Centre de Documentation Campus Montignies
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Mercredi 9h-16h30
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Auteur Gédéon Julio Tchuidjang Tchetnya |
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Identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse (MALDI-TOF) / Gédéon Julio Tchuidjang Tchetnya
Titre : Identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse (MALDI-TOF) Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : Gédéon Julio Tchuidjang Tchetnya ; Véronique Yvette Miendje Deyi, Promoteur du mémoire Editeur : Montignies-sur-Sambre : Haute Ecole Louvain en Hainaut Année de publication : 2023 Importance : 66p. Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur . Langues : Français (fre) Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Introduction
Les champignons filamenteux sont de plus en plus impliqués en pathologie humaine notamment chez les personnes immunodéprimées. Les méthodes d’identification conventionnelles sont fastidieuses et nécessitent une longue formation. Dans le contexte de centralisation des activités de mycologie du LHUB-ULB sur un seul centre d’activités, l’implémentation d’une méthode rapide et fiable serait la bienvenue.
But du travail
Le but de ce travail est de valider la technique MBT HT Filamentous fungi de Bruker pour l’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse (MALDI-TOF). En cas de résultats satisfaisants, l’objectif est d’implémenter cette méthode rapide en routine afin d’améliorer la prise en charge des patients et simplifier la tâche aux technologues du secteur de mycologie.
Matériels et méthodes
Les prélèvements cliniques issus des 5 hôpitaux partenaires du LHUB-ULB pour la recherche de moisissures, ainsi que les prélèvements issus des services de dermatologie de l’hôpital Erasme et du CHU Saint-Pierre pour recherche des dermatophytes seront traités en parallèle suivant les méthodes conventionnelles (culture, microscopie et macroscopie) et par spectrométrie de masse (MALDI-TOF). Le taux de concordance entre les 2 méthodes sera calculé. Les souches présentant les résultats discordants seront identifiées par séquençage afin de pouvoir départager les 2 méthodes.
Résultats et discussion
Au terme de ce travail, 100 souches de champignons filamenteux ont été identifiées par MALDI-TOF et par les méthodes conventionnelles avec une concordance de 94% entre ces 2 méthodes. Les scores obtenus par spectrométrie de masse étaient particulièrement bons. Les 6 souches discordantes n’ont donné aucune identification par MALDI-TOF. L’analyse par séquençage, concluante pour 4 souches, a confirmé que les cas d’échecs d’identification par MALDI-TOF étaient attribués à l’absence des souches concernées dans la base de données. Aucune concordance n’a été observée entre la biologie moléculaire et la méthode de routine pour les 4 cas souches. Par conséquent, le MALDI-TOF est une excellente méthode pour l’identification des champignons filamenteux pour autant que la souche à identifier soit présente dans la base de données.
Conclusion et perspectives
Au terme de ce travail, la technique MBT HT Filamentous fungi de Bruker pour l’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse a été validée néanmoins, il faudra progressivement enrichir la base de données du spectromètre de masse du LHUB-ULB. L’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse sera intégrée dans la routine du laboratoire de Mycologie du LHUB-ULB, ce qui permettra une simplification de la tâche des technologues et surtout une réponse plus rapide et par conséquent une amélioration de la prise en charge des patients.Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=114743 Identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse (MALDI-TOF) [TFE / Mémoire] / Gédéon Julio Tchuidjang Tchetnya ; Véronique Yvette Miendje Deyi, Promoteur du mémoire . - Montignies-sur-Sambre : Haute Ecole Louvain en Hainaut, 2023 . - 66p.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur .
Langues : Français (fre)
Index. décimale : TFE Bio Med TFE Biologie médicale Résumé : Introduction
Les champignons filamenteux sont de plus en plus impliqués en pathologie humaine notamment chez les personnes immunodéprimées. Les méthodes d’identification conventionnelles sont fastidieuses et nécessitent une longue formation. Dans le contexte de centralisation des activités de mycologie du LHUB-ULB sur un seul centre d’activités, l’implémentation d’une méthode rapide et fiable serait la bienvenue.
But du travail
Le but de ce travail est de valider la technique MBT HT Filamentous fungi de Bruker pour l’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse (MALDI-TOF). En cas de résultats satisfaisants, l’objectif est d’implémenter cette méthode rapide en routine afin d’améliorer la prise en charge des patients et simplifier la tâche aux technologues du secteur de mycologie.
Matériels et méthodes
Les prélèvements cliniques issus des 5 hôpitaux partenaires du LHUB-ULB pour la recherche de moisissures, ainsi que les prélèvements issus des services de dermatologie de l’hôpital Erasme et du CHU Saint-Pierre pour recherche des dermatophytes seront traités en parallèle suivant les méthodes conventionnelles (culture, microscopie et macroscopie) et par spectrométrie de masse (MALDI-TOF). Le taux de concordance entre les 2 méthodes sera calculé. Les souches présentant les résultats discordants seront identifiées par séquençage afin de pouvoir départager les 2 méthodes.
Résultats et discussion
Au terme de ce travail, 100 souches de champignons filamenteux ont été identifiées par MALDI-TOF et par les méthodes conventionnelles avec une concordance de 94% entre ces 2 méthodes. Les scores obtenus par spectrométrie de masse étaient particulièrement bons. Les 6 souches discordantes n’ont donné aucune identification par MALDI-TOF. L’analyse par séquençage, concluante pour 4 souches, a confirmé que les cas d’échecs d’identification par MALDI-TOF étaient attribués à l’absence des souches concernées dans la base de données. Aucune concordance n’a été observée entre la biologie moléculaire et la méthode de routine pour les 4 cas souches. Par conséquent, le MALDI-TOF est une excellente méthode pour l’identification des champignons filamenteux pour autant que la souche à identifier soit présente dans la base de données.
Conclusion et perspectives
Au terme de ce travail, la technique MBT HT Filamentous fungi de Bruker pour l’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse a été validée néanmoins, il faudra progressivement enrichir la base de données du spectromètre de masse du LHUB-ULB. L’identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse sera intégrée dans la routine du laboratoire de Mycologie du LHUB-ULB, ce qui permettra une simplification de la tâche des technologues et surtout une réponse plus rapide et par conséquent une amélioration de la prise en charge des patients.Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=114743 Exemplaires
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