Centre de Documentation Campus Montignies
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Auteur BRIEUC VAN HASSEL |
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Rôle du plasmide de la souche Bacillus amyloliquefaciens S499 dans les interactions au sein de la rhizosphère / BRIEUC VAN HASSEL
Titre : Rôle du plasmide de la souche Bacillus amyloliquefaciens S499 dans les interactions au sein de la rhizosphère Type de document : TFE / Mémoire Auteurs : BRIEUC VAN HASSEL, Auteur Année de publication : 2016 Note générale : Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur Langues : Français (fre) Mots-clés : AGRONOMIE AIBT Gembloux Agro-Biotech plasmide rhizosphère Bacillus amyloliquefaciens S499 Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Note de contenu : Table des matières
Remerciements ........................................................................................................................ 3
Table des matières ................................................................................................................... 4
Introduction générale ............................................................................................................... 7
1. Contexte général .............................................................................................................. 9
1.1. La rhizosphère .......................................................................................................... 9
1.2. Les PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) ................................................. 9
1.2.1. Mécanismes d’aide à la croissance d’espèces végétales ............................... 10
1.2.1.1. Mécanismes directs ................................................................................ 11
1.2.1.2. Mécanismes indirects ............................................................................. 11
1.3. Les Bacillus et leurs lipopeptides............................................................................ 13
1.3.1. Les surfactines ................................................................................................ 15
1.3.2. L’iturine........................................................................................................... 16
1.3.3. La fengycine .................................................................................................... 17
1.4. Bacillus amyloliquefaciens...................................................................................... 18
1.4.1. La souche FZB42 ............................................................................................. 19
1.4.2. La souche S499 ............................................................................................... 20
2. Objectifs et stratégie ...................................................................................................... 21
3. Matériel .......................................................................................................................... 23
3.1. Centrifugeuse ......................................................................................................... 23
3.2. Spectromètre UV-visible ........................................................................................ 23
3.3. SpectraMax ............................................................................................................. 24
3.4. Acquity class H UPLC Waters .................................................................................. 24
3.5. Sonicateur............................................................................................................... 25
3.6. NanoDrop 2000 ...................................................................................................... 26
3.7. StepOnePlus REAL-Time PCR System ..................................................................... 26
3.8. La souche 14A ......................................................................................................... 27 3.9. Graines de tomate (Solanum lycopersicum) et de tabac (Nicotiana tabacum) ..... 28
3.10. Fusarium oxysporum et Cladosporum cucumerinum ........................................ 28
4. Résultats ......................................................................................................................... 29
4.1. Influence du plasmide de la souche S499 (pS499) sur la colonisation et la production de lipopeptides in planta ................................................................................. 29
4.1.1. Tests sur tabac ................................................................................................ 29
4.1.2. Tests sur tomate ............................................................................................. 31
5
4.2. Croissance et production de lipopeptides ex vivo sur milieu « exudats recomposés » ..................................................................................................................... 36
4.2.1. Tests sur LB .................................................................................................... 36
4.2.2. Tests sur RE .................................................................................................... 37
4.3. Influence du plasmide sur les propriétés antagonistes de S499 ........................... 40
4.3.1. Antagonismes sur milieu LBA ......................................................................... 40
4.3.2. Antagonismes sur milieu REA ........................................................................ 43
5. Discussion ....................................................................................................................... 46
5.1. Implication du plasmide dans la colonisation de la rhizosphère ........................... 46
5.2. Implication du plasmide dans la production de lipopeptides ................................ 47
Conclusion et perspectives .................................................................................................... 49
Abréviations ........................................................................................................................... 50
Liste des figures ..................................................................................................................... 51
Liste des tableaux ................................................................................................................... 53
Bibliographie .......................................................................................................................... 54
Annexes .................................................................................................................................. 55Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65738 Rôle du plasmide de la souche Bacillus amyloliquefaciens S499 dans les interactions au sein de la rhizosphère [TFE / Mémoire] / BRIEUC VAN HASSEL, Auteur . - 2016.
Le fichier numérique de ce document est disponible uniquement pour les membres de la Haute Ecole Louvain-en-Hainaut ainsi que ses étudiants. Veuillez-vous connecter pour accéder à votre compte lecteur
Langues : Français (fre)
Mots-clés : AGRONOMIE AIBT Gembloux Agro-Biotech plasmide rhizosphère Bacillus amyloliquefaciens S499 Index. décimale : TFE AIBT TFE Agro-industries et biotechnologies Note de contenu : Table des matières
Remerciements ........................................................................................................................ 3
Table des matières ................................................................................................................... 4
Introduction générale ............................................................................................................... 7
1. Contexte général .............................................................................................................. 9
1.1. La rhizosphère .......................................................................................................... 9
1.2. Les PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) ................................................. 9
1.2.1. Mécanismes d’aide à la croissance d’espèces végétales ............................... 10
1.2.1.1. Mécanismes directs ................................................................................ 11
1.2.1.2. Mécanismes indirects ............................................................................. 11
1.3. Les Bacillus et leurs lipopeptides............................................................................ 13
1.3.1. Les surfactines ................................................................................................ 15
1.3.2. L’iturine........................................................................................................... 16
1.3.3. La fengycine .................................................................................................... 17
1.4. Bacillus amyloliquefaciens...................................................................................... 18
1.4.1. La souche FZB42 ............................................................................................. 19
1.4.2. La souche S499 ............................................................................................... 20
2. Objectifs et stratégie ...................................................................................................... 21
3. Matériel .......................................................................................................................... 23
3.1. Centrifugeuse ......................................................................................................... 23
3.2. Spectromètre UV-visible ........................................................................................ 23
3.3. SpectraMax ............................................................................................................. 24
3.4. Acquity class H UPLC Waters .................................................................................. 24
3.5. Sonicateur............................................................................................................... 25
3.6. NanoDrop 2000 ...................................................................................................... 26
3.7. StepOnePlus REAL-Time PCR System ..................................................................... 26
3.8. La souche 14A ......................................................................................................... 27 3.9. Graines de tomate (Solanum lycopersicum) et de tabac (Nicotiana tabacum) ..... 28
3.10. Fusarium oxysporum et Cladosporum cucumerinum ........................................ 28
4. Résultats ......................................................................................................................... 29
4.1. Influence du plasmide de la souche S499 (pS499) sur la colonisation et la production de lipopeptides in planta ................................................................................. 29
4.1.1. Tests sur tabac ................................................................................................ 29
4.1.2. Tests sur tomate ............................................................................................. 31
5
4.2. Croissance et production de lipopeptides ex vivo sur milieu « exudats recomposés » ..................................................................................................................... 36
4.2.1. Tests sur LB .................................................................................................... 36
4.2.2. Tests sur RE .................................................................................................... 37
4.3. Influence du plasmide sur les propriétés antagonistes de S499 ........................... 40
4.3.1. Antagonismes sur milieu LBA ......................................................................... 40
4.3.2. Antagonismes sur milieu REA ........................................................................ 43
5. Discussion ....................................................................................................................... 46
5.1. Implication du plasmide dans la colonisation de la rhizosphère ........................... 46
5.2. Implication du plasmide dans la production de lipopeptides ................................ 47
Conclusion et perspectives .................................................................................................... 49
Abréviations ........................................................................................................................... 50
Liste des figures ..................................................................................................................... 51
Liste des tableaux ................................................................................................................... 53
Bibliographie .......................................................................................................................... 54
Annexes .................................................................................................................................. 55Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=65738 Exemplaires
Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire