publication : 2022 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Aspergillus spp. et Pneumocystis jirovecii sont deux champignons capables de causer de graves pathologies chez l’homme. De la pneumopathie à l’infection invasive, ces agents pathogènes sont insidieux, difficilement détectables et le diagnostic est souvent très complexe. Afin de gagner le plus de temps possible et d’améliorer les chances de survie du patient face à ces infections souvent fatales, il est impératif d’améliorer la vitesse et la qualité des diagnostics. Pour cela, un outil s’impose facilement : la biologie moléculaire. Dans le cadre de ce travail, deux kits de QPCR de la société ELITech (Aspergillus et Pneumocystis) sont vérifiés intégralement : exactitude, reproductibilité, sensibilité, spécificité ainsi que la linéarité (pour le kit Aspergillus) sont étudiées. Cette vérification est réalisée grâce à de nombreux échantillons provenant du CHU UCL Mont-Godinne et d’ailleurs. Ces
échantillons sont principalement des lavages broncho-alvéolaires. L’apport de ces kits au diagnostic est également étudié. La vérification s’effectue sur l’automate ELITe InGenius de la société ELITech et les échantillons y sont traités de la manière standard. Des calibrations et des contrôles sont
également réalisés à l’aide de l’automate. Les résultats ont permis de révéler que le kit Pneumocystis possède une grande exactitude, reproductibilité et spécificité mais une sensibilité moins bonne. Le kit Aspergillus possède une exactitude moyenne, une mauvaise spécificité, une très bonne linéarité, sensibilité et une bonne reproductibilité à haute concentration de matériel génétique.
Concernant le kit Aspergillus, il s’est avéré qu’il existe une possibilité de discriminer les différentes classifications de pathologies fongiques invasives sur base des résultats donnés par l’InGenius. En effet, il est possible de différencier les aspergilloses prouvées, probables, possibles et les cas négatifs ou les cas de portage sain. Il est indéniable que ces outils de biologie moléculaire représentent un grand atout pour aider au diagnostic des maladies fongiques et que leur utilisation devrait être de plus en plus répandue durant les années à venir. Leur utilisation ne peut être qu’encouragée.Note de contenu : Table des matières
Présentation de l’établissement ...............................................................................................5
Introduction générale ..............................................................................................................6
Contexte général .....................................................................................................................8
1. Qu’est-ce qu’une mycose ? ..................................................................................................... 8
2. Aspergillus spp. ...................................................................................................................... 9
2.1. Epidémiologie................................................................................................................. 9
2.2. Pathologies....................................................................................................................11
2.3. Diagnostic biologique ....................................................................................................13
2.4. Traitement .....................................................................................................................15
3. Pneumocystis jirovecii ...........................................................................................................15
3.1. Epidémiologie................................................................................................................15
3.2. Pathologies....................................................................................................................17
3.3. Diagnostic biologique ....................................................................................................19
3.4. Traitement .....................................................................................................................21
4. Classification des maladies fongiques invasives .....................................................................22
5. Real time Q-PCR...................................................................................................................24
Objectifs et stratégie .............................................................................................................28
Matériel et méthodes ............................................................................................................29
Résultats et discussion ..........................................................................................................44
Conclusion générale .............................................................................................................55
Lexique ................................................................................................................................57
Liste des figures ...................................................................................................................58
Liste des tableaux .................................................................................................................60
Bibliographie ........................................................................................................................61
Annexes ...............................................................................................................................64Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=105769 Détection moléculaire d’Aspergillus spp. et de Pneumocystis jirovecii à l’aide de l’ELITe InGenius [TFE / Mémoire] / Bérénice Veraghen, Auteur ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche . - Montignies-sur-Sambre : Helha. Paramédical - Biologie médicale, 2022.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur
Langues : Français (fre)
Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Aspergillus spp. et Pneumocystis jirovecii sont deux champignons capables de causer de graves pathologies chez l’homme. De la pneumopathie à l’infection invasive, ces agents pathogènes sont insidieux, difficilement détectables et le diagnostic est souvent très complexe. Afin de gagner le plus de temps possible et d’améliorer les chances de survie du patient face à ces infections souvent fatales, il est impératif d’améliorer la vitesse et la qualité des diagnostics. Pour cela, un outil s’impose facilement : la biologie moléculaire. Dans le cadre de ce travail, deux kits de QPCR de la société ELITech (Aspergillus et Pneumocystis) sont vérifiés intégralement : exactitude, reproductibilité, sensibilité, spécificité ainsi que la linéarité (pour le kit Aspergillus) sont étudiées. Cette vérification est réalisée grâce à de nombreux échantillons provenant du CHU UCL Mont-Godinne et d’ailleurs. Ces
échantillons sont principalement des lavages broncho-alvéolaires. L’apport de ces kits au diagnostic est également étudié. La vérification s’effectue sur l’automate ELITe InGenius de la société ELITech et les échantillons y sont traités de la manière standard. Des calibrations et des contrôles sont
également réalisés à l’aide de l’automate. Les résultats ont permis de révéler que le kit Pneumocystis possède une grande exactitude, reproductibilité et spécificité mais une sensibilité moins bonne. Le kit Aspergillus possède une exactitude moyenne, une mauvaise spécificité, une très bonne linéarité, sensibilité et une bonne reproductibilité à haute concentration de matériel génétique.
Concernant le kit Aspergillus, il s’est avéré qu’il existe une possibilité de discriminer les différentes classifications de pathologies fongiques invasives sur base des résultats donnés par l’InGenius. En effet, il est possible de différencier les aspergilloses prouvées, probables, possibles et les cas négatifs ou les cas de portage sain. Il est indéniable que ces outils de biologie moléculaire représentent un grand atout pour aider au diagnostic des maladies fongiques et que leur utilisation devrait être de plus en plus répandue durant les années à venir. Leur utilisation ne peut être qu’encouragée.Note de contenu : Table des matières
Présentation de l’établissement ...............................................................................................5
Introduction générale ..............................................................................................................6
Contexte général .....................................................................................................................8
1. Qu’est-ce qu’une mycose ? ..................................................................................................... 8
2. Aspergillus spp. ...................................................................................................................... 9
2.1. Epidémiologie................................................................................................................. 9
2.2. Pathologies....................................................................................................................11
2.3. Diagnostic biologique ....................................................................................................13
2.4. Traitement .....................................................................................................................15
3. Pneumocystis jirovecii ...........................................................................................................15
3.1. Epidémiologie................................................................................................................15
3.2. Pathologies....................................................................................................................17
3.3. Diagnostic biologique ....................................................................................................19
3.4. Traitement .....................................................................................................................21
4. Classification des maladies fongiques invasives .....................................................................22
5. Real time Q-PCR...................................................................................................................24
Objectifs et stratégie .............................................................................................................28
Matériel et méthodes ............................................................................................................29
Résultats et discussion ..........................................................................................................44
Conclusion générale .............................................................................................................55
Lexique ................................................................................................................................57
Liste des figures ...................................................................................................................58
Liste des tableaux .................................................................................................................60
Bibliographie ........................................................................................................................61
Annexes ...............................................................................................................................64Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=105769 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Etude de la dynamique du développement du biofilm par les levures : influence des antifongiques / Rebecca Beki Mayala
Titre : Etude de la dynamique du développement du biofilm par les levures : influence des antifongiques Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Rebecca Beki Mayala, Auteur ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche Année de publication : 2018 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66070 Etude de la dynamique du développement du biofilm par les levures : influence des antifongiques [TFE / Mémoire] / Rebecca Beki Mayala, Auteur ; Nicolas Kesteman, Directeur de la recherche . - 2018.
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Mots-clés : biologie médicale Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=66070 Exemplaires
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