[article]
| Titre : |
Intérêts de la métagénomique clinique en infectiologie |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Victor Euzen ; Théo Ghelfenstein-Ferreira ; Jérôme Le Goff ; Maud Salmona |
| Année de publication : |
2024 |
| Article en page(s) : |
p. 63-68 |
| Langues : |
Français (fre) |
| Mots-clés : |
Infection |
| Résumé : |
La métagénomique clinique (MgC) est un nouvel outil de biologie moléculaire dans l’arsenal diagnostique des microbiologistes. Elle permet de détecter sans a priori tous les micro-organismes présents. Utilisable sur tous types de prélèvements, elle nécessite plusieurs étapes (extraction, préparation des banques, séquençage par next generation sequencing, analyses bio-informatiques). Son utilisation en diagnostic a été décrite dans différentes pathologies (infections du système nerveux central, infections respiratoires, digestives, oculaires, cutanées et en cas de sepsis). En une seule analyse, la MgC permet également d’étudier le microbiome présent dans le prélèvement, d’analyser les transcrits microbiens et d’étudier la réponse de l’hôte. Sa place dans l’algorithme diagnostique doit faire l’objet d’études supplémentaires. En sus du diagnostic, la MgC a démontré son utilité dans la recherche de résistance aux traitements antimicrobiens, mais également en épidémiologie. Malgré les progrès visant à réduire les coûts, la MgC reste encore à l’heure actuelle plus coûteuse que les méthodes conventionnelles. La mise sur le marché de séquenceurs plus accessibles ainsi que le développement de tests commerciaux permettront l’utilisation de la MgC dans un plus grand nombre de laboratoires dans les années futures. |
| Permalink : |
http://cdocs.helha.be/pmbgilly/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=81881 |
in La revue du praticien > Vol. 74, n° 1 (Janvier 2024) . - p. 63-68
[article] Intérêts de la métagénomique clinique en infectiologie [texte imprimé] / Victor Euzen ; Théo Ghelfenstein-Ferreira ; Jérôme Le Goff ; Maud Salmona . - 2024 . - p. 63-68. Langues : Français ( fre) in La revue du praticien > Vol. 74, n° 1 (Janvier 2024) . - p. 63-68
| Mots-clés : |
Infection |
| Résumé : |
La métagénomique clinique (MgC) est un nouvel outil de biologie moléculaire dans l’arsenal diagnostique des microbiologistes. Elle permet de détecter sans a priori tous les micro-organismes présents. Utilisable sur tous types de prélèvements, elle nécessite plusieurs étapes (extraction, préparation des banques, séquençage par next generation sequencing, analyses bio-informatiques). Son utilisation en diagnostic a été décrite dans différentes pathologies (infections du système nerveux central, infections respiratoires, digestives, oculaires, cutanées et en cas de sepsis). En une seule analyse, la MgC permet également d’étudier le microbiome présent dans le prélèvement, d’analyser les transcrits microbiens et d’étudier la réponse de l’hôte. Sa place dans l’algorithme diagnostique doit faire l’objet d’études supplémentaires. En sus du diagnostic, la MgC a démontré son utilité dans la recherche de résistance aux traitements antimicrobiens, mais également en épidémiologie. Malgré les progrès visant à réduire les coûts, la MgC reste encore à l’heure actuelle plus coûteuse que les méthodes conventionnelles. La mise sur le marché de séquenceurs plus accessibles ainsi que le développement de tests commerciaux permettront l’utilisation de la MgC dans un plus grand nombre de laboratoires dans les années futures. |
| Permalink : |
http://cdocs.helha.be/pmbgilly/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=81881 |
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